stringtranslate.com

Майкл Уотерман

Майкл Спенсер Уотерман (родился 28 июня 1942 года) — профессор биологии , математики и компьютерных наук в Университете Южной Калифорнии (USC) , [1] [6] , где он занимает должность ассоциированного профессора биологических наук, математики и компьютерных наук. Ранее [ когда? ] он занимал должности в Лос-Аламосской национальной лаборатории и Университете штата Айдахо .

Образование и ранняя жизнь

Уотерман вырос недалеко от Бэндона, штат Орегон , [7] и получил степень бакалавра по математике в Университете штата Орегон , а затем степень доктора философии по статистике и теории вероятностей в Университете штата Мичиган в 1969 году. [4] [8]

Исследования и карьера

Уотерман является одним из основателей и нынешних лидеров в области вычислительной биологии . Он фокусируется на применении математики, статистики и методов компьютерной науки к различным проблемам молекулярной биологии . Его работа внесла вклад в некоторые из наиболее широко используемых инструментов в этой области. В частности, алгоритм Смита-Уотермана (разработанный совместно с Темплом Ф. Смитом ) является основой для многих программ выравнивания последовательностей . [9] В 1988 году Уотерман и Эрик Ландер опубликовали знаменательную статью, описывающую математическую модель для картирования отпечатков пальцев. [10] Эта работа стала одним из теоретических краеугольных камней для многих более поздних проектов картирования и секвенирования ДНК, особенно проекта «Геном человека» . Статья Идури и Уотермана 1995 года представила сборку последовательностей Эйлера-де Брейна , которая широко используется в проектах секвенирования следующего поколения. [11]

С Павлом А. Певзнером (бывшим научным сотрудником его лаборатории), он начал международную конференцию Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) [12] и является одним из основателей и редакторов журнала Journal of Computational Biology . Уотерман также является автором одного из самых ранних учебников в этой области: Introduction to Computational Biology [13] .

Награды и почести

Вместе с Сайрусом Чотией и Дэвидом Хаусслером Уотерман был удостоен премии Дэна Дэвида 2015 года за вклад в область биоинформатики . [3] Он был удостоен почетной докторской степени от Тель-Авивского университета в 2011 году, [ нужна ссылка ] почетной докторской степени от Университета Южной Дании в 2013 году, [ нужна ссылка ] и почетной докторской степени от Университета штата Орегон в 2024 году.

Уотерман является членом Американской академии искусств и наук с 1995 года, [ требуется ссылка ] членом Национальной инженерной академии США с 2012 года, [ требуется ссылка ] членом Китайской академии наук с 2013 года, [ требуется ссылка ] и членом Национальной академии наук США с 2001 года. [ требуется ссылка ] Он является академиком Французской академии наук с 2005 года. [ требуется ссылка ]

В 2009 году Уотерман был избран членом ISCB Международным обществом вычислительной биологии [2] и в 2009 году получил премию ISCB Senior Scientist Award. [6]

Личная жизнь

Уотерман написал мемуары « Выход на улицу » [7] о детстве, проведенном на изолированном скотоводческом ранчо на южном побережье Орегона в середине двадцатого века.

Ссылки

  1. ^ abc Anon (2017). "Майкл С. Уотерман: профессор биологических наук, математики, компьютерных наук, Университет Южной Калифорнии". dornsife.usc.edu/labs/msw . Архивировано из оригинала 2017-02-02.
  2. ^ ab Anon (2017). "ISCB Fellows". iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . Архивировано из оригинала 2017-03-20.
  3. ^ ab Anon (2015). "Соучредитель Wikipedia Джимми Уэйлс среди победителей премии Дэна Дэвида 2015 года". eurekalert.org . Получено 13 февраля 2015 г. .
  4. ^ ab Майкл Уотерман в проекте «Генеалогия математики»
  5. ^ Американские мужчины и женщины науки, Томсон Гейл 2005 [ ISBN отсутствует ]
  6. ^ ab Maisel, M. (2006). "ISCB чествует Майкла С. Уотермана и Матье Бланшетт". PLOS Computational Biology . 2 (8): e105. Bibcode : 2006PLSCB...2..105M. doi : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 . 
  7. ^ ab Waterman, Michael (2016). Getting Outside: A Far-Western Childhood . CreateSpace Independent Publishing Platform. ISBN 978-1530929344.
  8. ^ Уотерман, Майкл Смит (1969). Некоторые эргодические свойства многомерных F-разложений (диссертация). Университет штата Мичиган. OCLC  25799203. ProQuest  302449931. (требуется подписка)
  9. ^ Смит, Т.; Уотерман, М.С. (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195–197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi :10.1016/0022-2836(81)90087-5. PMID  7265238. 
  10. ^ Ландер, ES ; Уотерман, MS (1988). «Геномное картирование с помощью дактилоскопирования случайных клонов: математический анализ». Genomics . 2 (3): 231–239. doi :10.1016/0888-7543(88)90007-9. PMID  3294162.
  11. ^ Idury, Ramana M.; Waterman, Michael S. (1995). "Новый алгоритм сборки последовательности ДНК" (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 2 (2): 291–306. CiteSeerX 10.1.1.79.6459 . doi :10.1089/cmb.1995.2.291. ISSN  1066-5277. PMID  7497130. 
  12. ^ Анон (2017). «Серия конференций RECOMB». recomb.org .
  13. ^ Waterman, Michael R.; Waterman, MS (1995). Введение в вычислительную биологию: карты, последовательности и геномы . Лондон: Chapman & Hall. ISBN 978-0-412-99391-6.