Виды вируса
Вирус GB C ( GBV-C ), ранее известный как вирус гепатита G ( HGV ), а также известный как человеческий пегивирус – HPgV – это вирус из семейства Flaviviridae и член Pegivirus , [1] известно, что он инфицирует людей, но не вызывает заболеваний у людей. Сообщается, что пациенты с ВИЧ , коинфицированные GBV-C, могут жить дольше, чем пациенты без GBV-C, но пациенты могут отличаться в других отношениях. Ведутся активные исследования воздействия вируса на иммунную систему у пациентов, коинфицированных GBV-C и ВИЧ. [2] [3] [4]
Инфекция человека
У большинства иммунокомпетентных лиц виремия GBV-C проходит , но у некоторых людей инфекция сохраняется в течение десятилетий. [5] Однако временной интервал между заражением GBV-C и устранением виремии (обнаружением РНК GBV-C в плазме) неизвестен.
Около 2% здоровых доноров крови в США инфицированы вирусом GBV-C, и до 13% доноров крови имеют антитела к белку E2 , что указывает на возможную предшествующую инфекцию. [5]
Были задокументированы парентеральная, половая и вертикальная передача GBV-C. Из-за общих путей передачи, лица, инфицированные ВИЧ, часто коинфицируются GBV-C; распространенность виремии GBV-C у пациентов с ВИЧ колеблется от 14 до 43%. [6]
Несколько, но не все исследования предположили, что коинфекция с GBV-C замедляет прогрессирование заболевания ВИЧ. [7] Модели in vitro также продемонстрировали, что GBV-C замедляет репликацию ВИЧ. Этот полезный эффект может быть связан с действием нескольких вирусных белков GBV-C, включая фосфопротеин NS5A и белок оболочки E2. [8]
Вирусология
Он имеет одноцепочечный геном РНК с положительным смыслом размером около 9,3 кб и содержит одну открытую рамку считывания (ORF), кодирующую два структурных (E1 и E2) и пять неструктурных (NS2, NS3, NS4, NS5A и NS5B) белка. Вирус GB-C, по-видимому, не кодирует белок C (ядро или нуклеокапсид ), как, например, вирус гепатита C. Тем не менее, было обнаружено, что вирусные частицы имеют нуклеокапсид. Источник белка нуклеокапсида остается неизвестным. [1]
Таксономия
GBV-C является членом семейства Flaviviridae и филогенетически связан с вирусом гепатита C , но реплицируется в основном в лимфоцитах и плохо, если вообще реплицируется, в гепатоцитах. [9] [10] GBV-A и GBV-B, вероятно, являются вирусами тамарина , в то время как GBV-C инфицирует людей . [11] Вирусы GB предварительно отнесены к четвертому роду внутри Flaviviridae под названием « Pegivirus », но это еще не было официально одобрено Международным комитетом по таксономии вирусов . [12]
Другой представитель этого клада , GBV-D, был выделен из летучей мыши ( Pteropus giganteus ). [13] GBV-D может быть предком GBV-A и GBV-C. [13]
Скорость мутации генома GBV-C оценивается в 10−2–10−3 замен / сайт/год. [ 14]
Эпидемиология
Инфекция GBV-C обнаружена во всем мире и в настоящее время поражает около шестой части населения мира. Высокая распространенность наблюдается среди лиц с риском парентерального заражения, включая лиц, контактировавших с кровью и ее продуктами, находящихся на гемодиализе и потребителей внутривенных наркотиков. Могут иметь место половой контакт и вертикальная передача. Около 10–25% пациентов, инфицированных гепатитом С, и 14–36% потребителей наркотиков, которые серопозитивны по ВИЧ-1, демонстрируют признаки заражения GBV-C.
