Каналоом , иногда называемый « ионным каналомом », представляет собой полный набор ионных каналов [1] и поринов [2], экспрессируемых в биологической ткани или организме. [3] Он аналогичен геному , метаболому ( описывающему метаболиты), протеому ( описывающему общую экспрессию белков ) и микробиому . Характеристика ионного каналома, называемая каналомикой , является разделом физиологии , биофизики , нейронауки и фармакологии , в котором особое внимание уделяется экспрессии генов . [4] [5] [6] Это может быть выполнено различными методами, включая электрофизиологию с патч-клампом , ПЦР и иммуногистохимию . [4] [7] Каналомика используется для скрининга и открытия новых лекарств. [4] [8]
Функциональные исследования
Структура и функция мембранных каналов тесно связаны, [9] [10] но, возможно, самая известная работа, изучающая структуру ионных каналов, — это статья Дойла и др . 1998 года, которая привела к присуждению Нобелевской премии по химии Родерику МакКиннону . [1] Аномалии структуры каналов, следовательно, приводят к их физиологическим неправильным функциям. Каналономные исследования включают систематическое изучение заболеваний, возникающих в результате таких неправильных функций. Такое заболевание называется каналопатией . [4] [8] Кроме того, каналомные исследования проверяют потенциальные лекарства на их эффективность при каналопатиях, исследуя сродство связывания потенциальных лекарственных соединений. [4] [8]
Ссылки
- ^ ab Doyle, DA, Morais-Cabral, J., Pfuetzner, RA, Kuo, A, Gulbis, JM, Cohen, SL, Chait, BT, MacKinnon, R (1998) Структура калиевого канала: молекулярная основа проводимости и селективности K + . Science 280 :69–77.
- ^ Preston GM, Carroll TP, Guggino WB, Agre P (1992). Появление водных каналов в ооцитах Xenopus, экспрессирующих белок эритроцитов CHIP28. Science 256 (5055): 385–387
- ^ Барретт-Джолли, Р., Р. Льюис и др. (2010). Возникающий каналом хондроцитов: Границы мембранной физиологии и биофизики. doi :10.3389/fphys.2010.00135
- ^ abcde Lehmann-Horn, F.; Jurkat-Rott, K. (2003). «Нанотехнологии для нейрональных ионных каналов». Журнал неврологии, нейрохирургии и психиатрии . 74 (11): 1466–1475. doi :10.1136/jnnp.74.11.1466. PMC 1738249. PMID 14617700 .
- ^ Jurkat-Rott, K.; Lehmann-Horn, F. (2004). «Техника патч-зажима в исследовании ионных каналов». Current Pharmaceutical Biotechnology . 5 (4): 387–395. doi :10.2174/1389201043376715. PMID 15320769.
- ^ Габашвили, С.; Соколовски, Х.; Мортон, К.; Гирш, Б. (сентябрь 2007 г.). «Экспрессия гена ионного канала во внутреннем ухе». Журнал Ассоциации исследований в области отоларингологии . 8 (3): 305–328. doi :10.1007/s10162-007-0082-y. ISSN 1525-3961. PMC 2538437. PMID 17541769 .
- ^ Perraud, AL; Schmitz, C.; Scharenberg, AM (2006). Обзоры и протоколы в исследовании DT40 . Субклеточная биохимия. Том 40. С. 257–270. doi :10.1007/978-1-4020-4896-8_15. ISBN 978-1-4020-4895-1. S2CID 436332.
- ^ abc Camerino, DC; Tricarico, D.; Desaphy, JF (апрель 2007 г.). «Фармакология ионных каналов». Neurotherapeutics . 4 (2): 184–198. doi : 10.1016/j.nurt.2007.01.013 . PMID 17395128.
- ^ Коэн, BE; Грейб, M.; Ян, LY (2003). «Ответы и вопросы из структур KvAP». Neuron . 39 (3): 395–400. doi : 10.1016/S0896-6273(03)00472-0 . PMID 12895415.
- ^ Рэндалл, А.; Макнотон, Н.; Грин, П. (август 2006 г.). «Свойства потенциалзависимых Na + -каналов в клеточной линии рабдомиосаркомы человека SJ-RH30: обычный и автоматизированный анализ методом патч-кламп». Pharmacological Research . 54 (2): 118–128. doi :10.1016/j.phrs.2006.03.005. ISSN 1043-6618. PMID 16675265.