Гаплогруппа О-М268

В генетике человека гаплогруппа O-M268 , также известная как O1b (ранее гаплогруппа O2), представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Гаплогруппа O-M268 является основным субкладом гаплогруппы O-F265, которая сама по себе является основной потомковой ветвью гаплогруппы O-M175 .

Источник

В статье, опубликованной в 2011 году группой китайских исследователей, связанных с Фуданьским университетом , было высказано предположение, что Китай является источником распространения гаплогруппы O-P31 (там она называется гаплогруппой O2-M268). ^[4]

Распределение

Гаплогруппа О-Р31 отличается особенностями географического распространения. Как и все клады гаплогруппы O-M175, гаплогруппа O-P31 встречается только среди мужчин современных популяций Восточной Евразии . Однако гаплогруппа O-P31 обычно встречается с высокой частотой только среди определенных популяций, таких как австроазиатские народы Индии, Бангладеш и Юго-Восточной Азии, никобарцы Никобарских островов в Индийском океане, корейцы и японцы .

Помимо широкого и неоднородного распространения, гаплогруппа O1b-P31 также примечательна тем, что ее можно разделить на два основных субклада, которые демонстрируют почти полностью разрозненное распространение: O1b1-M1304/K18 и O1b2-M176/P49. Один из этих субкладов, O1b1-M1304/K18 (также известный как O-F2320), в основном можно разделить на два субклада: O1b1a1-PK4 (ранее O2a) и O1b1a2-CTS4040 (ранее O2*(xM95,M176)). O1b1a1-PK4 встречается главным образом среди популяций Юго-Восточной Азии и некоторых племенных популяций Индии (таких как ремо , жуанг и никобарцы ), но он также распространен среди этнических меньшинств на юге Китая и встречается с низкой частотой по всей территории. Китае, а также в Японии. O1b1a2-CTS4040 относительно редок и в основном распространен в Восточной Азии, особенно в Китае , где он составляет примерно 3,22% мужского населения страны. ^[5] Другой первичный субклад гаплогруппы O1b-P31, то есть гаплогруппа O1b2-M176 (ранее O2b), встречается примерно у трети современных японских и корейских мужчин и с низкой частотой (приблизительно 0,70% ^[6] ) у Китайские мужчины.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Оригинальные исследовательские публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Хаммер 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ Вс 1999 г.
η Капелли 2001 г.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 (Карафет 2008) и последующих опубликованных исследованиях.

