Гаплогруппа R , или R-M207 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Он многочисленн и широко распространен среди современного населения.
Некоторые субклады- потомки были обнаружены с доисторических времен в Европе , Центральной Азии и Южной Азии . Другие уже давно присутствуют на более низких уровнях в некоторых частях Западной Азии и Африки . Некоторые авторитетные источники также предположили, что более спорно, что R-M207 уже давно присутствует среди коренных американцев в Северной Америке – теория, которая еще не получила широкого признания. [5]
По мнению генетика Спенсера Уэллса , гаплогруппа K, от которой происходят гаплогруппы P и Q, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии . [6] Однако Карафет и др. (2014) предположили, что «быстрая диверсификация… K-M526 », также известного как K2, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии (около Индонезии ), а затем распространилась на материковую Азию, хотя они не могли исключить, что она могла возникнуть в Евразия и позже там вымерли, и что любой из этих сценариев «одинаково экономен». [7]
Состав
Происхождение
Генетик Спенсер Уэллс предполагает, что гаплогруппа K, от которой происходит гаплогруппа P, вероятно, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии , возможно, в районе Ирана или Пакистана . [6] Гаплогруппа P1, возможно, возникла в Юго-Восточной Азии, однако, по мнению Карафета и др. эта гипотеза «экономна», и столь же вероятно, что она возникла где-то в Евразии. [7] Считается, что SNP M207 , определяющий гаплогруппу R, возник в эпоху верхнего палеолита , около 27 000 лет назад. [2] [1]
Только один подтвержденный пример базального R* был обнаружен в останках возрастом 24 000 лет, известных как MA1 , найденных в мальтийско-буретской культуре недалеко от озера Байкал в Сибири . [2] (Хотя о живом примере R-M207(xM17,M124) сообщалось в 2012 году, он не проверялся на SNP M478; поэтому рассматриваемый мужчина – среди выборки из 158 мужчин этнических таджиков из Бадахшана , Афганистан – может поэтому принадлежат R2.)
Возможно, что ни одна из первичных ветвей R-M207, а именно R1 (R-M173) и R2 (R-M479), до сих пор не существует в своих базальных, первоначальных формах, т.е. R1* и R2*. В научной литературе не зарегистрировано ни одного подтвержденного случая заболевания ни живым, ни мертвым. (Хотя в случае R2* проведено сравнительно мало исследований.)
Несмотря на редкость R* и R1*, часто отмечается относительно быстрое расширение – географическое и численное – субкладов из R1, в частности: «и R1a, и R1b представляют собой молодые звездообразные расширения» (Karafet 2008).
В частности, отмечено также широкое географическое распространение R1b. Халласт и др. (2014) упомянули, что живые примеры, обнаруженные в Центральной Азии, включают:
«самый глубокий субклад» R-M269 (R1b1a1a2) – самая многочисленная ветвь R1b в Западной Европе, а;
редкий субклад R-PH155 (R1b1b) обнаружен только у одного жителя Бутана и одного таджика.
(Хотя Халласт и др. предположили, что R-PH155 «почти так же стар, как и раскол R1a/R1b», позже было обнаружено, что R-PH155 является субкладом R-L278 (R1b1) и получил филогенетическое название R1b1b. )
Распределение
Y-гаплогруппа R-M207 распространена по всей Европе , Южной Азии и Центральной Азии (Kayser 2003). Встречается также на Кавказе и в Сибири . Некоторые меньшинства в Африке также несут субклады R-M207 с высокой частотой.
Хотя некоторые коренные народы Америки и Австралазии также имеют высокие уровни R-M207, неясно, являются ли они глубокими корнями или результатом европейской колонизации в эпоху раннего Нового времени .
Р (Р-М207)
Гаплогруппа R* Y-ДНК (xR1,R2) была обнаружена в останках возрастом 24 000 лет с Мальты в Сибири недалеко от озера Байкал. [9]
В 2013 году R-M207 был обнаружен у одного из 132 мужчин кыргызов Восточного Кыргызстана. [10]
Р1 (Р-М173)
Существует множество последующих мутаций гаплогруппы R (Семино 2000 и Россер 2000).
