СУМО4

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Малый модификатор 4, связанный с убиквитином, представляет собой белок , который у человека кодируется геном SUMO4 . ^{[3] [4]}

Функция

Этот ген является членом семейства генов SUMO. Это семейство генов кодирует небольшие модификаторы, связанные с убиквитином, которые присоединяются к белкам и контролируют субклеточную локализацию, стабильность или активность целевых белков. Белок, описанный в этой записи, расположен в цитоплазме и специфически модифицирует IKBA, приводя к негативной регуляции NF-каппа-В-зависимой транскрипции гена IL12B . Специфический полиморфизм в этом гене SUMO, который приводит к замене M55V, связан с диабетом I типа. RefSeq содержит этот полиморфизм. ^[4]

Взаимодействия

Было показано, что SUMO4 взаимодействует с IκBα . ^[5]

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000177688 — Ensembl , май 2017 г.
2. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
3. Борен К.М., Надкарни В., Сонг Дж.Х., Габбай К.Х., Овербах Д. (июнь 2004 г.). «Полиморфизм M55V в новом гене SUMO (SUMO-4) по-разному активирует факторы транскрипции теплового шока и связан с предрасположенностью к сахарному диабету I типа». Журнал биологической химии . 279 (26): 27233–8. дои : 10.1074/jbc.M402273200 . ПМИД  15123604.
4. «Ген Entrez: супрессор SUMO4 SMT3 гомолога 4 mif два 3 (S. cerevisiae)» .
5. Го Д, Ли М, Чжан Й, Ян П, Эккенроде С, Хопкинс Д, Чжэн В, Пурохит С, Подольски Р.Х., Мьюир А, Ван Дж, Донг З, Бруско Т, Аткинсон М, Поццилли П, Зейдлер А, Раффель LJ, Джейкоб СО, Парк Ю, Серрано-Риос М, Ларрад МТ, Чжан З, Гарчон Х.Дж., Бах Дж.Ф., Роттер Дж.И., Ше Дж.С., Ван Сай (август 2004 г.). «Функциональный вариант SUMO4, нового альфа-модификатора I каппа B, связан с диабетом 1 типа». Природная генетика . 36 (8): 837–41. дои : 10.1038/ng1391. PMID  15247916. S2CID  41123857.

