Аллоферменты (или также называемые аллозимами ) являются вариантными формами фермента , которые отличаются структурно, но не функционально от других аллоферментов, кодируемых различными аллелями в том же локусе . Они противопоставляются изоферментам , которые являются ферментами, выполняющими ту же функцию, но которые кодируются генами, расположенными в разных локусах. [1]
Аллоферменты — это распространенные биологические ферменты , которые демонстрируют высокий уровень функциональной эволюционной консервации во всех определенных типах и царствах . Они используются филогенетиками в качестве молекулярных маркеров для оценки эволюционной истории и взаимоотношений между различными видами. Это можно сделать, поскольку аллозимы не имеют одинаковой структуры. Их можно разделить с помощью капиллярного электрофореза . Однако некоторые виды являются мономорфными для многих своих аллозимов, что затруднит для филогенетиков оценку эволюционной истории этих видов. [2] В этих случаях филогенетикам придется использовать другой метод для определения эволюционной истории вида.
Эти ферменты обычно выполняют очень простые функции, которые встречаются во всех формах жизни, например, ДНК-полимераза , фермент, который восстанавливает и копирует ДНК . Значительные изменения в этом ферменте отражают важные события в эволюционной истории организмов. Как и ожидалось, ДНК-полимераза показывает относительно небольшие различия в своей аминокислотной последовательности между типами и даже царствами.
Ключ к выбору аллофермента для использования при сравнении нескольких видов — выбрать тот, который является максимально изменчивым, но при этом присутствует во всех организмах. Сравнивая аминокислотную последовательность фермента в видах, больше сходств аминокислот должно быть обнаружено у видов, которые более тесно связаны, и меньше — у тех, которые связаны более отдаленно. Чем менее хорошо сохранен фермент, тем больше различий аминокислот будет присутствовать даже у близкородственных видов. [3]