Гаплогруппа R0

Гаплогруппа R0 (ранее известная как гаплогруппа pre-HV ^[3] ) представляет собой гаплогруппу митохондриальной ДНК (мтДНК) человека.

Источник

Гаплогруппа R0 происходит от макрогаплогруппы R. Это предковая клада субклада R0a и гаплогруппы HV и, следовательно , является предшественником гаплогрупп H и V.

Большое разнообразие субкладов R0 на Аравийском полуострове предполагает, что клада возникла и распространилась оттуда.

Считается, что R0a возник в оазисах ледникового периода в Южной Аравии около 22 000 лет назад. Затем субклад распространился оттуда с наступлением позднего ледникового периода около 15 000 лн. ^[4]

Распределение

Гаплогруппа R0 обнаружена примерно в 55% остеологических останков, принадлежащих энеолитической трипольской культуре. ^[5]

Клада R0 также была обнаружена среди иберомаврских экземпляров в доисторических стоянках Тафоральт и Афалу , датируемых эпипалеолитом . Среди особей Тафоральта около 17% наблюдаемых гаплотипов принадлежали к различным субкладам R0, включая R0a1a (3/24; 13%) и R0a2c (1/24; 4%). Среди особей Афалу выявлен один гаплотип R0a1a (1/9; 11%). ^[6]

R0 также наблюдался среди мумий, раскопанных на археологическом памятнике Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодами доптолемеев / позднего Нового царства , птолемеевского и римского периодов. ^[7]

Святой католической церкви III века нашей эры Фортунато из Серракаприолы также был носителем субклада Роааб. ^{[ нужна цитата ]}

Сегодня R0 обычно встречается на Аравийском полуострове, причем его самая высокая частота наблюдается вблизи Сокотри ( 40,7%). ^[8] Сокотри также имеют наибольшее разнообразие субкладов R0. ^[9] Клада также часто встречается среди калашей в Южной Азии (23%). ^[10] Кроме того, умеренная частота R0 встречается в Северо-Восточной Африке , Анатолии , Иранском нагорье и Далмации . Гаплогруппа наблюдалась среди арабов Чада (19%), ^[11] суданских коптов (13,8%), ^[12] тигрей (13,6%), ^[8] сомалийцев (13,3%), ^[8] оромос (13,3%), ^[8] Афар (12,5%), ^[8] Амхара (11,5%), ^[8] Гураге (10%), ^[8] Регибате Сахрави (9,26%; 0,93% R0a и 8,33% R0a1a), ^[13] Гаалиен ( 9%), ^[12] беджа (8,3%), ^[12] нубийцы (8%), ^[8] аракиенцы (5,9%), ^[12] йеменцы (5,1–27,7%), ^[8] иракцы (4,8%) , ^[8] друзы (4,3%), ^[8] палестинцы (4%), ^[8] алжирцы (1,67%), ^[13] и саудовцы (0–25%). ^[8]

Субклады

Дерево

Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы R0 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера « Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» ^[2] и последующих опубликованных исследованиях.

р
- R0 (или до HV )
  - R0a'b - Албания
    - R0a (или (до HV)1 )
      - R0a1 или (до HV)1a
        R0a1a — Саудовская Аравия, Йемен, Катар, Бахрейн, Кувейт, Ливан, Италия.
        R0a1a1 - Йемен, ^[14] Тунис ^[15]
        R0a1a1a — Йемен ( Сокотра ) ^[14]
        R0a1a2 - Эфиопия ^[16]
        R0a1a3
        R0a1a4 — Саудовская Аравия, Катар, Кувейт, Ирак.
        R0a1-T152C! – Марокко, Испания
        R0a1b — Аравия ^[4]
      - R0a-60.1T - Италия, Армяне Турции, ^[17] Калаш Пакистана ^[18]
        R0a2'3 - Иран, Ливан
        R0a2 или (до HV)1b
        R0a2a – Португалия, Испания, Италия
        R0a2a1 – Италия, Алжир
        R0a2b - Эфиопия ^[4]
        R0a2c – Саудовская Аравия, ^[19] Катар, Кувейт, йеменские евреи ^[4]
        R0a2d
        R0a2e
        R0a2f - арабы из Чада, ^[14] Объединенных Арабских Эмиратов, ^[20] Саудовской Аравии.
        R0a2f1
        R0a2f1a — Оман, Саудовская Аравия, Йемен.
        R0a2f1b – Йемен, Объединенные Арабские Эмираты
        R0a2g
        R0a2g1
        R0a2g1a
        R0a2g1a1 - Сахо из Эритреи, ^[21] Амхара из Эфиопии ^[22]
        R0a2h - Объединенные Арабские Эмираты ^[23]
        R0a2h1 - Афар Эритреи ^[24]
        R0a2i - Йемен ^[25]
        R0a2-T195C! - Саудовская Аравия
        R0a2j - Йемен, ^[26] Оман, Объединенные Арабские Эмираты.
        R0a2k – Сардиния ^[27]
        R0a2k1 — Саудовская Аравия, Йемен
        R0a2l – Йемен ^[28]
        R0a2m - евреи-ашкенази , ^[29] Суэта из Испании, ^[30] Гитанос из Испании, ^[31] Мексика, ^[32] Эквадор, ^[33]^[34] Марокко ^[35]
        R0a2n - друзы Ливана, ^[36] ассирийцы , ^[37] Италия, Бельцы Пакистана ^[38]
        R0a2q - Оромо из Кении, ^[39] Сахо из Эритреи ^[40]
        R0a2r - Южная Европа (Румыния, Болгария), ^[4] Друзы ^[4]
        R0a3 - Йемен, ^[41] Персы ^[42]
        R0a3a - Ливан, ^[43] Йемен ^[44]
        R0a4 — Испания, Португалия, евреи-ашкенази , ^[45] Ирак ^[4]
    - R0b — Италия, ^[46] Азербайджан ^[47]
  - ВН
    - HV0
      - HV0a
        В
    - ЧАС

