stringtranslate.com

Импортин

Импортин — это тип кариоферина [1] , который транспортирует молекулы белка из цитоплазмы клетки в ядро . Он делает это , связываясь со специфическими последовательностями распознавания , называемыми последовательностями ядерной локализации (NLS).

Импортин имеет две субъединицы, импортин α и импортин β. Члены семейства импортинов-β могут связывать и транспортировать груз сами по себе или могут образовывать гетеродимеры с импортином-α. Как часть гетеродимера , импортин-β опосредует взаимодействия с поровым комплексом , в то время как импортин-α действует как адаптерный белок для связывания сигнала ядерной локализации (NLS) на грузе. Тример NLS-импортин α-импортин β диссоциирует после связывания с Ran GTP внутри ядра , [2] при этом два белка импортина возвращаются в цитоплазму для дальнейшего использования.

Открытие

Импортин может существовать как гетеродимер импортина-α/β или как мономер импортина-β. Импортин-α был впервые выделен в 1994 году группой, включающей Энно Хартманна, из Центра молекулярной медицины Макса Дельбрюка . [1] Процесс импорта ядерного белка уже был охарактеризован в предыдущих обзорах, [3] но ключевые белки, участвующие в этом процессе, до этого момента не были выяснены. Цитозольный белок массой 60 кДа, необходимый для импорта белка в ядро, и с 44% идентичностью последовательности с SRP1p, был очищен из яиц Xenopus . Он был клонирован, секвенирован и экспрессирован в E.coli , и для того, чтобы полностью восстановить сигнал-зависимый транспорт, его пришлось объединить с Ran (TC4). В исследовании также были обнаружены другие ключевые стимулирующие факторы. [1]

Импортин-β, в отличие от импортина-α, не имеет прямых гомологов в дрожжах, но был очищен как белок 90-95 кДа и было обнаружено, что он образует гетеродимер с импортином-α в ряде различных случаев. Они включали исследование под руководством Майкла Рексаха [4] и дальнейшие исследования Дирка Гёрлиха. [5] Эти группы обнаружили, что импортину-α для функционирования требуется другой белок, импортин-β, и что вместе они образуют рецептор для сигналов ядерной локализации (NLS) , тем самым обеспечивая транспорт в ядро . С момента этих первых открытий в 1994 и 1995 годах было обнаружено множество генов импортина, таких как IPO4 и IPO7 , которые облегчают импорт немного отличающихся грузовых белков из-за их различной структуры и локализации.

Структура

Импортин-α

Большая часть белка-адаптера импортина-α состоит из нескольких повторов броненосца (ARM), расположенных в тандеме . Эти повторы могут складываться вместе, образуя изогнутую структуру, которая облегчает связывание с NLS специфических грузовых белков. Основной сайт связывания NLS находится в направлении N-конца , а второстепенный сайт находится в C-конце . Помимо структур ARM , импортин-α также содержит 90- аминокислотную N-концевую область, ответственную за связывание с импортином-β, известную как домен связывания импортина-β (IBB). [6] Это также сайт аутоингибирования, [7] и участвует в высвобождении груза, как только импортин-α достигает ядра . [8]

Импортин-β

Импортин-β является типичной структурой более крупного суперсемейства кариоферинов . Основой их структуры являются 18-20 тандемных повторов мотива HEAT . Каждый из этих повторов содержит две антипараллельные альфа-спирали, связанные поворотом , которые складываются вместе , образуя общую структуру белка . [ 9]

Для того, чтобы транспортировать груз в ядро , импортин-β должен ассоциироваться с комплексами ядерных пор . Он делает это, образуя слабые, временные связи с нуклеопоринами в их различных мотивах F G (Phe-Gly). Кристаллографический анализ показал, что эти мотивы связываются с импортином-β в неглубоких гидрофобных карманах, обнаруженных на его поверхности. [10]

Цикл импорта ядерного белка

Основная функция импортина — опосредовать транслокацию белков с сигналами ядерной локализации в ядро ​​через комплексы ядерных пор (NPC) в процессе, известном как цикл импорта ядерного белка.

Грузовое крепление

Первым шагом этого цикла является связывание груза. Импортин может выполнять эту функцию как мономерный белок импортин-β , но обычно требует присутствия импортина-α, который действует как адаптер для белков груза (через взаимодействие с NLS ). NLS представляет собой последовательность основных аминокислот , которая помечает белок как груз, предназначенный для ядра . Белок груза может содержать один или два из этих мотивов , которые будут связываться с основными и/или второстепенными сайтами связывания на импортине-α. [11]


Обзор цикла импорта ядерного белка.

