Агитоксин — токсин, содержащийся в яде скорпиона Leiurus quinquestriatus hebraeus (желтый скорпион). Другие токсины, содержащиеся в этом виде, включают харибдотоксин (CTX). CTX — близкий гомолог агитоксина. [2]
Структура
Агитоксин можно очистить с помощью методов ВЭЖХ .
Первичная структура:
Можно выделить три типа агитоксина, каждый из которых идентифицирован как содержащий 38 аминокислот . Они высоко гомологичны, отличаясь только идентичностью остатков в положениях 7, 15, 29 и 31.
- Агитоксин-1 Gly-Val-Pro-Ile-Asn-Val-Lys-Cys-Thr-Gly-Ser-Pro-Gln-Cys-Leu-Lys-Pro-Cys-Lys-Asp-Ala-Gly-Met-Arg-Phe-Gly-Lys-Cys-Ile-Asn-Gly-Lys-Cys-His-Cys-Thr-Pro-Lys ( GVPINVKCTGSPQCLKPCKDAGMRFGKCINGKCHCTPK , молекулярная масса = 4014,87 Да , молекулярная формула = C169H278N52O47S7 )
- Агитоксин-2 Gly-Val-Pro-Ile-Asn-Val-Ser-Cys-Thr-Gly-Ser-Pro-Gln-Cys-Ile-Lys-Pro-Cys-Lys-Asp-Ala-Gly-Met-Arg-Phe-Gly-Lys-Cys-Met-Asn-Arg-Lys-Cys-His-Cys-Thr-Pro-Lys (GVPINVSCTGSPQCIKPCKDAGMRFGKCMNRKCHCTPK, молекулярная масса = 4090,95 Да , молекулярная формула = C169H278N54O48S8 )
- Агитоксин-3 Gly-Val-Pro-Ile-Asn-Val-Pro-Cys-Thr-Gly-Ser-Pro-Gln-Cys-Ile-Lys-Pro-Cys-Lys-Asp-Ala-Gly-Met-Arg-Phe-Gly-Lys-Cys-Met-Asn-Arg-Lys-Cys-His-Cys-Thr-Pro-Lys (GVPINVPCTGSPQCIKPCKDAGMRFGKCMNRKCHCTPK, молекулярная масса = 4100,98 Да , молекулярная формула = C171H280N54O47S8 , номер CAS 155646-23-4 )
Вторичная и третичная структура:
Агитоксин состоит из трехцепочечной антипараллельной бета-слои , в которой С-концевая цепь находится в центре слоя, и одной альфа-спирали, покрывающей одну сторону бета-слоя (см. изображение справа). Боковые цепи цистеина соединяют бета-слои и спираль посредством дисульфидных связей, образуя ядро молекулы.
Складка агитоксина гомологична ранее определенным складкам токсинов яда скорпиона, классифицированных Pfam как «короткие токсины скорпиона» . Эта складка и расположение дисульфидных связей являются общим элементом для токсинов, происходящих от членистоногих. Структура агитоксина-2 была определена методом ЯМР. [1]
Функция
Агитоксин связывается с каналом Shaker K + у дрозофилы, а также с его гомологом у млекопитающих. Он блокирует этот канал, связываясь с высоким сродством ( K d < 1 нмоль / л ) с его внешним вестибюлем.
