stringtranslate.com

Гаплогруппа C-M130

Гаплогруппа C является основной гаплогруппой Y-хромосомы , определяемой UEP M130/RPS4Y 711 , P184, P255 и P260, которые все являются мутациями SNP . Это одна из двух основных ветвей гаплогруппы CF наряду с гаплогруппой F. Гаплогруппа C обнаружена в древних популяциях на всех континентах, кроме Африки, и является преобладающей гаплогруппой Y-ДНК среди мужчин, принадлежащих многим народам, коренным жителям Восточной Азии , Центральной Азии , Сибири , Северной Америки и Австралии, а также некоторым популяциям в Европе , Леванте и позднее в Японии . [1]

Гаплогруппа также встречается с умеренной или низкой частотой среди многих современных популяций Юго-Восточной Азии , Южной Азии и Юго-Западной Азии .

Помимо базальной парагруппы C*, эта гаплогруппа теперь имеет две основные ветви: C1 (F3393/Z1426; ранее CxC3, т. е. старая C1, старая C2, старая C4, старая C5 и старая C6) и C2 (M217; бывшая C3).

Происхождение

Гаплогруппа C-M130, вероятно, происходит от исхода современных людей из Африки , которые распространились на восток из Юго-Западной Азии и постепенно колонизировали Южную Азию, Восточную Азию и Океанию. Исследования разделились относительно того, как произошла эта миграция; большинство исследований поддерживают Северный маршрут через Сибирь, в то время как другие поддерживают гипотезу Южного маршрута, в котором носители гаплогруппы C мигрировали вдоль побережья Индии и Юго-Восточной Азии, чтобы добраться до Китая. [2]

Гаплогруппа C-M130, по-видимому, появилась вскоре после того, как впервые произошла мутация SNP M168, в результате чего появилась современная гаплогруппа CT , от которой произошла гаплогруппа CF , а затем и гаплогруппа C. Вероятно, это произошло не менее 60 000 лет назад.

Гаплогруппа C-M130 достигает самых высоких частот среди коренного населения Казахстана , Монголии , российского Дальнего Востока , Полинезии , некоторых групп Австралии и с умеренной частотой среди корейцев и маньчжуров . Поэтому предполагается, что гаплогруппа C-M130 либо возникла, либо прошла самый длительный период эволюции в регионе Центральной Азии или в регионах Юго-Восточной Азии. Предполагается, что ее экспансия в Восточную Азию началась примерно 40 000 лет назад. [2]

Предполагается, что самцы, являющиеся носителями C-M130, мигрировали в Америку около 6000–8000 лет назад и были занесены народами, говорящими на языке на-дене, на северо-западное тихоокеанское побережье Северной Америки .

Азия также является областью, в которой сконцентрирована гаплогруппа D-M174 . Однако D-M174 более тесно связана с гаплогруппой E, чем с C-M130, и географическое распределение гаплогрупп C-M130 и D-M174 полностью и совершенно различно, при этом различные подтипы гаплогруппы C-M130 с высокой частотой встречаются среди современных казахов и монголов , а также у некоторых коренных народов Америки , маньчжуров . Она также встречается со средней частотой у корейцев , коренных жителей российского Дальнего Востока , некоторых групп австралийских аборигенов и с умеренной частотой в других местах по всей Азии и Океании. Носители гаплогруппы C среди поздних людей Дземон в Японии и некоторых палеолитических и неолитических европейцев несли C1a, C1b и C1a2. В то время как гаплогруппа D встречается с высокой частотой только среди тибетцев, японцев и жителей Андаманских островов и не была обнаружена ни в Индии, ни среди коренных жителей Америки или Океании. [1]

По словам Сакитани и др., гаплогруппа C-M130 возникла в Центральной Азии и распространилась оттуда в другие части Евразии и в части Австралии. Предполагается, что C-M130 была обнаружена у охотников-собирателей Восточной Евразии, а также в древних образцах Восточной и Юго-Восточной Азии и Европы. [1]

Структура

С* (M130/Страница 51/RPS4Y711, M216)

(Приведенная выше филогенетическая структура субкладов гаплогруппы C-M130 основана на дереве ISOGG 2015, дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях. [7] [8] )

Распределение

Прогнозируемое пространственное распределение частот для гаплогруппы C в Восточной Азии. [9]

Распространение гаплогруппы C-M130 в целом ограничено популяциями Сибири, части Восточной Азии, Океании и Америки . Из-за огромного возраста гаплогруппы C многочисленные вторичные мутации успели накопиться, и было идентифицировано множество регионально важных подветвей гаплогруппы C-M130.

