stringtranslate.com

Аморфея

Amorphea [1] — таксономическая супергруппа, включающая базальные Amoebozoa и Obazoa . Последняя содержит Opisthokonta , включающую Fungi , Animals и Choanomonada, или Choanoflagellates . Таксономические связи членов этой клады были первоначально описаны и предложены Томасом Кавальер-Смитом в 2002 году. [2] [4]

Международное общество протистологов, признанный орган по таксономии простейших, рекомендовало в 2012 году изменить термин Unikont на Amorphea, поскольку название «Unikont» основано на предполагаемой синапоморфии , которую авторы ISOP и другие ученые позже отвергли. [1] [5]

Включает амебозои , опистоконты , [6] [7] и Apusomonada. [8]

Таксономические ревизии в этой группе

Томас Кавальер-Смит предложил два новых типа: Sulcozoa , который состоит из подтипа Apusozoa ( Apusomonadida и Breviatea ), и Varisulca , который включает подтипы Diphyllatea , Discocelida, Mantamonadidae , Planomonadida и Rigifilida . [9]

Дальнейшие исследования Кавальер-Смита показали, что Sulcozoa парафилетичны . [10] Apusozoa также, по-видимому, парафилетичны. Varisulca был переопределен, чтобы включить планомонады, Mantamonas и Collodictyon . Был создан новый таксон - Glissodiscea - для планомонад и Mantamonas . Опять же, валидность этой пересмотренной таксономии ждет подтверждения.

Amoebozoa, по-видимому, монофилетичны с двумя основными ветвями: Conosa и Lobosa . Conosa делится на аэробный инфрафилум Semiconosia ( Mycetozoa и Variosea ) и вторично анаэробные Archamoebae . Lobosa полностью состоит из нежгутиковых лобозных амеб и делится на два класса: Discosea , которые имеют уплощенные клетки, и Tubulinea , которые имеют преимущественно трубчатые псевдоподии. [11]

Клад

Группа включает эукариотические клетки, которые, по большей части, имеют один выходящий жгутик , или являются амебами без жгутиков. Униконты включают опистоконты ( животные , грибы и родственные формы) и амебозои . Напротив, другие известные эукариотические группы, которые чаще имеют два выходящих жгутика (хотя есть много исключений), часто называют биконтами . Биконты включают Archaeplastida (растения и родственники) и супергруппу SAR , Cryptista , Haptista , Telonemia и picozoa .


Один из взглядов на великие царства и их стволовые группы. [12] [13] [14] [15] Метамонады трудно классифицировать, возможно, они являются сестринскими по отношению к Дискобе или Малавимонаде [ 15] или являются парафилетической группой, внешней по отношению ко всем другим эукариотам . [16]

Характеристики

Униконты имеют тройное слияние генов, которое отсутствует у биконтов. Три гена, которые слиты вместе у униконтов, но не у бактерий или биконтов, кодируют ферменты для синтеза пиримидиновых нуклеотидов : карбамоилфосфатсинтазу , дигидрооротазу , аспартаткарбамоилтрансферазу . Это должно было включать двойное слияние, редкую пару событий, подтверждающую общее происхождение Opisthokonta и Amoebozoa.

Кавальер-Смит [2] первоначально предположил, что униконты изначально имели один жгутик и одно базальное тельце . Однако это маловероятно, поскольку жгутиконосцы опистоконты, а также некоторые жгутиконосцы амебозоа, включая Breviata , на самом деле имеют два базальных тельца, как у типичных «биконтов» (хотя у большинства униконтов жгутиконосцы есть только одно). Такое парное расположение также можно увидеть в организации центриолей в типичных клетках животных. Несмотря на название группы, общим предком всех «униконтов», вероятно, была клетка с двумя базальными тельцами.

