Химические сущности биологического интереса , также известные как ChEBI , [1] [2] — это химическая база данных и онтология молекулярных сущностей, ориентированная на «малые» химические соединения, которая является частью проекта Open Biomedical Ontologies (OBO) Европейского института биоинформатики (EBI). Термин «молекулярная сущность» относится к любому «конституционально или изотопно различимому атому , молекуле , иону , ионной паре , радикалу , радикальному иону , комплексу , конформеру и т. д., идентифицируемому как отдельно различимая сущность». [3] Рассматриваемые молекулярные сущности являются либо продуктами природы, либо синтетическими продуктами, которые обладают потенциальной биологической активностью. Молекулы, напрямую кодируемые геномом, такие как нуклеиновые кислоты , белки и пептиды, полученные из белков путем протеолитического расщепления, как правило, не включаются в ChEBI.
ChEBI использует номенклатуру , символику и терминологию, одобренные Международным союзом теоретической и прикладной химии (ИЮПАК) и номенклатурным комитетом Международного союза биохимии и молекулярной биологии (NC-IUBMB).
Все данные в базе данных не являются собственностью или получены из источника, не являющегося собственностью. Таким образом, они находятся в свободном доступе и доступны любому. Кроме того, каждый элемент данных полностью прослеживается и явно ссылается на исходный источник. Он связан по области действия с другими базами данных, такими как ChEMBL , ChemSpider , DrugBank , MetaboLights и PubChem .
Данные ChEBI доступны через общедоступное веб-приложение , веб-сервисы , конечную точку SPARQL и загрузки. [1] [2]
ChEBI ID (P683) (см. использование )