YedZ (TC# 5.B.7) E. coli был исследован топологически и имеет 6 трансмембранных сегментов (TMS) с N- и C-концами, локализованными в цитоплазме. [1] Фон Розицки и др. 2004 идентифицировали гомологи YedZ у бактерий и животных. Гомологи YedZ демонстрируют консервативные остатки гистидина в своих трансмембранных доменах, которые могут функционировать в связывании гема. [2] Некоторые из гомологов, закодированных в геномах различных бактерий, имеют домены YedZ, слитые с транспортными, переносящими электроны и биогенезными белками. [2] Одним из животных гомологов является 6 TMS эпителиальный плазматический мембранный антиген простаты (STAMP1), который сверхэкспрессируется при раке простаты. Некоторые животные гомологи имеют домены YedZ, слитые C-концом с гомологами НАДФ- оксидоредуктаз .
Гомологи YedZ возникли в результате внутригенной трипликации элемента, кодирующего 2 TMS. Они демонстрируют статистически значимое сходство последовательностей с двумя семействами предполагаемых систем экспорта гема и одним семейством цитохромсодержащих переносчиков электронов и имеют биогенез. [2] Гомологи YedZ могут функционировать как связывающие гем белки, которые облегчают или регулируют оксидоредукцию, трансмембранный поток электронов и транспорт. Гомологи YedZ обнаружены у различных бактерий, включая магнитотактические бактерии и цианобактерии , где домены YedZ слиты с C-концом с транспортерами магнитосом суперсемейства MFS (TC# 2.A.1) и с переносчиками электронов семейства DsbD (TC# 5.A.1) соответственно.
Гомологи YedZ обнаружены у животных, где один из них включает человеческий антиген плазматической мембраны эпителия 6 TMS, который экспрессируется на высоком уровне в клетках рака простаты. [3] [4] Еще более отдаленные гомологи могут включать трансмембранный домен в членах семейства цитохрома b 558 (CytB) gp91 phox NADPH оксидазы (TC #5.B.2). Гем-содержащие трансмембранные домены железоредуктазы (FRD) обнаружены как в бактериальных, так и в эукариотических белках, включая железоредуктазы (FRE) и NADPH оксидазы (NOX). [2] Бактерии содержат белки FRD, состоящие только из домена железоредуктазы, такие как YedZ и короткие белки FRE. Полноразмерные ферменты FRE и NOX в основном встречаются у эукариот и обладают доменом дегидрогеназы, что позволяет им катализировать перенос электронов от цитозольного НАДФН к внеклеточным ионам металлов (FRE) или кислороду (NOX). У метазоа есть белки STEAP, связанные с YedZ. Филогенетический анализ показывает, что ферменты FRE появились на ранней стадии эволюции, за которым последовал переход к ферментам NOX, содержащим EF-руку (подобным NOX5 и DUOX). Ферменты NOX отличаются от ферментов FRE мотивом из четырех аминокислот, охватывающим трансмембранный домен 3 (TM3) до TM4, а белки YedZ/STEAP идентифицируются по замене первого канонического гем-охватывающего гистидина на высококонсервативный аргинин. [5]
Шести-трансмембранный эпителиальный антиген простаты 3 (Steap3) является основной железоредуктазой в развивающихся эритроцитах. Белки семейства Steap определяются общим трансмембранным доменом, который в Steap3, как было показано, функционирует как трансмембранный электронный челнок, перемещая цитоплазматические электроны, полученные из НАДФН, через липидный бислой к внеклеточной поверхности, где они используются для восстановления Fe 3+ до Fe 2+ и потенциально Cu 2+ до Cu 1+ . [6] Высокоаффинные сайты связывания FAD и железа, а также один сайт связывания гема b-типа присутствуют в трансмембранном домене Steap3. Steap3 функционирует как гомодимер и использует внутрисубъединичный путь переноса электронов через одиночный фрагмент гема, а не межсубъединичный путь электронов через потенциальный димер с обменом доменами. [6] Мотивы последовательности в трансмембранном домене, которые связаны с FAD и участками связывания металлов, присутствуют не только в Steap2 и Steap4, но также и в Steap1, в котором отсутствует N-концевой оксидоредуктазный домен, что позволяет предположить, что Steap1 обладает скрытой оксидоредуктазной активностью.
На момент редактирования эта статья использует контент из "5.B.7. The YedZ (YedZ) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.