stringtranslate.com

Ной Розенберг

Ноа Обри Розенберг — генетик, работающий в области эволюционной биологии , математической филогенетики и популяционной генетики , а также профессор популяционной генетики и общества в Стэнфорде. [2] Его исследования сосредоточены на математическом моделировании и статистических методах для генетики и эволюции [3] , и он является главным редактором журнала Theoretical Population Biology . [4]

Образование

Розенберг окончил Иллинойскую академию математики и наук в 1993 году, где он начал математический справочник, известный как The Noah Sheets. [5] Он получил степень бакалавра по математике в Университете Райса в 1997 году, где он вошел в сотню лучших студентов на конкурсе Патнэма . [6] Розенберг получил степень магистра по математике в Стэнфордском университете в 1999 году и степень доктора философии по биологии в Стэнфордском университете в 2001 году под руководством Маркуса Фельдмана . [7] Его диссертация называлась «Статистическое моделирование генетических историй и взаимосвязей популяций». [8] Часть его диссертационной работы была признана статьей года по версии The Lancet в 2003 году. [9] С 2001 по 2005 год Розенберг был постдокторантом в Университете Южной Калифорнии . [7]

Карьера

Розенберг был профессором Мичиганского университета с 2005 по 2011 год, где он занимал должности на кафедре генетики человека, кафедре экологии и эволюционной биологии и кафедре биостатистики. Он присоединился к кафедре биологии Стэнфордского университета в качестве доцента в 2011 году и был повышен до полного профессора в 2014 году, когда он был назначен Стэнфордским профессором популяционной генетики и общества. [2] Он является членом Стэнфордского института вычислительной и математической инженерии (ICME) и Stanford Bio-X. [10] [11] Розенберг был избран членом Американской ассоциации содействия развитию науки в 2018 году. [12]

Розенберг опубликовал более 150 рецензируемых статей и консультировал более 35 докторантов и постдокторантов. [6] Его стажеры стали профессорами в университетах, включая Корнельский университет , [13] Университет Дьюка , [14] Онкологический центр им. М. Д. Андерсона , [15] и Университет Южной Калифорнии . [16] [17]

Розенберг занимает должность главного редактора журнала Theoretical Population Biology с 2013 года [4] и был заместителем редактора в таких научных журналах, как Genetics and Evolution, Medicine и Public Health . [18] Он также является содиректором Стэнфордского центра вычислительной, эволюционной и геномной геномики человека. [19] В 2018 году Розенберг запустил проект Stanford X-Tree Project, веб-сайт, иллюстрирующий концепции филогенетики с использованием фотографий реальных деревьев из кампуса Стэнфорда. [20]

Исследовать

Большая часть работы Розенберга посвящена анализу глобальных моделей генетической и языковой изменчивости, [9] [21] [22] [23] включая разработку программного обеспечения для анализа и визуализации данных о происхождении населения. [24] [25] [ необходим неосновной источник ] Он также изучал генетическую историю определенных групп людей, таких как коренное население Олони в Калифорнии , [26] афроамериканцы , [27] и еврейское население. [28]

Работа Розенберга в области судебной генетики исследовала значение методов вменения для генетической конфиденциальности. [29] [30] Его работа в области теории коалесценции охарактеризовала влияние кровного родства , [31] событий-основателей , [32] и миграции [33] на закономерности генетической изменчивости . А его работа в области генетики человека исследовала значение истории популяции для исследований ассоциаций и полигенных оценок . [34] [35]

Розенберг внес вклад в понимание математических свойств объектов и величин, используемых в эволюционной биологии. Его работа включает комбинаторное перечисление филогенетических деревьев и объединенных историй, [36] [37] [38] [39] анализ эволюционных моделей, [40] [41] [42] и вывод математических границ для популяционно-генетической статистики. [43] [44] [45] Он также применял популяционно-генетическую статистику в других областях, таких как его статья 2020 года, объединяющая исследования эффективности здравоохранения и популяционно-генетическую статистику, которую он написал в соавторстве со своей женой Донной Зульман. [46]

