Уолтер Ян Липкин (родился 18 ноября 1952 года) — профессор эпидемиологии имени Джона Сноу в Школе общественного здравоохранения Мэйлмана в Колумбийском университете и профессор неврологии и патологии в Колледже врачей и хирургов Колумбийского университета. Он также является директором Центра инфекций и иммунитета, академической лаборатории по охоте на микробов при острых и хронических заболеваниях. Липкин получил международное признание за свою работу с вирусом Западного Нила , атипичной пневмонией и COVID-19 .
Липкин родился в Чикаго, штат Иллинойс, где он учился в Школе-лаборатории Чикагского университета и был президентом студенческого совета в 1969 году. Он переехал в Нью-Йорк и получил степень бакалавра в колледже Сары Лоуренс в 1974 году. В колледже Сары Лоуренс он «чувствовал, что если я сразу после колледжа пойду в культурную антропологию, то стану паразитом. Я пойду куда-нибудь, возьму информацию о мифах и ритуалах и ничего не смогу предложить. Поэтому я решил стать медицинским антропологом и попытаться вернуть традиционную медицину. Внезапно я оказался в медицинской школе». [1] Вернувшись в свой родной город Чикаго, Липкин получил степень доктора медицины в Медицинском колледже Раша в 1978 году. Затем он стал клиническим клерком в Институте неврологии UCL на Квин-сквер в Лондоне, по стипендии, и стажировался в области медицины в Университете Питтсбурга (1978–1979). Он закончил резидентуру по медицине в Университете Вашингтона (1979–1981) и закончил резидентуру по неврологии в Калифорнийском университете в Сан-Франциско (1981–1984). Он проводил постдокторские исследования в области микробиологии и нейронауки в Научно-исследовательском институте Скриппса с 1984 по 1990 год под руководством Майкла Олдстоуна и Флойда Блума . За шесть лет работы в Скриппсе Липкин стал старшим научным сотрудником после завершения своей постдокторской работы и был президентом Общества стипендиатов Скриппса в 1987 году.
Липкин заслужил репутацию «мастера-охотника за вирусами» благодаря своей скорости и инновационным методам выявления новых вирусов и был отмечен директором Национального института аллергии и инфекционных заболеваний доктором Энтони С. Фаучи . Будучи директором Центра инфекции и иммунитета в Школе общественного здравоохранения Мэйлмана, Липкин с самого начала пандемии COVID-19 руководил исследователями CII, сотрудничавшими с исследователями из Университета Сунь Ятсена в Китае. Доктор Липкин также консультировал китайское правительство и Всемирную организацию здравоохранения (ВОЗ) во время вспышки атипичной пневмонии в 2002–2004 годах . [2] [3] Доктор Липкин описал свое собственное заражение вирусом SARS-CoV-2, начавшееся в середине марта 2020 года, что привело к случаю COVID-19 и потребовало его выздоровления от болезни дома, в подкасте This Week in Virology . [4]
Липкин был заведующим кафедрой имени Луизы Тернер Арнольд в области нейронаук [5] в Калифорнийском университете в Ирвайне с 1990 по 2001 год и вскоре после этого был принят на работу в Колумбийский университет. Он начал свою текущую работу в Колумбийском университете в качестве директора-основателя Лаборатории инфекционных заболеваний имени Джерома Л. и Дон Грин с 2002 по 2007 год, которая перешла в должность профессора имени Джона Сноу, которую он занимает в настоящее время.
Врач-ученый, Липкин получил международное признание за свою работу с вирусом Западного Нила и атипичной пневмонией , а также за усовершенствование методов обнаружения патогенов путем разработки поэтапной стратегии с использованием методов, впервые разработанных в его лаборатории. Эти молекулярно-биологические методы, включая MassTag-PCR , диагностику GreeneChip и высокопроизводительное секвенирование, являются важным шагом на пути к выявлению и изучению новых вирусных патогенов, которые появляются локально по всему миру. Доктор Липкин, являющийся основным узлом в глобальной сети исследователей, работающих над решением проблем наблюдения и обнаружения патогенов, обучил более 30 международных ученых этим передовым диагностическим методам.
