ChemSpider is a freely accessible online database of chemicals owned by the Royal Society of Chemistry.[3][4][5][6][7] It contains information on more than 100 million molecules from over 270 data sources, each of them receiving a unique identifier called ChemSpider Identifier.
The database sources include:[8]
The ChemSpider database can be updated with user contributions including chemical structure deposition, spectra deposition and user curation. This is a crowdsourcing approach to develop an online chemistry database. Crowdsourced based curation of the data has produced a dictionary of chemical names associated with chemical structures that has been used in text-mining applications of the biomedical and chemical literature.[10]
However, database rights are not waived and a data dump is not available; in fact, the FAQ even states that only limited downloads are allowed:[11] therefore the right to fork is not guaranteed and the project can not be considered free/open.
A number of available search modules are provided:
База данных ChemSpider использовалась в сочетании с интеллектуальным анализом текста в качестве основы для разметки химических документов . ChemMantis, [14] Интегрированная система химической разметки и преобразования номенклатуры использует алгоритмы для идентификации и извлечения химических названий из документов и веб-страниц, а также преобразует химические названия в химические структуры с использованием алгоритмов преобразования имен в структуру и поиска по словарю в ChemSpider. база данных. Результатом является интегрированная система документов по химии и поиска информации с помощью ChemSpider в более чем 150 источниках данных.
SyntheticPages — это бесплатная интерактивная база данных процедур синтетической химии, управляемая Королевским химическим обществом . [15] Пользователи представляют синтетические процедуры, которые они провели сами, для публикации на сайте. Эти процедуры могут быть оригинальными разработками, но чаще всего они основаны на реакциях литературы. При необходимости даются ссылки на оригинальную опубликованную процедуру. Перед публикацией они проверяются научным редактором. Страницы не проходят формального рецензирования, как статьи в научных журналах , но комментарии могут оставлять авторизованные пользователи. Комментарии также модерируются научными редакторами. Цель состоит в том, чтобы собрать практический опыт проведения полезного химического синтеза в лаборатории. В то время как экспериментальные методы, опубликованные в обычном академическом журнале, перечислены формально и кратко, процедуры в ChemSpider SyntheticPages даны с более практическими подробностями. Неформальность приветствуется. Комментарии авторов также включены. Другие публикации с сопоставимым количеством деталей включают Organic Syntheses и Inorganic Syntheses . Сайт SyntheticPages был первоначально создан профессорами Кевином Букером-Милберном ( Бристольский университет ), Стивеном Кэддиком ( Университетский колледж Лондона ), Питером Скоттом ( Университет Уорика ) и Максом Хаммондом. В феврале 2010 года было объявлено о слиянии [16] с поисковой системой химической структуры ChemSpider Королевского химического общества и образовании ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP).
Ряд услуг доступен онлайн. К ним относятся преобразование химических названий в химические структуры , генерация строк SMILES и InChI , а также прогнозирование многих физико-химических параметров и интеграция с веб-сервисом, позволяющим прогнозировать ЯМР .
ChemSpider был приобретен Королевским химическим обществом (RSC) в мае 2009 года. [17] До приобретения RSC ChemSpider контролировалась частной корпорацией ChemZoo Inc. Система была впервые запущена в марте 2007 года в бета-версии. форме и перешел к выпуску в марте 2008 года.
ChemSpider служил хранилищем химических соединений в рамках проекта Open PHACTS , инициативы в области инновационных лекарственных средств . Открытые PHACTS разработаны в соответствии с открытыми стандартами, с открытым доступом и подходом семантической сети для устранения узких мест в разработке низкомолекулярных лекарств - разрозненных источников информации, отсутствия стандартов и информационной перегрузки. [18]