stringtranslate.com

Денни (гибридный гоминин)

Денисова 11, генетическое древо предков

Денни ( Денисова 11 ) — ископаемый образец возрастом около 90 000 лет, принадлежащийдевочке-гибриду неандертальца и денисовца в возрасте около 13 лет. [1] [2] На сегодняшний день она является единственным обнаруженным гибридным гоминином первого поколения. [3] Останки Денни состоят из одного окаменелого фрагмента длинной кости, обнаруженного среди более 2000 визуально неидентифицируемых фрагментов, раскопанных в Денисовой пещере в Алтайских горах , Россия, в 2012 году. [2]

Группа исследователей из Оксфордского университета под руководством Тома Хайэма использовала метод массовой дактилоскопии коллагенового пептида , называемый зооархеологией с помощью масс-спектрометрии (ZooMS) , и анализ митохондриальной ДНК (мтДНК), чтобы идентифицировать фрагмент как принадлежащий архаичному человеку с неандертальским происхождением. [4]

Геномное секвенирование и анализ, проведенные палеогенетиками Вивиан Слон и Сванте Паабо из Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка, показали, что Денни был потомком матери -неандертальца и отца -денисовца . [1] [3] Кроме того, ее геном предполагает, что ее отец также имел небольшую долю неандертальского происхождения от 300 до 600 поколений до своей жизни. [3]

Эти удивительные геномные данные заставили некоторых палеонтологов предположить, что межвидовое спаривание между денисовцами и неандертальцами могло происходить с некоторой частотой в течение нескольких периодов контактов на протяжении многих тысяч лет. [3] Кроме того, эти результаты подтверждают гипотезу о том, что схожие модели смешения или скрещивания между архаичными и современными людьми могли привести к частичному поглощению денисовцев и неандертальцев современными человеческими популяциями. [3]

Обзор

Анализ датировки в 2016 году определил, что Денни (Denisova 11) умер около 90 000 лет назад, а толщина кортикального слоя кости указывает на возраст на момент смерти не менее 13 лет. [3] Анализ всей последовательности генома (общая митохондриальная и ядерная ДНК) указывает на то, что она была женщиной, ее мать была неандертальцем, а отец — денисовцем. [1] [2] [3] В то время как предыдущие анализы других древних геномов пришли к выводу, что денисовцы, неандертальцы и современные люди скрещивались во время ледникового периода в Европе и Азии, эта находка является самым прямым доказательством того, что различные древние гоминины спаривались друг с другом и имели потомство. [2] [5] [6]

Предыдущие анализы других ископаемых, найденных в этой сибирской пещере, показали, что современные люди, неандертальцы и денисовцы населяли это место в разное время, и что все три вида людей скрещивались друг с другом. [2] [6] Гены обоих архаичных видов людей присутствуют у многих людей сегодня, что говорит о том, что когда эти группы встречались, происходил поток генов. [2] [5] Неясно, было ли спаривание согласованным или Денни был плодовитым. [1] Открытие Денисовой 11 может подтвердить идею о том, что неандертальцы и денисовцы, возможно, не подверглись прямому вымиранию, а были частично ассимилированы в современные популяции людей. [4] [6]

Открытие

Денисова пещера находится в России.
Денисова пещера
Денисова пещера
Расположение Денисовой пещеры в горах Алтая в Сибири
Денисова пещера в горах Алтая

Находка представляет собой один фрагмент кости длиной около 2 см, который был обнаружен в 2012 году российскими археологами в Денисовой пещере в слое 12 Восточной галереи. [7] Пещера расположена в Денисовой долине, Алтайские горы в Сибири, Россия. [2] [6] В то время происхождение фрагмента кости оставалось неизвестным, поскольку он был заархивирован вместе с тысячами других неописуемых фрагментов костей из пещеры. [4]

В 2015 году Том Хайэм и Катерина Дука [8] решили попробовать применить новые научные методы, чтобы посмотреть, можно ли их использовать для поиска человеческих останков среди тысяч неопознанных образцов костей на этом месте. В сотрудничестве с главными археологами Денисовой пещеры; Михаилом Шуньковым и Анатолием Деревянко, они отвезли несколько мешков, содержащих тысячи неопознанных фрагментов костей, обратно в Оксфордский университет . Саманта Браун, студентка магистратуры Оксфордского университета , работала над проектом в рамках своего диссертационного исследования, проведя скрининг более 2000 фрагментов костей. [4] Используя зооархеологию с помощью масс-спектрометрии (ZooMS) и работая с лабораторией Майкла Бакли в Манчестерском университете, они смогли сравнить отпечатки коллагеновых белков, полученные из костей Денисовой пещеры, с животными и людьми известного происхождения, и обнаружили, что одна из этих костей (DC1227) принадлежала архаичному человеку. [4] [9] [10] Микрокомпьютерная томография (МикроКТ) кости, проведенная Фионой Брок в Университете Крэнфилда, помогла выявить, что образец имел кислотное травление и ямки на своей поверхности, указывающие на то, что он мог пройти через пищеварительную систему животного, вероятно, гиены. [4] Прямое радиоуглеродное датирование показало, что возраст образца составляет более 50 000 лет, а секвенирование его митохондриальной ДНК (мтДНК) в Институте эволюционной антропологии Макса Планка показало, что у Denisova 11 была последовательность, соответствующая неандертальскому происхождению. [4]

