Фермент
Белок 1, родственный тирозиназе , также известный как TYRP1 , представляет собой межмембранный фермент , который у людей кодируется геном TYRP1 . [ 5] [6]
Функция
Tyrp1 — это меланоцит -специфический генный продукт, участвующий в синтезе меланина в меланосомах. [7] Большинство Tyrp1 обладают оксидазной активностью 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты (меланогенного промежуточного продукта). [8] Каталитическая функция Tyrp1 в человеческих меланоцитах менее ясна. Tyrp1 участвует в стабилизации белка тирозиназы и модулировании его каталитической активности. [7] Tyrp1 также участвует в поддержании структуры меланосом и влияет на пролиферацию меланоцитов и гибель меланоцитов. [9] Меланоциты происходят из нервного гребня и мигрируют в лежащую выше эпидермальную эктодерму развивающегося организма, которая формирует кожу и волосы. [10] Таким образом, Tyrp1 влияет на экспрессию меланина, особенно в коже и волосах организма.
Ген Tyrp1 также имеет некодирующую функцию, которая косвенно способствует пролиферации клеток опухоли меланомы, особенно при высокой экспрессии в клетке. [11] мРНК Tyrp1 взаимодействует с miR-16 и влияет на его способность подавлять гены, участвующие в образовании клеток меланомы. [11]
Клиническое значение
Мутации в гене Tyrp1 у мышей связаны с коричневой шерстью , а в гене TYRP1 у человека — с окулокутантным альбинизмом типа 3 (OCA3). [9] Аллель TYRP1, распространенный у жителей Соломоновых Островов, приводит к светлым волосам. Хотя фенотип похож на североевропейские светлые волосы, этот аллель не встречается у европейцев. [12] [13] Более позднее исследование, Ju et al. 2020, показало, что аллель TYRP1 был выбран в европейской популяции. [14]
Исследование Нортона и соавторов 2016 года показало, что TYRP1 не связан со светлым цветом волос у меланезийцев, поскольку многие популяции в Океании не имеют аллелей TYRP1, но все равно демонстрируют светлую пигментацию; исследование показывает, что дополнительные неизвестные аллели способствуют фенотипу светлой пигментации у меланезийцев. [15]
Изменения гена Tyrp1 отвечают за некоторые из различных фенотипов внешнего вида кожи и шерсти у разных животных. У далматинцев черный цвет пятен по сравнению с «печеночным» обусловлен генетической изменчивостью гена TYRP1. [16] Определенная делеция в гене Tyrp1 домашней китайско-тибетской свиньи приводит к «коричневой окраске» кожи и шерсти свиньи в отличие от «черного» фенотипа дикого типа. [17] У карпа цвета Оуцзян мутации гена Tyrp1 повлияли на выражение «серого» или «коричневого» фенотипического цвета чешуи. [18]
Повышенные уровни экспрессии гена Tyrp1 также связаны с неблагоприятным исходом для пациентов, страдающих меланомой. [11] Роль Tyrp1 в прогрессировании меланомы была определена путем сравнения линий клеток «нокаута», которые имеют неактивный Tyrp1, с клетками с нормальным и высокоэкспрессированным Tyrp1. [11] Такие исследования дают представление о возможном клиническом использовании и лечении меланомы посредством регуляции экспрессии Tyrp1 в клетках. [11]
Регулирование
Экспрессия TYRP1 регулируется фактором транскрипции, ассоциированным с микрофтальмией (MITF). [19] [20]
Взаимодействия
Было показано, что TYRP1 взаимодействует с GIPC1 . [21]
Смотрите также
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107165 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000005994 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ EntrezGene 7306
- ^ Box NF, Wyeth JR, Mayne CJ, O'Gorman LE, Martin NG, Sturm RA (январь 1998 г.). «Полное исследование последовательности и полиморфизма гена TYRP1 человека, кодирующего белок 1, связанный с тирозиназой». Mammalian Genome . 9 (1): 50–53. doi :10.1007/s003359900678. PMID 9434945. S2CID 10020827.