Первоначально шли споры о происхождении гаплогруппы R1b у коренных американцев. Два ранних исследования показали, что эта гаплогруппа могла быть одной из основополагающих сибирских линий коренных американцев, однако сейчас это считается маловероятным, поскольку линии R1b, обычно встречающиеся у коренных американцев, в большинстве случаев идентичны линиям у западных европейцев, и ее самая высокая концентрация наблюдается среди множества культурно не связанных племен в восточной части Северной Америки. [11]
Таким образом, по мнению ряда авторов, R1b, скорее всего, был занесен в результате примеси во время европейского заселения Северной Америки после 1492 года . [12] [13] [14]
Р2 (Р-М479)
Гаплогруппа R-M479 определяется наличием маркера M479. Парагруппа линии R-M479 встречается преимущественно в Южной Азии, хотя глубоко укоренившиеся примеры также были обнаружены среди португальского, испанского, татарского (Башкортостан, Россия) и осетинского (Кавказ) населения (Myres 2010).
^ abc ISOGG , Гаплогруппа R Y-ДНК и ее субклады - 2016 (12 декабря 2016 г.).
^ abc Рагхаван, М. и др. 2014. Геном Сибири эпохи верхнего палеолита обнаруживает двойное происхождение коренных американцев, Nature, 505, 87–91.
^ ван Дрим, Джордж Л. (25 мая 2021 г.). Этнолингвистическая предыстория: заселение мира с точки зрения языка, генов и материальной культуры. БРИЛЛ. п. 204. ИСБН978-90-04-44837-7.
^ Махал, Дэвид Г.; Мацукас, Янис Г. (2018). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: исследование древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК». Границы генетики . 9 :4. дои : 10.3389/fgene.2018.00004 . ISSN 1664-8021. ПМЦ 5787057 . PMID 29410676. Возник в Северной Азии около 27 000 лет назад (ISOGG, 2016). Это одна из самых распространенных гаплогрупп в Европе, ее ветви в некоторых регионах достигают 80 процентов населения (Eupedia, 2017). Откуда-то из Центральной Азии некоторые потомки человека, несущего мутацию M207 в Y-хромосоме, направились на юг и прибыли в Индию около 10 000 лет назад (Wells, 2007).
^ Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди жителей Северной Индии: исследование 560 Y-хромосом». Анналы биологии человека . 36 (1): 46–59. дои : 10.1080/03014460802558522. ISSN 0301-4460. ПМЦ 2755252 . PMID 19058044. Рисунок 3.
^ Аб Уэллс, Спенсер (20 ноября 2007 г.). Глубокое происхождение: знаковый поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого. Национальные географические книги. п. 79. ИСБН978-1-4262-0211-7.«Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».
^ ab Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Европейский журнал генетики человека . 23 (3): 369–73. дои : 10.1038/ejhg.2014.106. ПМЦ 4326703 . ПМИД 24896152. «Эта закономерность заставляет нас выдвинуть гипотезу о юго-восточном азиатском происхождении P-P295 и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q в материковую Азию. Альтернативное объяснение могло бы включать в себя событие исчезновения предковых хромосом P-P295* повсюду в Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо миграцию (P*-хромосом из Индонезии в материковую Азию), либо вымирание парагруппы P-P295* в Евразии».
^ Лбова, Людмила (2021). «Сибирский палеолитический памятник Мальта: уникальный источник для изучения детской археологии». Эволюционные гуманитарные науки . 3 :8, рис. 6-1. дои : 10.1017/ehs.2021.5 . ПМЦ 10427291 . ПМИД 37588521.
^ Рагхаван М., Скоглунд П., Граф К.Е., Метспалу М., Альбрехцен А., Мольтке I и др. (Январь 2014). «Геном Сибири верхнего палеолита обнаруживает двойное происхождение коренных американцев». Природа . 505 (7481): 87–91. Бибкод : 2014Natur.505...87R. дои : 10.1038/nature12736. ПМК 4105016 . ПМИД 24256729.
^ Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: место, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». ПЛОС ОДИН . 8 (10): е76748. Бибкод : 2013PLoSO...876748D. дои : 10.1371/journal.pone.0076748 . ПМЦ 3799995 . ПМИД 24204668.