Грузовой транспорт

После связывания белка-груза импортин-β взаимодействует с NPC , и комплекс диффундирует в ядро ​​из цитоплазмы . Скорость диффузии зависит как от концентрации импортина-α, присутствующего в цитоплазме, так и от связывающей способности импортина-α с грузом. Попав внутрь ядра , комплекс взаимодействует с ГТФазой семейства Ras , Ran-GTP . Это приводит к диссоциации комплекса путем изменения конформации импортина-β. Импортин-β остается связанным с Ran - GTP , готовым к переработке. [11]

Выпуск груза

Теперь, когда комплекс импортин-α/груз освободился от импортина-β, грузо-белок может быть высвобожден в ядро . N -концевой импортин-β-связывающий домен (IBB) импортина-α содержит ауторегуляторную область, которая имитирует мотив NLS . [7] Высвобождение импортина-β освобождает эту область и позволяет ему вернуться в петлю и конкурировать за связывание с грузо-белком в основном сайте связывания NLS . Эта конкуренция приводит к высвобождению белка . В некоторых случаях для высвобождения груза могут также использоваться специфические факторы высвобождения, такие как Nup2 и Nup50 . [11]

Переработка

Наконец, для того, чтобы вернуться в цитоплазму , импортин-α должен связаться с комплексом Ran-GTP / CAS (ядерный фактор экспорта), который облегчает его выход из ядра . CAS (клеточный белок восприимчивости к апоптозу) является частью суперсемейства кариоферинов импортина-β и определяется как ядерный фактор экспорта. Импортин-β возвращается в цитоплазму , все еще связанный с Ran-GTP. Попав в цитоплазму, Ran-GTP гидролизуется Ran GAP , образуя Ran - GDP и высвобождая два импортина для дальнейшей активности . Именно этот гидролиз GTP обеспечивает энергию для цикла в целом. В ядре GEF заряжает Ran молекулой GTP , которая затем гидролизуется GAP в цитоплазме , как указано выше. Именно эта активность Ran обеспечивает однонаправленный транспорт белков . [11]

Болезнь

Существует несколько болезненных состояний и патологий, связанных с мутациями или изменениями экспрессии импортина-α и импортина-β.

Импортины являются жизненно важными регуляторными белками в процессах гаметогенеза и эмбриогенеза . В результате было показано, что нарушение паттернов экспрессии импортина-α вызывает дефекты фертильности у Drosophila melanogaster . [12]

Также были исследования, связывающие измененный импортин-α с некоторыми случаями рака . Исследования рака молочной железы выявили укороченную форму импортина-α, в которой отсутствует домен связывания NLS . [13] Кроме того, было показано, что импортин-α переносит ген-супрессор опухоли , BRCA1 (белок восприимчивости к раку молочной железы 1 типа) , в ядро . Повышенная экспрессия импортина-α также была связана с низкими показателями выживаемости, наблюдаемыми у некоторых пациентов с меланомой . [14]

Активность импортина также связана с некоторыми вирусными патологиями . Например, в пути заражения вирусом Эбола ключевым шагом является ингибирование ядерного импорта PY-STAT1 . Это достигается путем секвестрации вирусом импортина-α в цитоплазме , что означает, что он больше не может связывать свой груз в NLS . [15] В результате импортин не может функционировать, и груз-белок остается в цитоплазме.

Виды грузов

Импортин может транспортировать в ядро ​​множество различных грузовых белков . Часто для перемещения различных белков требуются различные комбинации α и β. Ниже приведены некоторые примеры различных грузов.