Дальнейшая работа ученых из Института эволюционной антропологии Макса Планка , где предыдущие образцы ДНК денисовцев были секвенированы и проанализированы, выявила дополнительные ключевые доказательства, касающиеся образца [9] Вивиан Слон , Сванте Паабо и другие раскрыли смешанное происхождение Денни , подтвердив, что ее митохондриальная ДНК , унаследованная от ее матери, произошла от неандертальского происхождения, и обнаружив, что часть ее ядерной ДНК, унаследованная от ее отца, была денисовской. Публикация их результатов в 2018 году предоставила первое прямое доказательство архаичного человеческого скрещивания. [9] Это было названо «знаковой находкой», которая меняет наше понимание того, как взаимодействовали гоминины, и может помочь переписать историю архаичных и современных людей. [11] По словам популяционного генетика Понтуса Скоглунда из Гарвардской медицинской школы , который в настоящее время работает в Институте Фрэнсиса Крика в Лондоне, «найти человека первого поколения смешанного происхождения из [групп неандертальцев и денисовцев] — это абсолютно необычно. ... Это действительно великая наука в сочетании с небольшой долей удачи. Это действительно очевидный случай. Я думаю, что он сразу же войдет в учебники». [1]

Эта история рассказана в книге Тома Хайэма «Мир перед нами: как наука открывает новую историю происхождения человека» [12].

ДНК-анализ

Фрагмент кости, идентифицированный по коду DC1227 (GenBank Accession = KU131206) или как Denisova 11, мог происходить из руки или ноги человека. [9] До извлечения материала для генетического анализа DC1227 весил 1,68 г (0,059 унции) и имел максимальные размеры 24,7 мм (0,97 дюйма) на 8,39 мм (0,330 дюйма). [4] В 2016 году группа из Института эволюционной антропологии Макса Планка в Лейпциге, Германия, под руководством палеогенетиков Вивиан Слон и Сванте Паабо извлекла шесть образцов ДНК и создала десять библиотек полных последовательностей генома со средним покрытием 2,6-кратного. [3] Изолированные митохондриальная ДНК и ядерная ДНК показали, что архаичный человек был примерно в равной пропорции неандертальцем и денисовцем. [3] Сравнение Х-хромосом и аутосом образца показало, что он принадлежал женщине. [2] [3] Оценочная гетерозиготность Denisova 11, которая оказалась сопоставимой с современными африканцами, позволяет предположить, что девочка была гибридом неандертальца и денисовца первого поколения. [3]

Последующие анализы показали высокую вероятность того, что ее отец-денисовец также имел некоторое неандертальское происхождение, введенное в его геном за сотни поколений до его жизни. [2] [3] Таким образом, геном Денисовой 11 представляет собой первое прямое доказательство по крайней мере двух случаев скрещивания между неандертальцами и денисовцами. [3] [13] Еще более удивительно, что исследователи определили, что геном матери девочки был более тесно связан с ДНК западноевропейских неандертальцев, раскопанных за тысячи миль в пещере Виндия , Хорватия, чем с неандертальцами, которые жили в сибирской пещере, где были найдены останки ее дочери. [2] [3] [9] Это открытие предполагает, что неандертальцы мигрировали несколькими волнами из Западной Европы в Центральную Евразию и сталкивались с денисовцами несколько раз на протяжении десятков тысяч лет и, возможно, сосуществовали с ними в течение определенных периодов времени. [2] [9] [11]

Контекст и последствия

С момента открытия останков неандертальцев в 19 веке многие ученые поддержали гипотезу скрещивания архаичных и современных людей, также известную как гибридизация, смешение или теория гибридного происхождения. [14] Линейный взгляд на эволюцию человека подвергся критике в 1970-х годах, когда были обнаружены различные виды людей, что сделало упрощенную концепцию все более маловероятной. С появлением передовой молекулярной биотехнологии было проведено секвенирование всего генома неандертальца и генома человека , которое подтвердило недавнее смешивание между различными видами людей. [15] В 2010 году были опубликованы доказательства, раскрывающие недвусмысленные примеры скрещивания архаичных и современных людей во время среднего палеолита и раннего верхнего палеолита . [ необходима цитата ] Исследования показывают, что скрещивание происходило в нескольких независимых событиях, которые включали неандертальцев, денисовцев, а также нескольких неопознанных гомининов. [ необходима цитата ] Современные геномы евразийцев содержат около 2% ДНК неандертальцев со следами денисовского наследия, в то время как современные меланезийцы имеют в среднем 4–6% ДНК денисовцев. [9] Денни представляет собой первого обнаруженного древнего человека, родители которого принадлежали к двум отдельным видам людей, что предоставит уникальную возможность для будущих сравнительных генетических исследований. [1] [2]

