stringtranslate.com

Базальный западноафриканский

Базальная западноафриканская линия происхождения [1] [2] больше не существует. [3]

История

Используя западных африканцев (например, эсан из Нигерии , менде из Сьерра-Леоне , западных гамбийцев ), расхождение группы ранних современных или архаичных людей, насчитывающей около 25 000 или от 23 000 до 27 000 человек, от последнего общего предка народа сан и всех других современных людей или людей и неандертальцев , приблизительно произошло между 1 020 000 и 360 000 лет назад. [4] Между 124 000 и 0 лет назад 2% - 19% генов могли интрогрессировать в предков современных западных африканцев в результате смешения с этой архаичной человеческой популяцией. [4] Современные западные африканцы (например, йоруба из Ибадана , Нигерия, менде из Сьерра-Леоне) могут иметь больше предков из этой линии в результате их происхождения от базальных западных африканцев. [4] [5] Это же исследование также предполагает, что по крайней мере часть этой архаичной примеси также присутствует у евразийцев/неафриканцев, и что событие или события примеси варьируются от 0 до 124 тыс. лет назад, что включает период до миграции из Африки и до африканского/евразийского разделения (таким образом, частично затрагивая общих предков как африканцев, так и евразийцев/неафриканцев). [6] [7] [8] Чен и др. (2020) обнаружили, что африканцы имеют более высокое неандертальское происхождение, чем считалось ранее. 2504 африканских образца со всей Африки были проанализированы и проверены на неандертальское происхождение. Все африканские образцы показали наличие незначительного неандертальского происхождения, но всегда на более низком уровне, чем у евразийцев. [9]

Даже до 300 000–200 000 лет до нашей эры, когда предки современных сан отделились от других современных людей, группой, которая отделилась от современных людей раньше всех , могли быть базальные западноафриканцы. [10] Тем не менее, базальные западноафриканцы не разделились до того, как неандертальцы отделились от современных людей. [10]

Западноафриканские охотники-собиратели, койсаны и тафоральты

В то время как менее простое моделирование (без базальных западноафриканских народов) для предков собирателей Шум Лака было составлено из древних тафоральтов из иберомаврийской культуры и современных западноафриканцев, среди других типов моделирования , одно из них смоделировало предков собирателей Шум Лака как 65% базальных западноафриканских и 35% западноафриканских охотников-собирателей из западной части Центральной Африки . [11] Однако у современных охотников-собирателей Камеруна базальные западноафриканские предки отсутствуют . [11]

Народы южной Африки (например, койсаны ), которые по происхождению ближе к народам Восточной Африки, более далеки по происхождению от народов Западной Африки. [1] [2] Споря с моделью, которая поддерживает южных африканцев как самую раннюю группу, отделившуюся от современных людей, базальные западноафриканцы, как гипотетическая линия, поддерживают две модели равной вероятности — ранняя базальная группа из Восточной Африки, которая была частью древней генетической структуры в Африке, является частью современного происхождения современных западных африканцев (например, йоруба, менде) или смешанное происхождение современных западных африканцев (например, йоруба, менде) является результатом ранних миграционных базальных групп из разных частей Африки (например, Юго-Восточной Африки , Западной Африки ). [1] [2]

Помимо сходства с остатками более базальной африканской линии, распространенной к югу от Сахары (например, базальной западноафриканской линией, распространенной между народами йоруба и менде), [10] [12] африканская ДНК к югу от Сахары в тафоральтах иберомаврийской культуры может быть лучше всего представлена ​​современными западноафриканцами (например, йоруба). [ 12]

Потомки

Народы йоруба и менде происходят от базальных западноафриканцев и другого набора предков, родственных восточноафриканцам и неафриканцам, что свидетельствует о миграции из Восточной Африки . [10] У народа йоруба меньше предков от базальных западноафриканцев, чем у народа менде, [10] у которого большая доля предков. [13] Более конкретно, у народа йоруба 9% базальных западноафриканских предков, а у народа менде 13% базальных западноафриканских предков. [3]

