stringtranslate.com

Воздействие растворителя

Воздействие растворителя происходит, когда химикат , материал или человек вступают в контакт с растворителем . Химикаты могут растворяться в растворителях, материалы, такие как полимеры, могут химически разрушаться растворителями, и у людей могут развиться определенные заболевания от воздействия растворителей, как органических, так и неорганических.

Некоторые распространенные растворители включают ацетон , метанол , тетрагидрофуран , диметилсульфоксид и воду среди множества других.

В биологии воздействие растворителя на аминокислоту в белке измеряет, в какой степени аминокислота доступна растворителю ( обычно воде ), окружающему белок. Вообще говоря, гидрофобные аминокислоты будут скрыты внутри белка и, таким образом, защищены от растворителя, в то время как гидрофильные аминокислоты будут находиться близко к поверхности и, таким образом, будут открыты для растворителя. Однако, как и во многих биологических правилах, исключения являются обычным явлением, и гидрофильные остатки часто оказываются скрытыми в нативной структуре и наоборот.

Воздействие растворителя может быть численно описано несколькими мерами, наиболее популярными из которых являются доступная площадь поверхности и относительная доступная площадь поверхности . Другие меры, например:

Ссылки

Ли Б., Ричардс Ф. (1971) Интерпретация структур белков: оценка статической доступности. J. Mol. Biol. 55:379-400

Грир Дж., Буш Б. (1978) Макромолекулярная форма и карты поверхности методом исключения растворителя. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75:303-307.

Коннолли М. (1983) Поверхности белков и нуклеиновых кислот, доступные растворителям. Science 221:709-713

Чакраварти С., Варадараджан Р. (1999) Глубина остатка: новый параметр для анализа структуры и стабильности белка. Structure Fold. Des. 7:723-732.

Pintar A, Carugo O, Pongor S. (2003) Атомная глубина в структуре и функции белка. Trends Biochem. Sci. 28:593-597.

Хамелрик Т. (2005) У аминокислоты две стороны: новое двумерное измерение дает иной взгляд на воздействие растворителя. Proteins Struct. Func. Bioinf. 59:38-48.