В молекулярной биологии домен цинкового пальца FYVE назван в честь четырех богатых цистеином белков : F ab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), Y OTB, V ac 1 (белок транспорта везикул) и E EA1 , в которых он был обнаружен. Домены FYVE связывают фосфатидилинозитол-3-фосфат [ 2] способом, зависящим от его координации с ионами металлов и основными аминокислотами. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH. [3] Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом . [4]
Структура
Домен FYVE состоит из двух небольших бета-шпилек (или цинковых костяшек), за которыми следует альфа-спираль . [5] Палец FYVE связывает два иона цинка . Палец FYVE имеет восемь потенциальных позиций цистеина для координации цинка и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеинов. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:
R+HHC+XCG , где + представляет собой заряженный остаток, а X — любой остаток
Палец FYVE структурно похож на домен RING и палец PHD .
Примеры
Ниже приведен список человеческих белков, содержащих этот домен:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5, FGD6, FYCO1, HGS , MTMR3 , MTMR4, PIKFYVE , PLEKHF1, PLEKHF2
- RUFY1 , RUFY2 , RUFY3, RUFY4, WDFY1, WDFY2, WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE9 , ZFYVE16 , ZFYVE19 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , ZFYVE28
Ссылки
- ^ Дюма Дж. Дж., Меритью Э., Судхаршан Э. и др. (ноябрь 2001 г.). «Мультивалентное нацеливание на эндосомы с помощью гомодимерного EEA1». Мол. Клетка . 8 (5): 947–58. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00385-9 . ПМИД 11741531.
- ^ Голье Дж. М., Симонсен А., Д'Арриго А., Бремнес Б., Стенмарк Х., Осланд Р. (июль 1998 г.). «Пальцы FYVE связывают PtdIns(3)P». Природа . 394 (6692): 432–3. дои : 10.1038/28767. PMID 9697764. S2CID 4385768.
- ^ He J, Vora M, Haney RM и др. (сентябрь 2009 г.). «Вставка домена FYVE в мембрану модулируется pH». Proteins . 76 (4): 852–60. doi :10.1002/prot.22392. PMC 2909462 . PMID 19296456.
- ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (апрель 1999 г.). «Сигнализация через фосфоинозитид 3-киназы: липиды занимают центральное место». Curr. Opin. Cell Biol . 11 (2): 219–25. doi :10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156.
- ^ Misra S, Hurley JH (май 1999). "Кристаллическая структура фосфатидилинозитол-3-фосфатного специфического мембранно-нацеливающего мотива, домен FYVE Vps27p". Cell . 97 (5): 657–66. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80776-X . PMID 10367894. S2CID 15448444.
Дальнейшее чтение
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (сентябрь 1996 г.). «Эндосомальная локализация аутоантигена EEA1 опосредована цинксвязывающим пальцем FYVE». J. Biol. Chem . 271 (39): 24048–54. doi : 10.1074/jbc.271.39.24048 . PMID 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (декабрь 1999 г.). «FYVE-finger proteins — effectors of an inositol liver». J. Cell Sci . 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636.
