Сезон 1999 года был седьмым сезоном J-League Division 1. Лига началась в марте и закончилась в ноябре. В этом году в дивизионе соревновались 16 команд после роспуска Yokohama Flügels и перевода Consadole Sapporo в недавно сформированный Division 2. В год доминирования префектуры Сидзуока Júbilo Iwata выиграл 1-й этап, а соседи Shimizu S-Pulse выиграли 2-й этап. Iwata выиграл титул J.League Division 1 для после победы по пенальти в чемпионате Suntory .
В сезоне 1999 года в Дивизионе 1 Джей-лиги приняли участие следующие шестнадцать клубов.
Самый ценный игрок:
Алекс (Шимизу С-Пульс)