Большое суперсемейство белков клеточной поверхности и растворимых белков
Суперсемейство иммуноглобулинов ( IgSF ) — это большое суперсемейство белков клеточной поверхности и растворимых белков , которые участвуют в процессах распознавания, связывания или адгезии клеток . Молекулы классифицируются как члены этого суперсемейства на основе общих структурных особенностей с иммуноглобулинами (также известными как антитела); все они обладают доменом, известным как домен иммуноглобулина или складка . Члены IgSF включают рецепторы антигенов клеточной поверхности , корецепторы и костимулирующие молекулы иммунной системы , молекулы, участвующие в презентации антигенов лимфоцитам , молекулы клеточной адгезии , определенные рецепторы цитокинов и внутриклеточные мышечные белки. Они обычно связаны с ролями в иммунной системе. В противном случае, специфичный для сперматозоидов белок IZUMO1 , член суперсемейства иммуноглобулинов, также был идентифицирован как единственный белок мембраны сперматозоида, необходимый для слияния сперматозоида и яйцеклетки.
Иммуноглобулиновые домены
Белки IgSF обладают структурным доменом, известным как домен иммуноглобулина (Ig) . Домены Ig названы в честь молекул иммуноглобулина . Они содержат около 70-110 аминокислот и классифицируются в соответствии с их размером и функцией. [2] Домены Ig обладают характерной Ig-складкой , которая имеет сэндвич-подобную структуру, образованную двумя слоями антипараллельных бета-нитей . Взаимодействия между гидрофобными аминокислотами на внутренней стороне сэндвича и высококонсервативными дисульфидными связями, образованными между остатками цистеина в нитях B и F, стабилизируют Ig-складку. [ необходима цитата ]
Классификация
Домены, подобные Ig, можно классифицировать как IgV, IgC1, IgC2 или IgI. [3]
Большинство доменов Ig являются либо вариабельными (IgV), либо постоянными (IgC).
- IgV: Домены IgV с 9 бета-цепями, как правило, длиннее, чем домены IgC с 7 бета-цепями.
- IgC1 иIgC2: Домены Ig некоторых членов IgSF напоминают домены IgV по аминокислотной последовательности, но по размеру схожи с доменами IgC. Они называются доменами IgC2, тогда как стандартные домены IgC называются доменами IgC1.
- IgI: Существуют и другие домены Ig, которые называются промежуточными (I) доменами. [4]
Участники
Сообщалось, что домен Ig является самым многочисленным семейством белков в геноме человека, в нем идентифицировано 765 членов. [5] Члены этого семейства могут быть обнаружены даже в телах животных с простой физиологической структурой, таких как губки порифера. Они также были обнаружены у бактерий, где их присутствие, вероятно, обусловлено расхождением с общим предком доменов суперсемейства эукариотических иммуноглобулинов. [6]
Ссылки
- ^ Dall'Acqua W, Goldman ER, Lin W, Teng C, Tsuchiya D, Li H, Ysern X, Braden BC, Li Y, Smith-Gill SJ, Mariuzza RA (июнь 1998 г.). «Мутационный анализ связывающих взаимодействий в комплексе антиген-антитело-белок-белок». Биохимия . 37 (22): 7981–91. doi :10.1021/bi980148j. PMID 9609690.
- ^ Barclay AN (август 2003 г.). «Мембранные белки с доменами, подобными иммуноглобулину — главное суперсемейство молекул взаимодействия». Семинары по иммунологии . 15 (4): 215–23. doi :10.1016/S1044-5323(03)00047-2. PMID 14690046.
- ^ BD Gomperts; Ijsbrand M. Kramer; Peter ER Tatham (1 июля 2009 г.). Трансдукция сигнала. Academic Press. стр. 378–. ISBN 978-0-12-369441-6. Получено 28 ноября 2010 г.
- ^ Harpaz Y, Chothia C (май 1994). «Многие домены суперсемейства иммуноглобулинов в молекулах клеточной адгезии и поверхностных рецепторах принадлежат к новому структурному набору, который близок к тому, который содержит вариабельные домены». Журнал молекулярной биологии . 238 (4): 528–39. doi :10.1006/jmbi.1994.1312. PMID 8176743.
- ^ Lander ES, Linton LM, Birren B, Nusbaum C, Zody MC, Baldwin J, et al. (Февраль 2001). «Первоначальное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Nature . 409 (6822): 860–921. doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011.
- ^ Bateman A, Eddy SR, Chothia C (сентябрь 1996 г.). «Члены суперсемейства иммуноглобулинов у бактерий». Protein Science . 5 (9): 1939–41. doi :10.1002/pro.5560050923. PMC 2143528 . PMID 8880921.
- ^ Peggs KS, Allison JP (сентябрь 2005 г.). «Костимулирующие пути в регуляции лимфоцитов: суперсемейство иммуноглобулинов». British Journal of Haematology . 130 (6): 809–24. doi : 10.1111/j.1365-2141.2005.05627.x . PMID 16156851.
- ^ Гринвальд Р. Дж., Фримен Г. Дж., Шарп А. Х. (2005). «Возвращение к семейству B7». Ежегодный обзор иммунологии . 23 : 515–48. doi : 10.1146/annurev.immunol.23.021704.115611. PMID 15771580.
- ^ Boles KS, Stepp SE, Bennett M, Kumar V, Mathew PA (июнь 2001 г.). «2B4 (CD244) и CS1: новые члены подмножества молекул суперсемейства иммуноглобулинов CD2, экспрессируемых на естественных клетках-киллерах и других лейкоцитах». Immunological Reviews . 181 : 234–49. doi :10.1034/j.1600-065X.2001.1810120.x. PMID 11513145. S2CID 21801197.
- ^ Fraser CC, Howie D, Morra M, Qiu Y, Murphy C, Shen Q, Gutierrez-Ramos JC, Coyle A, Kingsbury GA, Terhorst C (февраль 2002 г.). «Идентификация и характеристика SF2000 и SF2001, двух новых членов семейства иммунных рецепторов SLAM/CD2». Immunogenetics . 53 (10–11): 843–50. doi :10.1007/s00251-001-0415-7. PMID 11862385. S2CID 10257502.
- ^ Tangye SG, Nichols KE, Hare NJ, van de Weerdt BC (сентябрь 2003 г.). «Функциональные требования к взаимодействиям между CD84 и белками, содержащими домен гомологии 2 Src, и их вклад в активацию Т-клеток человека». Журнал иммунологии . 171 (5): 2485–95. doi : 10.4049/jimmunol.171.5.2485 . PMID 12928397.
Внешние ссылки
- Трансмембранные человеческие белки из суперсемейства иммуноглобулинов, классифицируемые как рецепторы, лиганды и адгезионные белки
- Иммуноглобулиновый домен в СУПЕРСЕМЕЙСТВЕ