Желтый флуоресцентный белок ( YFP ) — это генетический мутант зеленого флуоресцентного белка (GFP), первоначально полученного из медузы Aequorea victoria . [1] Его пик возбуждения составляет 513 нм, а пик испускания — 527 нм. [2] Как и родительский GFP, YFP является полезным инструментом в клеточной и молекулярной биологии , поскольку пики возбуждения и испускания YFP отличаются от GFP, что позволяет изучать несколько процессов/белков в одном эксперименте.
Три улучшенных версии YFP — это Citrine, Venus и Ypet. Они имеют пониженную чувствительность к хлориду, более быстрое созревание и повышенную яркость (определяемую как произведение коэффициента экстинкции и квантового выхода ). Обычно YFP служит акцептором для генетически кодируемых сенсоров FRET , из которых наиболее вероятным донором FP является мономерный голубой флуоресцентный белок (mCFP). Красное смещение относительно GFP вызвано взаимодействием стекирования Pi-Pi в результате замены T203Y, введенной мутацией, что существенно увеличивает поляризуемость локальной среды хромофора , а также обеспечивает дополнительную электронную плотность в хромофоре.
«Venus» содержит новую аминокислотную замену –F46L–, которая ускоряет окисление хромофора при 37°C, скорость ограничивающего этапа созревания. Белок имеет другие замены (F64L/ M153T/ V163A/ S175G), что позволяет Venus хорошо складываться и дает ему относительную толерантность к ацидозу и Cl − . [3]
Для создания мутанта YFP потребовалось четыре мутации белка из дикого типа GFP, обнаруженного в медузе Aequorea Victoria. Самой важной мутацией была замена треонина на тирозин в позиции остатка 203 [1] (замена обозначается как T203Y, где T и Y представляют собой однобуквенный код для аминокислот треонина и тирозина соответственно).