О-П31 (П31, М268)
- О-К18
  - O-CTS4040 В основном встречается в ханьском китайском языке и иногда встречается в китайском (дай), маньчжурском, Таиланде ( фуан , тайюань , тайский ), Вьетнаме, на Филиппинах, в Западном Калимантане , Катаре , Хазаре , Японии, Корее.
  - О-ПК4
    - O-F838 Встречается у ханьских китайцев ^[4]^[7] и в экземпляре из средневекового Южного Казахстана , приписываемом тюркам ; ^[8] вероятно, также присутствует в Таиланде ( Калеун , Фуан , Тай ), ^[9] Ханое , ^[7] Амбоне , ^[7] регионе Иравади , ^[10] и округе Синьлун ^[11]
    - О-М95 (М95)
      - О-CTS350
        O-CTS350* найден в Японии.
        O-CTS10007 Найден у ханьцев в провинции Хунань.
      - О-М1310
        О-F1252
        O-SK1630/F5504 Китай ( Шэньси ), ^[3] Россия ( Рязанская область ) ^[3]
        О-SK1636
        О-F2924
        O-CTS5854 Встречается в Китае (Хань, Дай ), Лаосе, Таиланде, Японии и на Филиппинах.
        О-М88 (М88, М111) Встречается во Вьетнаме, Лаосе, Таиланде, Камбодже, Мьянме, Китае (Дай, Буи, Чжуан, Ли, Шуй, Ше, Мяо, Яо, Деанг, Булан, Цян, Туцзя, Лису, Ачан, Ну, Лаху, Цзинуо, Хани, Йи, Бай, Хан), Тайвань (Хан, Бунун, Ями), Ява, Борнео, Малайзия, Филиппины
        O-F789/M1283 Встречается в Китае, Вьетнаме, Камбодже, Сингапуре (Малайский), ^[12] Индонезии, Лаосе, Таиланде, Мьянме, Бутане, ^[13] Бангладеш и Индии.
- O-P49 (M176, SRY465, P49, 022454) Япония, ^[14] Южная Корея, ^[14] Китай, ^[14] Монголия, ^[14] Вьетнам, ^[14] Микронезия ^[14]
  - O-P49*(xPage92) Япония, Южная Корея
  - О-страница92
    - O-Page90 Япония ( Хиросима ), Цзилинь ^[3]
    - О-CTS9259
      - O-CTS562 Пекин ( Хань ), ^[3] Южная Корея , ^[15] Япония (Фукусима) ^[3]
      - О-К10/F1204
        O-K10* Япония (Токио ^[3] )
        O-CTS10687 Япония, ^[14] Монголия ^[14]
        O-K7/CTS11723/47z Встречается примерно у 24% японских мужчин и реже в Корее и Китае.
        O-BY130355 Сычуань ^[3]
        О-К2/CTS713
        O-K2* Япония (Токио, ^[3] Аомори ^[3] ), Южная Корея ^[3]
        O-CTS203 Япония (Токио, ^[3] Мияги ^[3] ), Хэнань ^[3]
        О-К14
        O-K14* Шаньси ^[3]
        O-M776 Япония (Токио ^[3] )
        O-Z24594
        O-Z24594* Южная Корея ^[3]
        O-CTS56 Япония (Токио, ^[3] Кумамото ^[3] )
        O-Y178266 Япония (Токио ^[3] ), Пекин ^[3]
        O-Z24599
        O-Z24599* Япония (Токио, ^[3] Ямагути ^[3] )
        O-K473 Япония (Токио ^[3] )
        O-Y181118 Южная Корея (Пусан ^[3] ), Хэбэй ^[3]
        О-К4
        O-K3/F940 Хунань ( Хань ), Цзянси, Хэнань (Хань)
        O-F940* Хунань, ^[3] Цзянси ^[3]
        O-K481 Хунань (Хань) ^[3]
        O-L682 Встречается примерно у 19% южнокорейских мужчин ^[16] и с меньшей частотой в Японии и Китае.
        O-L682* Шаньси ^[3]
        О-К485
        O-K485* Япония (Токио) ^[3]
        О-CTS723
        O-CTS723* Южная Корея ^[3]
        О-А23652
        O-A23652* Японский ^[3]
        О-А23653
        O-A23653* Япония, ^[3] Южная Корея ^[3]
        О-А23658
        O-A23658* Южная Корея ^[3]
        O-Y165475 Южная Корея ^[3]
        O-Y24057
        O-Y24057* Шаньдун ^[3]
        О-A12448
        O-A12448* Южная Корея (включая Тэгу ^[3] )
        O-PH40 Пекин (Хань), ^[3] Шаньдун, ^[3] Южная Корея, ^[3] Япония ^[14]
        O-MF14220 Южная Корея ^[3]
        O-Y26376/CTS7620 Япония, ^[14] Южная Корея ^[14]
        O-MF14346 Южная Корея ^[3]
        O-Y26377
        O-Y26377* Япония (Окаяма), ^[3] Хэчжэнь ^[3]
        O-CTS1175 Япония (Кочи, ^[3] Токио ^[3] )

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК О

О-47з
О-М101
О-М113
О-М117
О-М119
О-М121
О-М122
О-М134
О-М159
О-М162
О-М164
О-М175
О-М176
О-М50
О-М7
О-М88
О-М95
О-MSY2.2
О-П31

