stringtranslate.com

Хромодомен

Хромодомен ( модификатор организации хроматина [ 2] ) — это структурный домен белка , состоящий примерно из 40–50 аминокислотных остатков , обычно встречающийся в белках, связанных с ремоделированием и манипуляцией хроматином . Домен высококонсервативен как среди растений , так и среди животных и представлен в большом количестве различных белков во многих геномах , например, у мыши . Некоторые гены , содержащие хромодомен, имеют несколько альтернативных изоформ сплайсинга, которые полностью пропускают хромодомен. [3] У млекопитающих белки, содержащие хромодомен, отвечают за аспекты регуляции генов , связанные с ремоделированием хроматина и образованием гетерохроматиновых областей. [4] Белки, содержащие хромодомен, также связывают метилированные гистоны [5] [6] и появляются в комплексе транскрипционного подавления, индуцированного РНК . [7] В модификациях гистонов хромодомены очень консервативны. Они функционируют путем идентификации и связывания с метилированными остатками лизина , которые существуют на поверхности белков хроматина, и тем самым регулируют транскрипцию генов. [8]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Min J, Zhang Y, Xu RM (август 2003 г.). «Структурная основа специфического связывания хромодомена Polycomb с гистоном H3, метилированным по Lys 27». Genes Dev . 17 (15): 1823–8. doi :10.1101/gad.269603. PMC  196225. PMID  12897052 .
  2. ^ Мессмер С., Франке А., Паро Р. (июль 1992 г.). «Анализ функциональной роли домена поликомб-хромосомы у Drosophila melanogaster». Genes Dev . 6 (7): 1241–1254. doi : 10.1101/gad.6.7.1241 . PMID  1628830.
  3. ^ Таджул-Арифин К, Тисдейл Р, Раваси Т, Хьюм ДА, Мэттик Дж. С. (2003). «Идентификация и анализ содержащих хромодомен белков, закодированных в транскриптоме мыши». Genome Res . 13 (6B): 1416–1429. doi :10.1101/gr.1015703. PMC 403676. PMID  12819141 . 
  4. ^ Jones DO, Cowell IG, Singh PB (2000). «Хромодоменные белки млекопитающих: их роль в организации и экспрессии генома». BioEssays . 22 (2): 124–37. CiteSeerX 10.1.1.575.6410 . doi :10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E. PMID  10655032. 
  5. ^ Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с гистоном H3, метилированным по лизину 9». Nature . 416 (6876): 103–7. Bibcode :2002Natur.416..103N. doi :10.1038/nature722. PMID  11882902. S2CID  4423019.
  6. ^ Jacobs SA, Khorasanizadeh S (2002). "Структура хромодомена HP1, связанного с лизин-9-метилированным хвостом гистона H3". Science . 295 (5562): 2080–3. Bibcode :2002Sci...295.2080J. doi :10.1126/science.1069473. PMID  11859155. S2CID  38589662.
  7. ^ Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal SI, Moazed D (2004). "RNAi-опосредованное нацеливание гетерохроматина комплексом RITS". Science . 303 (5658): 672–6. Bibcode :2004Sci...303..672V. doi :10.1126/science.1093686. PMC 3244756 . PMID  14704433. 
  8. ^ Яп КЛ, Чжоу ММ (март 2011). «Структура и механизмы распознавания метилирования лизина хромодоменом в транскрипции генов». Биохимия . 50 (12): 1966–80. doi : 10.1021/bi101885m. PMC 3062707. PMID  21288002. 

Внешние ссылки


  • в
  • т
  • е