Липкин является директором Центра исследований в области диагностики и открытий в рамках программы Центров передового опыта по трансляционным исследованиям Национальных институтов здравоохранения. [6] Центр исследований объединяет ведущих исследователей в области микробной и человеческой генетики, инженерии, микробной экологии и общественного здравоохранения для разработки понимания механизмов заболеваний и методов обнаружения инфекционных агентов, характеристики микрофлоры и идентификации биомаркеров, которые могут быть использованы для руководства клиническим ведением. Ранее Липкин был директором Северо-восточного центра биологической защиты, [7] Регионального центра передового опыта в области биологической защиты и новых инфекционных заболеваний, который включал 28 частных и государственных академических и государственных медицинских учреждений в Нью-Йорке, Нью-Джерси и Коннектикуте. В рамках этого консорциума его исследования были сосредоточены на обнаружении патогенов, используя в качестве целей необъяснимую геморрагическую лихорадку, фебрильную болезнь, энцефалит и менингоэнцефалит. Он является главным исследователем Autism Birth Cohort, уникальной международной программы, которая изучает эпидемиологию и основу нейроразвивающих расстройств посредством анализа перспективной когорты из 100 000 детей и их родителей. ABC изучает взаимодействие генов, окружающей среды и времени, биомаркеры и траекторию нормального развития и заболевания. Липкин также руководит Центром сотрудничества Всемирной организации здравоохранения по диагностике зоонозных и новых инфекционных заболеваний, единственным академическим центром и одним из двух в США (другой — CDC), который участвует в расследовании вспышек для ВОЗ .
Липкин был сопредседателем Руководящего комитета Национального консультативного подкомитета по биологическому надзору (NBAS) CDC. [8] NBAS был создан в ответ на Президентскую директиву по внутренней безопасности 21 (HSPD-21) [9] «Общественное здравоохранение и медицинская готовность».
Он является почетным директором Пекинского центра инфекционных заболеваний, председателем Научно-консультативного совета Шанхайского института Пастера и входит в советы Австралийского кооперативного исследовательского центра биобезопасности новых инфекционных заболеваний, Института биомедицины и здравоохранения Гуанчжоу, EcoHealth Alliance , [10] Tetragenetics и 454 Life Sciences Corporation.
Липкин был научным консультантом фильма «Заражение» . [11] Фильм получил высокую оценку за свою научную точность .
Хотя Липкин и не совсем медицинский антрополог, он специализируется на инфекционных заболеваниях и их неврологическом влиянии. Его первая профессиональная публикация вышла в 1979 году во время его стажировки в Лондоне в виде письма редактору Архива внутренней медицины (теперь JAMA Internal Medicine ), где он излагает потенциальную корреляцию между эозинопенией и бактериемией в диагностических оценках для пациента с бактериемией. [12] Во время работы в UCL он работал с Джоном Ньюсомом-Дэвисом , который использовал плазмаферез для лучшего понимания миастении гравис , нервно-мышечного заболевания . [13]
В 1981 году Липкин начал свою резидентуру по неврологии и работал в местной клинике Сан-Франциско, что было примерно в то время, когда СПИД начал поражать местное городское население. Из-за социальных взглядов на гомосексуалистов в то время очень немногие врачи видели пациентов с этими симптомами. Он «наблюдал, как многие пациенты заболевают СПИДом. Ученым потребовались годы, чтобы обнаружить вирус, ответственный за это заболевание... «Я видел все это, и я сказал: «Мы должны найти новые и лучшие способы сделать это»» [14] . Именно во время этой эпидемии Липкин принял подход поиска генов вируса вместо поиска антител у инфицированных людей, чтобы ускорить процесс диагностики. К середине 1980-х годов Липкин опубликовал две статьи, посвященные исследованиям СПИДа [15] [16] , и перешел к использованию более патологического подхода к идентификации вируса. Он выявил иммунологические нарушения и воспалительную нейропатию, связанные со СПИДом, которые, как он показал, можно лечить с помощью плазмафереза, а также продемонстрировал, что раннее воздействие вирусных инфекций влияет на функцию нейромедиаторов .