Смотрите также

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой R0 (мтДНК) .

Рекомендации

^ Соарес, П; Эрмини, Л; Томсон, Н.; Мормина, М; Рито, Т; Рёль, А; Салас, А; Оппенгеймер, С; и другие. (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека». Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001. ПМЦ 2694979 . ПМИД 19500773.
^ Аб ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация . 30 (2): E386–E394. дои : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
^ Субклады гаплогруппы H, ДНК генеалогического древа.
^ abcdefg Франческа Гандини; Алессандро Ачилли; Мария Пала; Мартин Боднер; Стефания Брандини; Габриэла Хубер; Балаж Эгед; Лука Ферретти; Альберто Гомес-Карбалла; Антонио Салас; Розария Скоццари; Фульвио Кручиани; Альфредо Коппа; Уолтер Парсон; Орнелла Семино; Педро Соареш; Антонио Торрони; Мартин Б. Ричардс; Анна Оливьери (5 мая 2016 г.). «Картирование расселения людей на Африканский Рог из рефугиумов Аравийского ледникового периода с использованием митогеномов». Научные отчеты . 6 : 25472. Бибкод : 2016NatSR...625472G. дои : 10.1038/srep25472. ПМЦ 4857117 . ПМИД 27146119.
^ Никитин, Алексей Г.; Сохацкий Михаил П.; Ковалюх Николай М.; Видейко, Михаил Ю. (14 апреля 2011 г.). «Комплексная хронология памятников и анализ древней митохондриальной ДНК из пещеры Вертеба - памятника трипольской культуры энеолитической Украины» (PDF) . Interdisciplinaria Archaeologica - Естественные науки в археологии (1–2). Археологический центр Оломоуца, Бюджетная организация: 9–18. дои : 10.24916/iansa.2011.1.1 . Проверено 14 мая 2013 г.
^ Кефи, Рим; и другие. (2018). «О происхождении иберомавров: новые данные, основанные на древней митохондриальной ДНК и филогенетическом анализе популяций афалу и тафоральта». Митохондриальная ДНК Часть А. 29 (1): 147–157. дои : 10.1080/24701394.2016.1258406. PMID 28034339. S2CID 4490910.
^ Шунеманн, Верена Дж.; и другие. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД 28556824.
^ abcdefghijklm Нон, Эми (2010). Анализ генетических данных в рамках междисциплинарной структуры для исследования недавней эволюционной истории человека и сложных заболеваний (PDF) (кандидатская диссертация). Университет Флориды . Проверено 6 апреля 2023 г.
^ Черны, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии — поселение на острове Сокотра, что видно по генетическому разнообразию митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. дои : 10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня 2016 г.
^ Кинтана-Мурси Л. и др. (2004). «Там, где Запад встречается с Востоком: сложный ландшафт мтДНК юго-западного и центральноазиатского коридора» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 827–45. дои : 10.1086/383236. ПМК 1181978 . PMID 15077202. Архивировано из оригинала (PDF) 23 ноября 2009 г. Проверено 23 августа 2009 г.
^ Сересо, Мария; и другие. (2011). «Новое понимание структуры населения бассейна озера Чад, полученное с помощью высокопроизводительного генотипирования митохондриальной ДНК, кодирующей SNP». ПЛОС ОДИН . 6 (4): e18682. Бибкод : 2011PLoSO...618682C. CiteSeerX 10.1.1.291.8871 . дои : 10.1371/journal.pone.0018682 . ПМК 3080428 . ПМИД 21533064.
^ abcd Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. «Генетические закономерности вариаций Y-хромосомы и митохондриальной ДНК, имеющие значение для заселения Судана» (PDF) . Хартумский университет . Проверено 16 апреля 2016 г.
^ аб Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорая Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая гетерогенность в алжирских человеческих популяциях». ПЛОС ОДИН . 10 (9): e0138453. Бибкод : 2015PLoSO..1038453B. дои : 10.1371/journal.pone.0138453 . ПМЦ 4581715 . ПМИД 26402429. ; Таблица S5
