stringtranslate.com

Бесклеточная фетальная ДНК

Внеклеточная фетальная ДНК ( cffDNA ) — это фетальная ДНК , которая свободно циркулирует в материнской крови . Материнская кровь берется путем венепункции . Анализ cffDNA — это метод неинвазивной пренатальной диагностики, часто назначаемый беременным женщинам старшего материнского возраста . Через два часа после родов cffDNA больше не обнаруживается в материнской крови.

Фон

Бесклеточная ДНК плода попадает в материнский кровоток.

cffDNA происходит из плацентарных трофобластов . [1] [2] Фетальная ДНК фрагментируется, когда плацентарные микрочастицы попадают в материнский кровоток . [ 3]

Фрагменты cffDNA имеют длину около 200 пар оснований (пн). Они значительно меньше фрагментов материнской ДНК . [4] Разница в размерах позволяет отличить cffDNA от фрагментов материнской ДНК. [5] [6]

Примерно от 11 до 13,4 процентов бесклеточной ДНК в материнской крови имеет фетальное происхождение. Количество сильно варьируется от одной беременной женщины к другой. [7] cffDNA присутствует после пяти-семи недель беременности. Количество cffDNA увеличивается по мере развития беременности. [8] Количество cffDNA в материнской крови быстро уменьшается после родов. Через два часа после родов cffDNA больше не обнаруживается в материнской крови. [9]

Анализ cffDNA может обеспечить более раннюю диагностику состояний плода, чем существующие методы. Поскольку cffDNA обнаруживается в материнской крови, отбор проб не несет в себе никакого риска самопроизвольного аборта . [10] [11] [12] [13] [14] Анализ cffDNA имеет те же этические и практические проблемы , что и другие методы, такие как амниоцентез и проба ворсин хориона . [15]

Некоторые недостатки отбора проб cffDNA включают низкую концентрацию cffDNA в материнской крови; вариации в количестве cffDNA между индивидуумами; высокую концентрацию свободной от клеток ДНК матери по сравнению с cffDNA в материнской крови. [16]

Новые данные показывают, что частота неудачных тестов cffDNA выше, фетальная фракция (пропорция фетальной ДНК по сравнению с материнской в ​​образце материнской крови) ниже, а PPV для трисомий 18, 13 и SCA снижена при беременностях, полученных с помощью ЭКО, по сравнению с теми, которые были зачаты спонтанно. [ необходимо разъяснение ] [17]

Лабораторные методы

Разработан ряд лабораторных методов для бесклеточного скрининга фетальной ДНК на генетические дефекты. Основными из них являются (1) массивное параллельное секвенирование дробовика (MPSS), (2) целевое массивное параллельное секвенирование (t-MPS) и (3) подход на основе однонуклеотидного полиморфизма (SNP). [18] [19] [20]

Образец периферической крови матери берется путем венесекций примерно на десятой неделе беременности. [21]

Разделение cffDNA

Плазма крови отделяется от образца материнской крови с помощью лабораторной центрифуги . Затем cffDNA изолируется и очищается. [22] Стандартизированный протокол для этого был написан путем оценки научной литературы . Самый высокий выход при извлечении cffDNA был получен с помощью «QIAamp DSP Virus Kit». [23]

Добавление формальдегида к образцам материнской крови увеличивает выход cffDNA. Формальдегид стабилизирует неповрежденные клетки и, следовательно, подавляет дальнейшее высвобождение материнской ДНК. При добавлении формальдегида процент cffDNA, извлеченной из образца материнской крови, варьируется от 0,32 до 40 процентов, со средним значением 7,7 процента. [24] Без добавления формальдегида средний процент извлеченной cffDNA был измерен на уровне 20,2 процента. Однако другие цифры варьируются от 5 до 96 процентов. [25] [26]

Восстановление cffDNA может быть связано с длиной фрагментов ДНК. Другой способ увеличения фетальной ДНК основан на физической длине фрагментов ДНК. Более мелкие фрагменты могут составлять до семидесяти процентов от общей свободной от клеток ДНК в образце материнской крови. [ необходима цитата ]

Анализ cffDNA

В ПЦР в реальном времени флуоресцентные зонды используются для мониторинга накопления ампликонов . Сигнал флуоресценции репортера пропорционален количеству сгенерированных ампликонов. Наиболее подходящий протокол ПЦР в реальном времени разрабатывается в соответствии с конкретной мутацией или генотипом, которые необходимо обнаружить. Точечные мутации анализируются с помощью качественной ПЦР в реальном времени с использованием аллель- специфических зондов. Вставки и делеции анализируются путем измерения дозировки с использованием количественной ПЦР в реальном времени. [ необходима цитата ]

cffDNA может быть обнаружена путем поиска унаследованных от отца последовательностей ДНК с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). [27] [28]

Количественная ПЦР в реальном времени

Ген Y-области определения пола (SRY) и короткий тандемный повтор Y-хромосомы "DYS14" в cffDNA от 511 беременностей были проанализированы с помощью количественной ПЦР в реальном времени (RT-qPCR). В 401 из 403 беременностей, когда кровь у матери брали на седьмой неделе беременности или более, были обнаружены оба сегмента ДНК. [29]

Вложенная ПЦР

Использование гнездовой полимеразной цепной реакции (гнездовой ПЦР) было оценено для определения пола путем обнаружения специфического сигнала Y-хромосомы в cffDNA из материнской плазмы. Вложенная ПЦР обнаружила 53 из 55 плодов мужского пола. cffDNA из плазмы 3 из 25 женщин с плодами женского пола содержала специфичный для Y-хромосомы сигнал. Чувствительность гнездовой ПЦР в этом эксперименте составила 96 процентов. Специфичность составила 88 процентов. [30]

Цифровая ПЦР

Микрофлюидные устройства позволяют количественно определять сегменты cffDNA в плазме матери с точностью, превышающей точность ПЦР в реальном времени. Точечные мутации , потеря гетерозиготности и анеуплоидия могут быть обнаружены за один шаг ПЦР. [31] [32] [33] Цифровая ПЦР может различать плазму крови матери и ДНК плода мультиплексным способом . [31]