Ссылки

  1. ^ abc Capelli, Cristian; Montinaro, Francesco (24 октября 2018 г.). «Генетика и история Южной Африки». Oxford Research Encyclopedia of African History . Oxford University Research Archive. стр. 7. doi : 10.1093/acrefore/9780190277734.013.446. ISBN 978-0-19-027773-4. S2CID  134983982.
  2. ^ abc Монтинаро, Франческо; Капелли, Кристиан (2018). «Эволюционная история Южной Африки». Current Opinion in Genetics & Development . 53 : 160. doi : 10.1016/j.gde.2018.11.003. PMID  30522870. S2CID  54483869.
  3. ^ ab Видал, Жерар Серра (2018). «Взгляд на историю демографии человека в Африке посредством анализа последовательности всего генома» (PDF) . Университет Помпеу Фабра, Барселона. стр. 162. S2CID  108974583.
  4. ^ abc Дурвасула, Арун; Санкарараман, Шрирам (2020). «Восстановление сигналов архаичной интрогрессии призраков в африканских популяциях». Science Advances . 6 (7) : eaax5097. Bibcode : 2020SciA....6.5097D. doi : 10.1126/sciadv.aax5097. ISSN  2375-2548. OCLC  8538353312. PMC 7015685. PMID  32095519. S2CID  211472946. 
  5. ^ Сирак, Кендра А.; Савчук, Элизабет А.; Прендергаст, Мэри Э. (18 мая 2022 г.). «ДНК древнего человека и история населения Африки» (PDF) . Oxford Research Encyclopedia of African History . Oxford University Press. стр. 10–11.
  6. ^ Дурвасула А, Санкарараман С (февраль 2020 г.). «Восстановление сигналов архаичной интрогрессии призраков в африканских популяциях». Science Advances . 6 (7): eaax5097. Bibcode : 2020SciA....6.5097D. doi : 10.1126/sciadv.aax5097 . PMC 7015685. PMID  32095519 . «Неафриканские популяции (китайцы хань в Пекине и жители Юты с северо- и западноевропейским происхождением) также демонстрируют аналогичные закономерности в CSFS, что говорит о том, что компонент архаичного происхождения был общим до разделения африканских и неафриканских популяций... Одной из интерпретаций недавнего времени интрогрессии, которое мы документируем, является то, что архаичные формы сохранялись в Африке до сравнительно недавнего времени. С другой стороны, архаичная популяция могла интрогрессировать ранее в современную человеческую популяцию, которая затем впоследствии скрещивалась с предками популяций, которые мы здесь анализировали. Модели, которые мы здесь исследовали, не являются взаимоисключающими, и вполне вероятно, что история африканских популяций включает генетический вклад от нескольких дивергентных популяций, о чем свидетельствует большой эффективный размер популяции, связанный с интрогрессирующей архаичной популяцией... Учитывая неопределенность в наших оценках времени интрогрессии, мы задались вопросом, можно ли совместно анализировать CSFS как из CEU (жители Юты с северо- и западноевропейским происхождением), так и Геномы YRI могли бы обеспечить дополнительное разрешение. В рамках модели C мы смоделировали интрогрессию до и после разделения между африканскими и неафриканскими популяциями и наблюдали качественные различия между двумя моделями в высокочастотных производных аллельных ячейках CSFS в африканских и неафриканских популяциях (рис. S40). Используя ABC для совместного подбора высокочастотных производных аллельных ячейках CSFS в CEU и YRI (определяемых как частота более 50%), мы обнаружили, что нижний предел 95% достоверного интервала времени интрогрессии старше, чем смоделированное разделение между CEU и YRI (2800 против 2155 поколений BP), что указывает на то, что по крайней мере часть архаичных линий, наблюдаемых в YRI, также разделяется с CEU..."
  7. ^ [1] Архивировано 7 декабря 2020 г. в разделе Wayback Machine Supplementary Materials for Recovering signals of ghost archaic introgression in African populations", раздел "S8.2" "Мы смоделировали данные, используя те же априорные данные в разделе S5.2, но вычислили спектр как для YRI [западноафриканский йоруба], так и для CEU [популяция европейского происхождения]. Мы обнаружили, что наилучшими параметрами соответствия были архаичное время разделения 27 000 поколений назад (95% HPD: 26 000-28 000), доля примеси 0,09 (95% HPD: 0,04-0,17), время примеси 3 000 поколений назад (95% HPD: 2 800-3 400) и эффективный размер популяции 19 700 особей (95% HPD: 19 300-20 200). Мы обнаружили, что нижняя граница времени примеси находится дальше назад, чем смоделированный раздел между CEU и YRI (2 155 поколений назад), что дает некоторые доказательства в пользу события до выхода из Африки. Эта модель предполагает, что многие популяции за пределами Африки также должны содержать гаплотипы из этого интрогрессивного события, хотя обнаружение затруднено, поскольку многие методы используют несмешанные внешние группы для обнаружения интрогрессивных гаплотипов [Browning et al., 2018, Skov et al., 2018, Durvasula and Sankararaman, 2019] (5, 53, 22). Также возможно, что некоторые из этих гаплотипов были утеряны во время бутылочного горлышка из Африки».
  8. ^ Дурвасула А, Санкарараман С (февраль 2020 г.). «Восстановление сигналов архаичной интрогрессии призраков в африканских популяциях». Science Advances . 6 (7): eaax5097. Bibcode : 2020SciA....6.5097D. doi : 10.1126/sciadv.aax5097. PMC 7015685. PMID  32095519 . 
  9. ^ Chen L, Wolf AB, Fu W, Li L, Akey JM (февраль 2020 г.). «Определение и интерпретация очевидного неандертальского происхождения у африканских людей». Cell . 180 (4): 677–687.e16. doi : 10.1016/j.cell.2020.01.012 . PMID  32004458. S2CID  210955842.
  10. ^ abcde Скоглунд, Понтус; и др. (2017). «Реконструкция структуры доисторического африканского населения». Cell . 171 (1): 59–71.e21. doi :10.1016/j.cell.2017.08.049. ISSN  0092-8674. OCLC  7144495602. PMC 5679310 . PMID  28938123. S2CID  1257429. 
  11. ^ ab Lipson, Mark; et al. (2020). «Древние западноафриканские собиратели в контексте истории африканского населения». Nature . 577 (7792): 668–669. Bibcode :2020Natur.577..665L. doi :10.1038/s41586-020-1929-1. ISSN  0028-0836. OCLC  8516105991. PMC 8386425 . PMID  31969706. S2CID  210862788. 
  12. ^ ab Jeong, Choongwon (2020). «Текущие тенденции в изучении древней ДНК: за пределами человеческой миграции в Европе и вокруг нее». Справочник по изучению мумий: новые рубежи в научных и культурных перспективах . Springer Nature. стр. 6. doi :10.1007/978-981-15-1614-6_10-1. ISBN 978-981-15-1614-6. OCLC  1182512815. S2CID  226555687.
  13. ^ Вонкам, Амбруаз и др. (2022). «Секвенирование экзома семей из Ганы выявляет известные и потенциальные гены нарушения слуха». Communications Biology . 5 (1): 369. doi :10.1038/s42003-022-03326-8. OCLC  9478623435. PMC 9019055 . PMID  35440622. S2CID  248264573.