^ abc Виктор Черный; Конни Дж. Маллиган; Вероника Фернандес; и другие. (январь 2011 г.). «Внутренняя диверсификация митохондриальной гаплогруппы R0a свидетельствует о максимальном демографическом расширении после последнего ледникового периода в Южной Аравии». Молекулярная биология и эволюция . 28 : 71–78. doi : 10.1093/molbev/msq178. ПМИД 20643865.
^ Номер доступа GenBank : HM185263.1.
^ Инвентарный номер GenBank : KP407023.1.
^ Номер доступа GenBank : KX499665.1
^ Мухаммад Хасан Сиддики; Аллах Ракха; Хушбухат Хан; Танвир Ахтар (2021). «Текущий пул окончательной коллекции митохондриальной ДНК из остатков Калаша». Митохондриальная ДНК Часть B. 6 (8): 2412 (табл. 1). дои : 10.1080/23802359.2021.1952119. ПМЦ 8284132 . ПМИД 34345711.
^ Номер доступа GenBank : KM245132.1.
^ Фатма А. Альджасми; Ранджит Виджаян; Наганисваран Судалаимутуасари; Абдул-Кадер Суид; и другие. (август 2020 г.). «Геномный ландшафт митохондриального генома коренного населения Объединенных Арабских Эмиратов». Гены . 11 (8): 876. doi : 10.3390/genes11080876 . ПМЦ 7464197 . ПМИД 32752197.
^ Номер доступа GenBank : KP407060.1.
^ Инвентарный номер GenBank : KP407059.1.
^ Фатма А. Альджасми; Ранджит Виджаян; Наганисваран Судалаимутуасари; Абдул-Кадер Суид; и другие. (август 2020 г.). «Геномный ландшафт митохондриального генома коренного населения Объединенных Арабских Эмиратов». Гены . 11 (8): 876. doi : 10.3390/genes11080876 . ПМЦ 7464197 . ПМИД 32752197.
^ Номер доступа GenBank : KP407061.1.
^ Номер доступа GenBank : HM185243.1.
^ Номер доступа GenBank : HM185246.1.
^ Номер доступа GenBank : KY410137.1.
^ Номер доступа GenBank : HM185244.1.
^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкеназов . Пресса академических исследований . п. 86. ИСБН 978-1644699843.
^ Джоана Ф. Феррагут; Кристиан Рамон; Хосе А. Кастро; Антониу Аморим; Л. Альварес; А. Пикорнелл (8 декабря 2020 г.). «Ближневосточное генетическое наследие в отцовском и материнском генофондах чуэтасов». Научные отчеты . 10 (1): 21428. Бибкод : 2020NatSR..1021428F. дои : 10.1038/s41598-020-78487-9. hdl : 10216/145245 . ПМЦ 7722846 . ПМИД 33293675.
^ Номер доступа GenBank : ON155501.1.
^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . п. 87. ИСБН 978-1644699843.
^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкеназов . Пресса академических исследований . стр. 86–87. ISBN 978-1644699843.
^ Номер доступа GenBank : OR678686.1.
^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . п. 87. ИСБН 978-1644699843.
^ Инвентарный номер GenBank : KP407062.1.
^ Номер доступа GenBank : MK217175.1.
^ Хушбухат Хан; Мухаммад Хасан Сиддики; и другие. (февраль 2020 г.). «Анализ вариантов контрольной области митохондриальной ДНК в популяции Бельц в Гилгит-Балтистане, Пакистан». Мета Джин . 23 . doi : 10.1016/j.mgene.2019.100630. S2CID 209561126.
^ Номер доступа GenBank : KP407063.1.
^ Номер доступа GenBank : KP407064.1.
^ Номер доступа GenBank : HM185223.1.
^ Номер доступа GenBank : KC911556.1.
^ Инвентарный номер GenBank : KY797195.1.
^ Инвентарный номер GenBank : KP407075.1.
^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . стр. 88–89. ISBN 978-1644699843.
^ Номер доступа GenBank : KT272407.1.
^ Номер доступа GenBank : KT272406.1.

Внешние ссылки

- - Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
  - PhyloTree Манниса ван Овена
- Гаплогруппа R0
- Распространение гаплогруппы pre-HV по данным National Geographic .