Последовательность выстрелов дробовиком

Высокопроизводительное дробовое секвенирование с использованием таких инструментов, как Solexa или Illumina, дает около 5 миллионов меток последовательностей на образец материнской сыворотки. Анеуплоидные беременности, такие как трисомия, были выявлены при тестировании на четырнадцатой неделе беременности. Картирование всего генома плода с помощью анализа родительского гаплотипа было завершено с использованием секвенирования cffDNA из материнской сыворотки. [13] Беременные самки были изучены с использованием 2-плексного массивно-параллельного секвенирования ДНК материнской плазмы, и трисомия была диагностирована с z-счетом больше 3. [34] Секвенирование дало чувствительность 100 процентов, специфичность 97,9 процента, положительную прогностическую ценность 96,6 процента и отрицательную прогностическую ценность 100 процентов. [ необходима цитата ]

Масс-спектрометрия

Лазерная десорбция/ионизация с помощью матрицы - времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) в сочетании с одноосновным расширением после ПЦР позволяет обнаруживать cffDNA с одноосновной специфичностью и одноосновной чувствительностью молекулы ДНК. [35] ДНК амплифицируется с помощью ПЦР. Затем линейная амплификация с реакцией расширения оснований (с третьим праймером) предназначена для отжига в области выше по течению от места мутации . К праймеру расширения добавляют одно или два основания для получения двух продуктов расширения из ДНК дикого типа и мутантной ДНК. Одноосновная специфичность обеспечивает преимущества по сравнению с методами, основанными на гибридизации, с использованием зондов гидролиза TaqMan . При оценке метода не было обнаружено ложноположительных или отрицательных результатов при поиске cffDNA для определения пола плода в шестнадцати образцах материнской плазмы. [35] Пол девяносто одного плода мужского пола был правильно определен с помощью масс-спектрометрии MALDI-TOF. Метод имел точность, чувствительность и специфичность более 99 процентов. [36]

Эпигенетические модификации

Различия в активации генов между материнской и фетальной ДНК могут быть использованы. Эпигенетические модификации (наследственные модификации, которые изменяют функцию гена без изменения последовательности ДНК) могут быть использованы для обнаружения cffDNA. [ 37] [38] Гиперметилированный промотор RASSF1 A является универсальным фетальным маркером, используемым для подтверждения наличия cffDNA. [39] Была описана методика, при которой cffDNA извлекалась из материнской плазмы, а затем расщеплялась чувствительными и нечувствительными к метилированию рестрикционными ферментами . Затем был проведен анализ ПЦР в реальном времени RASSF1A, SRY и DYS14. [39] Процедура выявила 79 из 90 (88 процентов) образцов материнской крови, в которых присутствовал гиперметилированный RASSF1A. [ необходима цитата ]

мРНК

Транскрипты мРНК из генов, экспрессируемых в плаценте, обнаруживаются в материнской плазме. [40] В этой процедуре плазма центрифугируется, так что появляется водный слой. Этот слой переносится, и из него извлекается РНК . ОТ-ПЦР используется для обнаружения выбранной экспрессии РНК. Например, мРНК человеческого плацентарного лактогена (hPL) и бета-hCG стабильны в материнской плазме и могут быть обнаружены. (Ng et al. 2002). Это может помочь подтвердить наличие cffDNA в материнской плазме. [16]

Приложения

Пренатальное распознавание пола

Анализ cffDNA из образца материнской плазмы позволяет проводить пренатальное распознавание пола . Приложения пренатального распознавания пола включают:

По сравнению с акушерским УЗИ , которое ненадежно для определения пола в первом триместре, и амниоцентезом, который несет небольшой риск выкидыша , взятие проб материнской плазмы для анализа cffDNA не представляет риска. [42] Основными целями анализа cffDNA являются ген, отвечающий за белок Y-области определения пола (SRY) на хромосоме Y и последовательность DYS14. [43] [44]

Врожденная гиперплазия надпочечников

При врожденной гиперплазии надпочечников кора надпочечников не синтезирует соответствующие кортикостероиды, что приводит к избытку надпочечниковых андрогенов и влияет на плоды женского пола. [45] У плодов женского пола наблюдается внешняя маскулинизация гениталий. [46] Матерям плодов из группы риска назначают дексаметазон на 6 неделе беременности для подавления высвобождения андрогенов гипофизом . [47]

Если анализ cffDNA, полученный из образца материнской плазмы, не обнаруживает генетических маркеров, обнаруженных только на хромосоме Y, это указывает на женский пол плода. Однако это может также указывать на неудачу самого анализа (ложноотрицательный результат). Для обнаружения cffDNA можно использовать отцовские генетические полиморфизмы и независимые от пола маркеры. Для этого применения должна присутствовать высокая степень гетерозиготности этих маркеров. [48]

Тест на отцовство

Пренатальный ДНК-тест на отцовство доступен в продаже. Тест можно провести на девятой неделе беременности. [ необходима цитата ]

Заболевания отдельных генов

Аутосомно-доминантные и рецессивные моногенные заболевания, которые были диагностированы пренатально путем анализа ДНК, унаследованной от отца, включают муковисцидоз , бета-талассемию , серповидноклеточную анемию , спинальную мышечную атрофию и миотоническую дистрофию . [27] [43] Пренатальная диагностика моногенных заболеваний, которые вызваны аутосомно-рецессивной мутацией, материнской унаследованной аутосомно-доминантной мутацией или крупными мутациями последовательностей, которые включают дупликацию, расширение или вставку последовательностей ДНК, более сложна. [49]

В cffDNA фрагменты длиной 200–300 п.н., связанные с нарушениями одного гена, обнаружить сложнее. [ необходима цитата ]

Например, аутосомно-доминантное заболевание, ахондроплазия, вызывается точечной мутацией гена FGFR3. [50] В двух беременностях с плодом с ахондроплазией была обнаружена отцовская унаследованная мутация G1138A из cffDNA из образца материнской плазмы у одной и мутация G1138A de novo у другой. [50]