Розенберг является постоянным автором On-Line Encyclopedia of Integer Sequences . [47] [48] [49]

Ссылки

  1. ^ Ноа Розенберг в проекте «Генеалогия математики»
  2. ^ ab "Люди | Центр вычислительной, эволюционной и человеческой геномики (CEHG)". cehg.stanford.edu . Получено 2023-11-01 .
  3. ^ Университет, Стэнфорд (2020-06-01). «Там, где встречаются математика и биология». Stanford News . Получено 2023-11-02 .
  4. ^ ab "Редакционная коллегия журнала "Теоретическая популяционная биология"". Elsevier . Получено 26.04.2018 .
  5. ^ Ноа Шитс
  6. ^ ab "Резюме Ноя Розенберга" (PDF) .
  7. ^ ab "Профиль Ноа Розенберга | Стэнфордские профили". profiles.stanford.edu . Получено 2023-11-02 .
  8. ^ Розенберг, Ной Обри (2001). Статистическое моделирование генетических историй и взаимосвязей популяций (диссертация). OCLC  81533899. ProQuest  304727329.[ нужна страница ] [ нужен неосновной источник ]
  9. ^ ab Horton, Richard (2003). "Прочитайте об этом все: Статья года по версии The Lancet, 2003". The Lancet . 362 (9401): 2101–2103. doi :10.1016/s0140-6736(03)15110-0. ISSN  0140-6736. PMC 7123340. PMID 14697815  . 
  10. ^ "Ной Розенберг | Стэнфордский институт вычислительной и математической инженерии". profiles.stanford.edu . Получено 2023-11-02 .
  11. ^ Университет, © Стэнфорд; Стэнфорд; Калифорния 94305 (2014-06-20). "Ной Розенберг - профессор биологии". Добро пожаловать в Bio-X . Получено 2023-11-02 .{{cite web}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  12. ^ Корте, Андреа (27 ноября 2018 г.). «AAAS чествует выдающихся ученых как избранных членов 2018 года». AAAS .
  13. ^ "Джехи Ким". jaeheekimlab.github.io . Проверено 2 ноября 2023 г.
  14. ^ "Эми Голдберг, доктор философии - Люди". www.goldberglab.org . Получено 2023-11-02 .
  15. ^ "Лаборатория листов" . таблица.org . Проверено 2 ноября 2023 г.
  16. ^ "Edge Lab - Team". edgepopgen.github.io . Получено 2023-11-02 .
  17. ^ "Mooney Lab". mooney-lab.github.io . Получено 2023-11-02 .
  18. ^ "Редакционная коллегия". Эволюция, медицина и общественное здравоохранение . Получено 2023-11-02 .
  19. ^ "Содиректора | Центр вычислительной, эволюционной и человеческой геномики (CEHG)". cehg.stanford.edu . Получено 2023-11-02 .
  20. ^ Прилламан, Маккензи (2021-12-07). «Профессор Стэнфорда освещает концепции эволюционного дерева с помощью деревьев кампуса». Stanford News . Получено 2023-11-02 .
  21. ^ Браун, Дэвид (22.02.2008). «Генетические мутации дают представление о человеческом разнообразии». The Washington Post . ISSN  0190-8286 . Получено 02.11.2023 .
  22. ^ Балтер, Майкл (2011-09-23). ​​«По следам первых американцев» . Science . 333 (6050): 1692. Bibcode : 2011Sci...333.1692B. doi : 10.1126/science.333.6050.1692. ISSN  0036-8075.
  23. ^ Ханли, Кит (2015-02-17). «Переоценка глобальной генно-языковой коэволюции». Труды Национальной академии наук . 112 (7): 1919–1920. doi : 10.1073/pnas.1425000112 . ISSN  0027-8424. PMC 4343119. PMID 25675520  . 