^ Больник, Дебора; Больник, Дэниел; Смит, Дэвид (2006). «Асимметричные мужские и женские генетические истории среди коренных американцев восточной части Северной Америки». Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2161–2174. doi : 10.1093/molbev/msl088. ПМИД 16916941.«В большинстве случаев существует широко распространенное согласие относительно того, представляет ли конкретная гаплогруппа древнюю индейскую линию или примесь после 1492 года, но статус гаплогруппы R-M173 недавно стал предметом некоторых дискуссий. Некоторые авторы утверждают, что эта гаплогруппа представляет собой основополагающая линия коренных американцев (Лелл и др., 2002; Бортолини и др., 2003), тогда как другие предполагают, что она вместо этого отражает недавнюю европейскую примесь (Тарасона-Сантос и Сантос, 2002; Бош и др., 2003; Зегура и др., 2004). В восточной части Северной Америки характер вариаций гаплотипов внутри этой гаплогруппы подтверждает последнюю гипотезу: гаплотипы R-M173 не группируются по популяциям или культурным территориям, как это делают гаплотипы в других гаплогруппах-основателях, и большинство из них соответствуют или тесно связаны с R- Гаплотипы M173, которые распространены в Европе, но редки в Азии. Эта картина противоположна ожидаемой, если гаплотипы R-M173 коренных американцев произошли от азиатских гаплотипов, и предполагает, что недавняя европейская примесь ответственна за присутствие гаплогруппы R-M173 на востоке Севера. Америка."
^ Больник, Дебора Энн (2005). Генетическая предыстория восточной части Северной Америки: данные древней и современной ДНК. Калифорнийский университет в Дэвисе. п. 83.«Гаплогруппа R - M173, вероятно, представляет собой недавнюю (после 1492 г.) европейскую примесь, как и P-M45 * (Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003...»
↑ Рафф, Дженнифер (8 февраля 2022 г.). Происхождение: Генетическая история Америки. Издательство Гранд Сентрал. стр. 59–60. ISBN978-1-5387-4970-8.«Гаплогруппы-основатели Y-хромосомы у коренных американцев включают Q-M3 (и ее субгаплогруппы, Q-CTS1780) и C3-MPB373 (потенциально C-P39-Z30536). Другие гаплогруппы, обнаруженные [sic] в популяциях коренных американцев, такие как R1b, вероятно, были результатом постевропейской контактной примеси (44)».
^ Малхи, Рипан Сингх; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; и другие. (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски». Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883. ПМК 2584155 . ПМИД 18618732. «Все люди, которые не принадлежали к гаплогруппам Q и C, были исключены из набора данных гаплотипов, поскольку эти гаплотипы, вероятно, являются результатом неместной примеси (Tarazona-Santos and Santos, 2002; Zegura et al., 2004; Bolnick et al.) , 2006)...Частота гаплогруппы C наиболее высока на северо-западе Северной Америки, а частота гаплогруппы R, присутствие которой приписывают европейской примеси, достигает максимума на северо-востоке Северной Америки».
дальнейшее чтение
Майрес Н.М., Роотси С., Лин А.А., Ярве М., Кинг Р.Дж., Кутуев И. и др. (январь 2011 г.). «Эффект основателя основной гаплогруппы Y-хромосомы R1b голоцена в Центральной и Западной Европе». Европейский журнал генетики человека . 19 (1): 95–101. дои : 10.1038/ejhg.2010.146. ПМК 3039512 . ПМИД 20736979.
Лелл Дж.Т., Сукерник Р.И., Стариковская Ю.Б., Су Б., Джин Л., Шурр Т.Г., Андерхилл П.А., Уоллес округ Колумбия (январь 2002 г.). «Двойное происхождение и сибирское сходство Y-хромосом коренных американцев». Американский журнал генетики человека . 70 (1): 192–206. дои : 10.1086/338457. ПМЦ 384887 . ПМИД 11731934.
Сингх Малхи, Рипан; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; Кемп, Брайан М.; Гринберг, Джонатан А.; Добровский, Соломон З.; Смит, Дэвид Гленн; Ресендес, Андрес; Карафет, Татьяна; Хаммер, Майкл; Зегура, Стивен; Бровко, Татьяна (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883. ПМК 2584155 . PMID 18618732. Архивировано из оригинала (PDF) 17 июня 2010 г.
Кивисилд Т., Роотси С., Метспалу М., Мастана С., Калдма К., Парик Дж. и др. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенах, так и в кастах». Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–32. дои : 10.1086/346068. ПМК 379225 . ПМИД 12536373.
Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р., Андерхилл П.А., Евсеева И., Блю-Смит Дж. и др. (август 2001 г.). «Центр Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (18): 10244–9. Бибкод : 2001PNAS...9810244W. дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД 11526236.
Андерхилл П.А., Майрес Н.М., Руци С., Мецпалу М., Животовский Л.А., Кинг Р.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Разделение постледникового происхождения европейских и азиатских Y-хромосом в пределах гаплогруппы R1a». Европейский журнал генетики человека . 18 (4): 479–84. дои : 10.1038/ejhg.2009.194. ПМЦ 2987245 . ПМИД 19888303.
