stringtranslate.com

Бактериофаг Мю

Бактериофаг Mu , также известный как фаг mu или бактериофаг mu , является мувирусом (первым в своем роде, который был идентифицирован) семейства Myoviridae , который, как было показано, вызывает генетическую транспозицию . Он имеет особое значение, поскольку его открытие в Escherichia coli Ларри Тейлором было одним из первых наблюдений элементов вставки в геноме. Это открытие открыло мир для исследования транспонируемых элементов и их воздействия на самые разные организмы. В то время как Mu был специально вовлечен в несколько отдельных областей исследований (включая E. coli , кукурузу и ВИЧ ), более широкие последствия транспозиции и вставки преобразили всю область генетики . [1]

Анатомия

Фаг Mu не имеет оболочки , имеет голову и хвост. Голова имеет икосаэдрическую структуру шириной около 54 нм. Шейка имеет форму шишки, а хвост сократимый с базовой пластиной и шестью короткими концевыми волокнами. Геном полностью секвенирован и состоит из 36 717 нуклеотидов , кодирующих 55 белков. [2]

История

Фаг Mu был впервые обнаружен Ларри Тейлором в Калифорнийском университете в Беркли в конце 1950-х годов. Его работа продолжилась в Брукхейвенской национальной лаборатории , где он впервые наблюдал мутагенные свойства Mu; несколько колоний Hfr E. coli , которые были лизогенизированы с Mu, по-видимому, имели тенденцию к выработке новых пищевых маркеров. При дальнейшем исследовании он смог связать наличие этих маркеров с физическим связыванием Mu в определенных локусах . Он сравнил наблюдаемые генетические изменения с «контролирующими элементами» в кукурузе и назвал фаг «Mu» в честь мутации. [3] Однако это было только начало. В течение следующих шестидесяти лет сложность фага была конкретизирована многочисленными исследователями и лабораториями, что привело к гораздо более глубокому пониманию мобильной ДНК и механизмов, лежащих в основе мобильных элементов . [ требуется цитата ]

Основные выводы, связанные с Mu

1972–1975: Ахмад Бухари показывает, что Mu может вставляться случайным образом и в большом количестве по всему бактериальному геному, [4] создавая стабильные вставки. Он также показывает, что возвращение гена к его первоначальной и неповрежденной форме возможно с помощью вырезания Mu. [5]

1979: Джим Шапиро разрабатывает модель транспозиции, вдохновленную Mu, с участием «промежуточного звена Шапиро», в которой и донор, и цель подвергаются двум расщеплениям, а затем донор лигируется в цель, создавая две репликационные вилки и позволяя как транспозицию, так и репликацию. [6]

1983: Киёси Мизуучи разрабатывает протокол для наблюдения за транспозицией in vitro с использованием плазмид mini-Mu [7], что позволяет значительно улучшить понимание химических компонентов транспозиции.

1994–2012: Благодаря общим механизмам вставки Mu выступает в качестве полезного организма для выяснения процесса интеграции ВИЧ , что в конечном итоге привело к созданию ингибиторов интегразы ВИЧ, таких как ралтегравир в 2008 году. [8] Кроме того, Монтано и др. создали кристаллическую структуру транспозосомы бактериофага Mu, [9] что позволило детально изучить процесс амплификации Mu.

Ссылки

  1. ^ Harshey RM (декабрь 2012 г.). «История Mu: как независимый фаг продвинул область вперед». Mob DNA . 3 (1): 21. doi : 10.1186/1759-8753-3-21 . PMC  3562280. PMID  23217166 .
  2. ^ Морган, Г.Дж. и др. (2002), «Последовательность генома бактериофага Mu: анализ и сравнение с Mu-подобными профагами у Haemophilus, Neisseria и Deinococcus», J Mol Biol , 317 (3): 337–359, doi :10.1006/jmbi.2002.5437, PMID  11922669
  3. ^ Тейлор, Остин Л. (1963). «Мутация, вызванная бактериофагом в Escherichia coli». Труды Национальной академии наук . 50 (6): 1043–1051. Bibcode : 1963PNAS...50.1043T. doi : 10.1073/pnas.50.6.1043 . PMC 221271. PMID  14096176 . 
  4. ^ Бухари AI, Зипсер D (1972). «Случайная вставка ДНК Mu-1 в один ген». Nature New Biology . 236 (69): 240–243. doi :10.1038/newbio236240a0.
  5. ^ Бухари AI (1975). «Обратная интеграционная мутаторная фага Mu». Журнал молекулярной биологии . 96 (1): 87–94, IN15–IN18, 95–99. doi :10.1016/0022-2836(75)90183-7. PMID  1099217.
  6. ^ Шапиро JA (1979). «Молекулярная модель транспозиции и репликации бактериофага Mu и других мобильных элементов». Труды Национальной академии наук . 76 (4): 1933–1937. Bibcode : 1979PNAS...76.1933S. doi : 10.1073/pnas.76.4.1933 . PMC 383507. PMID  287033 . 
  7. ^ Киёси Мизуучи (1983). «Транспозиция бактериофага Mu in vitro: биохимический подход к новой реакции репликации». Cell . 35 (3): 785–794. doi :10.1016/0092-8674(83)90111-3. PMID  6317201. S2CID  39999883.
  8. ^ Summa V, Petrocchi A, Bonelli F, Crescenzi B, Donghi M, Ferrara M и др. (сентябрь 2008 г.). «Открытие ралтегравира, мощного селективного перорально биодоступного ингибитора ВИЧ-интегразы для лечения инфекции ВИЧ-СПИД». J. Med. Chem . 51 (18): 5843–55. doi :10.1021/jm800245z. PMID  18763751.
  9. ^ Монтано СП, Пигли ЙЗ, Райс ПА (2012). "4FCY: Кристаллическая структура транспозосомы бактериофага MU". Nature . 491 : 413–417. doi :10.2210/pdb4fcy/pdb.

Внешние ссылки