дальнейшее чтение

• Ван С.И., Подольский Р., Ше JX (октябрь 2006 г.). «Генетические и функциональные данные, подтверждающие, что SUMO4 является геном предрасположенности к диабету 1 типа». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1079 (1): 257–67. Бибкод : 2006NYASA1079..257W. дои : 10.1196/анналы.1375.039. PMID  17130563. S2CID  20462827.
• Дэвис Дж.Л., Кавагути Ю., Беннетт С.Т., Коупман Дж.Б., Корделл Х.Дж., Притчард Л.Е., Рид П.В., Гоф С.К., Дженкинс С.К., Палмер С.М. (сентябрь 1994 г.). «Полногеномный поиск генов предрасположенности человека к диабету 1 типа». Природа . 371 (6493): 130–6. Бибкод : 1994Natur.371..130D. дои : 10.1038/371130a0. PMID  8072542. S2CID  4275341.
• Луо Д.Ф., Бузцетти Р., Роттер Дж.И., Макларен Н.К., Раффель Л.Дж., Нистико Л., Джованнини С., Поццилли П., Томсон Дж., Ше Дж.Х. (май 1996 г.). «Подтверждение трех генов предрасположенности к инсулинозависимому сахарному диабету: IDDM4, IDDM5 и IDDM8». Молекулярная генетика человека . 5 (5): 693–8. дои : 10.1093/hmg/5.5.693 . ПМИД  8733139.
• Мангалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К., Эдвардс К.А., Ашерст Дж.Л., Уилминг Л., Джонс М.К., Хортон Р., Хант С.Э., Скотт К.Э., Гилберт Дж.Г., Клэмп М.Э., Бетел Г., Милн С., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Эмброуз К.Д. , Эндрюс Т.Д., Эшвелл Р.И., Бэббидж А.К., Бэггули К.Л., Бэйли Дж., Банерджи Р., Баркер Д.Д., Барлоу К.Ф., Бейтс К., Беар Д.М., Бисли Х., Бисли О., Бёрд С.П., Блейки С., Брей-Аллен С., Брук Дж. , Браун А.Дж., Браун Дж.И., Берфорд Д.С., Беррилл В., Бертон Дж., Кардер С., Картер Н.П., Чепмен Дж.К., Кларк С.Ю., Кларк Дж., Кли СМ, ​​Клегг С., Кобли В., Кольер Р.Э., Коллинз Дж.Э., Колман Л.К., Корби НР, Ковилл Г.Дж., Калли К.М., Дхами П., Дэвис Дж., Данн М., Земляной М.Э., Эллингтон А.Э., Эванс К.А., Фолкнер Л., Фрэнсис М.Д., Фрэнкиш А., Франкленд Дж., Френч Л., Гарнер П., Гарнетт Дж., Гори М.Дж., Гилби Л.М., Гиллсон СиДжей, Глитеро Р.Дж., Графэм Д.В., Грант М., Гриббл С., Гриффитс С., Гриффитс М., Холл Р., Холлс К.С., Хаммонд С., Харли Дж.Л., Харт Э.А., Хит П.Д., Хиткотт Р., Холмс С.Дж., Хауден П.Дж. , Хау К.Л., Хауэлл Г.Р., Хакл Э., Хамфри С.Дж., Хамфрис М.Д., Хант А.Р., Джонсон СМ, Джой А.А., Кей М., Кинан С.Дж., Кимберли А.М., Кинг А., Лэрд Г.К., Лэнгфорд С., Лоулор С., Леонгаморнлерт Д.А., Леверша М, Ллойд Ч.Р., Ллойд Д.М., Лавленд Дж.Э., Ловелл Дж., Мартин С., Машреги-Мохаммади М., Маслен Г.Л., Мэтьюз Л., Макканн О.Т., Макларен С.Дж., Маклей К., МакМюррей А., Мур М.Дж., Малликин Дж.К., Ниблетт Д., Никерсон Т., Новик К.Л., Оливер К., Овертон-Ларти Е.К., Паркер А., Патель Р., Пирс А.В., Пек А.И., Филлимор Б., Филлипс С., Пламб Р.В., Портер К.М., Рэмси Ю., Рэнби С.А., Райс К.М., Росс М.Т., Сирл СМ, Сехра Х.К., Шеридан Э., Скьюс CD, Смит С., Смит М., Спраггон Л., Квадраты С.Л., Стюард К.А., Сикамор Н., Тэмлин-Холл Дж., Тестер Дж., Тикер Эй.Дж., Томас Д.В., Торп А., Трейси А., Троманс А, Табби Б, Уолл М, Уоллис Дж.М., Вест АП, Уайт СС, Уайтхед С.Л., Уиттакер Х., Уайлд А, Уилли Диджей, Уилмер Т.Э., Вуд Дж.М., Рэй П.В., Уятт Дж.С., Янг Л., Младший Р.М., Бентли Д.Р., Коулсон А., Дурбин Р., Хаббард Т., Салстон Дж. Э., Данэм И., Роджерс Дж., Бек С. (октябрь 2003 г.). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M. дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД  14574404.
• Го Д, Ли М, Чжан Й, Ян П, Экенроде С, Хопкинс Д, Чжэн В, Пурохит С, Подольски Р.Х., Мьюир А, Ван Дж, Донг З, Бруско Т, Аткинсон М, Поццилли П, Зейдлер А, Раффель Л.Дж. , Джейкоб К.О., Парк Ю., Серрано-Риос М., Ларрад М.Т., Чжан З., Гарчон Х.Дж., Бах Дж.Ф., Роттер Дж.И., Ше Дж.С., Ван С.И. (август 2004 г.). «Функциональный вариант SUMO4, нового альфа-модификатора I каппа B, связан с диабетом 1 типа». Природная генетика . 36 (8): 837–41. дои : 10.1038/ng1391. PMID  15247916. S2CID  41123857.