В 1989 году Липкин первым идентифицировал микроб , используя исключительно молекулярные инструменты. [17] [18] За время своего пребывания на посту председателя Калифорнийского университета в Ирвайне Липкин опубликовал несколько статей на протяжении десятилетия, анализируя и интерпретируя борнавирус . [19] Как только стало очевидно, что вирусные инфекции могут избирательно изменять поведение и устойчивые уровни нейротрансмиттерных мРНК в мозге , следующим шагом стал поиск инфекционных агентов, которые можно было бы использовать в качестве зондов для картирования анатомических и функциональных доменов в центральной нервной системе (ЦНС). [20]
К середине 1990-х годов было заявлено, что «болезнь Борна — это нейротропный вирус РНК с отрицательной цепью, который заражает широкий спектр позвоночных», вызывая «иммунно-опосредованный синдром, приводящий к нарушениям движения и поведения». [21] Это привело к тому, что несколько групп по всему миру работали над определением того, существует ли связь между вирусом болезни Борна (BDV) или родственным агентом и нейропсихиатрическими заболеваниями человека. [22] Группа была официально названа «Микробиология и иммунология нейропсихиатрических расстройств» (MIND) и многоцентровой, многонациональной группой, сосредоточенной на использовании стандартизированных методов клинической диагностики и слепой лабораторной оценки инфекции BDV. [23] После почти двух десятилетий исследований первое слепое исследование связи между BDV и психическими заболеваниями [24] было завершено исследователями из Центра инфекций и иммунитета Колумбийского университета в результате совместных усилий, которые пришли к выводу, что между ними нет никакой связи. Липкин отметил, что «именно беспокойство по поводу потенциальной роли BDV в психических заболеваниях и невозможности идентифицировать его с помощью классических методов побудило нас разработать молекулярные методы обнаружения патогенов. В конечном итоге эти новые методы позволили нам опровергнуть роль BDV в заболеваниях человека. Но факт остается фактом: мы получили стратегии для обнаружения сотен других патогенов, которые имеют важное значение для медицины, сельского хозяйства и охраны окружающей среды». [25]
В 1999 году вирус Западного Нила был зарегистрирован у двух пациентов в медицинском центре больницы Флашинг в Квинсе, Нью-Йорк. Липкин возглавлял группу, идентифицирующую вирус Западного Нила в мозговой ткани жертв энцефалита в штате Нью-Йорк. [14] Было установлено, что потенциальные пути распространения вируса Западного Нила по всему Нью-Йорку (и восточной части Соединенных Штатов) исходят преимущественно от комаров, но также возможны от инфицированных птиц или людей. Существует высокая вероятность того, что два международных аэропорта поблизости от первых зарегистрированных случаев были также начальными точками въезда в Соединенные Штаты. [26] В течение пяти лет после первого зарегистрированного случая Липкин работал над исследованием с Национальными институтами здравоохранения (NIH) и Центром Уодсворта при Департаменте здравоохранения штата Нью-Йорк, чтобы определить, как можно разработать вакцину. Хотя они добились определенного успеха с иммунизацией мышей частицами, напоминающими структурный белок prME вируса Западного Нила, [27] по состоянию на 2018 год вакцины для человека от вируса Западного Нила все еще нет. [28]
Китайские ученые впервые обнаружили коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС) в феврале 2003 года, но из-за первоначальной неверной интерпретации данных информация о правильном возбудителе, связанном с ТОРС, была скрыта, и расследование вспышки началось с опозданием. Наибольшему риску подвергались передовые больничные учреждения, поскольку они были наиболее восприимчивы к передаче вируса, поэтому именно «классическая эпидемиология сыщика» «отслеживания контактов и изоляции» привела к быстрым действиям против эпидемии . [29] Липкин был приглашен Чэнь Чжоу, вице-президентом Китайской академии наук , и Сюй Гуаньхуа, министром Министерства науки и технологий Китая, чтобы «оценить состояние эпидемии, выявить пробелы в науке и разработать стратегию сдерживания вируса и снижения заболеваемости и смертности». [30] Это привело к разработке технологии полимеразной цепной реакции в реальном времени , которая по сути позволила обнаруживать инфекцию на более ранних этапах, поскольку процесс, в данном случае, нацелен на последовательность гена N и усиливает анализ в закрытой системе. Это значительно снижает риск заражения во время обработки. [31] Тестовые наборы были разработаны с использованием этого анализа на основе ПЦР [32], и 10 000 были доставлены в Пекин лично Липкиным в разгар вспышки, после чего он обучил местных клинических микробиологов правильному использованию. Он заболел по возвращении в США и был помещен на карантин. [33]
