stringtranslate.com

Домен дискоидина

Домен дискоидина (также известный как домен типа C F5/8 или домен типа C2 ) является основным белковым доменом многих факторов свертывания крови .

Факторы свертывания крови V и VIII содержат С-концевой, дважды повторенный, домен из примерно 150 аминокислот, который часто называют «C2-подобным доменом» (который не связан с доменом C2 ). В белке клеточной адгезии Dictyostelium discoideum (слизистая плесень) дискоидине был обнаружен родственный домен, названный дискоидин I-подобным доменом, DLD или DS, который имеет общую С-концевую область из примерно 110 аминокислот с доменом FA58C, но чьи N-концевые 40 аминокислот гораздо менее консервативны. Похожие домены были обнаружены в других внеклеточных и мембранных белках. [2] [3] [4] В факторах свертывания крови V и VIII повторяющиеся домены составляют часть более крупного функционального домена, который способствует связыванию с анионными фосфолипидами на поверхности тромбоцитов и эндотелиальных клеток. [5] Было показано, что C-концевой домен второго повтора FA58C (C2) фактора свертывания крови VIII отвечает за связывание фосфатидилсерина и необходим для активности. [6] [7] FA58C содержит два консервативных цистеина в большинстве белков, которые связывают концы домена дисульфидной связью. [8] [9] [10] Еще одна дисульфидная связь расположена вблизи C-конца второго домена FA58C в MFGM Q08431 . [10]

Белки человека, содержащие этот домен

AEBP1; BTBD9 ; CASPR4; CNTNAP1 ; CNTNAP2 ; CNTNAP3; CNTNAP4 ; CNTNAP5; CPXM1 ; CPXM2; DCBLD1; DCBLD2 ; DDR1 ; DDR2 ; EDIL3 ; F5 ; F8 ; F8B ; MFGE8 ; NRP1 ; NRP2 ; RS1 ; SSPO ; UNC13A

Ссылки

  1. ^ Veeraraghavan S, Baleja JD, Gilbert GE (июнь 1998 г.). «Структура и топография домена C2, связывающего мембрану, фактора VIII в присутствии мицелл додецилфосфохолина». Biochem. J . 332 (Pt 2) (Pt 2): 549–55. doi :10.1042/bj3320549. PMC  1219512 . PMID  9601086.
  2. ^ Davie EW, Kane WH (1986). «Клонирование кДНК, кодирующей человеческий фактор V, фактор свертывания крови, гомологичный фактору VIII и церулоплазмину». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (18): 6800–6804. doi : 10.1073 /pnas.83.18.6800 . PMC 386597. PMID  3092220. 
  3. ^ Rutter WJ, Edman JC, Johnson JD (1993). «Рецепторная тирозинкиназа, обнаруженная в клетках карциномы молочной железы, имеет внеклеточный домен, подобный дискоидину I». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (12): 5677–5681. doi : 10.1073/pnas.90.12.5677 . PMC 46784. PMID  8390675 . 
  4. ^ Couto JR, Taylor MR, Godwin SG, Ceriani RL, Peterson JA (1996). «Клонирование и анализ последовательности антигена эпителия молочной железы человека BA46 выявляют последовательность адгезии клеток RGD, представленную на домене, подобном эпидермальному фактору роста». DNA Cell Biol . 15 (4): 281–286. doi :10.1089/dna.1996.15.281. PMID  8639264.
  5. ^ Davie EW, Kane WH (1988). «Факторы свертывания крови V и VIII: структурные и функциональные сходства и их связь с геморрагическими и тромботическими расстройствами». Blood . 71 (3): 539–555. doi : 10.1182/blood.V71.3.539.539 . PMID  3125864.
  6. ^ Foster PA, Fulcher CA, Houghten RA, Zimmerman TS (1990). «Синтетические пептиды фактора VIII с аминокислотными последовательностями, содержащимися в домене C2 фактора VIII, ингибируют связывание фактора VIII с фосфатидилсерином». Blood . 75 (10): 1999–2004. doi : 10.1182/blood.V75.10.1999.1999 . PMID  2110840.
  7. ^ Kane WH, Peterson JA, Ortel TL, Quinn-Allen MA, Keller FG, Larocca D (1994). «Локализация функционально важных эпитопов во втором домене C-типа фактора свертывания крови V с использованием рекомбинантных химер». J. Biol. Chem . 269 (22): 15898–15905. doi : 10.1016/S0021-9258(17)40765-4 . PMID  7515064.
  8. ^ Mann KG, Xue J, Kalafatis M (1993). «Определение дисульфидных мостиков в легкой цепи фактора Va». Биохимия . 32 (22): 5917–5923. doi :10.1021/bi00071a002. PMID  8504111.
  9. ^ Фудзикава К, МакМаллен БА, Дэви ЭВ, Хеднер У, Эзбан М (1995). «Расположение дисульфидных связей и свободных цистеинов в тяжелых и легких цепях рекомбинантного человеческого фактора VIII (антигемофильный фактор А)». Protein Sci . 4 (4): 740–746. doi :10.1002/pro.5560040413. PMC 2143093. PMID  7613471 . 
  10. ^ ab Petersen TE, Hvarregaard J, AndersenMH, Berglund L, Rasmussen JT (сентябрь 1996 г.). "Характеристика гликопротеина PAS-6/7 из мембран жировых глобул коровьего молока". Eur. J. Biochem . 240 (3): 628–636. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0628h.x . PMID  8856064.
Примечания
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000421

Дальнейшее чтение

Баумгартнер, С.; Хофманн, К.; Шике-Эрисманн, П.; Бухер, Р. (1998). «Повторный взгляд на семейство доменов дискоидина: новые члены из прокариот и предсказание укладки на основе гомологии». Protein Science . 7 (7): 1626–1631. doi :10.1002/pro.5560070717. PMC  2144056 . PMID  9684896.