stringtranslate.com

Термотога

Thermotoga — род термотогота . Члены Thermotoga — это гипертермофильные бактерии , клетки которых обернуты уникальной внешней мембраной, напоминающей оболочку, называемой «тога».

Представители этого типа окрашивают грамотрицательные микроорганизмы, поскольку обладают тонким пептидогликаном между двумя липидными бислоями, хотя оба они своеобразны. [2] Пептидогликан необычен, поскольку поперечная связь представляет собой не только мезо-диаминопимелат, как это происходит у Pseudomonadota , но и D-лизин. [Примечание 1] [3]

Виды являются анаэробами с различной степенью толерантности к кислороду. Они способны восстанавливать элементарную серу (S 0 ) до сероводорода. [2]

Является ли термофилия нововведением линии или наследственной чертой, неясно и не может быть определено.
Геном Thermotoga maritima был секвенирован в 1999 году, в результате чего было выявлено несколько генов архейного происхождения, что, возможно, позволило осуществить его термофильную адаптацию. [4] Содержание CG (цитозин-гуанина) в T. maritima составляет 46,2%; [2] большинство термофилов на самом деле имеют высокое содержание CG; это привело к предположению, что содержание CG может быть несущественным следствием термофилии, а не движущей силой термофилии. [5] [6]

Имя

Статья и глава руководства Берджи были написаны несколькими авторами, в том числе микробиологами Карлом Стеттером и Карлом Везе . [2]

Неолатинское женское имя «термотога» означает «горячая верхняя одежда», являясь сочетанием греческого существительного θέρμη ( терме , тепло) [7] или , точнее, прилагательного θερμός, ή, όν ( термос, е, на , горячий) [8] и латинское существительное женского рода toga (римская верхняя одежда). [2]

Члены и родственники

Точное отношение Thermotogota к другим типам обсуждается ( против бактериальных типов ): несколько исследований показали, что они обладают глубоким ветвлением (в руководстве Берджи оно фактически появилось в «Томе I: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии»). "), [9] в то время как другие обнаружили, что Firmicutes имеют глубокие разветвления, а Thermotogota группируется вдали от основания.

Типовым видом рода является T. maritima , впервые описанный в 1986 году. [2] В то время это был первый описанный вид этого типа. Род Thermotoga теперь включает три официальных вида. [1] Недавно восемь видов были выведены из этого рода, и большинство из них оказались в составе рода Pseudothermotoga Бхандари и Гупта, 2014. Штамм T. subterranea SL1 был обнаружен в глубоком континентальном нефтяном резервуаре с температурой 70 ° C в Восточно-Парижском бассейне, Франция . [10]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) [1] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [11].

Сноски

  1. ^ Все протеиногенные аминокислоты имеют L-конфигурацию; в пептидогликане присутствуют некоторые аминокислоты с D-конфигурацией.
    Лизин синтезируется из мезо-диаминопимелата под действием диаминопимелатдекарбоксилазы.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ abc JP Эзеби. «Термотога». Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.
  2. ^ abcdef Хубер, Р.; Т. А. Лэнгуорси; Х. Кениг; М. Томм; Ч.Р. Везе; УБ Слейтр; КО Стеттер (1986). «Thermotoga maritima sp. nov. представляет новый род уникальных чрезвычайно термофильных эубактерий, растущих до 90°C» (PDF) . Арх. Микробиол . 144 (4): 324–333. дои : 10.1007/BF00409880. S2CID  12709437.
  3. ^ Бонифаций, А.; Паркет, К.; Артур, М.; Менжен-Лекрель, Д.; Бланот, Д. (2009). «Выяснение структуры пептидогликана Thermotoga maritima выявило два новых типа поперечных связей». Журнал биологической химии . 284 (33): 21856–21862. дои : 10.1074/jbc.M109.034363 . ПМЦ 2755910 . ПМИД  19542229. 
  4. ^ Фрейзер, CM; Клейтон, Кентукки; Гилл, РА; Гвинн, СР; Додсон, МЛ; Хафт, Р.Дж.; Хикки, Д.Х.; Петерсон, ЭК; Нельсон, доктор юридических наук; Кетчум, туалет; Макдональд, Калифорния; Аттербек, Л.; Малек, ТР; Линхер, Дж. А.; Гарретт, К.Д.; Стюарт, ММ; Коттон, AM; Пратт, доктор медицины; Филлипс, Миссисипи; Ричардсон, Калифорния; Гейдельберг, Д.; Саттон, Дж.; Флейшманн, Г.Г.; Эйзен, РД; Уайт, Дж.А.; Зальцберг, О.; Смит, СЛ; Вентер, ХО; Фрейзер, Дж. К. (1999). «Доказательства латерального переноса генов между архей и бактериями из последовательности генома Thermotoga maritima». Природа . 399 (6734): 323–329. Бибкод : 1999Natur.399..323N. дои : 10.1038/20601. ПМИД  10360571.
  5. ^ Пасамонтес, А.; Гарсия-Вальве, С. (2006). «Использование многофакторного метода для анализа аминокислотного состава консервативной группы ортологичных белков у прокариот». БМК Биоинформатика . 7 : 257. дои : 10.1186/1471-2105-7-257 . ПМК 1489954 . ПМИД  16709240. 
  6. ^ Пуигбо, П.; Пасамонтес, А.; Гарсия-Вальве, С. (2008). «Получение и потеря термофильной адаптации у прокариот». Тенденции в генетике . 24 (1): 10–14. дои :10.1016/j.tig.2007.10.005. ПМИД  18054113.
  7. ^ θέρμη. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  8. ^ θερμός. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  9. ^ Бун, Дэвид Р.; Кастенхольц, Ричард В. (18 мая 2001 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр. 721. ISBN. 978-0-387-98771-2. Британская библиотека №. GBA561951.
  10. ^ Ли Х, Ян СЗ, Му БЗ, Ронг ЗФ, Чжан Дж (2007). «Молекулярно-филогенетическое разнообразие микробного сообщества, связанного с высокотемпературным нефтяным резервуаром на морском нефтяном месторождении». ФЭМС Микробиол Экол . 60 (1): 74–84. дои : 10.1111/j.1574-6941.2006.00266.x . ПМИД  17286581.
  11. ^ Сэйерс; и другие. «Термотога». База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.
  12. ^ "ЛТП" . Проверено 23 февраля 2022 г.
  13. ^ "Дерево LTP_all в формате Ньюика" . Проверено 23 февраля 2022 г.
  14. ^ «Примечания к выпуску LTP_01_2022» (PDF) . Проверено 23 февраля 2022 г.
  15. ^ "Выпуск GTDB 07-RS207" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
  16. ^ "bac120_r207.sp_labels". База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
  17. ^ «История таксона». База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.