Герцогство Саксен-Мерзебург было герцогством Священной Римской империи со столицей в Мерзебурге . Оно существовало с 1656 или 1657 по 1738 год и принадлежало Альбертинскому секундогениту саксонского дома Веттинов .
Курфюрст Веттин Иоганн Георг I Саксонский в своем завещании от 20 июля 1652 года указал, что его трое младших сыновей должны получить княжества по наследству. После смерти курфюрста 8 октября 1656 года его сыновья заключили «дружеско-братский главный договор» в саксонской резиденции Дрездене 22 апреля 1657 года и еще один договор в 1663 году, окончательно разграничивший их территории и суверенные права. Договоры создали три герцогства: Саксен-Цейц , Саксен-Вайсенфельс и Саксен-Мерзебург.
Принц Кристиан, третий старший сын, получил, среди прочего имущества, поместья бывшего епископства Мерзебурга , секуляризированного в 1565 году: замки, города и районы Мерзебург , Плагвиц , Рюкмарсдорф, Делич (с замком Делич), Бад-Лаухштедт , Шкойдиц , Лютцен , Биттерфельд , Цёрбиг , графство Брена , а также маркграфство Нижняя Лужица , включая города и замки Люббен , Доберлуг , Финстервальде , Доберн , Форст и Губен . Многие из этих территорий принадлежали епархии Мерзебурга, пока она не была секуляризирована в 1562 году.
Территория Саксен-Мерзебурга простиралась до западных границ Лейпцига. Таможенный пункт находился в районе, который сейчас является внутренним городским районом Линденау.
После смерти последнего наследника мужского пола саксонской ветви в 1738 году герцогство Саксен-Мерзебург отошло к курфюршеству Саксонии .
Чтобы обеспечить своих трех младших сыновей доходами, подобающими герцогу, герцог Кристиан I создал апанажи для своих младших сыновей еще при жизни. Эти территории оставались зависимыми от главной линии, и их суверенитет был строго ограничен. Они были названы в честь резиденций их владельцев и исчезли со смертью их первого герцога, потому что ни один из них не оставил после себя выживших наследников мужского пола. До того, как она прервалась, линия Саксен-Мерзебург-Шпремберг унаследовала все Саксен-Мерзебург.