Кивисилд, Т.; Роотси, С.; Метспалу, М.; Мастана, С.; Калдма, К.; Парик, Дж.; Метспалу, Э.; Адоджаан, М.; Толк, Х.-В.; Степанов В.; Гёльге, М.; Усанга, Э.; Папиха, СС; Чинниоглу, К.; Кинг, Р.; Кавалли-Сфорца, Л.; Андерхилл, Пенсильвания; Виллемс, Р. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенных, так и в кастовых популяциях» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–332. дои : 10.1086/346068. PMID 12536373. S2CID 951358.
Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (1994). История и география человеческих генов . Издательство Принстонского университета. ISBN 978-0-691-08750-4.
Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Мейлерман М.Б., Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер М.Ф. (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои :10.1101/гр.7172008. ПМК 2336805 . ПМИД 18385274.
Семино О., Пассарино Г., Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е. и др. (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому». Наука . 290 (5494): 1155–9. Бибкод : 2000Sci...290.1155S. дои : 10.1126/science.290.5494.1155. ПМИД 11073453.
Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р., Андерхилл П.А., Евсеева И., Блю-Смит Дж. и др. (август 2001 г.). «Центр Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (18): 10244–9. Бибкод : 2001PNAS...9810244W. дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД 11526236.
Пассарино Дж., Каваллери Г.Л., Лин А.А., Кавалли-Сфорца Л.Л., Борресен-Дейл А.Л., Андерхилл, Пенсильвания (сентябрь 2002 г.). «Различные генетические компоненты норвежской популяции, выявленные с помощью анализа полиморфизмов мтДНК и Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека . 10 (9): 521–9. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200834 . ПМИД 12173029.
Бехар Д.М., Томас М.Г., Скорецкий К., Хаммер М.Ф., Булыгина Е., Розенгартен Д. и др. (октябрь 2003 г.). «Множественное происхождение ашкеназских левитов: свидетельства Y-хромосомы как ближневосточного, так и европейского происхождения». Американский журнал генетики человека . 73 (4): 768–79. дои : 10.1086/378506. ПМК 1180600 . ПМИД 13680527.
Саха А., Шарма С., Бхат А., Пандит А., Бамезай Р. (2005). «Генетическая близость между пятью различными группами населения в Индии, отражающая поток генов Y-хромосомы». Журнал генетики человека . 50 (1): 49–51. дои : 10.1007/s10038-004-0219-3 . ПМИД 15611834.
Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс К.А., Чоу К.Э. и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы с высоким разрешением в Индии определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД 16400607.
Чинниоглу (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF) . Генетика человека . 114 (2): 127–48. дои : 10.1007/s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736. Архивировано из оригинала (PDF) 19 июня 2006 г.
Андерхилл П.А., Майрес Н.М., Руци С., Мецпалу М., Животовский Л.А., Кинг Р.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Разделение постледникового происхождения европейских и азиатских Y-хромосом в пределах гаплогруппы R1a». Европейский журнал генетики человека . 18 (4): 479–84. дои : 10.1038/ejhg.2009.194. ПМЦ 2987245 . ПМИД 19888303.
Кайзер М., Брауэр С., Вайс Г., Шифенхёвель В., Андерхилл П., Шен П. и др. (февраль 2003 г.). «Снижение разнообразия Y-хромосомы, но не митохондриальной ДНК, в человеческих популяциях из Западной Новой Гвинеи». Американский журнал генетики человека . 72 (2): 281–302. дои : 10.1086/346065. ПМК 379223 . ПМИД 12532283.
Фирасат С., Халик С., Мохьюддин А., Папайоанну М., Тайлер-Смит С., Андерхилл П.А. и др. (январь 2007 г.). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана». Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726. ПМЦ 2588664 . ПМИД 17047675.
Кран, Томас. «Проект дерева Y-ДНК FTDNA (AKA YTree)». ДНК генеалогического древа . Архивировано из оригинала 15 августа 2015 г.
Россер Ж.Х., Зержал Т., Хёрлес М.Е., Адохаан М., Алавантик Д., Аморим А., Амос В., Арментерос М. и др. (2000). «Разнообразие Y-хромосомы в Европе является клинальным и зависит в первую очередь от географии, а не от языка». Американский журнал генетики человека . 67 (6): 1526–1543. дои : 10.1086/316890 . ПМЦ 1287948 . ПМИД 11078479.
Внешние ссылки
Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой R Y-ДНК .