stringtranslate.com

Трёхтактонный анализ

Анализ трех таксонов (3ia). Модифицировано на основе рисунка 1 из Grand A, Corvez A, Duque Velez LM, Laurin M. 2013. [1]

Трехтактонный анализ (или TTS , трехэлементный анализ , 3ia ) — это кладистический метод филогенетической реконструкции. Представленный Нельсоном и Платником в 1991 году [2] для реконструкции филогении организмов, этот метод также может быть применен к биогеографическим областям . Он пытается реконструировать сложные филогенетические деревья, разбивая проблему на более простые части. Вместо того, чтобы пытаться разрешить отношения всех таксонов X сразу, он рассматривает таксоны по 3 за раз. Относительно легко сгенерировать трехтактонные утверждения (3is); то есть утверждения вида «A и B более тесно связаны друг с другом, чем с C». [3] После того, как каждая группа из трех таксонов рассмотрена, метод строит дерево, которое согласуется с максимально возможным количеством трехэлементных утверждений. [3]

С теоретической точки зрения метод имеет три основные проблемы: (1) эволюция характера априори предполагается необратимой; (2) 3is, которые не являются логически независимыми, рассматриваются так, как если бы они были таковыми; (3) 3is, которые рассматриваются как независимая поддержка для данного дерева, могут быть взаимоисключающими на этом дереве. [4]

Компьютерная программа, реализующая трехтактонный анализ, — LisBeth [5] (для систематических и биогеографических исследований). LisBeth выпущены в свободном доступе. [6] Недавнее исследование на основе моделирования показало, что трехтактонный анализ дает хорошую мощность и промежуточный уровень ошибок между экономией с упорядоченными состояниями и экономией с неупорядоченными состояниями. [1]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Grand, Anaïs; Corvez, Adèle; Duque Velez, Lina Maria; Laurin, Michel (2013). «Филогенетический вывод с использованием дискретных признаков: выполнение упорядоченной и неупорядоченной экономии и трехэлементных утверждений». Biological Journal of the Linnean Society . 110 (4): 914–930. doi : 10.1111/bij.12159 .
  2. ^ Нельсон, Г.; Платник, Н.И. (1991). «Утверждения о трех таксонах: более точное использование экономичности?». Кладистика . 7 (4): 351. doi : 10.1111/j.1096-0031.1991.tb00044.x . S2CID  86270478.
  3. ^ ab Zaragueta-Bagils, R.; Bourdon, E. (2007). «Трехэлементный анализ: иерархическое представление и обработка отсутствующих и неприменимых данных». Comptes Rendus Palevol . 6 (6–7): 527. doi :10.1016/j.crpv.2007.09.013.
  4. ^ De Laet, J.; Smets, E. (1998). «О трехтаксономном подходе к анализу экономии». Cladistics . 14 (4): 363–381. doi : 10.1111/j.1096-0031.1998.tb00344.x . PMID  34929915. S2CID  221583681.
  5. ^ Багилс, RZE; Унг, В.; Гранд, А.С.; Винь-Леббе, Р.Г.; Цао, Нидерланды; Дюкасс, Дж. (2012). «ЛисБет: Новая кладистика для филогенетики и биогеографии». Comptes Рендус Палевол . 11 (8): 563. doi :10.1016/j.crpv.2012.07.002.
  6. ^ "Пакет ЛисБет".