Дальний восходящий элемент-связывающий белок 1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Дальний элемент-связывающий белок 1 - это белок , который у людей кодируется геном FUBP1 . [ ^{5] [6]}

Этот ген кодирует белок связывания одноцепочечной ДНК, который активирует дальний элемент вверх по течению (FUSE) c-myc и стимулирует экспрессию c-myc в недифференцированных клетках. Регулирование FUSE с помощью FUBP происходит посредством одноцепочечного связывания FUBP с некодирующей цепью. Было показано, что этот белок функционирует как АТФ-зависимая ДНК-хеликаза. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что белок 1, связывающий элемент дальнего восходящего потока, взаимодействует с MAPK14 ^[7] и SMN1 ^[8] .

Клиническое значение

Делеция гена FUBP1 является частью мутации коделеции 1p/19q , наблюдаемой при олигодендроглиоме , форме первичной опухоли головного мозга . ^{[9] Ген} CIC также теряется при мутации коделеции 1p/19q.

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000162613 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028034 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Дункан Р., Базар Л., Микелотти Г., Томонага Т., Крутч Х., Авиган М., Левенс Д. (апрель 1994 г.). «Специфичный к последовательности одноцепочечный связывающий белок активирует дальний восходящий элемент c-myc и определяет новый мотив связывания ДНК». Genes Dev . 8 (4): 465–80. doi : 10.1101/gad.8.4.465 . PMID  8125259.
6. "Ген Entrez: белок 1, связывающий дальний элемент FUBP1 (FUSE)".
7. Ким, Мин Чжун; Пак Бом-Джун; Кан Ён-Сон; Ким Хён Джун; Пак Чжэ-Хён; Кан Чжон У; Ли Сан Вон; Хан Чжон Мин; Ли Хан-Ун; Ким Сон Хун (июль 2003 г.). «Понижение регуляции FUSE-связывающего белка и c-myc кофактором тРНК-синтетазы p38 необходимо для дифференциации клеток легких». Nat. Genet . 34 (3). Соединенные Штаты: 330–6. doi : 10.1038/ng1182. ISSN  1061-4036. PMID  12819782. S2CID  41006480.
8. Williams, BY; Hamilton SL; Sarkar HK (март 2000). «Белок выживаемости двигательных нейронов взаимодействует с трансактиваторным связывающим белком FUSE из человеческого эмбрионального мозга». FEBS Lett . 470 (2). НИДЕРЛАНДЫ: 207–10. doi :10.1016/S0014-5793(00)01320-X. ISSN  0014-5793. PMID  10734235. S2CID  28330997.
9. Уэллер, Майкл (8 декабря 2020 г.). «Руководство EANO по диагностике и лечению диффузных глиом у взрослых». Nature Reviews. Клиническая онкология . 18 (3): 170–186. doi :10.1038/s41571-020-00447-z. PMC 7904519. PMID  33293629 . 

Дальнейшее чтение

• Williams BY, Hamilton SL, Sarkar HK (2000). «Белок выживаемости двигательных нейронов взаимодействует с трансактиваторным связывающим белком FUSE из человеческого эмбрионального мозга». FEBS Lett . 470 (2): 207–10. doi :10.1016/S0014-5793(00)01320-X. PMID  10734235. S2CID  28330997.
• Liu J, He L, Collins I, et al. (2000). «Взаимодействующий репрессор FBP нацеливается на TFIIH, чтобы ингибировать активированную транскрипцию». Mol. Cell . 5 (2): 331–41. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80428-1 . PMID  10882074.
• Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA и др. (2000). «Кооперативная сборка комплекса hnRNP, индуцированная тканеспецифическим гомологом белка, связывающего полипиримидиновый тракт». Mol. Cell. Biol . 20 (20): 7463–79. doi :10.1128/MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC  86300. PMID  11003644 .
• He L, Weber A, Levens D (2000). «Детерминанты ядерного нацеливания белка связывания дальнего элемента вверх по течению, фактора транскрипции c-myc». Nucleic Acids Res . 28 (22): 4558–65. doi :10.1093/nar/28.22.4558. PMC  113884. PMID  11071946 .
• Vindigni A, Ochem A, Triolo G, Falaschi A (2001). «Идентификация человеческой ДНК-хеликазы V с белком, связывающим элемент дальнего восходящего потока». Nucleic Acids Res . 29 (5): 1061–7. doi :10.1093/nar/29.5.1061. PMC  29729. PMID  11222755 .
• Liu J, Akoulitchev S, Weber A и др. (2001). «Дефектное взаимодействие активаторов и репрессоров с TFIH при пигментной ксеродерме». Cell . 104 (3): 353–63. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00223-9 . PMID  11239393.
• Braddock DT, Louis JM, Baber JL и др. (2002). «Структура и динамика доменов KH из FBP, связанных с одноцепочечной ДНК». Nature . 415 (6875): 1051–6. Bibcode :2002Natur.415.1051B. doi :10.1038/4151051a. PMID  11875576. S2CID  4401103.
• Rappsilber J, Ryder U, Lamond AI, Mann M (2002). «Масштабный протеомный анализ человеческой сплайсосомы». Genome Res . 12 (8): 1231–45. doi :10.1101/gr.473902. PMC  186633. PMID  12176931 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Kim MJ, Park BJ, Kang YS и др. (2003). «Понижение уровня FUSE-связывающего белка и c-myc кофактором тРНК-синтетазы p38 необходимо для дифференциации клеток легких». Nat. Genet . 34 (3): 330–6. doi :10.1038/ng1182. PMID  12819782. S2CID  41006480.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
• Kouzine F, Liu J, Sanford S и др. (2004). «Динамическая реакция восходящей ДНК на транскрипционно-генерируемый крутильный стресс». Nat. Struct. Mol. Biol . 11 (11): 1092–100. doi :10.1038/nsmb848. PMID  15502847. S2CID  28956216.
• Rush J, Moritz A, Lee KA и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M и др. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070.
• Fautsch MP, Vrabel AM, Johnson DH (2006). «Идентификация миоцилин-ассоциированных белков в трабекулярной сети человека». Exp. Eye Res . 82 (6): 1046–52. doi :10.1016/j.exer.2005.09.016. PMID  16289162.
• Liu J, Kouzine F, Nie Z и др. (2006). «Система FUSE/FBP/FIR/TFIIH — это молекулярная машина, программирующая импульс экспрессии c-myc». EMBO J . 25 (10): 2119–30. doi :10.1038/sj.emboj.7601101. PMC  1462968 . PMID  16628215.
• Ko HS, Kim SW, Sriram SR и др. (2006). «Идентификация белка-1, связывающего элемент дальнего восходящего направления, как аутентичного субстрата Паркина». J. Biol. Chem . 281 (24): 16193–6. doi : 10.1074/jbc.C600041200 . PMID  16672220.