Липкина попросили присоединиться к рабочей группе Defense Science Board по руководству карантином SARS в разгар вспышки SARS между 2003 и 2004 годами, чтобы консультировать Министерство обороны США по шагам по управлению эпидемией на национальном уровне. В рамках EcoHealth Alliance центр Липкина работал совместно с грантом NIH / NIAID [34], оценивая летучих мышей как резервуар для вируса SARS. 47 публикаций стали результатом этого гранта, который также включал оценку вирусов Nipah , Hendra , Ebola и Marburg . Это оказалось важным исследованием в общем изучении вирусных резервуаров, поскольку было установлено, что летучие мыши переносят коронавирусы и либо напрямую заражают людей путем обмена телесной жидкостью (например, при укусе), либо косвенно, заражая промежуточного хозяина, такого как свинья. [35] Липкин выступил на форуме здравоохранения в Гуанчжоу в январе 2004 года, где China Daily сообщила, что он сказал: «Вирус атипичной пневмонии, вероятно, укоренился и распространяется крысами». [36]
В 2016 году правительство Китая наградило его Премией за международное научно-техническое сотрудничество, высшей наградой страны для иностранных ученых [37] , а в январе 2020 года оно наградило его медалью в честь 70-летия Китайской Народной Республики. Обе награды были вручены за его работу во время вспышки атипичной пневмонии в 2002–2004 годах и за укрепление системы общественного здравоохранения Китая. [38]
Ближневосточный респираторный синдром (MERS) был впервые зарегистрирован в Саудовской Аравии в июне 2012 года , когда у местного мужчины изначально была диагностирована острая пневмония, а затем он умер от почечной недостаточности . Первые сообщения об этом заболевании были похожи на SARS , поскольку симптомы были похожи, но было быстро установлено, что эти случаи были вызваны новым штаммом, называемым коронавирусом MERS (MERS-CoV). Учитывая опыт Липкина в области вспышки SARS в Китае почти десять лет назад, Министерство здравоохранения Саудовской Аравии предоставило Липкину и его лаборатории местный доступ к образцам животных, связанным с первоначальными зарегистрированными случаями. [39] Используя редкую возможность, команда Липкина создала мобильную лабораторию, способную поместиться в шесть единиц личного багажа, и была доставлена из Нью-Йорка в Саудовскую Аравию коммерческим рейсом для завершения анализа образцов. [40]
Казалось маловероятным, что летучие мыши напрямую заражали людей, поскольку прямое физическое взаимодействие между ними в лучшем случае ограничено. [39] Исследование было завершено в более локальной близости, изучая разнообразные популяции летучих мышей на юго-востоке Мексики и определяя, насколько разнообразными могут быть переносимые ими вирусы. [41] Однако стало очевидно, что верблюды -дромадеры были посредниками в передаче между летучими мышами и людьми, поскольку верблюжье молоко и мясо являются основными продуктами питания в регионе Саудовской Аравии. [42] Случаи передачи от человека к человеку, по-видимому, были изолированы от пациентов и тех, кто находился в тесном прямом контакте с ними, в отличие от широкой передачи на открытом воздухе. [43] К 2017 году было установлено, что летучие мыши, скорее всего, являются эволюционным первоисточником MERS-CoV наряду с несколькими другими коронавирусами, хотя не все эти типы зоонозных вирусов представляют прямую угрозу для человека, как MERS-CoV [44] и «в совокупности эти примеры демонстрируют, что коронавирусы, связанные с MERS, тесно связаны с летучими мышами и широко распространены географически». [45]
