Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Гаплогруппа Q-M120 , также известная как Q1a1a1 , является гаплогруппой Y-ДНК . Это единственная первичная ветвь гаплогруппы Q1a1a (F746/NWT01). Линия наиболее распространена среди современных популяций в восточной Евразии .
Однако гаплогруппа могла быть исторически широко распространена в евразийских степях и Северной Азии, поскольку она обнаружена среди киммерийцев в Молдавии и уроженцев Хубсугула эпохи бронзового века . [1]
Распределение
Америка
Один из образцов 1K Genomes, HG01944, от перуанцев в Лиме, Перу, принадлежит к Q-M120. [2] [3] Q-M120 — это другая ветвь под Q-F746. Она наиболее известна как восточноазиатская ветвь Q. Это интригует; если это не результат постколониального смешения, то это будет четвертая или пятая линия Q в Америке. Ветвь Q-M120, включая этот образец, имеет расчетный TMRCA от 5000 до 7000 лет, [2] что означает, что она может быть результатом более поздней доколумбовой иммиграции из Северной или Восточной Азии.
Азия
Q-M120 присутствует в Восточной Азии и может иметь восточноазиатское происхождение . [ 4] [5] [6] Он был обнаружен с низкой частотой в образцах китайцев хань , [5] [6] дунган , [7] хмонг-до в Лаосе, [8] японцев , [9] калмыков дёрвод , [10] корейцев , [7] монголов , [11] [12] тибетцев , [6] [13] [14] уйгуров , [15] и вьетнамцев . [2] [3] Он также был обнаружен среди бутанцев , [16] мурутов в Брунее , [17] и азербайджанцев . [2] Сенгупта и др. (2006) сообщили об обнаружении Q-M120 в выборке HGDP пакистанских хазарейцев [18] , но байесовское дерево на дополнительном рисунке 12 Липпольда и др. (2014) предполагает, что эти пакистанские хазарейцы HGDP с большей вероятностью должны принадлежать к Q-L275, и что три члена выборки HGDP наси и один член выборки HGDP хань должны вместо этого принадлежать к Q-M120. [19] Ди Кристофаро и др. (2013) протестировали тот же образец пакистанских хазарейцев и сообщили, что они принадлежали к следующим гаплогруппам Y-ДНК: 1/25 C-PK2/M386(xM407, M532), 9/25 C-M401, 1/25 I-M223, 1/25 J-M530, 2/25 O-M122(xM134), 1/25 Q-M242(xM120, M25, M346, M378), 1/25 Q-M378, 1/25 R-M124, 8/25 R-M478/M73. [12]
Согласно исследованию 2019 года, Q-M120 можно найти в высоких концентрациях в северных и восточных регионах Китая. В меньшей степени его можно найти в Северной Корее, Южной Корее и на севере Филиппин. [20]
Европа
На сегодняшний день Q-M120 не обнаружен в европейских популяциях.
Ассоциированные SNP
Гаплогруппа Q-M120 определяется наличием полиморфизма одного нуклеотида (SNP) M120, а также SNP M265 (он же N14).
Филогенетическое дерево
Это Томас Кран из проекта геномного древа гаплогруппы Q-M120 Центра геномных исследований.
Смотрите также
Субклады Y-ДНК Q-M242
Y-ДНК остовное дерево
Ссылки
- ^ Сан, На; Ма, Пэн-Чэн; Янь, Ши; и др. (2019). «Филогеография гаплогруппы Y-хромосомы Q1a1a-M120, отцовской линии, соединяющей популяции Сибири и Восточной Азии». Annals of Human Biology . 46 (3): 261–266 – через Taylor & Francis Online.
- ^ abcd YFull Haplogroup YTree v6.03.05 от 20 июля 2018 г. Доступ 20 июля 2018 г.
- ^ abc G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez и др. (2016), «Пунктуированные всплески в демографии мужчин, выведенные из 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Nature Genetics 2016 Июнь; 48(6): 593–599. doi:10.1038/ng.3559.
- ^ Груни, Виола; Равеан, Алессандро; Онгаро, Линда; Батталья, Винченца; Тромбетта, Бениамино; Коломбо, Джулия; Каподиферро, Марко Росарио; Оливьери, Анна; Ахилли, Алессандро; Перего, Уго А.; Мотта, Хорхе; Трибальдос, Марибель; Вудворд, Скотт Р.; Ферретти, Лука; Кручиани, Фульвио (2019). «Анализ гаплогруппы Q Y-хромосомы человека характеризует древние перемещения населения в Евразии и Америке». БМК Биология . 17 (1): 3. дои : 10.1186/s12915-018-0622-4 . ISSN 1741-7007. ПМК 6345020 . ПМИД 30674303.
- ^ ab Wen B; Li H; Lu D; et al. (сентябрь 2004 г.). «Генетические данные подтверждают демическую диффузию культуры Хань». Nature . 431 (7006): 302–5. Bibcode :2004Natur.431..302W. doi :10.1038/nature02878. PMID 15372031. S2CID 4301581.– Дополнительная таблица 2: Распределение гаплогруппы NRY в популяциях хань
- ^ abcdefghij Су, Бинг; Сяо, Чуньцзе; Дека, Ранджан; Зейлстад, Марк Т.; Канванпонг, Даорунг; Сяо, Цзюньхуа; Лу, Дару; Андерхилл, Питер; Кавалли-Сфорца, Лука (2000). «Гаплотипы Y-хромосомы свидетельствуют о доисторических миграциях в Гималаи». Генетика человека . 107 (6): 582–90. дои : 10.1007/s004390000406. PMID 11153912. S2CID 36788262.