Открытие Денни и другие палеогенетические данные, полученные с 2010 года, показывают, что эволюцию человека не следует концептуализировать как простую линейную или разветвленную прогрессию, а скорее как сложное взаимодействие между родственными видами в течение различных периодов географической изоляции и конвергенции. [16] [17] [18] [19] Аккерман, Маккей и Арнольд подтверждают: «Недавние геномные исследования показали, что гибридизация между существенно разошедшимися линиями является правилом, а не исключением в эволюции человека». [20] Признавая, что все еще ведутся споры о том, как гибридизация сформировала генотипы и фенотипы человека , биологи-эволюционисты утверждают, что гибридизация была существенной творческой силой в появлении современных людей. [20]

В январе 2019 года ученые опубликовали хронологию плейстоценовых отложений в Денисовой пещере, сделав вывод, что по крайней мере две группы людей, включая денисовцев, неандертальцев и родственных им гибридов, занимали это сибирское место примерно от 300 000 до 20 000 лет назад, но необходимы дополнительные материальные доказательства, чтобы доказать, сосуществовали ли они там когда-либо. [21] [22] Материальные данные, собранные на месте, включая каменные орудия, браслеты и другие украшения, позволяют предположить, что денисовцы могли обладать способностью к мышлению более высокого порядка, сходному с мышлением современных людей. [22]