Ссылки

  1. ^ abc Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick RS, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (сентябрь 2012 г.). "Пересмотренная классификация эукариот". J Eukaryot Microbiol . 59 (5): 429–93. doi :10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC  3483872 . PMID  23020233.
  2. ^ abc Cavalier-Smith T (март 2002 г.). «Фаготрофное происхождение эукариот и филогенетическая классификация простейших». Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 2): 297–354. doi :10.1099/00207713-52-2-297. PMID  11931142.
  3. ^ Дерелль, Ромен; Торруэлла, Гифре; Климеш, Владимир; Бринкманн, Хеннер; Ким, Ынсу; Влчек, Честмир; Ланг, Б. Франц; Элиаш, Марек (17 февраля 2015 г.). «Бактериальные белки определяют один эукариотический корень». Труды Национальной академии наук . 112 (7): E693–E699. Бибкод : 2015PNAS..112E.693D. дои : 10.1073/pnas.1420657112 . ПМЦ 4343179 . ПМИД  25646484. 
  4. ^ Кавальер-Смит, Томас (2003). «Филогения протистов и высокоуровневая классификация простейших». Европейский журнал протистологии . 39 (4): 338–348. doi :10.1078/0932-4739-00002.
  5. ^ Роджер А. Дж., Симпсон АГ (2009). «Эволюция: пересмотр корня дерева эукариот». Current Biology . 19 (4): R165–R167. doi : 10.1016/j.cub.2008.12.032 . PMID  19243692. S2CID  13172971.
  6. ^ A Minge M, Silberman JD, Orr RJ, et al. (Ноябрь 2008). «Эволюционное положение breviate amoebae и первичная дивергенция эукариот». Proc. Biol. Sci . 276 (1657): 597–604. doi :10.1098/rspb.2008.1358. PMC 2660946. PMID  19004754 . 
  7. ^ Бурки Ф, Павловски Дж (октябрь 2006 г.). «Монофилия ризарий и мультигенная филогения одноклеточных биконтов». Мол. Биол. Эвол . 23 (10): 1922–30. doi : 10.1093/molbev/msl055. ПМИД  16829542.
  8. ^ Берки, Фабьен; Роджер, Эндрю Дж.; Браун, Мэтью У.; Симпсон, Аластер ГБ (2020-01-01). «Новое дерево эукариот». Тенденции в экологии и эволюции . 35 (1): 43–55. doi : 10.1016/j.tree.2019.08.008 . ISSN  0169-5347. PMID  31606140.
  9. ^ Кавальер-Смит Т. (май 2013 г.). «Ранняя эволюция способов питания эукариот, структурное разнообразие клеток и классификация типов простейших Loukozoa, Sulcozoa и Choanozoa». Eur J Protistol . 49 (2): 115–78. doi :10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID  23085100.
  10. ^ Cavalier-Smith T, Chao EE, Snell EA, Berney C, Fiore-Donno AM, Lewis R (декабрь 2014 г.). «Мультигенная филогения эукариот выявляет вероятных простейших предков опистоконтов (животных, грибов, хоанозойных) и амебозоа». Mol Phylogenet Evol . 81 : 71–85. doi : 10.1016/j.ympev.2014.08.012 . PMID  25152275.
  11. ^ Cavalier-Smith T, Fiore-Donno AM, Chao E, Kudryavtsev A, Berney C, Snell EA, Lewis R (февраль 2015 г.). «Мультигенная филогения разрешает глубокое ветвление амебозоа». Mol Phylogenet Evol . 83 : 293–304. doi : 10.1016/j.ympev.2014.08.011 . PMID  25150787.
  12. ^ Браун М.В., Хейсс А.А., Камикава Р., Инагаки Ю., Ябуки А., Тайс АК, Ширатори Т., Исида К.И., Хашимото Т., Симпсон А., Роджер А. (19 января 2018 г.). «Филогеномика помещает сиротские линии протистанов в новую супергруппу эукариот». Геномная биология и эволюция . 10 (2): 427–433. дои : 10.1093/gbe/evy014. ПМЦ 5793813 . ПМИД  29360967. 
  13. ^ Schön ME, Zlatogursky VV, Singh RP и др. (2021). «Picozoa are archaeplastids without plastid». Nature Communications . 12 (1): 6651. bioRxiv 10.1101/2021.04.14.439778 . doi :10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508 . PMID  34789758. S2CID  233328713.  
  14. ^ Тихоненков Д.В., Михайлов КВ, Гаврилюк Р.М. и др. (декабрь 2022 г.). «Микробные хищники образуют новую супергруппу эукариот». Природа . 612 (7941): 714–719. дои : 10.1038/s41586-022-05511-5. PMID  36477531. S2CID  254436650.
  15. ^ ab Burki F, Roger AJ, Brown MW, Simpson AG (2020). «Новое дерево эукариот». Тенденции в экологии и эволюции . 35 (1). Elsevier BV: 43–55. doi : 10.1016/j.tree.2019.08.008 . ISSN  0169-5347. PMID  31606140. S2CID  204545629.
  16. ^ Аль Джуари, Цезарь; Балдауф, Сандра Л. (28 апреля 2023 г.). «Выкопанный корень для эукариотического дерева жизни». Science Advances . 9 (17): eade4973. Bibcode : 2023SciA....9E4973A. doi : 10.1126/sciadv.ade4973. ISSN  2375-2548. PMC 10146883. PMID 37115919  . 

Внешние ссылки