- ^ abcd Уэллс RS; Юлдашева N; Рузибакиев R; и др. (август 2001 г.). "Евразийский хартленд: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (18): 10244–9. Bibcode : 2001PNAS...9810244W. doi : 10.1073/pnas.171305098 . PMC 56946. PMID 11526236 . – Таблица 1: Частоты гаплотипов Y-хромосомы в 49 популяциях Евразии, перечисленных в соответствии с географическим регионом
- ^ Cai X, Qin Z, Wen B, Xu S, Wang Y и др. (2011), «Миграция людей через узкие места из Юго-Восточной Азии в Восточную Азию во время последнего ледникового максимума, выявленная Y-хромосомами». PLoS ONE 6(8): e24282. doi:10.1371/journal.pone.0024282
- ^ ab Nonaka, I.; Minaguchi, K.; Takezaki, N. (2007). "Y-хромосомные бинарные гаплогруппы в японской популяции и их связь с 16 полиморфизмами Y-STR". Annals of Human Genetics . 71 (4): 480–95. doi :10.1111/j.1469-1809.2006.00343.x. hdl : 10130/491 . PMID 17274803. S2CID 1041367.
- ^ Борис Малярчук, Мирослава Деренко, Галина Денисова, Санж Хойт, Марцин Возняк, Томаш Гжибовский и Илья Захаров, «Разнообразие Y-хромосомы у калмыков на этническом и племенном уровнях». Журнал генетики человека (2013) 58, 804–811; дои:10.1038/jhg.2013.108
- ^ Батталья В., Гругни В., Перего У.А., Ангерхофер Н., Гомес-Пальмьери Дж.Э. и др. (2013), «Первое заселение Южной Америки: новые доказательства из гаплогруппы Q Y-хромосомы». PLoS ONE 8(8): e71390. doi:10.1371/journal.pone.0071390
- ^ abc Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А. и др. (2013) «Афганский Гиндукуш: место, где сходятся потоки генов на Евразийском субконтиненте». PLoS ONE 8(10): e76748. doi:10.1371/journal.pone.0076748
- ^ ab Gayden T; Cadenas AM; Regueiro M; et al. (май 2007 г.). «Гималаи как направленный барьер для потока генов». Am. J. Hum. Genet . 80 (5): 884–94. doi :10.1086/516757. PMC 1852741 . PMID 17436243.
- ^ Wang CC, Wang LX, Shrestha R, Zhang M, Huang XY и др. (2014), «Генетическая структура популяций Qiangic, проживающих в Западном Сычуаньском коридоре». PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
- ^ abcd Zhong, H.; Shi, H.; Qi, X.-B.; Duan, Z.-Y.; Tan, P.-P.; Jin, L.; Su, B.; Ma, RZ (2010). «Расширенное исследование Y-хромосомы предполагает постледниковые миграции современных людей в Восточную Азию по северному маршруту». Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 717–27. doi : 10.1093/molbev/msq247 . PMID 20837606.
- ^ Пилле Халласт, Кьяра Батини, Дэниел Задик и др. , «Дерево Y-хромосомы распускается: 13 000 высоконадежных однонуклеотидных полиморфизмов, охватывающих большинство известных клад». Публикация Molecular Biology and Evolution Advance Access, 2 декабря 2014 г. doi:10.1093/molbev/msu327
- ^ Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. (2015), «Недавнее узкое место в разнообразии хромосомы Y совпадает с глобальным изменением в культуре». Genome Research 25:1–8. Опубликовано Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISSN 1088-9051/15; www.genome.org.
- ^ Сенгупта, Сангхамитра; Животовский, Лев А.; Кинг, Рой; Мехди, SQ; Эдмондс, Кристофер А.; Чоу, Шерил-Эмилиана Т.; Лин, Элис А.; Митра, Миташри; Сил, Самир К. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как коренные, так и экзогенные экспансии и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230. PMID 16400607 .
- ^ Себастьян Липпольд, Хуньян Сюй, Альберт Ко, Минкунь Ли, Габриэль Рено, Энн Буттхоф, Роланд Шрёдер и Марк Стоункинг, «Отцовские и материнские демографические истории человека: выводы из последовательностей Y-хромосомы и мтДНК высокого разрешения». Investigative Genetics 2014, 5:13. http://www.investigativegenetics.com/content/5/1/13
- ^ Сан, На; Ма, Пэн-Чэн; Янь, Ши; и др. (2019). «Филогеография гаплогруппы Y-хромосомы Q1a1a-M120, отцовской линии, соединяющей популяции Сибири и Восточной Азии». Annals of Human Biology . 46 (3): 261–266 – через Taylor & Francis Online.
Внешние ссылки
- Проект Y-ДНК гаплогруппы Q