До 46% мужчин- аборигенов Австралии несли либо базальную C* (C-M130*), C1b2b* (C-M347*), либо C1b2b1 (C-M210) до контакта с европейцами и их значительной иммиграции, согласно исследованию 2015 года, проведенному Nagle et al. [10] То есть, 20,0% Y-хромосом 657 современных людей, до того, как 56% этих образцов были исключены как «некоренные». C-M130*, по-видимому, носили до 2,7% мужчин-аборигенов до колонизации; 43% несли C-M347, которая не была обнаружена за пределами Австралии. Другие гаплогруппы австралийских аборигенов похожи на папуасов и других негритосов ( гаплогруппы S-M230 и M-P256 ). [10] [11]

Низкие уровни C-M130* наблюдаются у мужчин:

Базальный C1a* (CTS11043) был обнаружен у европейцев верхнего палеолита ( ориньякцев ), GoyetQ116-1 и Pestera Muerii2. [13]

C1b был идентифицирован в доисторических останках, датируемых 34 000 лет до н.э., найденных в России и известных как « Костенки 14 ». [14]

Гаплогруппа C2 (M217) — самая многочисленная и широко распространенная линия C — когда-то считалось, что она возникла в Центральной Азии , распространилась оттуда в Северную Азию и Америку , в то время как другая теория предполагает, что она возникла в Восточной Азии. [7] C-M217 простирается в продольном направлении от Центральной Европы и Турции до народа вайю в Колумбии и Венесуэле , а в широтном направлении — от атабаскских народов Аляски до Вьетнама и Малайского архипелага . Найдена в низких концентрациях в Восточной Европе , где она может быть наследием вторжений/миграций гуннов , турок и /или монголов в Средние века. Особенно часто встречается у бурят , дауров , хазарейцев , ительменов , калмыков , коряков , маньчжуров , монголов , орокенов и сибеев , а также умеренно распространена среди других тунгусских народов , корейцев , айнов , нивхов , алтайцев , тувинцев , узбеков , китайцев хань , туцзя , хани и хуэй . [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] Самые высокие частоты гаплогруппы C-M217 обнаружены среди популяций Монголии и Дальнего Востока России , где она является модальной гаплогруппой. Гаплогруппа C-M217 — единственная разновидность гаплогруппы C-M130, обнаруженная среди коренных американцев , среди которых она достигает самой высокой частоты в популяциях на-дене . Также имело бы смысл предположение, что эта линия могла возникнуть в Америке, поскольку это единственная разновидность, обнаруженная среди коренного населения.

Другие субклады специфичны для определенных популяций в пределах ограниченного географического ареала; даже там, где эти другие ветви встречаются, они, как правило, проявляются как очень низкочастотный, незначительный компонент палитры разнообразия Y-хромосомы на этих территориях:

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименований для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. В таблице ниже все эти работы объединены в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании YCC Tree приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Известные члены

Один конкретный гаплотип в гаплогруппе C-M217 привлек большое внимание в связи с возможностью того, что он может представлять собой прямое происхождение по отцовской линии от Чингисхана .

В исследовательской работе, опубликованной в 2017 году, «Генетический след ранних миграций Айсин Гиоро, императорского дома династии Цин» [42] подтверждается, что клан Айсин Гиоро принадлежит к гаплогруппе C3b1a3a2-F8951, родственной ветви скопления звезд C3* (в настоящее время именуемого C3b1a3a1-F3796, когда-то связанного с Чингисханом ).