В исследованиях генетики хореи Гентингтона с использованием ОТ-ПЦР cffDNA из образцов материнской плазмы повторы CAG были обнаружены на нормальном уровне (17, 20 и 24). [51]

cffDNA также может использоваться для диагностики нарушений одного гена . [15] Развитие лабораторных процессов с использованием cffDNA может позволить проводить пренатальную диагностику анеуплоидий , таких как трисомия 21 (синдром Дауна) у плода. [52] [32]

Гемолитическая болезнь плода и новорожденного

Несовместимость антигенов RhD плода и матери является основной причиной гемолитической болезни новорожденных . [53] Примерно 15 процентов женщин белой расы , от 3 до 5 процентов женщин чернокожей Африки и менее 3 процентов женщин азиатской расы имеют отрицательный RhD. [54]

Точная пренатальная диагностика важна, поскольку заболевание может быть смертельным для новорожденного, а матерям из группы риска может быть назначено лечение, включающее внутримышечный иммуноглобулин (анти-D) или внутривенный иммуноглобулин . [55]

ПЦР для обнаружения гена RHD (ген) экзонов 5 и 7 из cffDNA, полученной из материнской плазмы между 9 и 13 неделями беременности, дает высокую степень специфичности, чувствительности и диагностической точности (>90 процентов) по сравнению с определением RhD из сыворотки пуповинной крови новорожденного . [53] Аналогичные результаты были получены при определении экзонов 7 и 10. [56] Капельная цифровая ПЦР при определении RhD плода была сопоставима с обычной методикой ПЦР в реальном времени. [57]

Рутинное определение резус-фактора плода с помощью cffDNA в сыворотке крови матери позволяет проводить раннее ведение беременностей с высоким риском, одновременно снижая ненужное использование анти-D более чем на 25 процентов. [58]

Анеуплоидия

Половые хромосомы

Анализ cffDNA материнской сыворотки методом высокопроизводительного секвенирования может обнаружить распространенные анеуплоидии половых хромосом плода, такие как синдром Тернера , синдром Клайнфельтера и синдром трисомии X, но положительная прогностическая ценность процедуры низкая. [59]

Пример алгоритма определения показаний к пренатальному генетическому тестированию на трисомию 21 ( синдром Дауна ), при котором генетический анализ крови (в центре) выполняется путем обнаружения cffDNA в образце крови матери. [60]
Трисомия 21

Трисомия плода по хромосоме 21 является причиной синдрома Дауна. Эту трисомию можно обнаружить с помощью анализа cffDNA из материнской крови методом массивного параллельного дробового секвенирования (MPSS). [61] Другой метод — цифровой анализ выбранных регионов (DANSR). [61] Такие тесты показывают чувствительность около 99% и специфичность более 99,9%. Поэтому их нельзя рассматривать как диагностические процедуры, но их можно использовать для подтверждения положительного скринингового теста матери, такого как скрининг первого триместра или ультразвуковые маркеры состояния. [61] [62]

Трисомия 13 и 18

Возможен анализ cffDNA из материнской плазмы с MPSS для поиска трисомии 13 или 18 [63]

Факторы, ограничивающие чувствительность и специфичность, включают уровни cffDNA в материнской плазме; материнские хромосомы могут иметь мозаицизм . [64]

Можно обнаружить ряд молекул нуклеиновых кислот плода, полученных из анеуплоидных хромосом, включая мРНК SERPINEB2, clad B, гипометилированный SERPINB5 из хромосомы 18, плацента-специфическую 4 (PLAC4), гиперметилированную синтетазу голокарбоксилазы (HLCS) и мРНК c21orf105 из хромосомы 12. [65] При полной трисомии аллели мРНК в материнской плазме не соответствуют нормальному соотношению 1:1, а фактически составляют 2:1. Аллельные соотношения, определяемые эпигенетическими маркерами, также можно использовать для обнаружения полных трисомий. Массовое параллельное секвенирование и цифровую ПЦР для обнаружения анеуплоидии плода можно использовать без ограничений для молекул нуклеиновых кислот, специфичных для плода. (MPSS) оценивается как имеющая чувствительность от 96 до 100% и специфичность от 94 до 100% для обнаружения синдрома Дауна. Его можно проводить на 10 неделе гестационного возраста . [66] В одном исследовании, проведенном в Соединенных Штатах, была оценена частота ложноположительных результатов в 0,3% и положительная прогностическая ценность в 80% при использовании cffDNA для выявления синдрома Дауна. [67]

Преэклампсия

Преэклампсия — это сложное состояние беременности, включающее гипертензию и протеинурию, обычно после 20 недель беременности. [68] Оно связано с плохой цитотрофобластической инвазией миометрия . Начало состояния между 20 и 34 неделями беременности считается «ранним». [69] Образцы материнской плазмы при беременности, осложненной преэклампсией, имеют значительно более высокие уровни cffDNA, чем при нормальной беременности. [70] [71] [72] Это справедливо и для ранней преэклампсии. [69]

История

В 1997 году доктор Юк Минг Деннис Ло вместе со своей командой впервые применил анализ Y-ПЦР для идентификации последовательностей хромосомы Y плода (поскольку Y-специфические последовательности являются генетическими последовательностями плода, а не материнского генома [73] ) в образцах материнской плазмы. [74] За эту новаторскую работу он был удостоен премии Lasker DeBakey Clinical Medical Research Award 2022. [75]

