stringtranslate.com

Фонд молекулярной генеалогии Соренсона

Фонд молекулярной генеалогии Соренсона (SMGF) был независимым учреждением, занимающимся исследованием ДНК и генеалогии, целью которого было продемонстрировать родство народов мира. SMGF собрал образцы ДНК и генеалогическую информацию от людей со всего мира, чтобы установить эти связи.

История

SMGF возник в 1999 году и был вдохновлен несколькими беседами между изобретателем и филантропом Джеймсом Левоем Соренсоном и профессором Университета Бригама Янга доктором Скоттом Вудвордом . [1] Г-н Соренсон предвидел разработку генетико-генеалогической модели всего человечества. Этот план, разработанный доктором Вудвордом, покажет, насколько тесно люди связаны друг с другом, продемонстрировав семейные отношения между уникальными людьми. Сбор образцов ДНК и связанных с ними семейных родословных начался в 2000 году, сначала со студентов Университета имени Бригама Янга, а затем быстро распространился за пределы Юты, а затем и на остальной мир.

В 2003 году SMGF перенесла свою деятельность из кампуса Университета Бригама Янга в Солт-Лейк-Сити. SMGF также передала Sorenson Genomics всю свою лабораторную работу [2] , предоставив исследователям возможность создать общедоступный онлайн-репозиторий. Это хранилище было известно как база данных Соренсона.

SMGF собрал более 100 000 образцов ДНК и семейных родословных от доноров со всего мира, и все они были доступны в базе данных Соренсона. Эта база данных была приобретена Ancestry.com до запуска AncestryDNA, когда они приобрели GeneTree в 2012 году. [3] Genetree была коммерческим подразделением SMGF. [4]

База данных Соренсона

База данных Соренсона содержала более 100 000 образцов ДНК и семейных родословных, включая 2,8 миллиона генеалогических записей и 2,4 миллиона генотипов.

База данных Соренсона сопоставила генетическую информацию с семейными фамилиями. Человек, просматривавший базу данных, мог найти как генетические, так и генеалогические совпадения, но мог осуществлять поиск, используя либо гаплотипы ДНК, либо семейную фамилию. Средняя семейная родословная содержала информацию о шести поколениях (более 150 лет) с более чем 6 миллионами генетически связанных предков.

В базе данных Соренсона было только две области для поиска: база данных Y-хромосомы и база данных митохондриальной ДНК . База данных Y-ДНК позволяла мужчинам искать свою прямую отцовскую линию; База данных мтДНК позволяла как мужчинам, так и женщинам искать свою прямую материнскую линию. Согласно ISOGG.org, Соренсон «также имел большие базы данных Х-хромосом и аутосомных STR, но эти базы данных никогда не были общедоступными». [5]

База данных Y-хромосомы:

Y-хромосома передается от отца к сыну с небольшими изменениями в Y-ДНК. Фамилии также обычно передаются от отца к сыну. База данных Соренсона использовала генетические маркеры Y-хромосомы и фамилии для определения общих предков. Пользователи могли делиться результатами ДНК и родословными, полученными из других источников. Они могли искать предков, используя их фамилию, значения генетических маркеров, полученные в результате анализа ДНК, или их комбинацию. В базе данных также были значения по умолчанию для генетических маркеров, если у пользователей не было собственной генетической информации.

Тест Y-ДНК анализирует сходство маркеров ДНК Y-хромосомы, соответствующих определенным участкам Y-хромосомы. Маркеры имеют короткие тандемные повторы (STR), которые включают повторы из 2–5 пар оснований ДНК. В лабораториях Соренсона количество STR в 36-маркерном гаплотипе сравнивалось между данным образцом и базой данных для определения родства. Также был исследован однонуклеотидный полиморфизм (SNP ) . SNP Y-хромосомы встречаются редко и могут использоваться для разделения популяций мужчин или гаплогрупп, а также в популяционных исследованиях. [6]

Митохондриальная база данных:

И мужчины, и женщины наследуют митохондриальную ДНК (мтДНК) от своей матери, что позволяет мтДНК определять материнскую линию. База данных Соренсона сравнила митохондриальную ДНК более чем 76 000 человек в своей митохондриальной базе данных, чтобы найти родственников, связанных между поколениями. Пользователи могли делиться результатами своих мтДНК из других коммерческих лабораторий.

Тест мтДНК исследует три области D-петли мтДНК: HVR1, HVR2 и HVR3, которая называется гипервариабельной областью . Мутации в этих областях мтДНК чрезвычайно редки и, вероятно, не изменились между двоюродными братьями по материнской линии за последние 500 лет. Следовательно, изучение мутаций в этих областях может определить материнскую линию. Образцы мтДНК, представленные в Фонд молекулярной генеалогии Соренсона, сравнивались с Кембриджской эталонной последовательностью (CRS) мтДНК, а затем друг с другом на предмет родства.