- ^ ab Kobayashi T, Imokawa G, Bennett DC, Hearing VJ (ноябрь 1998 г.). «Стабилизация тирозиназы с помощью Tyrp1 (белка коричневого локуса)». Журнал биологической химии . 273 (48): 31801–31805. doi : 10.1074/jbc.273.48.31801 . PMID 9822646.
- ^ Хименес-Сервантес C, Солано F, Кобаяши T, Урабе K, Хеаринг VJ, Лозано JA, Гарсия-Боррон JC (июль 1994). «Новая ферментативная функция в меланогенном пути. Активность оксидазы 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты тирозиназного белка-1 (TRP1)». Журнал биологической химии . 269 (27): 17993–18000. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32408-0 . PMID 8027058.
- ^ ab Sarangarajan R, Boissy RE (декабрь 2001 г.). "Tyrp1 и окулокутанный альбинизм типа 3". Pigment Cell Research . 14 (6): 437–444. doi : 10.1034/j.1600-0749.2001.140603.x . PMID 11775055.
- ^ Mayer TC (сентябрь 1973 г.). «Миграционный путь клеток нервного гребня в кожу эмбрионов мышей». Developmental Biology . 34 (1): 39–46. doi :10.1016/0012-1606(73)90337-0. PMID 4595498.
- ^ abcde Жило Д., Миго М., Башло Л., Журне Ф., Рожье А., Донну-Фурне Э. и др. (ноябрь 2017 г.). «Некодирующая функция мРНК TYRP1 способствует росту меланомы» (PDF) . Природная клеточная биология . 19 (11): 1348–1357. дои : 10.1038/ncb3623. PMID 28991221. S2CID 23539385.
- ^ Bhanoo SN (3 мая 2012 г.). «Еще одна генетическая причуда Соломоновых островов: светлые волосы». The New York Times . Получено 3 мая 2012 г.
- ^ Kenny EE, Timpson NJ, Sikora M, Yee MC, Moreno-Estrada A, Eng C и др. (май 2012 г.). «Меланезийские светлые волосы вызваны изменением аминокислоты в TYRP1». Science . 336 (6081): 554. Bibcode :2012Sci...336..554K. doi :10.1126/science.1217849. PMC 3481182 . PMID 22556244.
- ^ Ju, Dan; Mathieson, Iain (21 декабря 2020 г.). «Эволюция вариаций, связанных с пигментацией кожи, в Западной Евразии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 118 (1). doi : 10.1073/pnas.2009227118 . PMC 7817156. PMID 33443182 .
- ^ Norton HL, Hanna M, Werren E, Friedlaender J (май 2016 г.). «ОНП rs387907171 в TYRP1 не связан с цветом светлых волос на острове Бугенвиль». American Journal of Human Biology . 28 (3): 431–435. doi :10.1002/ajhb.22795. PMID 26450459. S2CID 13727757.
- ^ Cargill EJ, Famula TR, Schnabel RD, Strain GM, Murphy KE (июль 2005 г.). «Цвет пятен далматина: доказательства сцепления в поддержку гена TYRP1». BMC Veterinary Research . 1 (1): 1. doi : 10.1186/1746-6148-1-1 . PMC 1192828. PMID 16045797 .
- ^ Ren J, Mao H, Zhang Z, Xiao S, Ding N, Huang L (май 2011 г.). «Делеция 6 пар оснований в гене TYRP1 вызывает фенотип коричневой окраски у китайских местных свиней». Наследственность . 106 (5): 862–868. doi :10.1038/hdy.2010.129. PMC 3186233. PMID 20978532 .
- ^ Chen H, Wang J, Du J, Mandal BK, Si Z, Xu X и др. (август 2021 г.). «Анализ недавно дублированных генов TYRP1 и их влияние на образование черных пятен у карпа цвета Оуцзян (Cyprinus carpio var. color)». Animal Genetics . 52 (4): 451–460. doi :10.1111/age.13071. PMID 33939849. S2CID 233720032.
