Афтавирус (от греч. aphtha -, пузырьки во рту) - вирусный род семейства Picornaviridae . Афтавирусы поражают раздвоенных копытных животных и включают в себя возбудителя ящура , вирус ящура (FMDV). [1] Существует семь серотипов FMDV : A, O, C, SAT 1, SAT 2, SAT 3 и Asia 1, и четыре не-FMDV серотипа, принадлежащие к трем дополнительным видам: вирус ринита быков А (BRAV), вирус ринита быков В (BRBV) и вирус ринита лошадей А (ERAV).
Афтовирусы не имеют оболочки и имеют икосаэдрический капсид диаметром около 27–30 нм. [2] Собранный вирусный капсид содержит одну копию генома РНК и 60 копий четырех вирусных капсидных белков VP1, VP2, VP3 и VP4. Протомеры образуют стороны икосаэдрического капсида. Белок VP4 является внутренним. [3]
Афтавирусы отличаются от других пикорнавирусов тем, что имеют более крупный геном (7,5–8,5 килобаз ). [2] Геном не сегментирован и состоит из одноцепочечной РНК с положительным смыслом . Он содержит одну открытую рамку считывания с белком, связанным с 5'-концом ( VPg ), который связан с геномом через фосфодиэфирную связь , связанную с остатком тирозина . [3] 5'-нетранслируемая область ( UTR) генома содержит поли(C)-тракт и внутренний сайт входа рибосомы (IRES), в то время как 3'-UTR полиаденилирована . [4] Область P1 кодирует структурные белки. Области P2 и P3 кодируют неструктурные белки , связанные с репликацией. [3]
Афтовирусы реплицируются так же, как и все пикорнавирусы . Репликация цитоплазматическая и изначально включает прикрепление экзогенного вируса к клеточной мембране. Прикрепление к мембране и последующее проникновение в клетку опосредовано мембранным рецептором. После репликации генома в цитоплазме происходит сборка вирионов, и новые вирусные частицы агрегируются внутри клетки. Высвобождение вирусных частиц опосредовано лизисом клетки . [1]
Геном РНК афтовируса способен подвергаться генетической рекомбинации . [5] Рекомбинация происходит в большом количестве геномных участков, что указывает на то, что рекомбинация РНК у афтовируса является общим, а не сайт-специфическим явлением. [6]
Афтавирусы включают возбудителей ящура (FMD), который в первую очередь поражает домашний скот, такой как крупный рогатый скот, свиньи, овцы и козы. Ящур был впервые обнаружен в Италии в XVI веке. С тех пор распространенность заболевания сохраняется, несмотря на то, что многие страны были объявлены свободными от ящура. Эндемичные регионы заболевания включают районы Африки, Азии и Южной Америки. Вирус обычно сохраняется в кормах для животных и способен выживать в окружающей среде до одного месяца. Искоренение ящура в эндемичных районах было сложным, несмотря на наличие вакцины . [ 1]
Вирус ринита лошадей А (ERAV) был впервые выделен у лошадей в 1960-х и 1970-х годах, проявляя признаки острого лихорадочного респираторного заболевания, включая лихорадку, кашель, прозрачные выделения из носа и летаргию. Учитывая его сходство с простудой у людей (вызванной другим пикорнавирусом, риновирусом), ERAV изначально был назван «риновирусом лошадей 1». Современные методы молекулярной биологии, такие как секвенирование нуклеотидов, продемонстрировали, что ERAV на самом деле более тесно связан с FMDV, и был переклассифицирован в род Aphthovirus . [7]