stringtranslate.com

Область организатора ядрышка

Расположение ЯОР и ядрышковый цикл в клетках человека.

Области организаторов ядрышка (ЯОР) — это хромосомные области, имеющие решающее значение для формирования ядрышка . У человека ЯОР расположены на коротких плечах акроцентрических хромосом 13, 14, 15, 21 и 22, генов RNR1 , RNR2 , RNR3 , RNR4 и RNR5 соответственно. [1] Эти регионы кодируют 5.8S , 18S и 28S рибосомальную РНК . [1] NOR «зажаты» между повторяющимися гетерохроматическими последовательностями ДНК центромер и теломер . [1] Точная последовательность этих областей не включена в эталонный геном человека по состоянию на 2016 год [1] или в GRCh38.p10, выпущенный 6 января 2017 года. [2] 28 февраля 2019 года был выпущен GRCh38.p13, который добавил последовательности NOR для коротких плеч хромосом 13, 14, 15, 21 и 22. [3] Однако известно, что NOR содержат тандемные копии генов рибосомальной ДНК (рДНК). [1] Сообщалось о некоторых последовательностях фланкирующих последовательностей, расположенных проксимальнее и дистальнее NOR. [4] Сообщается, что NOR лори сильно различаются. [5] Существуют также последовательности ДНК, связанные с рДНК, которые находятся на других хромосомах и могут участвовать в формировании ядрышек. [6]

Окрашенная серебром область организатора ядрышка (стрелка) на кончике хромосомы геккона Lepidodactylus lugubris

Визуализация

DJ образует перинуклеолярный якорь для повторов рДНК.

Барбара МакКлинток впервые описала «ядрышковое организующее тело» у Zea mays в 1934 году. [7] При анализе кариотипа для идентификации NOR можно использовать серебряное пятно . [8] [9] NOR также можно увидеть в ядрышках с помощью окрашивания серебром, которое используется для исследования раковых изменений. [10] [11] [12] NOR также можно обнаружить с помощью антител, направленных против белка UBF , который связывается с ДНК NOR. [1]

Молекулярная биология

Помимо UBF, NOR также связываются с белком ATRX , патокой , сиртуином-7 и другими белками. [1] UBF был идентифицирован как митотическая «закладка» экспрессируемой рДНК, которая позволяет ей быстро возобновить транскрипцию после митоза . [1] Было показано, что дистальное фланкирующее соединение (DJ) ЯОР связано с периферией ядрышек. [4] Было обнаружено, что опероны рДНК в Escherichia coli группируются рядом друг с другом, подобно эукариотическому ядрышку. [13]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ abcdefgh McStay B (2016). «Области ядрышкового организатора: геномная« темная материя », требующая освещения». Гены и развитие . 30 (14): 1598–610. дои : 10.1101/gad.283838.116. ПМЦ  4973289 . ПМИД  27474438.
  2. ^ анон. «Обзор генома человека». ncbi.nlm.nih.gov/ . Консорциум по изучению генома . Проверено 17 июня 2017 г.
  3. ^ Консорциум ссылок на геном. «GRCh38.p13 выпущен». Ссылка на геном . Проверено 16 августа 2019 г.
  4. ^ ab Floutsakou I, Agrawal S, Nguyen TT, Seoighe C, Ganley AR, McStay B (2013). «Общая геномная архитектура областей ядрышкового организатора человека». Геномные исследования . 23 (12): 2003–12. дои : 10.1101/гр.157941.113. ПМЦ 3847771 . ПМИД  23990606. 
  5. ^ Байчароен С., Хираи Ю., Шрикулнатх К., Конгпром Ю., Хираи Х. (2016). «Гипервариабельность областей-организаторов ядрышка у бенгальских медленных лори, Nycticebus bengalensis (Primates, Lorisidae)». Цитогенетические и геномные исследования . 149 (4): 267–273. дои : 10.1159/000449145. ПМИД  27648559.
  6. ^ Куприянова Н.С., Нечволодов К.К., Садова А.А., Черепанова М.Д., Рысков А.П. (2015). «Неканонические сегменты рибосомальной ДНК в геноме человека и функционирование ядрышек». Джин . 572 (2): 237–42. дои : 10.1016/j.gene.2015.07.019. ПМИД  26164756.
  7. ^ МакКлинток Б (1934). «Связь определенного хромосомного элемента с развитием ядрышек у Zea mays». Zeitschrift für Zellforschung und Mikroskopische Anatomy . 21 (2): 294–328. дои : 10.1007/BF00374060.
  8. ^ Блум SE, Гудпасчер C (октябрь 1976 г.). «Улучшенная методика селективного окрашивания серебром областей ядрышкового организатора в хромосомах человека». Генетика человека . 34 (2): 199–206. дои : 10.1007/bf00278889. ПМИД  63440.
  9. ^ Лау Ю.Ф., Пфайффер Р.А., Арриги Ф.Е., Сюй Т.К. (январь 1978 г.). «Комбинация серебра и флуоресцентного окрашивания метафазных хромосом». Американский журнал генетики человека . 30 (1): 76–9. ПМК 1685453 . ПМИД  74950. 
  10. ^ Степан А, Симионеску С, Пиричи Д, Чуря Р, Маргаритеску С (2015). «Фрактальный анализ и диагностическая ценность областей ядрышкового организатора, окрашиваемых серебром, при аденокарциноме простаты». Аналитическая клеточная патология . 2015 : 250265. дои : 10.1155/2015/250265 . ПМЦ 4558419 . ПМИД  26366372. 
  11. ^ Gundog M, Yildiz OG, Имамоглу Н, Аслан Д, Айтекин А, Сойер I, Сойер С (2015). «Прогностическое значение двумерной оценки AgNOR при местном распространенном раке прямой кишки, леченном химиолучевой терапией». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 16 (18): 8155–61. дои : 10.7314/apjcp.2015.16.18.8155 . ПМИД  26745054.
  12. ^ Совмья Г.В., Нахар П., Астекар М., Агарвал Х., Сингх М.П. (2017). «Анализ областей ядрышкового организатора, связывающих серебро, в мазках эксфолиативной цитологии потенциально злокачественных и злокачественных поражений полости рта». Биотехника и гистохимия . 92 (2): 115–121. дои : 10.1080/10520295.2017.1283055. ПМИД  28296547.
  13. ^ Гаал Т, Брэттон Б.П., Санчес-Васкес П., Сливицки А., Сливицки К., Вегель А., Панну Р., Гурс Р.Л. (2016). «Колокализация отдаленных хромосомных локусов в пространстве у E. coli: бактериальное ядрышко». Гены и развитие . 30 (20): 2272–2285. дои : 10.1101/gad.290312.116. ПМК 5110994 . ПМИД  27898392.