Сериновые гидролазы являются одним из крупнейших известных классов ферментов , включающих приблизительно ~200 ферментов или 1% генов в человеческом протеоме. [1] Определяющей характеристикой этих ферментов является наличие определенного серина в активном центре , который используется для гидролиза субстратов . Гидролиз эфирной или пептидной связи происходит в два этапа. Сначала ацильная часть субстрата (кислотная часть эфира или часть пептида, заканчивающаяся карбоксильной группой) переносится на серин, создавая новую эфирную или амидную связь и высвобождая другую часть субстрата (спирт эфира или часть пептида, заканчивающаяся аминогруппой ) . Позже, на более медленном этапе, связь между серином и ацильной группой гидролизуется водой или гидроксид-ионом, восстанавливая свободный фермент. [2] В отличие от других, некаталитических, серинов, реактивный серин этих гидролаз обычно активируется протонным реле, включающим каталитическую триаду, состоящую из серина, кислотного остатка (например, аспартата или глутамата ) и основного остатка (обычно гистидина ), хотя существуют вариации этого механизма.
Суперсемейства сериновых гидролаз включают:
- Сериновые протеазы , включая трипсин , химотрипсин и субтилизин
- Внеклеточные липазы , включая панкреатическую липазу , печеночную липазу , желудочную липазу , эндотелиальную липазу и липопротеинлипазу
- Внутриклеточные липазы , включая гормоночувствительную липазу , моноацилглицероллипазу , липазу триглицеридов жировой ткани и диацилглицероллипазу
- Холинэстеразы , включая ацетилхолинэстеразу и бутирилхолинэстеразу
- Низкомолекулярные тиоэстеразы , включая синтазу жирных кислот и ацил-КоА-тиоэстеразы
- Некоторые фосфолипазы , включая фосфолипазу А2 и ацетилгидролазу фактора активации тромбоцитов
- Белковые и гликановые гидролазы, включая протеинфосфатметилэстеразу 1, ацилоксиацилгидролазу и ацетилэстеразу сиаловой кислоты
- Некоторые амидазы , включая гидролазу амида жирных кислот
- Некоторые пептидазы, включая дипептидилпептидазу 4 , белок активации фибробластов и пролилендопептидазу
Смотрите также
Ссылки
- ^ Simon GM, Cravatt BF (апрель 2010 г.). «Протеомика суперсемейств ферментов на основе активности: сериновые гидролазы как пример исследования». J. Biol. Chem . 285 (15): 11051–5. doi : 10.1074/jbc.R109.097600 . PMC 2856978. PMID 20147750 .
- ^ Lubert Stryer (1981). Биохимия (2-е изд.). С. 162.