  24. ^ Розенберг, Ноа А. (2004). "distruct: программа для графического отображения структуры популяции". Заметки о молекулярной экологии . 4 (1): 137–138. doi :10.1046/j.1471-8286.2003.00566.x.
  25. ^ Копельман, Наама М.; Майзель, Джонатан; Якобссон, Маттиас; Розенберг, Ноа А.; Майроуз, Итай (2015). «Clumpak: программа для определения режимов кластеризации и упаковки выводов о структуре популяции в K». Ресурсы молекулярной экологии . 15 (5): 1179–1191. doi :10.1111/1755-0998.12387. PMC 4534335. PMID  25684545 . 
  26. ^ Имблер, Сабрина (12 апреля 2022 г.). «Новый анализ ДНК подтверждает древние корни неизвестного племени в Калифорнии». The New York Times .
  27. ^ MacCormick, Holly Alyssa (2023-07-10). «Новый метод генеалогии помогает заполнить пробелы в афроамериканском происхождении». Stanford News . Получено 2023-11-02 .
  28. ^ Розенберг, Ноа А.; Вайцман, Стивен П. (2013). «От поколения к поколению: генетика еврейского населения». Биология человека . 85 (6): 817–823. doi :10.1353/hub.2013.a548063. Проект MUSE  548063.[ необходим неосновной источник ]
  29. ^ Коллинз, Натан (2017-05-15). «Совпадения генов могут помочь науке, но вызывают опасения по поводу конфиденциальности». Stanford News . Получено 2023-11-02 .
  30. ^ Коллинз, Натан (2018-10-17). "Новый способ найти родственников с помощью судебной ДНК". Stanford News . Получено 2023-11-02 .
  31. ^ Северсон, Алисса Л.; Карми, Шай; Розенберг, Ноа А. (2019). «Влияние родства на разделение идентичности между индивидуумами по происхождению». Генетика . 212 (1): 305–316. doi :10.1534/genetics.119.302136. PMC 6499533. PMID  30926583 . [ необходим неосновной источник ]
  32. ^ ДеДжорджио, Майкл; Дегнан, Джеймс Х; Розенберг, Ноа А (2011). «Распределения времени коалесценции в модели последовательного основателя истории эволюции человека». Генетика . 189 (2): 579–593. doi :10.1534/genetics.111.129296. PMC 3189793. PMID  21775469 . [ необходим неосновной источник ]
  33. ^ Алькала, Николас; Голдберг, Эми; Рамакришнан, Ума; Розенберг, Ноа А. (2019). Хейер, Эвелин (ред.). «Коалесцентная теория мотивов миграционной сети». Молекулярная биология и эволюция . 36 (10): 2358–2374. doi :10.1093/molbev/msz136. PMC 6759081. PMID  31165149. [ необходим неосновной источник ]
  34. ^ Эдж, Майкл Д.; Горручурн, Пракаш; Розенберг, Ноа А. (2013). «Неожиданные удачи и ловушки». Эволюция, медицина и общественное здравоохранение . 2013 (1): 254–272. doi :10.1093/emph/eot021. ISSN  2050-6201. PMC 3868415. PMID 24481204  . [ необходим неосновной источник ]
  35. ^ Розенберг, Ноа А.; Эдж, Майкл Д.; Притчард, Джонатан К.; Фельдман, Маркус В. (2019-01-01). «Интерпретация полигенных оценок, полигенной адаптации и фенотипических различий человека». Эволюция, медицина и общественное здравоохранение . 2019 (1): 26–34. doi :10.1093/emph/eoy036. PMC 6393779. PMID  30838127 . [ необходим неосновной источник ]
  36. ^ Розенберг, Ноа А. (2007). «Подсчет объединенных историй». Журнал вычислительной биологии . 14 (3): 360–377. doi :10.1089/cmb.2006.0109. hdl : 2027.42/63175 . PMID  17563317.[ необходим неосновной источник ]