Гены импортина человека

Хотя импортин-α и импортин-β используются для описания импортина в целом, на самом деле они представляют собой более крупные семейства белков , которые имеют схожую структуру и функцию. Для α и β были идентифицированы различные гены, некоторые из которых перечислены ниже. Обратите внимание, что часто кариоферин и импортин используются как взаимозаменяемые.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Görlich D, Prehn S, Laskey RA, Hartmann E (декабрь 1994 г.). «Выделение белка, необходимого для первого этапа импорта ядерного белка». Cell . 79 (5): 767–78. doi :10.1016/0092-8674(94)90067-1. PMID  8001116. S2CID  7539929.
  2. ^ Mattaj IW, Englmeier L (1998). «Ядерно-цитоплазматический транспорт: растворимая фаза». Annual Review of Biochemistry . 67 : 265–306. doi : 10.1146/annurev.biochem.67.1.265 . PMID  9759490.
  3. ^ Garcia-Bustos J, Heitman J, Hall MN (март 1991). «Локализация ядерного белка». Biochim. Biophys. Acta . 1071 (1): 83–101. doi :10.1016/0304-4157(91)90013-m. PMID  2004116.
  4. ^ Enenkel C, Blobel G, Rexach M (июль 1995 г.). «Идентификация гетеродимера дрожжевого кариоферина, который нацеливает импортный субстрат на комплексы ядерных пор млекопитающих». J. Biol. Chem . 270 (28): 16499–502. doi : 10.1074/jbc.270.28.16499 . PMID  7622450.
  5. ^ Görlich D, Kostka S, Kraft R, Dingwall C, Laskey RA, Hartmann E, Prehn S (апрель 1995 г.). «Две различные субъединицы импортина взаимодействуют для распознавания сигналов ядерной локализации и связывания их с ядерной оболочкой». Current Biology . 5 (4): 383–92. Bibcode :1995CBio....5..383G. doi :10.1016/s0960-9822(95)00079-0. hdl : 11858/00-001M-0000-002D-1CBD-2 . PMID  7627554. S2CID  6055941.
  6. ^ Лотт К, Чинголани Г (сентябрь 2011 г.). «Домен связывания импортина β как главный регулятор ядерно-цитоплазматического транспорта». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1813 (9): 1578–92. doi :10.1016/j.bbamcr.2010.10.012. PMC 3037977. PMID  21029753 . 
  7. ^ ab Pufall MA, Graves BJ (2002). «Автоингибиторные домены: модульные эффекторы клеточной регуляции». Annual Review of Cell and Developmental Biology . 18 : 421–62. doi : 10.1146/annurev.cellbio.18.031502.133614. PMID  12142282.
  8. ^ Conti E, Uy M, Leighton L, Blobel G, Kuriyan J (июль 1998 г.). «Кристаллографический анализ распознавания сигнала ядерной локализации ядерным фактором импорта кариоферином альфа». Cell . 94 (2): 193–204. doi : 10.1016/s0092-8674(00)81419-1 . PMID  9695948. S2CID  16230174.
  9. ^ Lee SJ, Matsuura Y, Liu SM, Stewart M (июнь 2005 г.). «Структурная основа диссоциации комплекса ядерного импорта с помощью RanGTP». Nature . 435 (7042): 693–6. Bibcode :2005Natur.435..693L. doi :10.1038/nature03578. PMID  15864302. S2CID  4304731.
  10. ^ Bayliss R, Littlewood T, Stewart M (июль 2000 г.). «Структурная основа взаимодействия между повторами нуклеопорина FxFG и импортином-бета в ядерном транспорте». Cell . 102 (1): 99–108. doi : 10.1016/s0092-8674(00)00014-3 . PMID  10929717. S2CID  17495979.
  11. ^ abcd Weis K (февраль 2003 г.). «Регулирование доступа к геному: ядерно-цитоплазматический транспорт на протяжении клеточного цикла». Cell . 112 (4): 441–51. doi : 10.1016/s0092-8674(03)00082-5 . PMID  12600309. S2CID  17664108.
  12. ^ Terry LJ, Shows EB, Wente SR (ноябрь 2007 г.). «Пересечение ядерной оболочки: иерархическая регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта». Science . 318 (5855): 1412–6. Bibcode :2007Sci...318.1412T. doi :10.1126/science.1142204. PMID  18048681. S2CID  163986.
  13. ^ Kim IS, Kim DH, Han SM, Chin MU, Nam HJ, Cho HP, Choi SY, Song BJ, Kim ER, Bae YS, Moon YH (июль 2000 г.). «Усеченная форма импортина альфа, выявленная в клетках рака груди, ингибирует ядерный импорт p53». Журнал биологической химии . 275 (30): 23139–45. doi : 10.1074/jbc.M909256199 . PMID  10930427.
  14. ^ Виннепеннинкс В, Лазар В, Михильс С, Дессен П, Стас М, Алонсо С.Р., Аврил М.Ф., Ортис Ромеро П.Л., Роберт Т., Балаческу О., Эггермонт А.М., Ленуар Г., Сарасин А., Турс Т., ван ден Оорд Дж.Дж., Спатц А (апрель 2006 г.). «Профиль экспрессии генов первичной меланомы кожи и клинический исход». Журнал Национального института рака . 98 (7): 472–82. дои : 10.1093/jnci/djj103 . ПМИД  16595783.
  15. ^ Sekimoto T, Imamoto N, Nakajima K, Hirano T, Yoneda Y (декабрь 1997 г.). «Внеклеточный сигнально-зависимый ядерный импорт Stat1 опосредован образованием комплекса, нацеленного на ядерную пору, с NPI-1, но не с Rch1». The EMBO Journal . 16 (23): 7067–77. doi :10.1093/emboj/16.23.7067. PMC 1170309 . PMID  9384585. 

Внешние ссылки

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR002652
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR001494