Он был классифицирован на семь генотипов и множество подтипов с различным географическим распространением. [15] Генотипы 1 и 2 распространены в Северной и Центральной Африке и в Америке. Генотипы 3 и 4 распространены в Азии. Генотип 5 присутствует в Центральной и Южной Африке . Генотип 6 может встречаться в Юго-Восточной Азии . Наконец, генотип 7 был зарегистрирован в Китае . Возможно заражение несколькими генотипами. [16]
Генотип 5, по-видимому, является базальным в филогенетическом дереве, что предполагает африканское происхождение этого вируса. [17]
История
Вирус гепатита G и вирус GB C (GBV-C) являются РНК-вирусами, которые были независимо идентифицированы в 1995 году и впоследствии были признаны двумя изолятами одного и того же вируса. [18] [19] [20] [21] Хотя изначально считалось, что GBV-C связан с хроническим гепатитом , обширные исследования не смогли выявить никакой связи между этим вирусом и каким-либо клиническим заболеванием. [22] Вирус GB C (и, действительно, GBV-A и GBV-B) назван в честь хирурга Г. Баркера, который заболел в 1966 году гепатитом не-A-не-B, который в то время считался вызванным новым инфекционным гепатовирусом. [23]
Ссылки
- ^ ab Stapleton, JT; Foung, S.; Muerhoff, AS; Bukh, J.; Simmonds, P. (2010). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в пределах семейства Flaviviridae». Журнал общей вирусологии . 92 (2): 233–46. doi : 10.1099/vir.0.027490-0. PMC 3081076. PMID 21084497.
- ^ Xiang J, George SL, Wünschmann S и др. (2004). «Ингибирование репликации ВИЧ-1 инфекцией вируса ГБ C посредством увеличения RANTES, MIP-1alpha, MIP-1beta и SDF-1». Lancet . 363 (9426): 2040–6. doi :10.1016/S0140-6736(04)16453-2. PMID 15207954. S2CID 54317667.
- ^ Mosam A, Sathar MA, Dawood H, Cassol E, Esterhuizen TM, Coovadia HM (2007). «Влияние коинфекции вируса ГБ C на ответ на общую ВААРТ у африканских пациентов с инфекцией ВИЧ-1 Clade C». AIDS . 21 (10): 1377–9. doi : 10.1097/QAD.0b013e3281532cb8 . PMID 17545721. S2CID 19630054.
- ^ Юнг С., Эйхенмюллер М., Донхаузер Н. и др. (2007). «Ингибирование проникновения ВИЧ гликопротеином оболочки 2 вируса ГБ С». AIDS . 21 (5): 645–7. doi : 10.1097/QAD.0b013e32803277c7 . PMID 17314528. S2CID 45809720.
- ^ ab "Гепатит G". Мое здоровье и питание. Архивировано из оригинала 2013-11-02.
- ^ Джордж SL, Вармаз D, Стэплтон JT (2006). «Вирус GB C реплицируется в первичных лимфоцитах T и B». J. Infect. Dis . 193 (3): 451–4. doi : 10.1086/499435 . PMID 16388494.
- ^ Zhang W, Chaloner K, Tillmann HL, Williams CF, Stapleton JT (2006). «Влияние ранней и поздней виремии вируса ГБ C на выживаемость ВИЧ-инфицированных лиц: метаанализ». HIV Med . 7 (3): 173–180. doi : 10.1111/j.1468-1293.2006.00366.x . PMID 16494631.
- ^ Giret, MTM; Kallas, EG (март 2012 г.). «GBV-C: современное состояние и перспективы на будущее». Current HIV/AIDS Reports . 9 (1): 26–33. doi :10.1007/s11904-011-0109-1. PMID 22246585. S2CID 22887740.
- ^ Leary TP, Muerhoff AS, Simons JN, Pilot-Matias TJ, Erker JC, Chalmers ML, Schlauder GG, Dawson GJ, Desai SM, Mushahwar IK (1996). "Последовательность и геномная организация GBV-C: новый представитель Flaviviridae, связанный с человеческим гепатитом не-A–E". J. Med. Virol . 48 (1): 60–7. doi :10.1002/(SICI)1096-9071(199601)48:1<60::AID-JMV10>3.0.CO;2-A. PMID 8825712. S2CID 28977057.
- ^ Тернер С., Витвер С., Хофакер И.Л., Штадлер П.Ф. (май 2004 г.). «Консервативные вторичные структуры РНК в геномах флавивирусов». Дж. Генерал Вирол . 85 (Часть 5): 1113–24. дои : 10.1099/vir.0.19462-0 . ПМИД 15105528.[ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Simons JN, Desai SM, Schultz DE, Lemon SM, Mushahwar IK (1996). «Инициация трансляции в вирусах GB A и C: доказательства внутреннего проникновения рибосомы и последствия для организации генома». J. Virol . 70 (9): 6126–35. doi :10.1128/JVI.70.9.6126-6135.1996. PMC 190635. PMID 8709237 .
