Дон Фелипе Антонио де Гойкоэчеа родился в 1747 году в Косале , Синалоа , Мексика . Он присоединился к испанской армии в возрасте 35 лет в качестве кадета. В июне 1782 года был повышен до альфереса. В 1783 году, служа в президентской роте Буэнависта (Нижняя Калифорния), дон Фелипе был произведен в лейтенанты и получил приказ отправиться в Верхнюю Калифорнию, чтобы принять командование Пресидио Санта-Барбара . Он принял командование в Санта-Барбаре 25 января 1784 года, сменив Хосе Франсиско Ортегу . Он руководил строительством укреплений и жилых помещений для солдат и их семей и оставался командующим до 1802 года. Пресидио было построено на основе проектов, которые он составил в 1788 году.
В 1805 году он был назначен губернатором провинции Нижняя Калифорния , но вступил в должность только в 1806 году. Он занимал эту должность до своей смерти в 1814 году в Лорето, Южная Нижняя Калифорния .