Миалгический энцефаломиелит/синдром хронической усталости ( ME/CFS ) — хроническое заболевание, характеризующееся крайней усталостью после нагрузки, которая не проходит после отдыха и включает в себя другие симптомы, такие как мышечные и суставные боли и когнитивную дисфункцию. В сентябре 2017 года NIH выделил Колумбийскому университету грант в размере 9,6 млн долларов на «CfS для ME/CFS», предназначенный для проведения фундаментальных исследований и разработки инструментов, помогающих как врачам, так и пациентам эффективно контролировать течение болезни. [46] Это сотрудничество, возглавляемое Липкиным, охватывает другие учреждения, такие как Центр Бейтмана Хорна (Люсинда Бейтман), Гарвардский университет ( Энтони Л. Комарофф ), Стэнфордский университет (Кеган Монегетти), Sierra Internal Medicine ( Дэниел Петерсон ), Калифорнийский университет в Дэвисе (Оливер Файн) и Медицинский колледж Альберта Эйнштейна (Джон Грилли), а также частных врачей в Нью-Йорке. [47]
Команда исследователей и врачей изначально сотрудничала, чтобы отделить ксенотропный вирус мышиного лейкоза (XMRV) от ME/CFS после того, как NIH запросил исследование противоречивых отчетов между XMRV и ME/CFS. Группа «консолидировала свое видение при поддержке Инициативы по хронической усталости Фонда семьи Хатчинс и краудфандинговой организации The Microbe Discovery Project, чтобы изучить роль инфекции и иммунитета в заболевании и определить биомаркеры для диагностики с помощью функционального геномного , протеомного и метаболомного открытия». [48] Проект соберет большую клиническую базу данных и репозиторий образцов, представляющих образцы пероральной, фекальной и крови от хорошо охарактеризованных субъектов ME/CFS и контрольных лиц с соответствующей частотой, собранных по всей стране в течение нескольких лет. Кроме того, исследователи работают с сообществом ME/CFS и группами поддержки по мере продвижения проекта. [49]
Острый вялый миелит (ОВМ) — это серьезное заболевание спинного мозга с такими симптомами, как быстрое начало слабости рук или ног, снижение рефлексов, затруднение движения глаз, речи или глотания. Иногда может наблюдаться онемение или боль, а осложнения могут включать затрудненное дыхание. В августе 2019 года Липкин и доктор Нишай Мишра опубликовали совместное исследование с CDC по анализу серологических данных для образцов сыворотки и спинномозговой жидкости (СМЖ) пациентов с ОВМ. [50] Команда Липкина использовала массивы пептидов высокой плотности (также известные как серочипы) для выявления антител к EV-D68 в этих образцах. Технология была представлена на шоу доктора Оза в середине сентября, иллюстрируя, как энтеровирус влияет на СМЖ, и фактический серочип, используемый для проведения анализа. [51] [52] В октябре Калифорнийский университет в Сан-Франциско опубликовал отдельное совместное исследование с CDC , которое подтвердило наличие антител к энтеровирусу в образцах спинномозговой жидкости пациентов с АСМ с использованием фагового дисплея (VirScan). [53] «Всегда приятно видеть воспроизводимость. Это определенно придает больше уверенности в результатах», — прокомментировал Липкин в статье CNN в октябре 2019 года. «Это дает нам больше поддержки того, что мы обнаружили». [54] [55] [56]
По данным Financial Times , Липкин впервые узнал о COVID-19 от контактов в Китае, где он впервые появился, в середине декабря. [57] В начале января он неоднократно призывал своих китайских коллег опубликовать генетическую последовательность вируса для содействия исследованиям и посетил высокопоставленных китайских чиновников, включая премьера Ли Кэцяна , [58] чтобы обсудить болезнь. Липкин описал свое участие в ранних расследованиях COVID-19 во время интервью в апреле 2023 года с Комитетом по пандемии коронавируса Палаты представителей США . [59]
29 января 2020 года Липкин вылетел в Гуанчжоу , Китай , чтобы узнать о вспышке SARS-CoV-2 . [60] Липкин встретился с эпидемиологом и пульмонологом Чжун Наньшанем , [61] ведущим советником китайского правительства во время вспышки. [62] Липкин также работал с Центром по контролю и профилактике заболеваний Китая , чтобы получить доступ к образцам крови со всей страны для дальнейшего изучения происхождения и распространения вируса. [63] Липкин не поехал в Ухань , эпицентр вспышки, из-за опасений, что это помешает ему вернуться в Соединенные Штаты. [64] Вернувшись в Соединенные Штаты, Липкин самостоятельно провел 14 дней на карантине. [65] Позже Липкин заразился SARS-CoV-2 в Нью-Йорке, [66] отказавшись ехать в больницу и лечась гидроксихлорохином дома . [57]