Перспективы на будущее

Секвенирование нового поколения может быть использовано для получения последовательности целого генома из cffDNA. Это поднимает этические вопросы. [76] Однако полезность процедуры может возрасти, поскольку будут обнаружены четкие ассоциации между определенными генетическими вариантами и состояниями болезни. [77] [78]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Alberry M, Maddocks D, Jones M, Abdel Hadi M, Abdel-Fattah S, Avent N, Soothill PW (май 2007 г.). «Свободная фетальная ДНК в материнской плазме при анэмбриональных беременностях: подтверждение того, что источником является трофобласт». Пренатальная диагностика . 27 (5). Wiley-Blackwell: 415–8. doi :10.1002/pd.1700. PMID  17286310. S2CID  39693586.
  2. ^ Gupta AK, Holzgreve W, Huppertz B, Malek A, Schneider H, Hahn S (ноябрь 2004 г.). «Обнаружение фетальной ДНК и РНК в микрочастицах синцитиотрофобласта, полученных из плаценты, полученных in vitro». Клиническая химия . 50 (11). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 2187–90. doi : 10.1373/clinchem.2004.040196 . PMID  15502097.
  3. ^ Сметс Э.М., Виссер А., Го АТ, ван Вугт Дж.М., Оудейанс CB (февраль 2006 г.). «Новые биомаркеры преэклампсии». Клиника Химика Акта; Международный журнал клинической химии . 364 (1–2). Эльзевир Б.В.: 22–32. doi : 10.1016/j.cca.2005.06.011. ПМИД  16139262.
  4. ^ Chan KC, Zhang J, Hui AB, Wong N, Lau TK, Leung TN, Lo KW, Huang DW, Lo YM (январь 2004 г.). «Распределение размеров материнской и фетальной ДНК в материнской плазме». Клиническая химия . 50 (1). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 88–92. doi : 10.1373/clinchem.2003.024893 . PMID  14709639.
  5. ^ Li Y, Zimmermann B, Rusterholz C, Kang A, Holzgreve W, Hahn S (июнь 2004 г.). «Разделение циркулирующей ДНК в плазме матери по размеру позволяет легко обнаружить полиморфизмы фетальной ДНК» (PDF) . Клиническая химия . 50 (6). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 1002–11. doi : 10.1373/clinchem.2003.029835 . PMID  15073090.
  6. ^ Li Y, Di Naro E, Vitucci A, Zimmermann B, Holzgreve W, Hahn S (февраль 2005 г.). «Обнаружение отцовски унаследованных фетальных точечных мутаций при бета-талассемии с использованием фракционированной по размеру бесклеточной ДНК в материнской плазме». JAMA . 293 (7). Американская медицинская ассоциация (AMA): 843–9. doi : 10.1001/jama.293.7.843 . PMID  15713774.
  7. ^ Wang E, Batey A, Struble C, Musci T, Song K, Oliphant A (июль 2013 г.). «Влияние гестационного возраста и веса матери на внеклеточную ДНК плода в плазме матери». Пренатальная диагностика . 33 (7): 662–6. doi : 10.1002/pd.4119 . PMID  23553731. S2CID  31630351.
  8. ^ Lo YM, Tein MS, Lau TK, Haines CJ, Leung TN, Poon PM, Wainscoat JS, Johnson PJ, Chang AM, Hjelm NM (апрель 1998 г.). «Количественный анализ фетальной ДНК в материнской плазме и сыворотке: значение для неинвазивной пренатальной диагностики». American Journal of Human Genetics . 62 (4). Elsevier BV: 768–75. doi :10.1086/301800. PMC 1377040 . PMID  9529358. 
  9. ^ Lo YM, Zhang J, Leung TN, Lau TK, Chang AM, Hjelm NM (январь 1999). «Быстрая очистка фетальной ДНК от материнской плазмы». American Journal of Human Genetics . 64 (1). Elsevier BV: 218–24. doi :10.1086/302205. PMC 1377720. PMID  9915961 . 
  10. ^ Lo YM, Hjelm NM, Fidler C, Sargent IL, Murphy MF, Chamberlain PF, Poon PM, Redman CW, Wainscoat JS (декабрь 1998 г.). «Пренатальная диагностика резус-фактора плода с помощью молекулярного анализа материнской плазмы». The New England Journal of Medicine . 339 (24). New England Journal of Medicine (NEJM/MMS): 1734–8. doi : 10.1056/nejm199812103392402 . PMID  9845707.
  11. ^ Allyse M, Sayres LC, King JS, Norton ME, Cho MK (ноябрь 2012 г.). «Тестирование бесклеточной фетальной ДНК на анеуплоидию плода и далее: проблемы клинической интеграции в контексте США». Human Reproduction . 27 (11). Oxford University Press (OUP): 3123–31. doi :10.1093/humrep/des286. PMC 3472618 . PMID  22863603. 
  12. ^ Mujezinovic F, Alfirevic Z (сентябрь 2007 г.). «Осложнения, связанные с процедурой амниоцентеза и взятия проб хорионических ворсин: систематический обзор». Акушерство и гинекология . 110 (3). Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health): 687–94. doi :10.1097/01.aog.0000278820.54029.e3. PMID  17766619. S2CID  25548568.
  13. ^ ab Lo YM (август 2008 г.). «Фетальные нуклеиновые кислоты в материнской плазме». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1137 (1). Wiley-Blackwell: 140–3. Bibcode : 2008NYASA1137..140L. doi : 10.1196/annals.1448.004. PMID  18837938. S2CID  3445205.
  14. ^ "Надежная и точная пренатальная неинвазивная диагностика". Проект NHS RAPID . Архивировано из оригинала 2019-03-01 . Получено 2016-07-08 .
  15. ^ ab Hahn S, Chitty LS (апрель 2008 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика: текущая практика и будущие перспективы». Current Opinion in Obstetrics & Gynecology . 20 (2): 146–51. doi :10.1097/GCO.0b013e3282f73349. PMID  18388814. S2CID  7222299.
