stringtranslate.com

Гем А

Гем А (или гем А ) представляет собой гем , координационный комплекс , состоящий из макроциклического лиганда, называемого порфирином , хелатирующего атом железа. Гем А представляет собой биомолекулу и естественным образом вырабатывается многими организмами. Гем А, в растворе часто имеет дихроичный зеленый/красный цвет, является структурным родственником гема В , компонента гемоглобина , красного пигмента крови.

Связь с другими гемами

Гем A отличается от гема B тем, что метильная боковая цепь в положении кольца 8 окислена до формильной группы, а гидроксиэтилфарнезильная группа , изопреноидная цепь, присоединена к виниловой боковой цепи в положении кольца 2 гема тетрапиррола железа . Гем A похож на гем o тем, что оба имеют добавление фарнезила в положении 2, но гем O не имеет формильной группы в положении 8, но все еще содержит метильную группу. Правильная структура гема А, основанная на ЯМР и ИК-экспериментах восстановленной Fe(II) формы гема, была опубликована в 1975 году. [1] Структура была подтверждена синтезом диметилового эфира безжелезной формы. . [2]

История

Гем А был впервые выделен немецким биохимиком Отто Варбургом в 1951 году и показал, что он является активным компонентом интегрального мембранного металлопротеина цитохром соксидазы. [3]

Стереохимия

Было показано, что последний структурный вопрос точной геометрической конфигурации первого углерода в положении 3 кольца I, углерода, связанного с гидроксильной группой, представляет собой хиральную S-конфигурацию. [4]

Как и гем B, гем A часто присоединяется к апопротеину через координационную связь между железом гема и консервативной боковой цепью аминокислоты. В важном респираторном белке цитохром с оксидазе (CCO) этот лиганд 5 гема А в кислородном реакционном центре представляет собой гистидильную группу. [5] Гистидин является общим лигандом для многих гемопротеинов, включая гемоглобин и миоглобин .

Гем а в цитохром с-оксидазе, связанный двумя остатками гистидина (показан розовым цветом)

Гем А в цитохроме, часть цитохром-с-оксидазы, связанная двумя остатками гистидина (показаны розовым цветом) [6]

Примером металлопротеина, содержащего гем А, является цитохром с-оксидаза. Этот очень сложный белок содержит гем А в двух разных местах, каждый из которых выполняет разные функции. Железо гема А цитохрома А гексакоординировано, то есть связано с 6 другими атомами. Железо гема А цитохрома а3 иногда связывается с 5 другими атомами, оставляя шестой участок доступным для связывания дикислорода (молекулярного кислорода ). [6] Кроме того, этот фермент связывает 3 иона меди, магния, цинка и несколько ионов калия и натрия. Считается, что две группы гема А в CCO легко обмениваются электронами между собой, ионами меди и тесно связанным белком цитохромом с.

Считается, что как формильная группа, так и боковая цепь изопреноида играют важную роль в сохранении энергии восстановления кислорода цитохром-с-оксидазой . Считается, что CCO отвечает за сохранение энергии восстановления дикислорода путем перекачки протонов в межмембранное митохондриальное пространство. По данным влиятельной группы С. Йошикавы, как формильная, так и гидроксиэтилфарнезильная группы гема А играют важную роль в этом критическом процессе. [7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Коги, WS; Смайт, Джорджия; О'Киф, Д.Х.; Маскаски, Дж. Э.; Смит, М.Л. (1975). «Гем А цитохром с-оксидазы». Журнал биологической химии . 250 (19): 7602–7622. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40860-0 . ПМИД  170266.
  2. ^ Баттерсби, Алан Р.; Макдональд, Эдвард; Томпсон, Мервин; Чаудри, Иршад А.; Клези, Питер С.; Фукс, Кристофер-младший; Хай, Тон Тат (1985). «Выделение, кристаллизация и синтез диметилового эфира порфирина а, безжелезной простетической группы цитохром с оксидазы». Журнал Химического общества, Perkin Transactions 1 : 135. doi : 10.1039/P19850000135.
  3. ^ Варбург, О; Гевиц Х. С. (1951). «Цитогемин аус Герцмускель». Zeitschrift für Physiologische Chemie . 288 (1): 1–4. дои : 10.1515/bchm2.1951.288.1.1. ПМИД  14860765.
  4. ^ Ямашита Э., Аояма Х., Яо М. и др. (2005). «Абсолютная конфигурация гидроксифарнезилэтильной группы гема А, определенная с помощью рентгеноструктурного анализа цитохром с-оксидазы бычьего сердца с использованием методов, применимых с разрешением 2,8 Ангстрем». Акта Кристаллографика Д. 61 (10): 1373–1377. дои : 10.1107/S0907444905023358 . ПМИД  16204889.
  5. ^ Цукихара Т., Симоката К., Катаяма Ю. и др. (2003). «Низкоспиновый гем цитохром-с-оксидазы как движущий элемент процесса протонной перекачки». ПНАС . 100 (26): 15304–15309. Бибкод : 2003PNAS..10015304T. дои : 10.1073/pnas.2635097100 . ПМК 307562 . ПМИД  14673090. 
  6. ^ Аб Ёсикава, С.; Синдзава-Ито, К.; Накашима, Р.; и другие. (1998). «Редокс-связанные кристаллические структурные изменения в цитохром с-оксидазе бычьего сердца». Наука . 280 (5370): 1723–1729. дои : 10.1126/science.280.5370.1723. PMID  9624044. S2CID  37147458.
  7. ^ Симоката К., Катаяма Ю., Мураяма Х. и др. (2007). «Путь протонной перекачки цитохром с оксидазы бычьего сердца». ПНАС . 104 (10): 4200–4205. Бибкод : 2007PNAS..104.4200S. дои : 10.1073/pnas.0611627104 . ПМК 1820732 . ПМИД  17360500.