Липкин раскритиковал то, что он считал ксенофобским ответом, который обвиняет Китай в вирусе, в частности слова президента США Дональда Трампа, назвавшего его «китайским вирусом», и его решение приостановить финансирование Всемирной организации здравоохранения за то, что она «ориентирована на Китай», призывая решать «глобальные проблемы» с помощью «глобальных решений». Он сказал, что ряд правительственных ошибок способствовал очень быстрому распространению вируса по всему миру, и раскритиковал ответные меры США и Великобритании, назвав их медленными, и обвинил недостаточное и неадекватное тестирование и отслеживание в росте числа смертей. В США он выделил в качестве проблемы то, что он считал непоследовательностью в рекомендациях, в том числе президента Трампа, и подчеркнул необходимость национального лидерства, признав при этом, что штаты имеют возможность принимать решения в определенных областях. Он похвалил своего начальника из NIAID Энтони Фаучи за его честность. Он также предупредил об опасности появления новых смертельных вирусов в будущем. [57]
После поездки в Китай Липкин поддерживал связи с Лу Цзяхаем, своим научным партнером в Университете Сунь Ятсена в Гуанчжоу , и Чжун Наньшанем, чтобы попытаться установить происхождение вируса. [61] Их усилия, направленные на выяснение того, появился ли вирус в других частях Китая и циркулировал ли он до того, как был впервые обнаружен в Ухане в декабре, включают тесты на антитела образцов крови из общенационального банка крови пациентов с пневмонией, которые предшествовали пандемии, что привело к сотрудничеству с китайскими Центрами по контролю и профилактике заболеваний. [58] По словам Липкина, это исследование началось в начале февраля. Международная исследовательская группа также начала изучать образцы крови от разных диких животных, которых она считала потенциальными источниками вируса, чтобы понять передачу от животных к человеку. [58]
Липкин считает, что вирус мог возникнуть в результате торговли дикими животными и подвергнуться «повторным скачкам» от животного к человеку за несколько недель до того, как были зарегистрированы первые случаи заболевания; такой поток событий имел недавние прецеденты в появлении MERS-CoV, который перешел от одногорбых верблюдов к человеку в 2012 году, и SARS-CoV, который перешел от циветт к человеку в 2003 году. [57]
Липкин был соавтором статьи «Проксимальное происхождение SARS-CoV-2», которая была опубликована в Nature Medicine в марте 2020 года. [67] Заключение геномного анализа состояло в том, что COVID-19 не был случаем утечки в лаборатории или заражения человеком. В 2023 году республиканцы США обвинили эту статью в сокрытии, основанном на определенных неправомерных действиях, чтобы опровергнуть теорию утечки в лаборатории . Статья и спор стали известны как « Проксимальное происхождение ». [68] [69]
Эксперименты по приобретению функции направлены на повышение вирулентности и/или трансмиссивности патогенов, чтобы лучше их понять и информировать об усилиях по обеспечению готовности общественного здравоохранения. [70] Это включает в себя целевую генетическую модификацию (для создания гибридных вирусов), последовательное пассирование вируса через животное-хозяина (для создания адаптивных мутаций) и целевой мутагенез (для введения мутаций). [71] Липкин является зарегистрированным «сторонником» группы сторонников приобретения функции, Scientists for Science , [72] которая была соучредителем Колумбийского университета вместе с коллегой Винсентом Раканиелло. [73] Национальные институты здравоохранения США наложили мораторий на исследования по приобретению функции в октябре 2014 года и сняли мораторий в декабре 2017 года после внедрения более строгих мер контроля. [74] [75]
Липкин, хотя и не одобряет каждый эксперимент по приобретению функции, сказал, что «очевидно, будут случаи, когда исследования по приобретению функции необходимы и уместны». В примере с Эболой, которая не способна передаваться воздушно-капельным путем, Липкин считает, что «исследователи могли бы обосновать необходимость определения того, как вирус может эволюционировать в природе, путем создания более опасной версии в лаборатории». Липкин считает, что должны быть разработаны руководящие принципы для управления экспериментами по приобретению функции. [76] Липкин призвал Всемирную организацию здравоохранения установить строгие критерии биосдерживания, которые можно было бы применять во всем мире, в том числе в развивающихся странах, к исследованиям по приобретению функции. [77]
В 2003 году Липкин секвенировал часть вируса атипичной пневмонии непосредственно из легочной ткани [...]. Он заболел вскоре после возвращения в США и был помещен на карантин.