stringtranslate.com

Список программного обеспечения для молекулярного моделирования Монте-Карло

Это список компьютерных программ, использующих методы Монте-Карло для молекулярного моделирования .

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Потребности, Р.Дж.; Таулер, доктор медицины; Драммонд, Северная Дакота; Риос, П. Лопес (20 января 2010 г.). «Континуальные вариационные и диффузионные квантовые расчеты Монте-Карло». J. Phys.: Condens. Иметь значение . 22 : 023201. arXiv : 1002.2127 . дои : 10.1088/0953-8984/22/2/023201.
  2. ^ Шах, Джиндал К.; Марин-Римольди, Элисео; Маллен, Райан Готчи; Кин, Брайан П.; Хан, Сандип; Палух, Эндрю С.; Рай, Нирадж; Романьело, Люсьен Л.; Рош, Томас В.; Йоу, Брайан; Магинн, Эдвард Дж. (15 июля 2017 г.). «Кассандра: пакет Монте-Карло с открытым исходным кодом для молекулярного моделирования». Журнал вычислительной химии . 38 (19): 1727–1739. дои : 10.1002/jcc.24807 . ПМИД  28436594.
  3. ^ Хэтч, Гарольд; Махинский, Натан; Шен, Винсент (1 марта 2018 г.). «FEASST: Набор инструментов для моделирования свободной энергии и расширенного отбора проб». Журнал исследований Национального института стандартов и технологий . 123 : 1–3. дои : 10.6028/jres.123.004 . ПМЦ 7339717 . ПМИД  34877133. 
  4. ^ Неджахи, Юнес; Соруш Бархаги, Мохаммед; Мик, Джейсон; Джекман, Брок; Рушайдат, Камель; Ли, Юаньчжэ; Швиберт, Лорен; Потофф, Джеффри (28 ноября 2018 г.). «GOMC: метод Монте-Карло, оптимизированный для графического процессора, для моделирования фазового равновесия и физических свойств сложных жидкостей». Программное обеспечениеX . 9 : 20–27. дои : 10.1016/j.softx.2018.11.005 .
  5. ^ Гласс, Колин В.; Райзер, Штеффен; Руткай, Габор; Дюблен, Стефан; Кестер, Андреас; Гевара-Каррион, Габриэла; Вафай, амер; Хорш, Мартин; Бернройтер, Мартин; Виндманн, Торстен; Хассе, Ганс (декабрь 2014 г.). «ms2: инструмент молекулярного моделирования термодинамических свойств, выпуск новой версии». Компьютерная физика. Коммуникации . 185 (12): 3302–3306. arXiv : 1507.07548 . Бибкод : 2014CoPhC.185.3302G. дои : 10.1016/j.cpc.2014.07.012. ISSN  0010-4655. S2CID  31816838.
  6. ^ Доблен, Стефан; Экль, Бернхард; Столл, Юрген; Лищук Сергей В.; Гевара-Каррион, Габриэла; Гласс, Колин В.; Меркер, Торстен; Бернройтер, Мартин; Хассе, Ганс; Врабец, Ядран (ноябрь 2011 г.). «ms2: инструмент молекулярного моделирования термодинамических свойств». Компьютерная физика. Коммуникации . 182 (11): 2350–2367. Бибкод : 2011CoPhC.182.2350D. дои : 10.1016/j.cpc.2011.04.026. ISSN  0010-4655.
  7. ^ Фингерхат, Робин; Гевара-Каррион, Габриэла; Нитцке, Изабель; Шарич, Денис; Маркс, Джошуа; Лангенбах, Кай; Прокопьев Сергей; Целны, Давид; Бернройтер, Мартин; Стефан, Саймон; Конс, Максимилиан (май 2021 г.). «ms2: инструмент молекулярного моделирования термодинамических свойств, версия 4.0». Компьютерная физика. Коммуникации . 262 : 107860. Бибкод : 2021CoPhC.26207860F. дои : 10.1016/j.cpc.2021.107860. ISSN  0010-4655. S2CID  232283889.
  8. ^ Руткай, Габор; Кестер, Андреас; Гевара-Каррион, Габриэла; Янзен, Татьяна; Шаппалс, Майкл; Гласс, Колин В.; Бернройтер, Мартин; Вафай, амер; Стефан, Саймон; Конс, Максимилиан; Райзер, Штеффен (декабрь 2017 г.). «ms2: инструмент молекулярного моделирования термодинамических свойств, версия 3.0». Компьютерная физика. Коммуникации . 221 : 343–351. Бибкод : 2017CoPhC.221..343R. дои : 10.1016/j.cpc.2017.07.025. ISSN  0010-4655.
  9. ^ Дуббельдам, Дэвид; Калеро, София ; Эллис, Дональд Э.; Снурр, Рэндалл К. (26 февраля 2015 г.). «RASPA: программное обеспечение для молекулярного моделирования адсорбции и диффузии в гибких нанопористых материалах». Молекулярное моделирование . 42 (2): 81–101. дои : 10.1080/08927022.2015.1010082. ISSN  0892-7022. S2CID  53077055. Викиданные  Q60395799.
  10. ^ Ким, Дж.; и другие. (QMCPACK) (27 марта 2018 г.). «QMCPACK: пакет ab initio Quantum Monte Carlo с открытым исходным кодом для изучения электронной структуры атомов, молекул и твердых тел». Физический журнал: конденсированное вещество . 30 (19): 195901. arXiv : 1802.06922 . Бибкод : 2018JPCM...30s5901K. дои : 10.1088/1361-648X/aab9c3. PMID  29582782. S2CID  4913347.
  11. ^ Топпер, Роберт К.; Топпер, Стивен Л.; Ли, Санджун (21 ноября 2022 г.), Пэриш, Кэрол А.; Хопкинс, Тодд А. (ред.), «TransRot: портативный пакет программного обеспечения для имитации отжига, оптимизация геометрии атомных и молекулярных кластеров методом Монте-Карло», серия симпозиумов ACS , Вашингтон, округ Колумбия: Американское химическое общество, том. 1428, стр. 19–38, doi : 10.1021/bk-2022-1428.ch002, ISBN 978-0-8412-9743-2
  12. ^ Мартин, Маркус Г.; и другие. (Тови) (16 сентября 2013 г.). «MCCCS Towhee: инструмент для молекулярного моделирования Монте-Карло». Молекулярное моделирование . 39 (14–15): 1212–1222. дои : 10.1080/08927022.2013.828208. S2CID  97160184.