stringtranslate.com

Домен LCCL

В молекулярной биологии домен LCCL — это белковый домен , который был назван в честь нескольких хорошо охарактеризованных белков, которые, как было обнаружено, содержат его, а именно фактор свертывания крови Limulus C , Cochlin (Coch-5b2) и Lgl1 ( CRISPLD2 ). Это домен из примерно 100 аминокислот , C-концевая часть которого содержит высококонсервативный гистидин в консервативном мотиве YxxxSxxCxAAVHxGVI. Считается, что модуль LCCL представляет собой автономно складывающийся домен, который использовался для построения различных модульных белков посредством перетасовки экзонов . Он был обнаружен в различных белках метазоа в ассоциации с доменами комплемента B-типа, доменами лектина C-типа , доменами фон Виллебранда типа A, доменами CUB , доменами лектина дискоидина или доменами CAP . Было высказано предположение, что домен LCCL может быть вовлечен в связывание липополисахаридов (ЛПС) . [1] [2] LCCL демонстрирует новую складку . [3]

Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен LCCL, включают фактор Limulus C, чувствительную к эндотоксину ЛПС сериновую протеазу трипсинового типа , которая служит для защиты организма от бактериальной инфекции; кохлеарный белок позвоночных кохлин или coch-5b2 (кохлин, вероятно, является секретируемым белком, мутации, затрагивающие домен LCCL coch-5b2, вызывают глухоту DFNA9 у людей); и белок легких поздней стадии беременности млекопитающих Lgl1, содержащий две тандемные копии домена LCCL. [4]

Ссылки

  1. ^ Trexler M, Banyai L, Patthy L (сентябрь 2000 г.). «Модуль LCCL». Eur. J. Biochem . 267 (18): 5751–7. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01641.x . PMID  10971586.
  2. ^ Robertson NG, Lu L, Heller S, Merchant SN, Eavey RD, McKenna M, Nadol JB, Miyamoto RT, Linthicum FH, Lubianca Neto JF, Hudspeth AJ, Seidman CE, Morton CC, Seidman JG (ноябрь 1998 г.). «Мутации в новом кохлеарном гене вызывают DFNA9, несиндромальную глухоту у человека с вестибулярной дисфункцией». Nat. Genet . 20 (3): 299–303. doi :10.1038/3118. PMID  9806553. S2CID  16350815.
  3. ^ Лиепиньш, Э.; Трекслер, М.; Кайкконен, А.; Вайгельт, Дж.; Баньяи, Л.; Патти, Л.; Оттинг, Г. (1 октября 2001 г.). «ЯМР-структура домена LCCL и ее значение для расстройства глухоты DFNA9». Журнал EMBO . 20 (19): 5347–53. doi :10.1093/emboj/20.19.5347. PMC 125649. PMID 11574466  . 
  4. ^ Kaplan F, Ledoux P, Kassamali FQ, Gagnon S, Post M, Koehler D, Deimling J, Sweezey NB (июнь 1999 г.). "Новый ген, регулируемый развитием в мезенхиме легких: гомология с ингибитором трипсина, полученным из опухоли". Am. J. Physiol . 276 (6 Pt 1): L1027-36. doi :10.1152/ajplung.1999.276.6.L1027. PMID  10362728.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR004043