• Смит DJ, Хаусон Дж.М., Лоу CE, Уокер Н.М., Лам AC, Натланд С., Хатчингс Дж., Туомилехто-Вольф Е., Туомилехто Дж., Гуджа К., Ионеску-Тырговисте К., Ундлиен Д.Е., Роннинген К.С., Сэвидж Д., Дангер Д.Б., Твеллс Р.К., Макардл В.Л., Страчан Д.П., Тодд Дж.А. (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском развития диабета 1 типа». Природная генетика . 37 (2): 110–1, ответ автора 112–3. дои : 10.1038/ng0205-110. PMID  15678134. S2CID  33336557.
• Цюй Х., Бхарадж Б., Лю XQ, Кертис Дж.А., Ньюхук Л.А., Патерсон А.Д., Хадсон Т.Дж., Полихронакос С. (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском развития диабета 1 типа». Природная генетика . 37 (2): 111–2, ответ автора 112–3. дои : 10.1038/ng0205-111 . ПМИД  15678135.
• Пак Й, Пак С, Кан Дж, Ян С, Ким Д (февраль 2005 г.). «Оценка достоверности связи между вариантом SUMO4 M55V и риском развития диабета 1 типа». Природная генетика . 37 (2): 112, ответ автора 112–3. дои : 10.1038/ng0205-112a . PMID  15678137. S2CID  30406915.
• Овербах Д., Маккей Э.М., Йе Э.Т., Габбай К.Х., Борен К.М. (ноябрь 2005 г.). «Остаток пролина-90, уникальный для SUMO-4, предотвращает созревание и сумойлирование». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 337 (2): 517–20. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.09.090. ПМИД  16198310.
• Го Д., Хан Дж., Адам Б.Л., Колберн Н.Х., Ван М.Х., Донг З., Эйзирик Д.Л., Ше JX, Ван С.И. (декабрь 2005 г.). «Протеомный анализ субстратов SUMO4 в клетках HEK293 в условиях стресса, вызванного сывороточным голоданием». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 337 (4): 1308–18. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.09.191. ПМИД  16236267.
• Носо С., Икегами Х., Фудзисава Т., Кавабата Ю., Асано К., Хиромине Ю., Цурумару М., Сугихара С., Ли И., Кавасаки Е., Авата Т., Огихара Т. (декабрь 2005 г.). «Генетическая гетерогенность в связи варианта SUMO4 M55V с предрасположенностью к диабету 1 типа». Диабет . 54 (12): 3582–6. дои : 10.2337/диабет.54.12.3582 . ПМИД  16306380.
• Цурумару М, Кавасаки Э, Ида Х, Мигита К, Мориучи А, Фукусима К, Фукусима Т, Абиру Н, Ямасаки Х, Носо С, Икегами Х, Авата Т, Сасаки Х, Эгучи К (август 2006 г.). «Доказательства роли небольшого убиквитиноподобного модификатора 4 как общего локуса аутоиммунитета у японской популяции». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 91 (8): 3138–43. дои : 10.1210/jc.2006-0206 . ПМИД  16735488.
• Костас Дж., Перес-Пампин Е., Феррейрос-Видал И., Торрес М., Филлипс С., Викарио Х.Л., Паблос Х.Л., Карраседо А., Гомес-Рейно Дж.Дж., Гонсалес А. (июнь 2006 г.). «Однонуклеотидные полиморфизмы SUMO4 и MAP3K7IP2 и восприимчивость к ревматоидному артриту». Журнал ревматологии . 33 (6): 1048–51. ПМИД  16755651.
• Седимби С.К., Шастри А., Пак Ю., Румба И., Сандживи CB (октябрь 2006 г.). «Связь полиморфизма SUMO4 M55V с аутоиммунным диабетом у латвийских пациентов». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1079 (1): 273–7. Бибкод : 2006NYASA1079..273S. дои : 10.1196/анналы.1375.041. PMID  17130565. S2CID  22345614.
• Линь ХИ, Ван С.Л., Сяо П.Дж., Лу Ю.К., Чен С.Ю., Линь К.Д., Синь С.К., Се MC, Шин С.Дж. (апрель 2007 г.). «Вариант SUMO4 M55V связан с диабетической нефропатией при диабете 2 типа». Диабет . 56 (4): 1177–80. дои : 10.2337/db06-1283 . ПМИД  17229939.
• Седимби С.К., Канунго А., Шастри А., Пак Ю., Сандживи CB (апрель 2007 г.). «Нет связи SUMO4 M55V с аутоиммунным диабетом у азиатско-индийских пациентов». Международный журнал иммуногенетики . 34 (2): 137–42. дои : 10.1111/j.1744-313X.2007.00668.x. PMID  17373940. S2CID  10433791.
• Носо С., Фудзисава Т., Кавабата Ю., Асано К., Хиромине Ю., Фукаи А., Огихара Т., Икегами Х. (июнь 2007 г.). «Ассоциация варианта малого убиквитиноподобного модификатора 4 (SUMO4), расположенного в локусе IDDM5, с диабетом 2 типа у японской популяции». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 92 (6): 2358–62. дои : 10.1210/jc.2007-0031 . ПМИД  17374705.
• Борен К.М., Габбай К.Х., Овербах Д. (август 2007 г.). «Аффинная хроматография нативных белков SUMO с использованием рекомбинантного UBC9, меченного His, связанного с смолой когтя, заряженной Co2+». Экспрессия и очистка белков . 54 (2): 289–94. дои : 10.1016/j.pep.2007.03.013. ПМИД  17459725.