  16. ^ ab Wright CF, Burton H (22 октября 2008 г.). «Использование бесклеточных фетальных нуклеиновых кислот в материнской крови для неинвазивной пренатальной диагностики». Human Reproduction Update . 15 (1). Oxford University Press (OUP): 139–51. doi : 10.1093/humupd/dmn047 . PMID  18945714.
  17. ^ Ли Т.Дж., Рольник Д.Л., Менезес МА., Макленнан А.С., да Силва Коста Ф. (апрель 2018 г.). «Тестирование бесклеточной фетальной ДНК при одноплодном ЭКО». Репродукция человека . 33 (4): 572–578. doi : 10.1093/humrep/dey033 . PMID  29462319.
  18. ^ Dar P, Shani H, Evans MI (июнь 2016 г.). «Бесклеточная ДНК: сравнение технологий». Clinics in Laboratory Medicine . 36 (2): 199–211. doi :10.1016/j.cll.2016.01.015. PMID  27235906.
  19. ^ Grace MR, Hardisty E, Dotters-Katz SK, Vora NL, Kuller JA (август 2016 г.). «Скрининг бесклеточной ДНК: сложности и проблемы клинической реализации». Obstetrical & Gynecological Survey . 71 (8): 477–87. doi :10.1097/OGX.00000000000000342. PMC 5548289. PMID  27526871 . 
  20. ^ Allen S, Young E, Bowns B (апрель 2017 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика нарушений одного гена». Current Opinion in Obstetrics & Gynecology . 29 (2): 73–79. doi :10.1097/GCO.00000000000000347. PMID  28134670. S2CID  33474139.
  21. ^ Guibert J, Benachi A, Grebille AG, Ernault P, Zorn JR, Costa JM (август 2003 г.). «Кинетика появления гена SRY в материнской сыворотке: обнаружение методом ПЦР в реальном времени на ранних сроках беременности после вспомогательных репродуктивных технологий». Human Reproduction . 18 (8): 1733–6. doi : 10.1093/humrep/deg320 . PMID  12871892.
  22. ^ Chiu RW, Poon LL, Lau TK, Leung TN, Wong EM, Lo YM (сентябрь 2001 г.). «Влияние протоколов обработки крови на количественную оценку фетальной и общей ДНК в материнской плазме». Клиническая химия . 47 (9): 1607–13. doi : 10.1093/clinchem/47.9.1607 . PMID  11514393.
  23. ^ Леглер Т.Дж., Лю З., Мавру А., Финнинг К., Громадникова И., Гальбиати С., Мини С., Хультен М.А., Креа Ф., Олссон М.Л., Мэддокс Д.Г., Хуанг Д., Фишер С.А., Шпренгер-Хаусселс М., Суссан А.А., ван дер Schoot CE (сентябрь 2007 г.). «Отчет семинара по выделению ДНК плода из материнской плазмы». Пренатальная диагностика . 27 (9). Уайли-Блэквелл: 824–9. дои : 10.1002/pd.1783. PMID  17604339. S2CID  38860225.
  24. ^ Dhallan R, Au WC, Mattagajasingh S, Emche S, Bayliss P, Damewood M, Cronin M, Chou V, Mohr M (март 2004 г.). «Методы увеличения процента свободной фетальной ДНК, извлеченной из материнской циркуляции». JAMA . 291 (9). Американская медицинская ассоциация (AMA): 1114–9. doi : 10.1001/jama.291.9.1114 . PMID  14996781.
  25. ^ Беначи А, Ямгнан А, Оливи М, Дюмез И, Готье Э, Коста Дж. М. (январь 2005 г.). «Влияние формальдегида на in vitro пропорцию фетальной ДНК в плазме и сыворотке матери». Клиническая химия . 51 (1). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 242–4. doi : 10.1373/clinchem.2004.038125 . PMID  15514098.
  26. ^ Chinnapapagari SK, Holzgreve W, Lapaire O, Zimmermann B, Hahn S (март 2005 г.). «Обработка образцов материнской крови формальдегидом не изменяет долю циркулирующих фетальных нуклеиновых кислот (ДНК и мРНК) в материнской плазме». Клиническая химия . 51 (3). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 652–5. doi : 10.1373/clinchem.2004.042119 . PMID  15738521.
  27. ^ ab Traeger-Synodinos J (2006). "ПЦР в реальном времени для пренатальной и преимплантационной генетической диагностики моногенных заболеваний". Молекулярные аспекты медицины . 27 (2–3). Elsevier BV: 176–91. doi :10.1016/j.mam.2005.12.004. PMID  16430951.
  28. ^ Boon EM, Schlecht HB, Martin P, Daniels G, Vossen RH, den Dunnen JT, Bakker B, Elles R (октябрь 2007 г.). «Обнаружение Y-хромосомы методом ПЦР в реальном времени и полимеризации, активированной пирофосфоролизом, с использованием свободной фетальной ДНК, выделенной из материнской плазмы». Пренатальная диагностика . 27 (10). Wiley-Blackwell: 932–7. doi :10.1002/pd.1804. PMID  17600849. S2CID  24498216.
  29. ^ Хилл М, Паржижек А, Цибула Д, Канчева Р, Йирасек Й.Е., Йирковска М, Великова М, Кубатова Дж, Климкова М, Пашкова А, Жижка З, Канчева Л, Казигниткова Х, Замразилова Л, Старка Л (октябрь 2010 г.). «Метаболом стероидов в жидкостях организма плода и матери на поздних сроках беременности». Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 122 (4). Эльзевир Б.В.: 114–32. дои : 10.1016/j.jsbmb.2010.05.007. PMID  20580824. S2CID  25820012.
  30. ^ Аль-Ятама МК, Мустафа АС, Али С, Авраам С, Хан З, Хаджа Н (май 2001 г.). «Обнаружение ДНК, специфичной для Y-хромосомы, в плазме и моче беременных женщин с использованием вложенной полимеразной цепной реакции». Пренатальная диагностика . 21 (5). Wiley-Blackwell: 399–402. doi :10.1002/pd.69. PMID  11360283. S2CID  20169086.
