stringtranslate.com

Роп-протеин

Rop (также известный как репрессор праймера или модулятор РНК один ( ROM )) — небольшой димерный белок, отвечающий за поддержание низкого числа копий семейства ColE1 и родственных бактериальных плазмид в E. coli за счет увеличения скорости спаривания между препраймерной РНК, РНК II, и ее антисмысловой РНК , РНК I. [1] Структурно Rop представляет собой гомодимерный белок с четырьмя спиралями, образованный антипараллельным взаимодействием двух мономеров спираль-поворот-спираль . Структура белка Rop была решена с высоким разрешением. [2] Благодаря своему небольшому размеру и известной структуре Rop использовался в работе по проектированию белков для перестройки его спиральной топологии и реинжиниринга его петлевых областей. [3] В целом, четырехспиральный пучок широко использовался в работе по проектированию белков de novo в качестве простой модели для понимания взаимосвязи между аминокислотной последовательностью и структурой.

Контроль репликации ColE1
Контроль репликации ColE1

Внешние ссылки

Ссылки

  1. ^ del Solar G, Espinosa M (август 2000 г.). «Контроль числа копий плазмиды: постоянно растущая история». Молекулярная микробиология . 37 (3): 492–500. doi : 10.1046/j.1365-2958.2000.02005.x . PMID  10931343.
  2. ^ Баннер, Дэвид В.; Коккинидис, Майкл; Церноглу, Деметриус (август 1987 г.). «Структура белка ColE1 Rop при разрешении 1,7 Å». Журнал молекулярной биологии . 196 (3): 657–675. doi :10.1016/0022-2836(87)90039-8. PMID  3681971.
  3. ^ Крессе, HP; Чубайко, M.; Ньякатура, G.; Вринд, G.; Сандер, C.; Блёкер, H. (1 ноября 2001 г.). «Реинжиниринг топологии пучка из четырех спиралей: варианты мономерного белка Rop с различным расположением петель». Protein Engineering Design and Selection . 14 (11): 897–901. doi :10.1093/protein/14.11.897. PMID  11742109.