Участие

Одной из, возможно, слишком амбициозных миссий SMGF было соединить любых двух людей в мире, показав обоим, как они связаны. Для достижения этой цели SMGF собрал образцы ДНК и сопоставил семейные родословные участников со всего мира. [7] Достигнув своей цели в 100 000 образцов, SMGF изменила свои цели, сосредоточившись меньше на сборе новых образцов и больше на анализе предыдущих образцов.

Новых участников по-прежнему принимали через дочернюю компанию SMGF GeneTree в течение многих лет. Кроме того, предыдущие участники SMGF могли купить свой отчет о ДНК через GeneTree.com. [8]

Другой целью SMGF было продвижение исследований в области молекулярной генеалогии. SMGF провел исследование с целью выявления дополнительных маркеров ДНК, которые связывают человека с его генеалогической семьей, какой бы прямой или отдаленной она ни была. Исследователи SMGF опубликовали ряд исследовательских работ, [9] многие из которых проводились в сотрудничестве с другими исследователями.

Сбор ДНК для проекта первоначально включал в себя взятие образцов крови; с августа 2002 года SMGF использует метод сбора жидкости для полоскания рта (GenetiRinse), преимущество которого заключается в том, что его можно рассылать по почте участникам, живущим в отдаленных районах.

Споры и закрытие

В мае 2015 года Ancestry.com закрыл веб-сайт SMGF, сославшись на то, что «сайт использовался не по назначению, что вынудило [Ancestry.com] прекратить работу на сайте». [10] Действия Ancestry.com были предприняты в ответ на сообщения в новостях о том, что база данных SMGF использовалась Ancestry.com и местными правоохранительными органами без какого-либо судебного надзора [например, ордера] и в нарушение политики конфиденциальности SMGF. , чтобы попытаться связать подозреваемых в совершении преступлений с местом преступления. [11] Хотя в конечном итоге было признано, что действия по делу всех сторон, особенно Ancestry.com и местных правоохранительных органов, соответствовали надлежащим конституционным процедурам защиты конфиденциальности и судебного надзора по делу, скандал существенно повлиял на репутацию Ancestry.com. и привело к решению деактивировать сайт и законсервировать базу данных SMGF.

Рекомендации

  1. ↑ Харт, Джон Л. (24 апреля 2004 г.). «Разблокировка ДНК». Церковные новости . Проверено 26 июля 2011 г.
  2. ^ «О нас». Соренсон Геномика.
  3. ^ Мур, СиСи . «Ancestry.com покупает GeneTree (еще одного конкурента) и запускает для подписчиков свой новый продукт на основе аутосомной ДНК» . Ваш генетический генеалог .
  4. ^ «Ancestry.com запускает AncestryDNA» . Родословная Инсайдер .
  5. ^ "Фонд молекулярной генеалогии Соренсона" . ISOGG Wiki . Международное общество генетической генеалогии.
  6. ^ «Простое руководство для дураков по популяционной геномике». Стэнфордский университет – Лаборатория Палумби. Архивировано из оригинала 24 февраля 2020 года.
  7. ↑ Бойл, Алан (3 июля 2011 г.). «Африканцы навещают своих американских кузенов». MSNBC . Проверено 19 мая 2017 г.
  8. ^ «База данных генетической генеалогии Фонда молекулярной генеалогии Соренсона пересекла историческую веху, накопив 100 000 образцов ДНК, чему способствовал подарок основателя на несколько миллионов долларов» (пресс-релиз). Фонд молекулярной генеалогии Соренсона. 28 апреля 2010 года . Проверено 19 мая 2017 г.
  9. ^ «В новом мире было по меньшей мере 15 «матерей-основательниц», согласно последнему исследованию Фонда молекулярной генеалогии Соренсона и Университета Павии, Италия» . Business Wire (Пресс-релиз) . Проверено 19 мая 2017 г.
  10. ↑ Эстес, Роберта (15 мая 2015 г.). «RIP Соренсон – сокрушительная потеря». Объяснение ДНК . Проверено 4 мая 2016 г.
  11. ↑ Линч, Дженнифер (1 мая 2015 г.). «Как частные данные ДНК привели полицейских Айдахо в погоню за дикими гусями и связали невиновного человека с делом об убийстве 20-летней давности». Фонд электронных границ . Проверено 4 мая 2016 г.

Внешние ссылки

Официальные сайты

Новостные статьи