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК C

Y-ДНК остовное дерево

Ссылки

  1. ^ abcd 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』(勉誠出版 2009年) (на японском языке)
  2. ^ abcdefgh Zhong H, Shi H, Qi XB и др. (июль 2010 г.). «Глобальное распределение гаплогруппы Y-хромосомы C-M130 раскрывает доисторические пути миграции африканского исхода и раннего поселения в Восточной Азии». J. Hum. Genet . 55 (7): 428–35. doi : 10.1038/jhg.2010.40 . PMID  20448651.
  3. ^ «В настоящее время большинство археологических и генетических свидетельств подтверждают, что самый ранний исход африканцев начался из Африки через Красное море, а затем быстро мигрировал на материковую часть Юго-Восточной Азии через побережье Индии и в конечном итоге достиг Океании.36, 37, 38, 39 Недавний анализ Y-хромосомы и митохондриальной ДНК в Австралии и Новой Гвинее показал, что Hg C, вероятно, является одним из самых ранних типов-основателей, пришедших из Африки,12 что также было предложено в другом исследовании,6 и что линии митохондриальной ДНК, состоящие из типов-основателей (M и N), датируются приблизительно 50–70 тыс. лет назад.12» ... «Мы предполагаем, что Hg C произошел от исхода африканцев и постепенно колонизировал Южную Азию, Юго-Восточную Азию, Океанию и Восточную Азию в результате единой палеолитической миграции из Африки в Азию и Океанию, которая произошла более 40 тыс. лет назад».
  4. ^ "ISOGG 2018 Y-ДНК гаплогруппа C".
  5. ^ abc Tumonggor, Meryanne K; Karafet, Tatiana M; Downey, Sean; et al. (2014). «Изоляция, контакт и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе». Journal of Human Genetics . 59 (9): 1–10. doi :10.1038/jhg.2014.62. PMC 4521296 . PMID  25078354. 
  6. ^ ab Scheinfeldt, L.; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). «Неожиданная вариация хромосомы NRY на северном острове Меланезия». Молекулярная биология и эволюция . 23 (8): 1628–41. doi : 10.1093/molbev/msl028 . PMID  16754639.
  7. ^ abcdefgh ISOGG, 2015 «Y-ДНК гаплогруппа C и ее субклады – 2015» (15 сентября 2015 г.).
  8. ^ Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID  18385274. 
  9. ^ Ван, CC; Ли, H (2013 ) . «Вывод истории человечества в Восточной Азии из Y-хромосом». Investig Genet . 4 (1): 11. doi : 10.1186/2041-2223-4-11 . PMC 3687582. PMID  23731529. 
  10. ^ ab Nagle, N.; et al. (2015). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии». Американский журнал физической антропологии . 159 (3): 367–81. doi :10.1002/ajpa.22886. PMID  26515539. S2CID  2225529.
  11. ^ Худжашов Г., Кивисилд Т., Андерхилл ПА и др. (май 2007 г.). «Выявление доисторического заселения Австралии с помощью анализа Y-хромосомы и мтДНК». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 104 (21): 8726–30. Bibcode : 2007PNAS..104.8726H. doi : 10.1073 /pnas.0702928104 . PMC 1885570. PMID  17496137. 
  12. ^ Cognoms Catalans, без даты, Результат (15 сентября 2015 г.). (Проект Cognoms Catalans, который исследует «генетические фамилии» в Каталонии, Валенсии и на Балеарских островах, базируется в Университете Помпеу Фабра в Барселоне.)
  13. ^ Фу, К.; Пост, К.; Хайдиняк, М.; Петр, М.; Маллик, С.; Фернандес, Д.; Фуртвенглер, А.; Хаак, В.; Мейер, М.; Миттник, А.; Никель, Б.; Пельтцер, А.; Роланд, Н.; Слон, В.; Таламо, С.; Лазаридис, И.; Липсон, М.; Мэтисон, И.; Шиффельс, С.; Скоглунд, П.; Деревянко А.П.; Дроздов Н.; Славинский В.; Цыбанков А.; Кремонези, РГ; Маллени, Ф.; Жели, Б.; Вакка, Э.; Гонсалес Моралес, MR; и др. (2016). «Генетическая история Европы ледникового периода». Природа . 534 (7606): 200–205. Bibcode : 2016Natur.534..200F. doi : 10.1038/nature17993. PMC 4943878. PMID  27135931. 
