Индол-3-глицерол-фосфатсинтаза

Класс ферментов

Фермент индол -3-глицеролфосфатсинтаза (ИГПС) ( КФ 4.1.1.48) катализирует химическую реакцию

1-(2-карбоксифениламино)-1-дезокси-D-рибулозо-5-фосфат 1-C-(индол-3-ил)-глицерол-3-фосфат + CO ₂ + H ₂ O ${\displaystyle \rightleftharpoons }$

Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , а точнее, карбокси-лиаз, которые расщепляют углерод-углеродные связи. Систематическое название этого класса ферментов - 1-(2-карбоксифениламино)-1-дезокси-D-рибулозо-5-фосфат карбокси-лиаза [циклизирующая 1-C-(индол-3-ил)глицерол-3-фосфат-образующая] . Другие общеупотребительные названия включают индолглицеролфосфатсинтетазу , индолглицеролфосфатсинтазу , индол-3-глицерофосфатсинтазу , 1-(2-карбоксифениламино)-1-дезокси-D-рибулозо-5-фосфат и карбокси-лиазу (циклизирующую) . Этот фермент участвует в биосинтезе фенилаланина , тирозина и триптофана и двухкомпонентной системе - в целом. Он использует один кофактор , пируват .

Структурные исследования

У некоторых бактерий IGPS является одноцепочечным ферментом . У других, таких как Escherichia coli , это N-концевой домен бифункционального фермента, который также катализирует активность N-(5'-фосфорибозил)антранилатизомеразы ( EC 5.3.1.24) (PRAI), третий этап биосинтеза триптофана . У грибов IGPS является центральным доменом трифункционального фермента, который содержит C-концевой домен PRAI и N-концевой домен глутаминамидотрансферазы ( EC 2.4.2.-) (GATase).

Структура домена IGPS бифункционального фермента из мезофильной бактерии E. coli (eIGPS) была сравнена с мономерной индол-3-глицеролфосфатсинтазой из гипертермофильной археи Sulfolobus solfataricus (sIGPS). Оба являются однодоменными (бета/альфа)8-ствольными белками с одной (eIGPS) или двумя (sIGPS) дополнительными спиралями, вставленными перед первой бета-цепью . ^[1]

По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов было решено 11 структур с кодами доступа PDB 1A53, 1I4N, 1J5T, 1JCM, 1JUK, 1JUL, 1LBF, 1LBL, 1PII, 1VC4 и 2C3Z.

Ссылки

1. Голдман А. (декабрь 1995 г.). «Как заставить мою кровь кипеть». Структура . 3 (12): 1277–9. doi : 10.1016/s0969-2126(01)00263-5 . PMID  8747452.

Дальнейшее чтение

• Creighton TE, Yanofsky C (1966). «Индол-3-глицеролфосфатсинтетаза Escherichia coli, фермент триптофанового оперона». J. Biol. Chem . 241 (20): 4616–24. doi : 10.1016/S0021-9258(18)99693-6 . PMID  5332729.
• Creighton TE; Yanofsky C (1970). "Хоризмат в триптофан (Escherichia coli) — антранилатсинтетаза, PR-трансфераза, PRA-изомераза, InGP-синтетаза, триптофан-синтетаза". Хоризмат в триптофан (Escherichia coli) — антранилатсинтетаза, PR-трансфераза, PRA-изомераза, InGP-синтетаза, триптофан-синтетаза . Методы энзимологии. Т. 17A. С. 365–380. doi :10.1016/0076-6879(71)17215-1. ISBN 978-0-12-181874-6.
• Kung CC, Huang WN, Huang YC, Yeh KC (2006). «Протеомное исследование медьсвязывающих белков в корнях Arabidopsis с помощью иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и масс-спектрометрии». Proteomics . 6 (9): 2746–58. doi :10.1002/pmic.200500108. PMID  16526091. S2CID  25896917.

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR013798