  31. ^ ab Zimmermann BG, Grill S, Holzgreve W, Zhong XY, Jackson LG, Hahn S (декабрь 2008 г.). «Цифровая ПЦР: новый мощный инструмент для неинвазивной пренатальной диагностики?». Пренатальная диагностика . 28 (12). Wiley-Blackwell: 1087–93. doi : 10.1002/pd.2150 . PMID  19003785. S2CID  2909830.
  32. ^ ab Lo YM, Lun FM, Chan KC, Tsui NB, Chong KC, Lau TK, Leung TY, Zee BC, Cantor CR, Chiu RW (август 2007 г.). «Цифровая ПЦР для молекулярного обнаружения фетальной хромосомной анеуплоидии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (32). Труды Национальной академии наук: 13116–21. Bibcode : 2007PNAS..10413116L. doi : 10.1073/pnas.0705765104 . PMC 1934923. PMID  17664418 . 
  33. ^ Quake S (июль 2007). «На стыке физики и биологии». BioTechniques . 43 (1): 19. PMID  17695250.
  34. ^ Chiu RW, Lo YM (ноябрь 2010 г.). «Связанные с беременностью микроРНК в плазме матери: канал для связи плода и матери?». Клиническая химия . 56 (11). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 1656–7. doi : 10.1373/clinchem.2010.153684 . PMID  20837782.
  35. ^ ab Ding C (2008). "MALDI-TOF Mass Spectrometry for Analyzing Cell-Free Fetal DNA in Maternal Plasma". Пренатальная диагностика . Методы в молекулярной биологии. Т. 444. Тотова, Нью-Джерси: Humana Press. С. 253–67. doi :10.1007/978-1-59745-066-9_20. ISBN 978-1-58829-803-4. PMID  18425487.
  36. ^ Akolekar R, Farkas DH, VanAgtmael AL, Bombard AT, Nicolaides KH (октябрь 2010 г.). «Определение пола плода с использованием циркулирующей бесклеточной фетальной ДНК (ccffDNA) на 11–13 неделях беременности». Пренатальная диагностика . 30 (10). Wiley-Blackwell: 918–23. doi :10.1002/pd.2582. PMID  20721878. S2CID  20744999.
  37. ^ Tong YK, Chiu RW, Chan KC, Leung TY, Lo YM (сентябрь 2012 г.). «Технические проблемы иммунопреципитации метилированной фетальной ДНК для неинвазивной диагностики трисомии 21». Nature Medicine . 18 (9). Springer Nature: 1327–8, ответ автора 1328–9. doi :10.1038/nm.2915. PMID  22961155. S2CID  31316176.
  38. ^ Papageorgiou EA, Karagrigoriou A, Tsaliki E, Velissariou V, Carter NP, Patsalis PC (апрель 2011 г.). «Соотношение фетально-специфического метилирования ДНК позволяет проводить неинвазивную пренатальну диагностику трисомии 21». Nature Medicine . 17 (4). Springer Nature: 510–3. doi :10.1038/nm.2312. PMC 3977039 . PMID  21378977. 
  39. ^ ab White HE, Dent CL, Hall VJ, Crolla JA, Chitty LS (14 сентября 2012 г.). Oudejans C (ред.). «Оценка нового анализа для обнаружения фетального маркера RASSF1A: содействие повышению диагностической надежности неинвазивной пренатальной диагностики». PLOS ONE . ​​7 (9). Публичная научная библиотека (PLoS): e45073. Bibcode :2012PLoSO...745073W. doi : 10.1371/journal.pone.0045073 . PMC 3443218 . PMID  23024794. 
  40. ^ Ng EK, Tsui NB, Lam NY, Chiu RW, Yu SC, Wong SC, Lo ES, Rainer TH, Johnson PJ, Lo YM (август 2002 г.). «Присутствие фильтруемой и нефильтруемой мРНК в плазме больных раком и здоровых людей». Клиническая химия . 48 (8): 1212–7. doi : 10.1093/clinchem/48.8.1212 . PMID  12142376.
  41. ^ Baird PA, Anderson TW, Newcombe HB, Lowry RB (май 1988). «Генетические нарушения у детей и молодых людей: популяционное исследование». American Journal of Human Genetics . 42 (5): 677–93. PMC 1715177. PMID  3358420 . 
  42. ^ Шеффер П.Г., ван дер Шут CE, Пейдж-Кристианс GC, Боссерс Б, ван Эрп Ф, де Хаас М (январь 2010 г.). «Надежность определения пола плода с использованием материнской плазмы». Акушерство и гинекология . 115 (1). Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health): 117–26. дои : 10.1097/aog.0b013e3181c3c938. PMID  20027043. S2CID  26126381.
  43. ^ ab Bustamante-Aragones A, Gonzalez-Gonzalez C, de Alba MR, Ainse E, Ramos C (март 2010 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика с использованием ccffDNA в материнской крови: современное состояние». Expert Review of Molecular Diagnostics . 10 (2). Informa UK Limited: 197–205. doi : 10.1586/erm.09.86. PMID  20214538. S2CID  207219250.
  44. ^ Циммерманн Б., Эль-Шейха А., Николаидес К., Хольцгрев В., Хан С. (сентябрь 2005 г.). «Оптимизированное количественное ПЦР-измерение в реальном времени мужской фетальной ДНК в материнской плазме». Клиническая химия . 51 (9). Американская ассоциация клинической химии (AACC): 1598–604. doi : 10.1373/clinchem.2005.051235 . PMID  16020496.
  45. ^ Finning KM, Chitty LS (апрель 2008 г.). «Неинвазивное определение пола плода: влияние на клиническую практику». Семинары по фетальной и неонатальной медицине . 13 (2). Elsevier BV: 69–75. doi :10.1016/j.siny.2007.12.007. PMID  18243829.
  46. ^ Markey CM, Wadia PR, Rubin BS, Sonnenschein C, Soto AM (июнь 2005 г.). «Долгосрочные эффекты воздействия низких доз ксеноэстрогена бисфенола-А на плод в половых путях самок мышей». Biology of Reproduction . 72 (6). Oxford University Press (OUP): 1344–51. doi : 10.1095/biolreprod.104.036301 . PMID  15689538.
  47. ^ Sayres LC, Cho MK (июль 2011 г.). «Тестирование нуклеиновых кислот плода без использования клеток: обзор технологии и ее применения». Obstetrical & Gynecological Survey . 66 (7). Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health): 431–42. doi : 10.1097/ogx.0b013e31822dfbe2. PMID  21944155. S2CID  17018886.