  14. ^ Seguin-Orlando, A.; et al. (2014). «Геномная структура европейцев, датируемая как минимум 36 200 годами» (PDF) . Science . 346 (6213): 1113–1118. Bibcode :2014Sci...346.1113S. doi :10.1126/science.aaa0114. PMID  25378462. S2CID  206632421. Архивировано из оригинала (PDF) 29.08.2016.
  15. ^ ab Xue Y, Zerjal T, Bao W и др. (апрель 2006 г.). «Мужская демография в Восточной Азии: контраст между севером и югом во времена расширения человеческой популяции». Genetics . 172 (4): 2431–9. doi :10.1534/genetics.105.054270. PMC 1456369 . PMID  16489223. 
  16. ^ abc Hammer MF, Karafet TM, Park H, et al. (2006). «Двойное происхождение японцев: общая почва для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». J. Hum. Genet . 51 (1): 47–58. doi : 10.1007/s10038-005-0322-0 . PMID  16328082.
  17. ^ Тадзима, Ацуси; Хаями, Масанори; Токунага, Кацуси; Джуджи, Т; Мацуо, М; Марзуки, С; Омото, К; Хораи, С (2004). «Генетическое происхождение айнов, выведенное из комбинированного анализа ДНК материнских и отцовских линий». Журнал генетики человека . 49 (4): 187–193. doi : 10.1007/s10038-004-0131-x . PMID  14997363.
  18. ^ abcd Sengupta S, Zhivotovsky LA, King R, et al. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как местные, так и экзогенные расширения и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Am. J. Hum. Genet . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230 . PMID  16400607. 
  19. ^ аб Лелль Дж.Т., Сукерник Р.И., Стариковская Ю.Б. и др. (январь 2002 г.). «Двойное происхождение и сибирское сходство Y-хромосом коренных американцев». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (1): 192–206. дои : 10.1086/338457. ПМЦ 384887 . ПМИД  11731934. 
  20. ^ Уэллс RS, Юлдашева N, Рузибакиев R и др. (август 2001 г.). «Евразийский центр: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (18): 10244–9. Bibcode : 2001PNAS...9810244W. doi : 10.1073/pnas.171305098 . PMC 56946. PMID  11526236 . 
  21. ^ Насидзе И, Куинк Д, Дюпанлуп И, Кордо Р, Кокшунова Л, Стоункинг М (декабрь 2005 г.). «Генетические доказательства монгольского происхождения калмыков». Am. J. Phys. Anthropol . 128 (4): 846–54. doi :10.1002/ajpa.20159. PMID  16028228. S2CID  27115596.
  22. ^ Скоццари Р., Массая А., Д'Атанасио Э., Майрес Н.М., Перего Ю.А. и др. (2012). «Молекулярное рассечение базальных клад филогенетического дерева Y-хромосомы человека». ПЛОС ОДИН . 7 (11): e49170. Бибкод : 2012PLoSO...749170S. дои : 10.1371/journal.pone.0049170 . ПМЦ 3492319 . ПМИД  23145109. 
  23. ^ "Блог антропологии Диенекеса: смуглый, голубоглазый, носитель Y-гаплогруппы C европейский охотник-собиратель из Испании (Олальде и др., 2014)". 2014-01-26.
  24. ^ http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2015/02/10/013433.full.pdf [ пустой URL-адрес PDF ]
  25. ^ Фу, Цяомей и др. (2016). «Генетическая история Европы ледникового периода». Nature . 534 (7606): 200–5. Bibcode :2016Natur.534..200F. doi :10.1038/nature17993. PMC 4943878 . PMID  27135931. 
  26. ^ abc Gayden, Tenzin; Cadenas, Alicia M.; Regueiro, Maria; Singh, NB; Zhivotovsky, LA; Underhill, PA; Cavalli-Sforza, LL; Herrera, RJ (2007). «Гималаи как направленный барьер для потока генов». American Journal of Human Genetics . 80 (5): 884–894. doi :10.1086/516757. PMC 1852741. PMID  17436243 . 
  27. ^ ab Fornarino, Simona; Pala, Maria; Battaglia, Vincenza; et al. (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Tharus (Непал): резервуар генетической изменчивости». BMC Evolutionary Biology . 9 (1): 154. Bibcode : 2009BMCEE...9..154F. doi : 10.1186/1471-2148-9-154 . PMC 2720951. PMID  19573232 . 
