stringtranslate.com

Янив Эрлих

Янив Эрлихизраильско-американский учёный . Ранее он занимал должность доцента кафедры компьютерных наук в Колумбийском университете и был главным научным сотрудником MyHeritage . [1] Работа Эрлиха сочетает в себе компьютерные науки и геномику .

Биография

Доктор Эрлих родился в Израиле . Он получил степень бакалавра наук в области наук о мозге в 2006 году в Тель-Авивском университете и степень доктора философии в области биоинформатики в 2010 году в Школе биологических наук Уотсона в лаборатории Cold Spring Harbor . С 2010 по 2015 год Эрлих был научным сотрудником Института Уайтхеда Массачусетского технологического института . С 2015 по 2019 год он руководил лабораторией в Колумбийском университете по вычислительной геномике. [2] С 2020 года по настоящее время он занимает должность генерального директора Eleven Therapeutics. [3]

Научная работа

Краудсорсинг геномной информации

Команда Эрлиха опубликовала исследование в журнале Science , в котором сообщалось о краудсорсинге десятков миллионов генеалогических записей с сайта Geni.com . [4] Команда смогла создать единое генеалогическое древо из 13 миллионов человек, которые все связаны и охватывают десятки поколений и более 600 лет истории. [5] Исследование использовало данные для анализа генетики долголетия и семейной дисперсии [6]

В другом направлении исследований Эрлих и Джо Пикрелл создали веб-сайт под названием DNA.Land для сбора геномных наборов данных участников потребительской геномики. [7] К ноябрю 2018 года на веб-сайте было собрано более 130 000 наборов данных.

Генетическая конфиденциальность

Группа Эрлиха опубликовала несколько исследований на тему генетической конфиденциальности . В 2013 году они сообщили о возможности восстановления фамилии мужчины из его якобы анонимного геномного набора данных, что может привести к отслеживанию его полной личности. [8] Метод использует совместное наследование фамилий и Y-хромосом в большинстве обществ. Таким образом, сравнивая Y-хромосому интересующего человека с генетической генеалогической базой данных Y-хромосом, в некоторых случаях можно вывести фамилию. Команда подсчитала, что 12% мужчин в США подлежат успешному восстановлению фамилии. Команда также продемонстрировала, что после восстановления фамилии основные демографические идентификаторы, такие как возраст и место жительства, могут позволить отследить личность человека. Чтобы продемонстрировать силу метода, они восстанавливают идентичность нескольких 1000 геномов путем выведения фамилии.

В 2014 году Эрлих и Арвинд Нараянан опубликовали обзор методов взлома геномных наборов данных. [9] Они предсказали, что аутосомный поиск в GEDmatch может быть использован для отслеживания личности анонимных людей, как только база пользователей GEDmatch достигнет определенного размера, что действительно произошло в 2018 году, когда веб-сайт использовался для поимки « Убийцы из Золотого штата» .

В 2018 году команда Эрлиха опубликовала исследование в журнале Science, в котором сообщалось, что около 60% американцев европейского происхождения имеют по крайней мере троюродного брата, совпадающего в GEDmatch, что теоретически может позволить их идентификацию. [10] Через два-три года практически любого человека в этой этнической группе можно будет теоретически отследить с помощью этой техники, если текущие темпы роста GEDmatch сохранятся. [11] Команда предложила технику криптографической подписи, чтобы снизить вероятность неправомерного использования прямых поисков на потребительских веб-сайтах полицией.

Ссылки

  1. ^ "Сайт лаборатории Эрлиха".
  2. ^ "Спикеры TEDxDanubia".
  3. ^ "О нас". Eleven Therapeutics . Получено 2023-04-16 .
  4. ^ Капланис, Джоанна; Гордон, Ассаф; Шор, Таль; Вайсброд, Омер; Гейгер, Дэн; Валь, Мэри; Гершовиц, Майкл; Маркус, Барак; Шейх, Мона; Джимрек, Мелисса; Бхатия, Гаурав; Макартур, Дэниел Г.; Прайс, Алкес Л.; Эрлих, Янив (2018). «Количественный анализ генеалогических деревьев в масштабе популяции с миллионами родственников». Science . 360 (6385): 171–175. Bibcode :2018Sci...360..171K. doi :10.1126/science.aam9309. PMC 6593158 . PMID  29496957. 
  5. ^ «Краудсорсинг 600 лет истории человечества». 13 марта 2018 г.
  6. ^ Хотц, Роберт Ли (март 2018 г.). "WSJ". Wall Street Journal .
  7. ^ «DNA.Land — это платформа для сбора геномов и феноменов в эпоху обильной генетической информации».
  8. ^ Джимрек, Мелисса; МакГвайр, Эми Л.; Голан, Дэвид; Гальперин, Эран; Эрлих, Янив (2013). «Идентификация персональных геномов по выводу фамилии». Science . 339 (6117): 321–324. Bibcode :2013Sci...339..321G. doi :10.1126/science.1229566. PMID  23329047. S2CID  3473659.
  9. ^ Эрлих, Янив; Нараянан, Арвинд (2014). «Пути нарушения и защиты генетической конфиденциальности». Nature Reviews Genetics . 15 (6): 409–421. doi :10.1038/nrg3723. PMC 4151119. PMID  24805122 . 
  10. ^ Эрлих, Янив; Шор, Таль; Пе'Эр, Ицик; Карми, Шай (2018). «Вывод идентичности геномных данных с использованием долгосрочных семейных поисков». Science . 362 (6415): 690–694. Bibcode :2018Sci...362..690E. doi :10.1126/science.aau4832. PMC 7549546 . PMID  30309907. 
  11. ^ Мерфи, Хизер (11 октября 2018 г.). «ДНК большинства белых американцев можно идентифицировать с помощью генеалогических баз данных». The New York Times .