Список программного обеспечения для здравоохранения с открытым исходным кодом

Ниже приведен список известных программных пакетов и приложений, лицензированных по лицензии с открытым исходным кодом или находящихся в общественном достоянии для использования в сфере здравоохранения .

Общественное здравоохранение и бионадзор

• Epi Info — общедоступное статистическое программное обеспечение для эпидемиологии, разработанное Центрами по контролю и профилактике заболеваний . ^[1]
• Spatiotemporal Epidemiological Modeler — это инструмент, изначально разработанный в IBM Research для моделирования и визуализации распространения инфекционных заболеваний. Он поддерживается Eclipse Foundation и доступен на условиях Eclipse Public License . ^{[2] [3]}

Электронные записи и управление медицинской практикой

Управление системой здравоохранения

• iHRIS — это интегрированная информационная система по кадрам, разработанная IntraHealth International в рамках финансируемого USAID проекта CapacityPlus и развернутая в более чем 20 странах мира. ^[27] iHRIS распространяется по лицензии GNU GPL . ^[28]
• DHIS — это информационная система управления здравоохранением округа и хранилище данных. DHIS2 выпущена под лицензией BSD . ^[29]
• HRHIS — это информационная система по кадрам в здравоохранении, разработанная факультетом информационных и коммуникационных технологий Университета Дар-эс-Салама , кафедрой компьютерных наук и инженерии, для Министерства здравоохранения и социального обеспечения (Танзания) и финансируемая Японским агентством международного сотрудничества ( JICA ). ^{[ необходима ссылка ]}

Управление заболеванием

• Breathing Games — это серия научно обоснованных, совместно созданных игр для профилактики, диагностики и лечения хронических респираторных заболеваний. Они выпускаются по лицензии Peer Production. ^[30]
• Nightscout — это набор программных инструментов, включая мобильные клиенты, для самостоятельного облачного непрерывного мониторинга уровня глюкозы «…в информационных и образовательных целях». ^[31] Отдельные компоненты доступны по различным лицензиям с открытым исходным кодом, включая GNU GPL , ^[32] GNU AGPL , ^[33] MIT License , ^[34] и BSD licenses . ^[35]

• Tidepool создает инструменты с открытым исходным кодом, помогающие людям лучше справляться с диабетом. Они получили одобрение FDA на свое приложение для дозирования инсулина Loop. ^{[36] [37]}

Визуализация/изображение

• CamBA — это набор конвейеров нейровизуализации , распространяемый по лицензии GNU GPL . ^[38]
• Drishti — пакет объемной визуализации для просмотра данных компьютерной томографии. Возможность импорта стеков изображений DICOM. Доступен по лицензии MIT . ^[39]
• Endrov Просмотрщик и редактор изображений и данных. Доступен по лицензии BSD . ^[40]
• GIMIAS — это среда, ориентированная на рабочий процесс, сфокусированная на биомедицинских вычислениях и моделировании изображений. Она доступна по лицензии в стиле BSD. ^[41]
• Ginkgo CADx Кроссплатформенный просмотрщик и дикомизатор DICOM с открытым исходным кодом. Доступен под лицензией GNU LGPL . ^[42]
• Набор инструментов Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) v4.0+ выпущен под лицензией Apache . ^[43]
• InVesalius — программное обеспечение для реконструкции 3D-визуализации медицинских изображений. Доступно под лицензией GNU GPL . ^[44]
• ITK-SNAP Интерактивное программное обеспечение для навигации по 3D-изображениям, аннотации и автоматической сегментации. Доступно под лицензией GNU GPL . ^{[45] [46]}
• Orthanc – легкий, RESTful DICOM-сервер для медицинской визуализации. Доступен под лицензией GNU GPLv3 . ^[47]
• ParaView — инструмент масштабной визуализации. Доступен под лицензией BSD . ^[48]
• 3DSlicer Платформа для визуализации медицинских изображений и разработки алгоритмов. Поддержка DICOM, сегментация и регистрация, обработка диффузионной МРТ и поддержка хирургии с визуальным контролем. Доступно по лицензии в стиле BSD. ^[49]
• Voreen — механизм визуализации объёма — библиотека для визуального исследования объёмных наборов данных. Поддерживается DICOM, Voreen используется в медицинской визуализации, а также для визуализации данных электронной микроскопии . Доступен под лицензией GNU GPL . ^[50]
• VTK — это набор инструментов визуализации, доступный по лицензии BSD . ^[51]
• Studierfenster (StudierFenster) — это бесплатная, некоммерческая клиент-серверная онлайн-платформа обработки медицинских изображений (MIP) с открытой научной платформой. ^[52]
• Медицинская открытая сеть для искусственного интеллекта — это фреймворк для глубокого обучения в области медицинской визуализации, который имеет открытый исходный код и доступен по лицензии Apache и поддерживается сообществом. ^[53]