  48. ^ Хилл М., Барретт АН, Уайт Х., Читти Л.С. (октябрь 2012 г.). «Использование бесклеточной фетальной ДНК в кровообращении матери». Передовая практика и исследования. Клиническое акушерство и гинекология . 26 (5). Elsevier BV: 639–54. doi :10.1016/j.bpobgyn.2012.03.004. PMID  22542961.
  49. ^ Norbury G, Norbury CJ (апрель 2008 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика нарушений одного гена: насколько мы близки?». Семинары по фетальной и неонатальной медицине . 13 (2). Elsevier BV: 76–83. doi :10.1016/j.siny.2007.12.008. PMID  18234572.
  50. ^ ab Li Y, Page-Christiaens GC, Gille JJ, Holzgreve W, Hahn S (январь 2007 г.). «Неинвазивное пренатальное обнаружение ахондроплазии в фракционированной по размеру бесклеточной ДНК с помощью анализа MALDI-TOF MS». Пренатальная диагностика . 27 (1). Wiley-Blackwell: 11–7. doi :10.1002/pd.1608. PMID  17154237. S2CID  5808436.
  51. ^ [1] de Die-Smulders CE, de Wert GM, Liebaers I, Tibben A, Evers-Kiebooms G (2013). «Репродуктивные возможности для потенциальных родителей в семьях с болезнью Хантингтона: клинические, психологические и этические размышления». Human Reproduction Update . 19 (3): 304–15. doi : 10.1093/humupd/dms058 . PMID  23377865.
  52. ^ Fan HC, Blumenfeld YJ, Chitkara U, Hudgins L, Quake SR (октябрь 2008 г.). «Неинвазивная диагностика фетальной анеуплоидии с помощью дробового секвенирования ДНК из материнской крови». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (42). Труды Национальной академии наук: 16266–71. Bibcode : 2008PNAS..10516266F. doi : 10.1073/pnas.0808319105 . PMC 2562413. PMID  18838674 . 
  53. ^ ab Cardo L, García BP, Alvarez FV (август 2010 г.). «Неинвазивное генотипирование RHD плода в первом триместре беременности». Клиническая химия и лабораторная медицина . 48 (8). Walter de Gruyter GmbH: 1121–6. doi :10.1515/cclm.2010.234. PMID  20482298. S2CID  31027958.
  54. ↑ Чинен П.А., Нардоцца Л.М., Мартиньяго К.Д., Камано Л., Дахер С., Парес Д.Б., Минетт Т., Араужо Жуниор Э., Морон А.Ф. (ноябрь 2010 г.). «Неинвазивное определение резус-группы крови плода и статуса антигена D путем анализа бесклеточной ДНК в плазме матери: опыт бразильской популяции». Американский журнал перинатологии . 27 (10). Георг Тиме Верлаг, КГ: 759–62. дои : 10.1055/с-0030-1253560. PMID  20408112. S2CID  25705372.
  55. ^ Okwundu CI, Afolabi BB (январь 2013 г.). «Внутримышечное и внутривенное введение анти-D для предотвращения резус-аллоиммунизации во время беременности». База данных систематических обзоров Cochrane (1): CD007885. doi :10.1002/14651858.CD007885.pub2. PMID  23440818.
  56. ^ Айкут А, Онай Х, Сагол С, Гундуз С, Озкинай Ф, Когулу О (декабрь 2013 г.). «Определение резус-статуса плода по анализу ДНК материнской плазмы». Балканский журнал медицинской генетики . 16 (2). Вальтер де Грюйтер ГмбХ: 33–8. doi : 10.2478/bjmg-2013-0029. ПМК 4001413 . ПМИД  24778561. 
  57. ^ Свободова И, Пазуркова Е, Горжинек А, Новотна М, Калда П, Корабечна М (2015). «Эффективность капельной цифровой ПЦР при неинвазивном генотипировании RHD плода - сравнение с обычным подходом на основе ПЦР в реальном времени». ПЛОС ОДИН . 10 (11): e0142572. Бибкод : 2015PLoSO..1042572S. дои : 10.1371/journal.pone.0142572 . ПМЦ 4642940 . ПМИД  26562517. 
  58. ^ Папасавва Т, Мартин П, Леглер ТДж, Лиасид М, Анастасиу Г, Христофидес А, Христодулу Т, Деметриу С, Керимис П, Контос С, Леонтиадес Г, Папапетру Д, Патроклос Т, Филакту М, Зоттис Н, Каритци Э, Павлу Э., Кунтурис П., Вельдхуизен Б., ван дер Шут Э., Клеантхаус М. (апрель 2016 г.). «Распространенность RhD-статуса и клиническое применение неинвазивного пренатального определения RHD плода в плазме матери: 5-летний опыт на Кипре». Исследовательские заметки BMC . 9 (1). Springer Nature: 198. doi : 10.1186/s13104-016-2002-x . ПМЦ 4818414 . PMID  27036548. 
  59. ^ Zhang B, Lu BY, Yu B, Zheng FX, Zhou Q, Chen YP, Zhang XQ (апрель 2017 г.). «Неинвазивный пренатальный скрининг анеуплоидий общей половой хромосомы плода из материнской крови». Журнал международных медицинских исследований . 45 (2). Публикации SAGE: 621–630. doi : 10.1177/0300060517695008. PMC 5536640. PMID  28357876 . 
  60. ^ Диаграмма Микаэля Хэггстрема, доктора медицины, с использованием следующих источников: Жаклин В. Холлидей, магистр наук, Гералин М. Мессерлиан, доктор философии, Гленн Э. Паломаки, доктор философии. «Обучение пациентов: следует ли мне проходить скрининговый тест на синдром Дауна во время беременности? (За пределами основ)». UpToDate .{{cite web}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )Последнее обновление темы: 16 февраля 2023 г.
  61. ^ abc Kazemi M, Salehi M, Kheirollahi M (10 августа 2016 г.). «Синдром Дауна: Текущее состояние, проблемы и перспективы на будущее». Международный журнал молекулярной и клеточной медицины . 5 (3): 125–133. PMC 5125364. PMID  27942498 . 
