stringtranslate.com

Вложенность

Вложенность — это мера структуры экологической системы , обычно применяемая к системам видов-участков (описывающим распределение видов по локациям) или сетям взаимодействия видов-видов (описывающим взаимодействия между видами, обычно в виде двусторонних сетей, таких как хозяева-паразиты). , растения-опылители и др.).

Система (обычно представляемая в виде матрицы) называется вложенной, когда элементы, содержащие несколько элементов (локации с небольшим количеством видов, виды с небольшим количеством взаимодействий), имеют подмножество элементов с большим количеством элементов. Представьте себе серию островов, упорядоченных по удаленности от материка. Если на материке есть все виды, на первом острове есть подмножество видов с материка, на втором острове есть подмножество видов с первого острова и т. д., то эта система является идеально вложенной.

Меры вложенности

Одной из единиц измерения вложенности является « температура » системы, предложенная Атмаром и Паттерсоном в 1993 году. [1] Она измеряет порядок, в котором будет происходить вымирание видов в системе (или, с другой стороны, порядок колонизации системы). . Чем «холоднее» система, тем более фиксированным будет порядок вымирания. В более теплой системе вымирание будет происходить в более случайном порядке. Температура меняется от 0°, самой холодной и абсолютно фиксированной, до 100°, абсолютно случайной.

По разным причинам калькулятор температуры вложенности не является математически удовлетворительным (нет уникального решения, недостаточно консервативен). [2] [3] Программное обеспечение (BINMATNEST) можно получить у авторов по запросу и в журнале «Биогеография» для исправления этих недостатков. [4] Кроме того, ANINHADO решает проблемы большого размера матрицы и обработки большого количества рандомизированных матриц. ; кроме того, он реализует несколько нулевых моделей для оценки значимости вложенности. [5] [6]

Бастолла и др. ввел простую меру вложенности, основанную на количестве общих соседей для каждой пары узлов. [7] Они утверждают, что это может помочь снизить эффективную конкуренцию между узлами в определенных ситуациях. Например, два вида насекомых могут «помогать» друг другу, опыляя одну и ту же группу растений, тем самым уменьшая степень их вреда друг для друга. Авторы предполагают, что этот эффект лежит в основе корреляции между гнездованностью и разнообразием экосистем растений-опылителей. Однако Джонсон и др. показали, что эта мера на самом деле не обеспечивает должным образом желаемого эффекта. [8] Эти авторы предлагают усовершенствованную версию показателя и продолжают показывать, как определенные свойства сети влияют на вложенность.

Рекомендации

  1. ^ Паттерсон и Атмар; Паттерсон, Брюс Д. (1993). «Мера порядка и беспорядка в распределении видов во фрагментированной среде обитания». Экология . 96 (3): 373–382. Бибкод : 1993Oecol..96..373A. дои : 10.1007/BF00317508. PMID  28313653. S2CID  12177277.
  2. ^ Родригес-Жиронес, Массачусетс, Сантамария Л (2006). «Новый алгоритм расчета температуры вложенности матриц присутствия-отсутствия». Журнал биогеографии . 33 (5): 924–935. дои : 10.1111/j.1365-2699.2006.01444.x. S2CID  84989243.
  3. ^ Гимарайнш, PR, П. Гимарайнш (2006). «Улучшение анализа вложенности больших наборов матриц». Экологическое моделирование и программное обеспечение . 21 (10): 1512–1513. doi : 10.1016/j.envsoft.2006.04.002.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  4. ^ Родригес-Хиронес, Мигель А.; Сантамария, Луис (2006). «Новый алгоритм расчета температуры вложенности матриц присутствия-отсутствия». Журнал биогеографии . 33 (5): 924–935. дои : 10.1111/j.1365-2699.2006.01444.x. S2CID  84989243.
  5. ^ Гимарайншр, П.; Гимарайнш, П. (2006). «Улучшение анализа вложенности больших наборов матриц». Экологическое моделирование . 21 (10): 1512–1513. doi : 10.1016/j.envsoft.2006.04.002.
  6. ^ http://www.iemss.org/shortcom/software/software.php?aid=201 [ постоянная неработающая ссылка ]
  7. ^ Бастолла Ю, Фортуна М.А., Паскуаль-Гарсия А, Феррера А, Луке Б, Баскомпте Дж (2009). «Архитектура мутуалистических сетей сводит к минимуму конкуренцию и увеличивает биоразнообразие». Природа . 458 (7241): 1018–1020. Бибкод : 2009Natur.458.1018B. дои : 10.1038/nature07950. PMID  19396144. S2CID  4395634.
  8. ^ Джонсон С., Домингес-Гарсия В., Муньос М.А. (2013). «Факторы, определяющие вложенность в сложных сетях». ПЛОС ОДИН . 8 (9): е74025. arXiv : 1307.4685 . Бибкод : 2013PLoSO...874025J. дои : 10.1371/journal.pone.0074025 . ПМЦ 3777946 . ПМИД  24069264. 

Программное обеспечение