Основополагающее дерево Y-ДНК

Рекомендации

^ Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес и др. , «Периодические всплески демографических показателей мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Нат Жене. 2016 июнь; 48 (6): 593–599. doi:10.1038/ng.3559.
^ ab Моника Кармин, Родриго Флорес, Лаури Сааг, Георгий Худжашов, Николас Брукато, Челзи Кренна-Дарусаллам, Максимилиан Ларена, Филипп Л. Эндикотт, Маттиас Якобссон, Дж. Стивен Лансинг, Херавати Судойо, Мэтью Ливсли, Мейт Метспалу, Франсуа-Ксавье Рико, и Мюррей П. Кокс, «Эпизоды диверсификации и изоляции в мужских линиях островной Юго-Восточной Азии и Ближнего Океании», « Молекулярная биология и эволюция », том 39, выпуск 3, март 2022 г., msac045, https://doi.org/10.1093/molbev/ msac045
^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw YFull Haplogroup YTree v5.04, 16 мая 2017 г.
^ ab Ши Ян, Чуан-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Лин Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические положения мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; doi:10.1038/ejhg.2011.64
^ "O-Cts4040单倍群详情" .
^ "O-P49单倍群详情" .
^ abc Жан А. Трежо, Эстелла С. Полони, Джу-Чен Йен и др. (2014), «Вариации ДНК Y-хромосомы Тайваня и ее связь с островами Юго-Восточной Азии». БМК Генетика 2014, 15:77. http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
^ Питер де Баррос Дамгаард, Нина Марчи, Саймон Расмуссен и др. (2018), «137 геномов древнего человека со всех концов евразийских степей». Nature, том 557, страницы 369–374 (2018). https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
^ Вибху Кутанан, Джатупол Кампуансай, Метави Срикуммул, Андреа Брунелли, Сильвия Гиротто, Леонардо Ариас, Энрико Махольдт, Александр Хюбнер, Роланд Шредер и Марк Стоункинг, «Сравнение отцовских и материнских генетических историй тайского и лаосского населения». Мол. Биол. Эвол. Публикация в предварительном доступе, 12 апреля 2019 г. doi :10.1093/molbev/msz083
^ Мин-Шэн Пэн, Цзюнь-Донг Хэ, Лонг Фан и др. (2013), «Извлечение деревьев гаплогрупп Y-хромосомы с использованием данных GWAS». Европейский журнал генетики человека (2013), 1–5. doi:10.1038/ejhg.2013.272
^ Ван CC, Ван LX, Шреста Р., Чжан М, Хуан XY и др. (2014), «Генетическая структура цянских популяций, проживающих в Западном Сычуаньском коридоре». PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
^ Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. , «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре». Геномные исследования 25:1–8; ISSN 1088-9051/15; www.genome.org
^ Пилле Халласт, Кьяра Батини, Даниэль Задик и др. (2015), «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 SNP с высокой степенью достоверности, охватывающие большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция, март 2015 г.;32(3):661-73. doi:10.1093/molbev/msu327
^ abcdefghijk Гаплодерево Y-ДНК в генеалогическом древе ДНК
^ O Проект Y-гаплогруппы в генеалогическом древе ДНК
^ Со Юн Квон, Хван Ён Ли, Ын Ён Ли, У Ик Ян и Кён-Джин Шин, «Подтверждение топологии дерева гаплогрупп Y с недавно предложенными Y-SNP для подгаплогрупп C2, O2b и O3a». Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 42–46. https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003

Сноски

Цитируемые работы

Журналы

Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; Чжан, Вейлин; Хорошо, Джошуа; Хуан, Вэй; Шен, Ди; и другие. (1999). «Свидетельства Y-хромосомы миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода». Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–24. дои : 10.1086/302680. ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926.

Веб-сайты

«Описания гаплогрупп Y-ДНК». Архивировано из оригинала 19 марта 2009 г.

Источники таблиц преобразования

Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и другие. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205. ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891.
Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и другие. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360.
Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и другие. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК». Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID 11313742. S2CID 21432405.
Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и другие. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы». Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299. ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588.
Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, М.Ф. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi : 10.1101/gr.7172008, PMC 2336805 , PMID 18385274
Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и другие. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S, doi : 10.1126/science.290.5494. 1155, ПМИД 11073453
Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и другие. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.

дальнейшее чтение

Фирасат, Садаф; Халик, Шагуфта; Мохьюддин, Аиша; Папайоанну, Мирто; Тайлер-Смит, Крис; Андерхилл, Питер А; Аюб, Касим (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана». Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726. ПМЦ 2588664 . ПМИД 17047675.
Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантакьяра-Бенерекетти, Сильвана А (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Таруса (Непал): резервуар генетических вариаций». Эволюционная биология BMC . 9 (1): 154. Бибкод : 2009BMCEE...9..154F. дои : 10.1186/1471-2148-9-154 . ПМК 2720951 . ПМИД 19573232.
Херлс, М; Сайкс, Б; Джоблинг, М; Форстер, П. (2005). «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: данные по материнской и отцовской линии». Американский журнал генетики человека . 76 (5): 894–901. дои : 10.1086/430051. ПМЦ 1199379 . ПМИД 15793703.
Карафет Татьяна М.; Лансинг, Дж. С.; Редд, Алан Дж.; Уоткинс, Джозеф К.; Сурата, СПК; Артхавигуна, Вашингтон; Майер, Лаура; Бамшад, Майкл; и другие. (2005). «Балийский взгляд на Y-хромосому на заселение Индонезии: генетический вклад донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев». Человеческая биология . 77 (1): 93–114. дои : 10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID 16114819. S2CID 7953854.
Саху, Сангамитра; Кашьяп, В.К. (2006). «Филогеография митохондриальной ДНК и гаплогрупп Y-хромосомы выявляет асимметричный поток генов в популяциях Восточной Индии». Американский журнал физической антропологии . 131 (1): 84–97. дои : 10.1002/ajpa.20399. ПМИД 16485297.
Триведи, Раджни; Ситалакшими, Т.; Банерджи, Джилам; Сингх, Анамика; Сиркар, ПК; Кашьяп, В.К. (2006). «Молекулярное понимание происхождения шомпенов, сокращающегося населения Никобарского архипелага». Журнал генетики человека . 51 (3): 217–26. дои : 10.1007/s10038-005-0349-2 . ПМИД 16453062.