Это высокое сродство к каналу «Shaker K» зависит от остатков Arg 24 , Lys 27 и Arg 31. [1] Способность агитоксина блокировать канал «Shaker K» предполагает механизм стыковки, при котором токсин располагается на канале, а затем предотвращает его открытие посредством гибких движений боковых цепей, тем самым позволяя вступать в действие различным белок-белковым комплексам. [3] Было обнаружено, что AgTx2 претерпевает конформационные изменения при связывании с каналом «Shaker K», что предполагает, что модель индуцированного соответствия может присутствовать во взаимодействии токсина с каналом. Этот режим взаимодействия сопровождается и объясняет гибкие боковые цепи. [4] Аминокислотный состав токсина определяет способ каждого из них, взаимодействующих с каналами Shaker K. [1]
В Agitoxin, например, аргинин взаимодействует электростатически с аспартатом канала «Shaker K». [ 1] Окончательное блокирование поры в канале Shaker K + происходит через боковую цепь Lys 27. [3] Lys 27 взаимодействует с Shaker K, закупоривая фильтр селективности и водородные связи с карбонилами Tyr 395 каждой субъединицы калиевого канала. [5] Важные стабилизирующие водородные связи между различными остатками на AgTx2 и субъединицами канала удерживают комплекс токсин-канал вместе. Мутации в Arg24Ala, Lys27Met и Asn30Ala увеличили диссоциацию или разрушение комплекса, что позволяет предположить, что все они играют важную роль в удержании токсина на канале. [5]
Ссылки
- ^ abcde Krezel AM, Kasibhatla C, Hidalgo P, MacKinnon R, Wagner G (август 1995 г.). «Структура раствора ингибитора калиевых каналов агитоксина 2: штангенциркуль для зондирования геометрии канала». Protein Science . 4 (8): 1478–89. doi :10.1002/pro.5560040805. PMC 2143198 . PMID 8520473.
- ^ Bontems F, Roumestand C, Gilquin B, Ménez A, Toma F (декабрь 1991 г.). «Уточненная структура харибдотоксина: общие мотивы в токсинах скорпиона и дефензинах насекомых». Science . 254 (5037): 1521–3. Bibcode :1991Sci...254.1521B. doi :10.1126/science.1720574. PMID 1720574.
- ^ ab Eriksson MA, Roux B (ноябрь 2002 г.). «Моделирование структуры агитоксина в комплексе с каналом Shaker K+: вычислительный подход, основанный на экспериментальных ограничениях расстояния, извлеченных из термодинамических мутантных циклов». Biophysical Journal . 83 (5): 2595–609. Bibcode :2002BpJ....83.2595E. doi :10.1016/S0006-3495(02)75270-3. PMC 1302345 . PMID 12414693.
- ^ Lin YW, Wang KJ, Lei HY, Lin YS, Yeh TM, Liu HS, Liu CC, Chen SH (декабрь 2002 г.). «Репликация вируса и продукция цитокинов в человеческих В-лимфоцитах, инфицированных вирусом денге». Журнал вирусологии . 76 (23): 12242–9. doi :10.1128/JVI.76.23.12242-12249.2002. PMC 136880. PMID 12414963 .
- ^ ab Gao YD, Garcia ML (август 2003 г.). «Взаимодействие агитоксина 2, харибдотоксина и ибериотоксина с калиевыми каналами: селективность между потенциалзависимыми и Maxi-K каналами». Белки . 52 (2): 146–54. doi :10.1002/prot.10341. PMID 12833539. S2CID 7136604.
Дальнейшее чтение
- Oiki, S.; Uchihashi, T.; Sumikama, T.; Sumino, A. (1 июля 2019 г.). «Высокоскоростная АСМ выявляет ускоренное связывание агитоксина-2 с каналом K+ с помощью индуцированного соответствия». Science Advances . 5 (7): eaax0495. Bibcode :2019SciA....5..495S. doi : 10.1126/sciadv.aax0495 . ISSN 2375-2548. PMC 6609221 . PMID 31281899.
- Garcia ML, Garcia-Calvo M, Hidalgo P, Lee A, MacKinnon R (июнь 1994 г.). «Очистка и характеристика трех ингибиторов потенциалзависимых каналов K+ из яда Leiurus quinquestriatus var. hebraeus». Биохимия . 33 (22): 6834–9. doi :10.1021/bi00188a012. PMID 8204618.
- Gao YD, Garcia ML (август 2003 г.). «Взаимодействие агитоксина 2, харибдотоксина и ибериотоксина с калиевыми каналами: селективность между потенциалзависимыми и Maxi-K каналами». Белки . 52 (2): 146–54. doi :10.1002/prot.10341. PMID 12833539. S2CID 7136604.