Медицинские информационные системы

• Caisis — это веб-система информации для хранения и анализа данных пациентов с раком, призванная сократить разрыв между клиникой и исследованиями. Она доступна под лицензией GNU GPL . ^[54]
• cTAKES ( «Программное обеспечение для извлечения знаний клинического анализа текста» ) — это система обработки естественного языка для извлечения информации из электронных медицинских записей клинических свободных текстов, проект Apache верхнего уровня (TLP) с 2013 года, разработанный клиникой Майо и другими. Он доступен по лицензии Apache . ^[55]

Исследовать

• Galaxy — это веб-платформа для интенсивной обработки данных в области биологии с использованием географически распределенных суперкомпьютеров. ^[56]
• LabKey Server — это расширяемая платформа для интеграции, анализа и обмена всеми типами данных биомедицинских исследований. Она обеспечивает безопасный веб-доступ к данным исследований и включает настраиваемый конвейер обработки данных . Она распространяется по лицензии Apache . ^[57]

Мобильные устройства[58]

• OpenAPS — это набор инструментов разработки и документации для поддержки самостоятельной реализации искусственной поджелудочной железы для людей с диабетом 1 типа . Обычные настройки включают интерфейс CGM , инсулиновых помп и устройств Raspberry Pi . Он выпущен под лицензией MIT , но совместимые медицинские устройства являются собственностью компании. ^[59]
• Ushahidi позволяет людям отправлять информацию о кризисе с помощью текстовых сообщений с помощью мобильного телефона , электронной почты или веб-формы. Отображает информацию в виде карты. Он выпущен под лицензией GNU Affero General Public License , но некоторые библиотеки используют другие лицензии. ^[60]

Готовые дистрибутивы

• БиоЛинукс
• Debian-Med — это чистая смесь Debian для использования в медицинских и биомедицинских учреждениях. ^[61]
• Ubuntu-Med

Взаимодействие[62]

• Mirth — это кроссплатформенный интерфейсный движок HL7 с открытым исходным кодом , который позволяет осуществлять двунаправленную отправку сообщений HL7 между системами и приложениями через несколько транспортных средств. Он доступен по лицензии Mozilla Public License . ^[63]

Технические характеристики

• Документ о непрерывности ухода
• Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) — это спецификация взаимодействия Health Level 7 , которая определяет форматы данных JSON и XML , а также RESTful API . ^{[64] [65]} Она доступна по лицензии CC0 . ^[66]
• openEHR — это открытая стандартная спецификация в области медицинской информатики, описывающая управление и хранение, извлечение и обмен данными о здоровье в электронных медицинских картах (EHR) в соответствии с двухуровневой парадигмой моделирования. Базовая спецификация OpenEHR доступна по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported. ^[67]

Смотрите также

• Портал бесплатного и открытого программного обеспечения

• Электронная медицинская карта
• электронное здравоохранение
• Язык выражений Гелло
• Информатика в здравоохранении
• Больничные информационные системы
• Список бесплатного программного обеспечения для здравоохранения
• Список программного обеспечения биомедицинской кибернетики
• Список программного обеспечения с открытым исходным кодом для биоинформатики
• Список оборудования для здравоохранения с открытым исходным кодом
• мобильное здравоохранение