- ^ Fang D, Tsuji Y, Setaluri V (июль 2002 г.). «Избирательная регуляция гена семейства тирозиназ TYRP1 путем ингибирования активности фактора транскрипции меланоцитов, MITF». Nucleic Acids Research . 30 (14): 3096–3106. doi :10.1093/nar/gkf424. PMC 135745. PMID 12136092 .
- ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO и др. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Pigment Cell & Melanoma Research . 21 (6): 665–676. doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971.
- ^ Liu TF, Kandala G, Setaluri V (сентябрь 2001 г.). «PDZ-доменный белок GIPC взаимодействует с цитоплазматическим хвостом меланосомального мембранного белка gp75 (тирозиназно-связанный белок-1)». Журнал биологической химии . 276 (38): 35768–35777. doi : 10.1074/jbc.M103585200 . PMID 11441007.
Дальнейшее чтение
- Sarangarajan R, Boissy RE (декабрь 2001 г.). «Tyrp1 и окулокутанный альбинизм типа 3». Pigment Cell Research . 14 (6): 437–444. doi : 10.1034/j.1600-0749.2001.140603.x . PMID 11775055.
- Lowings P, Yavuzer U, Goding CR (август 1992 г.). «Положительные и отрицательные элементы регулируют меланоцит-специфический промотор». Молекулярная и клеточная биология . 12 (8): 3653–3662. doi :10.1128/MCB.12.8.3653. PMC 364632. PMID 1321344 .
- Shibata K, Takeda K, Tomita Y, Tagami H, Shibahara S (апрель 1992 г.). «Нижележащая область гена белка, связанного с тирозиназой человека, усиливает его промоторную активность». Biochemical and Biophysical Research Communications . 184 (2): 568–575. doi :10.1016/0006-291X(92)90627-W. PMID 1575733.
- Murty VV, Bouchard B, Mathew S, Vijayasaradhi S, Houghton AN (май 1992 г.). «Присвоение локуса TYRP (коричневого) человека участку хромосомы 9p23 методом нерадиоактивной гибридизации in situ». Genomics . 13 (1): 227–229. doi :10.1016/0888-7543(92)90228-K. PMID 1577487.
- Colman MA, Shibahara S, Kwon B, Jenkins T, Ramsay M (февраль 1991 г.). "Двухаллельный XbaI RFLP в локусе каталазы 2". Nucleic Acids Research . 19 (4): 960. doi :10.1093/nar/19.4.960-a. PMC 333744. PMID 1673236 .
- Halaban R, Moellmann G (июнь 1990 г.). «Гены пигментации блокусов мыши и человека кодируют гликопротеин (gp75) с каталазной активностью». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4809–4813. Bibcode : 1990PNAS...87.4809H. doi : 10.1073 /pnas.87.12.4809 . PMC 54207. PMID 1693779.
- Abbott C, Jackson IJ, Carritt B, Povey S (октябрь 1991 г.). «Человеческий гомолог гена brown мыши отображается на коротком плече хромосомы 9 и расширяет известную область гомологии с хромосомой 4 мыши». Genomics . 11 (2): 471–473. doi :10.1016/0888-7543(91)90160-G. PMID 1769662.
- Chintamaneni CD, Ramsay M, Colman MA, Fox MF, Pickard RT, Kwon BS (июль 1991 г.). «Картирование гена CAS2 человека, гомолога локуса brown (b) мыши, на хромосоме 9p22-pter человека». Biochemical and Biophysical Research Communications . 178 (1): 227–235. doi :10.1016/0006-291X(91)91803-K. PMID 1906272.
- Urquhart A (октябрь 1991 г.). "Карбоксильный конец человеческого тирозиназоподобного белка (TYRL): более тесная гомология с мышиным белком, чем сообщалось ранее". Nucleic Acids Research . 19 (20): 5803. doi :10.1093/nar/19.20.5803. PMC 329017 . PMID 1945866.
- Cohen T, Muller RM, Tomita Y, Shibahara S (май 1990). "Нуклеотидная последовательность кДНК, кодирующей белок, связанный с тирозиназой человека". Nucleic Acids Research . 18 (9): 2807–2808. doi :10.1093/nar/18.9.2807. PMC 330768. PMID 2111010 .