  37. ^ Розенберг, Ноа А.; Дегнан, Джеймс Х. (2010). «Объединенные истории для несогласованных генных деревьев и деревьев видов». Теоретическая популяционная биология . 77 (3): 145–151. doi :10.1016/j.tpb.2009.12.004. PMID  20064540.[ необходим неосновной источник ]
  38. ^ Дисанто, Филиппо; Розенберг, Ноа А. (2015). «Объединенные истории для деревьев скрученных деревьев». Журнал вычислительной биологии . 22 (10): 918–929. arXiv : 1503.03560 . doi : 10.1089/cmb.2015.0015. PMID  25973633.[ необходим неосновной источник ]
  39. ^ Розенберг, Ноа А. (2019). «Перечисление одиноких пар генных деревьев и видовых деревьев с помощью антиподальных вишен». Успехи в прикладной математике . 102 : 1–17. doi : 10.1016/j.aam.2018.09.001 . PMC 6456302. PMID  30983650 . [ необходим неосновной источник ]
  40. ^ Розенберг, Ноа А. (2006). «Среднее значение и дисперсия чисел r-ветвистых узлов и r-гусениц в генеалогических деревьях, созданных на Юле». Annals of Combinatorics . 10 (1): 129–146. doi :10.1007/s00026-006-0278-6. S2CID  2484974.[ необходим неосновной источник ]
  41. ^ Мехта, Рохан С.; Брайант, Дэвид; Розенберг, Ноа А. (2016). «Вероятность монофилии выборки генных линий на видовом дереве». Труды Национальной академии наук . 113 (29): 8002–8009. Bibcode : 2016PNAS..113.8002M. doi : 10.1073 /pnas.1601074113 . PMC 4961160. PMID  27432988. [ необходим неосновной источник ]
  42. ^ Дисанто, Филиппо; Фукс, Майкл; Панингбатан, Ариэль Р.; Розенберг, Ноа А. (2022). «Распределения в рамках двух моделей видового дерева числа корневых предковых конфигураций для сопоставления генных деревьев и видовых деревьев». Анналы прикладной вероятности . 32 (6): 4426–4458. arXiv : 2006.09106 . doi : 10.1214/22-AAP1791 .[ необходим неосновной источник ]
  43. ^ Эдж, Майкл Д.; Розенберг, Ноа А. (2014). «Верхние границы FST с точки зрения частоты наиболее частого аллеля и общей гомозиготности: случай указанного числа аллелей». Теоретическая популяционная биология . 97 : 20–34. doi :10.1016/j.tpb.2014.08.001. PMC 4180022 . PMID  25132646. [ необходим неосновной источник ]
  44. ^ Алькала, Николас; Розенберг, Ноа А. (2017). «Математические ограничения на F ST: биаллельные маркеры в произвольном количестве популяций». Генетика . 206 (3): 1581–1600. doi :10.1534/genetics.116.199141. ISSN  1943-2631. PMC 5500152. PMID 28476869  . [ необходим неосновной источник ]
  45. ^ Моррисон, Майке Л.; Розенберг, Ноа А. (2023). «Математические границы энтропии Шеннона с учетом распространенности i-го наиболее распространенного таксона». Журнал математической биологии . 87 (5): 76. doi :10.1007/s00285-023-01997-3. PMC 10603011. PMID  37884812 . [ необходим неосновной источник ]
  46. ^ Армитидж, Ханае (13.02.2020). «Формула для момента «ага»: объединитесь со своим супругом». Область действия . Получено 02.11.2023 .
  47. ^ "A354690 - OEIS". oeis.org . Получено 2023-11-02 .
  48. ^ "A355108 - OEIS". oeis.org . Получено 2023-11-02 .
  49. ^ "A354970 - OEIS". oeis.org . Получено 2023-11-02 .

Внешние ссылки