  28. ^ ab Каденас, Алисия М; Животовский, Лев А; Кавалли-Сфорца, Лука Л; Андерхилл, ПА; Эррера, Р. Дж. (2008). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–386. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . PMID  17928816.
  29. ^ ab Абу-Амеро, Халед К; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами». BMC Genetics . 10 : 59. doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . PMC 2759955. PMID  19772609 . 
  30. ^ Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID  18385274. 
  31. ^ Cox MP, Redd AJ, Karafet TM и др. (октябрь 2007 г.). «Полинезийский мотив на Y-хромосоме: структура населения в отдаленных районах Океании». Hum. Biol . 79 (5): 525–35. doi :10.1353/hub.2008.0004. hdl : 1808/13585 . PMID  18478968. S2CID  4834817.
  32. ^ Underhill PA, Shen P, Lin AA и др. (ноябрь 2000 г.). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nat. Genet . 26 (3): 358–61. doi :10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  33. ^ Zegura SL, Karafet TM, Zhivotovsky LA, Hammer MF (январь 2004 г.). «Высокоточные однонуклеотидные полиморфизмы и микросателлитные гаплотипы указывают на единичный недавний въезд Y-хромосом коренных американцев в Америку». Mol. Biol. Evol . 21 (1): 164–75. doi : 10.1093/molbev/msh009 . PMID  14595095.
  34. ^ Пакендорф Б, Новгородов И.Н., Осаковский В.Л., Данилова А.П., Протодьаконов А.П., Стоункинг М. (октябрь 2006 г.). «Исследование последствий доисторических миграций в Сибири: генетическая изменчивость и происхождение якутов». Хм. Жене . 120 (3): 334–53. дои : 10.1007/s00439-006-0213-2. PMID  16845541. S2CID  31651899.
  35. ^ Харьков ВН, Степанов ВА, Медведев ОФ и др. (2008). "[Происхождение якутов: анализ гаплотипов Y-хромосомы]". Мол. биол. (Моск.) . 42 (2): 226–37. PMID  18610830.
  36. ^ abc Борис Малярчук, Мирослава Деренко, Галина Денисова и др. , «Филогеография гаплогруппы С Y-хромосомы в Северной Евразии». Анналы генетики человека (2010) 74 539–546. doi: 10.1111/j.1469-1809.2010.00601.x.
  37. ^ Манфред Кайзер, Силке Брауэр, Ричард Кордо и др. (2006), «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: градиенты мтДНК и Y-хромосомы по всему Тихому океану». Mol. Biol. Evol. 23(11):2234–2244. doi:10.1093/molbev/msl093
  38. ^ Мона, Стефано; Грюнц, Катарина Э.; Брауэр, Силке; и др. (2009). «История генетического смешения Восточной Индонезии, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». Mol. Biol. Evol . 26 (8): 1865–1877. doi : 10.1093/molbev/msp097 . PMID  19414523.
  39. ^ Karafet Tatiana M.; Hallmark Brian; Cox Murray P.; et al. (2010). «Основное разделение Восток–Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии». Mol. Biol. Evol . 27 (8): 1833–1844. doi : 10.1093/molbev/msq063 . PMID  20207712. S2CID  4819475.
  40. ^ JD Cristofaro et al., 2013, «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента», http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0076748
  41. ^ ab Wang CC, Wang LX, Shrestha R, Zhang M, Huang XY и др. (2014), «Генетическая структура популяций цянгиков, проживающих в Западном Сычуаньском коридоре». PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
  42. ^ Вэй, Лан-Хай; Ян, Ши; Ю, Ге; Хуан, Юн-Чжи; Яо, Да-Ли; Ли, Ши-Лин; Джин, Ли; Ли, Хуэй (2017). «Генетический след ранних миграций Айсин Гиоро, императорского дома династии Цин». Джей Хум Жене . 62 (62 марта (3)): 407–411. дои : 10.1038/jhg.2016.142. PMID  27853133. S2CID  7685248.

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки