Takifugu rubripes , широко известный как японский иглобрюх , японская рыба-собака , тигровый иглобрюх или торафугу ( яп .虎河豚), — рыба-собака из рода Takifugu . Он отличается очень маленьким геномом , который был полностью секвенирован из-за его использования в качестве модельного вида и широко используется в качестве эталона в геномике. [3]
Вид часто упоминается в литературе по геномике как Fugu rubripes . Род Fugu является синонимом в настоящее время предпочитаемого Takifugu . [4] Takifugu по-японски означает «фугу», а rubripes происходит от латинских ruber и pēs , что означает «красная лапка». [ требуется ссылка ]
Вид известен из Японского моря , Восточно-Китайского моря и Желтого моря на север до южного Сахалина , на глубине 10–135 м (33–443 фута). Это демерсальный вид. Нерест происходит в эстуариях ; молодь рыбы может переносить широкий диапазон солености и остается в устьях рек и лагунах, созревая в течение одного года, прежде чем мигрировать на постоянное жительство в открытый океан. [1]
Особенностью этого вида является то, что у него очень маленький геном , который используется в качестве «эталона» для идентификации генов и других элементов в геномах человека и других позвоночных. Геном был опубликован в 2002 году Международным консорциумом по геному фугу с помощью полногеномного секвенирования. После инициирования в 1989 году это был первый геном позвоночного после генома человека , который был сделан общедоступным. [5] Он остается одним из самых маленьких известных геномов позвоночных; его число пар оснований составляет ~6%, а число ранее известных генов, кодирующих белок, составляет ~13% от числа генома человека, хотя число хромосом (22) сопоставимо с числом хромосом человека (23). Это делает его особенно полезным для сравнительных исследований. Текущие оценки показывают в общей сложности 392 376 244 пар оснований , 1 138 известных и 18 093 новых генов , кодирующих белки , и 593 гена РНК . [6]
Один из видов торафугу, 22-seiki fugu (что означает «фугу 22-го века»), был генетически модифицирован путем удаления четырех генов рецепторов лептина , которые контролируют аппетит. Результатом стало повышение аппетита и увеличение веса, в среднем торфугу растет в 1,9 раза быстрее, чем обычный торафугу. Он продается в коммерческих целях как еда. [7] [8]
Как и некоторые другие рыбы-собаки, некоторые органы японской рыбы-собаки содержат тетродотоксин и являются высокотоксичными. Токсин в высокой концентрации содержится в печени и яичниках, в незначительном количестве присутствует в кишечнике и плоти и отсутствует в коже и яичках. [1]
Японский иглобрюх классифицируется МСОП как близкий к уязвимому положению . Это одна из самых ценных коммерческих рыб в Японии, и хотя текущие уловы (101 тонна / год в 2004 году, что ниже пика в 2000 тонн в 1987 году) невелики по сравнению с уловами многих других коммерческих видов, таких как сардины и анчоусы , они, по-видимому, неустойчивы и мешают восстановлению вида после более ранней чрезмерной эксплуатации. Для содействия восстановлению были рекомендованы ограничения на орудия лова (большинство уловов происходит при ярусном лове ) и корректировка сезонов рыболовства для защиты молоди. Вид широко выращивается в аквакультуре . [1]