Ссылки

1. "Epi Info". CDC . 13 сентября 2016 г.
2. "Загрузить STEM". Eclipse . 22 июня 2017 г.
3. "Соглашение об использовании программного обеспечения Eclipse Foundation". Eclipse . 9 апреля 2014 г.
4. "clearhealth/LICENSE". GitHub . 30 января 2013 г.
5. "clearhealth/clearhealth". GitHub . Получено 30 июня 2017 .
6. "ERPNext Healthcare/LICENSE". GitHub . 29 января 2016 г.
7. "gaiaehr/LICENSE". GitHub . 29 января 2016 г.
8. "Часто задаваемые вопросы Gnumed". Gnumed . 10 октября 2011 г.
9. "GNU Health - Summary". Саванна . Получено 29 июня 2017 г.
10. "Hospital OS". SourceForge . 10 апреля 2013 г.
11. "HOSxP". SourceForge . 17 апреля 2013 г.
12. "À propos" [О проекте]. Medintux (на французском) . Получено 30 июня 2017 г.
13. "dev". Medintux (на французском). 29 июня 2012 г.
14. "Installation". Medintux (на французском) . Получено 10 июля 2017 г.
15. "MedWebTux". Medintux (на французском). 13 июля 2013 г.
16. "Возможности OpenEMR". OpenEMR . 6 мая 2017 г.
17. "Политики разработки". OpenEMR Project Wiki . 17 апреля 2017 г.
18. "Open Source License". Open Dental . Получено 29 июня 2017 г.
19. "Open Hospital". SourceForge . 4 июня 2017 г.
20. "Информация о лицензии OpenMRS". OpenMRS . Получено 29 июня 2017 г. .
21. "Welcome". OSCAR User's Manual . Получено 29 июня 2017 г.
22. "Добро пожаловать в Spinnaker". Spinnaker . Dental IT Ltd . Получено 30 июня 2017 г. .
23. "Spinnaker". Dental IT Ltd. Получено 30 июня 2017 г.
24. "Системы электронных медицинских записей THIRRA". SourceForge . 31 января 2017 г.
25. "Распределения VistA". WorldVistA . Получено 1 ноября 2021 г. .
26. "Лицензирование". ICTedge . Архивировано из оригинала 10 сентября 2014 года.
27. "О iHRIS". iHRIS . Получено 3 июля 2017 г. .
28. "Часто задаваемые вопросы". iHRIS . Получено 30 июня 2017 г. .
29. "Обзор DHIS 2". DHIS2 . Получено 30 июня 2017 г. .
30. "Get Involved". Дыхательные игры . 17 декабря 2016 г.
31. "The Nightscout Project" . Получено 3 июля 2017 г.
32. "android-uploader/LICENSE". GitHub . 27 сентября 2014 г.
    "lasso/LICENSE". GitHub . 2 июля 2015 г.
    "chrome-uploader/LICENSE.md". GitHub . 24 ноября 2014 г.
    "windows-phone-app/LICENSE". GitHub . 29 ноября 2014 г.
33. "cgm-remote-monitor/LICENSE". GitHub . 25 сентября 2014 г.
    "process-controls/LICENSE". GitHub . 11 января 2015 г.
34. "nightscout-apple-watch/LICENSE". GitHub . 23 июня 2015 г.
35. "fda-presubmission/LICENSE". GitHub . 24 июня 2014 г.
    "cgm-pebble/LICENSE". GitHub . 22 февраля 2014 г.
36. "tidepool-org/Loop: Шаблон приложения для автоматизированной доставки инсулина для iOS, созданный на основе LoopKit". GitHub . 8 декабря 2023 г.
37. «Tidepool Loop получил разрешение FDA!». Tidepool . 4 января 2023 г.
38. "CamBA: Tool/Resource Info". NITRC . Neuroimaging Informatics Tools and Resources Clearinghouse . Получено 3 июля 2017 г.
39. "дришти/license.md". Гитхаб . 1 февраля 2016 г.
40. "Эндров". SourceForge . 3 января 2016 г.
41. "Лицензия". GIMIAS . Получено 30 июня 2017 .
42. "Ginkgo CADx" . Получено 30 июня 2017 г. .
43. "Авторское право и лицензия". ITK . Kitware.
44. "invesalius3/LICENSE.txt". GitHub . 10 июня 2009 г.
45. "ITK-SNAP". NITRC . Neuroimaging Informatics Tools and Resources Clearinghouse . Получено 30 июня 2017 г.
46. «Лицензия». МИТК . 1 декабря 2014 г.
47. "Download". Orthanc . Получено 30 июня 2017 .
48. "ParaView License". ParaView . Получено 30 июня 2017 .
49. «Лицензия». СлайсерВики . 24 ноября 2016 г.
50. "About Voreen". Voreen . Получено 30 июня 2017 .
51. "Лицензия". VTK . Получено 30 июня 2017 .
52. "Лицензия". StudierFenster . Получено 5 октября 2020 г. .
53. Кардосо, М. Хорхе; Ли, Вэньци; Браун, Ричард (2022-10-04). «MONAI: фреймворк с открытым исходным кодом для глубокого обучения в здравоохранении». стр. 1–25. arXiv : 2211.02701 [cs.LG].
54. "Часто задаваемые вопросы". Caisis . BioDigital . Получено 30 июня 2017 г. .
55. "История". cTAKES . Apache Software Foundation . Получено 30 июня 2017 г. .
56. "Авторские права и лицензии". Galaxy Wiki . 14 мая 2015 г.
57. "FAQ - Часто задаваемые вопросы". Поддержка LabKey . Получено 30 июня 2017 г.
58. "глюкозио-андроид/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 19 августа 2015 г.
    «глюкозио-ios/ЛИЦЕНЗИЯ». Гитхаб . 19 августа 2015 г.
59. "LICENSE.txt". GitHub . 26 августа 2017 г.
60. "platform/LICENSE.md". GitHub . 18 ноября 2014 г.
61. "Debian Med". Debian . Software in the Public Interest, Inc. 5 июля 2016 г.
62. "LAIKA: EHR Testing Framework". SourceForge . 19 апреля 2013 г.
63. Брауэр, Якоб (14 августа 2013 г.). «Руководство по внесению вклада в исходный код». Mirth Connect .
64. "FHIR Foundation" . Получено 3 июля 2017 г.
65. "Фундаментальный модуль" . ФХИР . HL7. 19 апреля 2017 г.
66. «Лицензия и юридические условия». FHIR . HL7. 19 апреля 2017 г.
67. "спецификации-BASE/LICENSE". GitHub . 29 июля 2015 г.

Дальнейшее чтение

• «Медицинское свободное/свободное и открытое программное обеспечение». Рабочая группа IMIA по открытому исходному коду . Получено 3 июля 2017 г.
• Миллард, Питер С.; Бру, Хуан; Бергер, Кристофер А. (4 июля 2012 г.). «Открытые электронные медицинские записи для использования в условиях ограниченных ресурсов: систематический обзор и анкетирование». BMJ Open . 2 (4): e000690. doi :10.1136/bmjopen-2011-000690. PMC  3391372. PMID  22763661 .