- Виджаясарадхи С., Бушар Б., Хоутон АН. (апрель 1990 г.). «Меланомный антиген gp75 — человеческий гомолог генного продукта мышиного локуса b (brown)». Журнал экспериментальной медицины . 171 (4): 1375–1380. doi :10.1084/jem.171.4.1375. PMC 2187848. PMID 2324688 .
- Бокс НФ, Штурм РА (декабрь 1994 г.). "Полиморфизм динуклеотидных повторов в локусе TYRP1 человека". Молекулярная генетика человека . 3 (12): 2270. doi :10.1093/hmg/3.12.2270. PMID 7881448.
- Orlow SJ, Zhou BK, Chakraborty AK, Drucker M, Pifko-Hirst S, Pawelek JM (август 1994 г.). «Высокомолекулярные формы тирозиназы и связанные с тирозиназой белки: доказательства меланогенного комплекса». Журнал исследовательской дерматологии . 103 (2): 196–201. doi : 10.1111/1523-1747.ep12392743 . PMID 8040609.
- Sturm RA, O'Sullivan BJ, Box NF, Smith AG, Smit SE, Puttick ER и др. (сентябрь 1995 г.). «Хромосомная структура человеческих локусов TYRP1 и TYRP2 и сравнение семейства генов белков, связанных с тирозиназой». Genomics . 29 (1): 24–34. doi :10.1006/geno.1995.1211. PMID 8530077.
- Boissy RE, Zhao H, Oetting WS, Austin LM, Wildenberg SC, Boissy YL и др. (июнь 1996 г.). «Мутация и отсутствие экспрессии тирозиназо-связанного белка-1 (TRP-1) в меланоцитах у человека с коричневым окулокутантным альбинизмом: новый подтип альбинизма, классифицируемый как «OCA3»». American Journal of Human Genetics . 58 (6): 1145–1156. PMC 1915069 . PMID 8651291.
- Manga P, Kromberg JG, Box NF, Sturm RA, Jenkins T, Ramsay M (ноябрь 1997 г.). «Рыжий окулокутанный альбинизм у южноафриканских чернокожих вызван мутациями в гене TYRP1». American Journal of Human Genetics . 61 (5): 1095–1101. doi :10.1086/301603. PMC 1716031 . PMID 9345097.
- Box NF, Wyeth JR, Mayne CJ, O'Gorman LE, Martin NG, Sturm RA (январь 1998 г.). «Полное исследование последовательности и полиморфизма гена TYRP1 человека, кодирующего белок 1, связанный с тирозиназой». Mammalian Genome . 9 (1): 50–53. doi :10.1007/s003359900678. PMID 9434945. S2CID 10020827.
- Bertolotto C, Buscà R, Abbe P, Bille K, Aberdam E, Ortonne JP, Ballotti R (февраль 1998 г.). «Различные цис-действующие элементы участвуют в регуляции активности промотора TRP1 и TRP2 циклическим AMP: основная роль M-боксов (GTCATGTGCT) и микрофтальмии». Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 694–702. doi : 10.1128 /mcb.18.2.694. PMC 108780. PMID 9447965.
- Abe T, Sato M, Tamai M (декабрь 1998 г.). «Дедифференциация ретинального пигментного эпителия по сравнению с пролиферативными мембранами пролиферативной витреоретинопатии». Current Eye Research . 17 (12): 1103–1109. doi :10.1076/ceyr.17.12.1103.5126. PMID 9872531.
- Commo S, Bernard BA (август 2000 г.). «Оборот субпопуляции меланоцитов во время цикла роста волос у человека: иммуногистохимическое исследование». Pigment Cell Research . 13 (4): 253–259. doi :10.1034/j.1600-0749.2000.130407.x. PMID 10952393.
Внешние ссылки
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P17643 (оксидаза 5,6-дигидроксииндол-2-карбоновой кислоты) на сайте PDBe-KB .