- ^ Stapleton JT, Foung S, Muerhoff AS, Bukh J, Simmonds P (февраль 2011 г.). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в пределах семейства Flaviviridae». Журнал общей вирусологии . 92 (Pt 2): 233–46. doi : 10.1099/vir.0.027490-0. PMC 3081076. PMID 21084497. [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ ab Epstein JH, Quan PL, Briese T, et al. (2010). "Идентификация GBV-D, нового GB-подобного флавивируса от плодоядных летучих мышей Старого Света (Pteropus giganteus) в Бангладеш". PLOS Pathog . 6 (7): e1000972. doi : 10.1371/journal.ppat.1000972 . PMC 2895649 . PMID 20617167.
- ^ Romano CM, Zanotto PM, Holmes EC (март 2008 г.). «Байесовский коалесцентный анализ выявляет высокую скорость молекулярной эволюции в вирусе ГБ C». J. Mol. Evol . 66 (3): 292–7. Bibcode :2008JMolE..66..292R. doi :10.1007/s00239-008-9087-3. PMC 3324782 . PMID 18320258.
- ^ Feng Y, Zhao W, Feng Y, Dai J, Li Z, Zhang X, Liu L, Bai J, Zhang H, Lu L, Xia X (2011). Davis T (ред.). "Новый генотип вируса ГБ C: его идентификация и преобладание среди потребителей инъекционных наркотиков в Юньнани, Китай". PLOS ONE . 6 (10): e21151. Bibcode : 2011PLoSO...621151F. doi : 10.1371/journal.pone.0021151 . PMC 3188531. PMID 21998624 .
- ^ Сингх, Шиванк; Блэкард, Джейсон Т (2017). «Инфекция человеческого пегивируса (HPgV) в странах Африки к югу от Сахары — призыв к обновлению повестки дня исследований». Обзоры в медицинской вирусологии . 27 (6): e1951. doi :10.1002/rmv.1951. PMID 29148108. S2CID 4061848.
- ^ Muerhoff AS, Leary TP, Sathar MA, Dawson GJ, Desai SM (июнь 2005 г.). «Африканское происхождение вируса GB C, определенное филогенетическим анализом полного генома генотипа 5 из Южной Африки». J. Gen. Virol . 86 (Pt 6): 1729–35. doi : 10.1099/vir.0.80854-0 . PMID 15914851.[ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Simons JN, Pilot-Matias TJ, Leary TP и др. (апрель 1995 г.). «Идентификация двух геномов, подобных флавивирусам, у возбудителя гепатита GB». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (8): 3401–5. Bibcode :1995PNAS...92.3401S. doi : 10.1073/pnas.92.8.3401 . PMC 42174 . PMID 7724574.
- ^ Simons JN, Leary TP, Dawson GJ, et al. (Июнь 1995). «Выделение новых вирусоподобных последовательностей, связанных с человеческим гепатитом». Nat. Med . 1 (6): 564–9. doi :10.1038/nm0695-564. PMID 7585124. S2CID 27358642.
- ^ Йошиба М., Окамото Х., Миширо С. (октябрь 1995 г.). «Обнаружение генома вируса гепатита GBV-C в сыворотке пациентов с молниеносным гепатитом неизвестной этиологии». Lancet . 346 (8983): 1131–2. doi :10.1016/S0140-6736(95)91802-7. PMID 7475605. S2CID 42480382.
- ^ Биркенмейер Л.Г., Десаи С.М., Мюерхофф А.С., Лири Т.П., Саймонс Дж.Н., Монтес CC, Мушахвар И.К. (1998). «Выделение генома, связанного с вирусом ГБ, у шимпанзе». Дж. Мед. Вирол . 56 (1): 44–51. doi : 10.1002/(SICI)1096-9071(199809)56:1<44::AID-JMV8>3.0.CO;2-N . PMID 9700632. S2CID 38749195.
- ^ Alter, HJ (июнь 1996 г.). «Клонирование и клинические последствия HGV и HGBV-C». N. Engl. J. Med . 334 (23): 1536–7. doi :10.1056/NEJM199606063342310. PMID 8618611.
- ^ Решетняк, В.И.; Карлович, Т.И.; Ильченко, Л.Ю. (2008). «Вирус гепатита G». Всемирный журнал гастроэнтерологии . 14 (30): 4725–34. дои : 10.3748/wjg.14.4725 . ПМЦ 2739332 . ПМИД 18720531.
Внешние ссылки
- «GB вирус C». Браузер таксономии NCBI . 54290.