  62. ^ Mersy E, Smits LJ, van Winden LA, de Die-Smulders CE, Paulussen AD, Macville MV, Coumans AB, Frints SG (2013). «Неинвазивное обнаружение трисомии плода 21: систематический обзор и отчет о качестве и результатах исследований диагностической точности, проведенных между 1997 и 2012 годами». Human Reproduction Update . 19 (4): 318–29. doi : 10.1093/humupd/dmt001 . PMID  23396607.
  63. ^ Clark-Ganheart CA, Iqbal SN, Brown DL, Black S, Fries MH (май 2014 г.). «Понимание ограничений циркулирующей бесклеточной фетальной ДНК: пример двух уникальных случаев». Журнал клинической гинекологии и акушерства . 3 (2): 38–70. doi :10.14740/jcgo229w. PMC 4185925. PMID  25298847 . 
  64. ^ Wataganara T, LeShane ES, Farina A, Messerlian GM, Lee T, Canick JA, Bianchi DW (февраль 2003 г.). «Уровни бесклеточной ДНК плода в материнской сыворотке увеличиваются в случаях трисомии 13, но не трисомии 18». Генетика человека . 112 (2): 204–8. doi :10.1007/s00439-002-0853-9. PMID  12522563. S2CID  9721963.
  65. ^ Chiu RW, Lo YM (апрель 2011 г.). «Неинвазивная пренатальная диагностика с помощью анализа нуклеиновых кислот плода в плазме матери: взросление». Семинары по фетальной и неонатальной медицине . 16 (2). Elsevier BV: 88–93. doi :10.1016/j.siny.2010.10.003. PMID  21075065.
  66. ^ Неинвазивная пренатальная диагностика анеуплоидии плода с использованием внеклеточных нуклеиновых кислот плода в крови матери: клиническая политика (вступила в силу 05.01.2013 г.) Архивировано 07.03.2014 на Wayback Machine из Oxford Health Plans
  67. ^ Bianchi DW, Parker RL, Wentworth J, Madankumar R, Saffer C, Das AF, Craig JA, Chudova DI, Devers PL, Jones KW, Oliver K, Rava RP, Sehnert AJ (февраль 2014 г.). «Секвенирование ДНК против стандартного пренатального скрининга анеуплоидии». The New England Journal of Medicine . 370 (9): 799–808. doi : 10.1056/NEJMoa1311037 . PMID  24571752. S2CID  13278444.Недавнее исследование, опубликованное в New England Journal of Medicine, продемонстрировало возможность использования НИПТ в группе низкого риска.
  68. ^ Henderson JT, Thompson JH, Burda BU, Cantor A (апрель 2017 г.). «Скрининг преэклампсии: отчет о фактических данных и систематический обзор для целевой группы профилактических служб США». JAMA . 317 (16). Американская медицинская ассоциация (AMA): 1668–1683. doi :10.1001/jama.2016.18315. PMID  28444285. S2CID  205077025.
  69. ^ ab Seval MM, Karabulut HG, Tükün A, Koç A (2015). «Бесклеточная фетальная ДНК в плазме беременных женщин с преэклампсией». Клиническое и экспериментальное акушерство и гинекология . 42 (6): 787–91. doi : 10.12891/ceog1982.2015 . PMID  26753487. S2CID  20971322.
  70. ^ Lo YM, Lau TK, Zhang J, Leung TN, Chang AM, Hjelm NM, Elmes RS, Bianchi DW (октябрь 1999 г.). «Повышенная концентрация фетальной ДНК в плазме беременных женщин, вынашивающих плоды с трисомией 21». Клиническая химия . 45 (10): 1747–51. doi : 10.1093/clinchem/45.10.1747 . PMID  10508120.
  71. ^ Leung TN, Zhang J, Lau TK, Chan LY, Lo YM (январь 2001 г.). «Повышенная концентрация ДНК плода в материнской плазме у женщин, у которых в конечном итоге развивается преэклампсия». Клиническая химия . 47 (1): 137–9. doi : 10.1093/clinchem/47.1.137 . PMID  11148193.
  72. ^ Zhong XY, Holzgreve W, Hahn S (2002). «Уровни свободной фетальной ДНК в плазме матери повышаются до начала преэклампсии». Гипертензия при беременности . 21 (1). Informa UK Limited: 77–83. doi : 10.1081/prg-120002911. PMID  12044339. S2CID  72519129.
  73. ^ Рамезанзаде, Махбубех; Хосрави, Шарифех; Салехи, Расул (2017). «Бесклеточные маркеры идентификации фетальных нуклеиновых кислот в кровообращении матери». Advanced Biomedical Research . 6 (1): 89. doi : 10.4103/2277-9175.211800 . ISSN  2277-9175. PMC 5549546. PMID 28828340  . 
  74. ^ Lo, YM Dennis; Corbetta, Noemi; Chamberlain, Paul F; Rai, Vik; Sargent, Ian L; Redman, Christopher WG; Wainscoat, James S (1997-08-16). «Присутствие фетальной ДНК в материнской плазме и сыворотке». The Lancet . 350 (9076): 485–487. doi :10.1016/S0140-6736(97)02174-0. PMID  9274585.
  75. ^ Хофшнайдер, Марк. «Неинвазивное пренатальное тестирование с использованием фетальной ДНК». Фонд Ласкера . Получено 2024-05-06 .
  76. ^ Юркевич ИР, Корф БР, Леманн ЛС (январь 2014). «Пренатальное секвенирование всего генома — этична ли попытка узнать будущее плода?». The New England Journal of Medicine . 370 (3): 195–7. doi :10.1056/NEJMp1215536. PMID  24428465. S2CID  205109276.
  77. ^ Wellcome Trust Case Control Consortium (июнь 2007 г.). «Исследование ассоциаций по всему геному 14 000 случаев семи распространенных заболеваний и 3 000 общих контролей». Nature . 447 (7145): 661–78. Bibcode :2007Natur.447..661B. doi :10.1038/nature05911. PMC 2719288 . PMID  17554300. 
  78. ^ Mailman MD, Feolo M, Jin Y, Kimura M, Tryka K, Bagoutdinov R и др. (октябрь 2007 г.). «База данных генотипов и фенотипов NCBI dbGaP». Nature Genetics . 39 (10): 1181–6. doi :10.1038/ng1007-1181. PMC 2031016 . PMID  17898773.