В феврале 2019 года ученые обнаружили доказательства, основанные на генетических исследованиях с использованием искусственного интеллекта (ИИ), которые предполагают существование неизвестного вида предков человека, а не неандертальца, денисовца или гибрида человека (как Денни), в геноме современных людей . [23] [24]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcdef Уоррен, Мэтью (22 августа 2018 г.). «Мама — неандерталец, папа — денисовец: первое открытие древнечеловеческого гибрида». Nature . 560 (7719): 417–418. Bibcode :2018Natur.560..417W. doi : 10.1038/d41586-018-06004-0 . PMID  30135540.
  2. ^ abcdefghijkl Фогель, Гретхен (22 августа 2018 г.). «Эта древняя кость принадлежала ребенку двух вымерших человеческих видов». Science . doi :10.1126/science.aav1858. S2CID  188160693 . Получено 22 августа 2018 г. .
  3. ^ abcdefghijklmn Слон, Вивиан; Мафессони, Фабрицио; Вернот, Бенджамин; де Филиппо, Чезаре; Гроте, Штеффи; Виола, Бенце; Хайдиняк, Матея; Пейрень, Стефан; Нагель, Сара; Браун, Саманта; Дука, Катерина (6 сентября 2018 г.). «Геном потомства матери-неандертальца и отца-денисовца». Nature . 561 (7721): 113–116. Bibcode :2018Natur.561..113S. doi :10.1038/s41586-018-0455-x. ISSN  1476-4687. PMC 6130845 . PMID  30135579. 
  4. ^ abcdefgh Браун, Саманта; Хайэм, Томас; Слон, Вивиан; Паабо, Сванте; Мейер, Маттиас; Дука, Катерина; Брок, Фиона; Комески, Дэниел; Прокопио, Ноэми; Шунков, Майкл; Деревянко, Анатолий (29 марта 2016 г.). «Идентификация новой кости гоминина из Денисовой пещеры, Сибирь, с использованием коллагенового отпечатка пальцев и анализа митохондриальной ДНК». Scientific Reports . 6 (1): 23559. Bibcode :2016NatSR...623559B. doi :10.1038/srep23559. ISSN  2045-2322. PMC 4810434 . PMID  27020421. 
  5. ^ ab Zimmer, Carl (22 августа 2018 г.). «Смешанная семья: ее мать была неандертальцем, ее отец — кем-то совершенно другим». The New York Times . Получено 22 августа 2018 г.
  6. ^ abcd Маршалл, Майкл (22 августа 2018 г.). «У доисторической девочки были родители, принадлежавшие к разным человеческим видам». New Scientist . Получено 22 августа 2018 г.
  7. ^ Худ, Марлоу (22 августа 2018 г.). «Мать-неандерталец, отец-денисовец — недавно секвенированный геном проливает свет на взаимодействие древних гоминидов». Phys.org . Получено 22 августа 2018 г. .
  8. ^ "PalaeoChron Project ERC". Архивировано из оригинала 18 августа 2014 года . Получено 30 июня 2024 года .
  9. ^ abcdefg Wei-Haas, Maya (22 августа 2018 г.). «Родители древней девушки были двумя разными человеческими видами». National Geographic . Архивировано из оригинала 22 августа 2018 г. Получено 22 августа 2018 г.
  10. ^ «Новая коллагеновая дактилоскопия идентифицирует кость неандертальца среди 2000 фрагментов». Оксфордский университет . 29 марта 2016 г. Получено 1 апреля 2016 г.
  11. ^ ab Zhang, Sarah (22 августа 2018 г.). «Ученые ошеломлены обнаружением неандертальского гибрида в сибирской пещере». The Atlantic . Получено 22 августа 2018 г. .
  12. ^ Хайэм, Том (2021). Мир перед нами: как наука открывает новую историю происхождения человека . Penguin/RandomHouse. ISBN 978-0241440674.
  13. ^ Шарпинг, Натаниэль (22 августа 2018 г.). «Гибридный гоминин: мать и отец этой девочки произошли от двух разных видов». Discover . Получено 22 августа 2018 г.
  14. ^ Хаксли, Т. (1890). «Арийский вопрос и доисторический человек». Собрание сочинений: Том VII, Место человека в природе .
  15. ^ Грин, RE; Краузе, J.; Бриггс, AW; Маричич, T.; Стенцель, U.; Кирхер, M.; и др. (2010). «Проект последовательности генома неандертальца». Science . 328 (5979): 710–22. Bibcode :2010Sci...328..710G. doi :10.1126/science.1188021. PMC 5100745 . PMID  20448178. 
  16. ^ Райх, Д.; Грин, Р. Э.; Кирхер, М.; и др. (2010). «Генетическая история архаичной группы гомининов из Денисовой пещеры в Сибири» (PDF) . Nature . 468 (7327): 1053–60. Bibcode :2010Natur.468.1053R. doi :10.1038/nature09710. hdl :10230/25596. PMC 4306417 . PMID  21179161. 
  17. ^ Антрозио, Джейсон (2011). «Денисовцы и неандертальцы». Жизнь антропологически .
  18. ^ Hammer, Michael F. (май 2013 г.). "Human Hybrids" (PDF) . Scientific American . 308 (5): 66–71. Bibcode : 2013SciAm.308e..66H. doi : 10.1038/scientificamerican0513-66. PMID  23627222. Архивировано из оригинала (PDF) 24 августа 2018 г. – через grochbiology.org.
  19. ^ Йонг, Эд (2011). «Мозаичные люди, гибридные виды». New Scientist . 211 (2823): 34–38. Bibcode : 2011NewSc.211...34Y. doi : 10.1016/S0262-4079(11)61839-3 .
  20. ^ ab Роджерс Акерманн, Ребекка; Маккей, Алекс; Арнольд, Майкл Л. (2016). «Гибридное происхождение «современных» людей». Эволюционная биология . 43 : 1–11. doi :10.1007/s11692-015-9348-1. S2CID  14329491.
  21. ^ Джейкобс, Зенобия; Ли, Бо; Шунков Михаил Владимирович; Козликин Максим Борисович; Болиховская Наталья С.; Агаджанян Александр К.; Ульянов Владимир А.; Васильев Сергей К.; О'Горман, Киран; Деревянко Анатолий П.; Робертс, Ричард Г. (2019). «Время заселения архаичными человекообразными Денисовой пещеры на юге Сибири». Природа . 565 (7741): 594–599. Бибкод : 2019Natur.565..594J. дои : 10.1038/s41586-018-0843-2. ISSN  1476-4687. PMID  30700870. S2CID  59525956.
  22. ^ ab Zimmer, Carl (30 января 2019 г.). «Высокие потолки и прекрасный вид: Денисова пещера была домом для затерянной ветви человечества». The New York Times . Получено 31 января 2019 г.
  23. ^ Мондал, Маюх; Бертранпедт, Жауме; Лео, Оскар (16 января 2019 г.). «Приблизительное байесовское вычисление с глубоким обучением поддерживает третью архаичную интрогрессию в Азии и Океании». Nature Communications . 10 (246): 246. Bibcode :2019NatCo..10..246M. doi :10.1038/s41467-018-08089-7. PMC 6335398 . PMID  30651539. 
  24. ^ Докрилл, Питер (11 февраля 2019 г.). «Искусственный интеллект нашел неизвестного предка-«призрака» в геноме человека». ScienceAlert.com . Получено 11 февраля 2019 г.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки