stringtranslate.com

Номенклатурные коды

Номенклатурные кодексы или кодексы номенклатуры — это различные своды правил, которые регулируют наименование живых организмов. Стандартизация научных названий биологических организмов позволяет исследователям обсуждать результаты (включая открытие новых видов).

По мере того, как изучение биологии становилось все более специализированным, для различных типов организмов были приняты особые коды.

Конечному пользователю, который имеет дело только с названиями видов, и который знает, что виды можно отнести к родам , семействам и другим таксонам более высоких рангов, может быть не заметно, что существует более одного кода, но за пределами этого базового уровня они работают по-разному.

Биномиальная номенклатура

В таксономии , биномиальная номенклатура («двухчленная система наименования»), также называемая бинарной номенклатурой , является формальной системой наименования видов живых существ путем присвоения каждому имени, состоящему из двух частей, обе из которых используют латинские грамматические формы , хотя они могут быть основаны на словах из других языков. Такое имя называется биномиальным именем (которое может быть сокращено до просто «биномиальный»), биноменом , биноминальным именем или научным именем ; более неформально его также исторически называют латинским именем . В МКЗН система также называется биномиальной номенклатурой , [1] «binomi'N'al» с «N» перед «al», что не является опечаткой, что означает «двухименная система наименования». [2]

Первая часть имени — родовое имя — определяет род , к которому принадлежит вид, тогда как вторая часть — видовое имя или видовой эпитет — различает виды внутри рода. Например, современные люди принадлежат к роду Homo , а внутри этого рода — к виду Homo sapiens . Tyrannosaurus rex , вероятно, является наиболее широко известным биномиалом. [3]

Формальное введение этой системы наименования видов приписывается Карлу Линнею , фактически начавшему с его работы Species Plantarum в 1753 году. [ 4] Но еще в 1622 году Гаспар Баухин ввел в своей книге Pinax theatri botanici (англ., Иллюстрированное изложение растений ), содержащую множество названий родов, которые позже были приняты Линнеем. [5] Введение Линнеем двухсоставных названий (биноминальной номенклатуры) для видов было желанным упрощением, поскольку по мере расширения наших знаний о биоразнообразии увеличивалась и длина названий, многие из которых стали громоздкими. [6]

Кодификация научных названий

С принятием натуралистами по всему миру биноминальной номенклатуры возникло несколько школ мысли о деталях. Становилось все более очевидным, что для управления научными названиями необходим подробный свод правил . С середины 19-го века и далее было несколько инициатив по достижению всемирно принятых наборов правил. В настоящее время номенклатурные кодексы регулируют наименование:

Различия между кодами

Начальная точка

Начальная точка, то есть время, с которого эти коды вступают в силу (обычно ретроактивно), варьируется от группы к группе, а иногда и от ранга к рангу. [7] В ботанике и микологии начальной точкой часто является 1 мая 1753 года ( Linnaeus , Species plantarum ). В зоологии это 1 января 1758 года (Linnaeus, Systema Naturae , 10-е издание ). С другой стороны, бактериология начала заново, совершив чистую чистку в 1980 году (Skerman et al., «Утвержденные списки названий бактерий»), хотя и сохранила первоначальных авторов и даты публикации. [8]

Исключения в ботанике: [9] [10] [11]

Исключения в зоологии: [13]

Выработки

Существуют также различия в работе кодов. Например, ICN (код водорослей, грибов и растений) запрещает тавтонимы , тогда как ICZN (код животных) их разрешает.

Терминология

Эти коды различаются по терминологии, и существует долгосрочный проект по ее «гармонизации». Например, ICN использует «действительный» в «действительной публикации имени» (=акт публикации формального имени), с «установлением имени» в качестве эквивалента ICZN . ICZN использует «действительный» в «действительном имени» (=правильное имя), с «правильным именем» в качестве эквивалента ICN . Гармонизация продвигается очень ограниченно.

Типы

Существуют различия в отношении того, какие типы используются . Бактериологический код предпочитает живые культуры типов, но допускает другие типы. Продолжаются дебаты относительно того, какой тип типа более полезен в случае, подобном цианобактериям . [14]

Другие коды

БиоКод

Более радикальный подход был реализован в 1997 году, когда Международный комитет по биономенклатуре (ICB) IUBS / IUMS представил долго обсуждавшийся проект Биокода , в котором предлагалось заменить все существующие кодексы путем их гармонизации. [15] [16] Первоначально запланированной датой внедрения проекта Биокода было 1 января 2000 года, но соглашение о замене существующих кодексов достигнуто не было.

В 2011 году был предложен пересмотренный Биокод , который вместо замены существующих Кодексов обеспечивал бы для них единый контекст, ссылаясь на них при необходимости. [17] [18] [19] Изменения в существующие кодексы медленно вносятся в предлагаемых направлениях. [20] [21] Однако участники последнего серьезного обсуждения проекта Биокода пришли к выводу, что он, вероятно, не будет реализован при их жизни. [22]

ФилоКод

Многие авторы столкнулись с проблемами при использовании системы Линнея в филогенетической классификации. [23] Фактически, ранние сторонники номенклатуры, основанной на рангах, такие как Альфонс де Кандоль и авторы версии кодекса номенклатуры Американского союза орнитологов 1886 года, уже предвидели, что в будущем от номенклатуры, основанной на рангах, придется отказаться. [24] [6] Еще один кодекс , который был разработан с 1998 года, — это PhyloCode , который теперь регулирует названия, определенные в рамках филогенетической номенклатуры вместо традиционной номенклатуры Линнея . Этот новый подход требует использования филогенетических определений, которые ссылаются на «спецификаторы», аналогичные «типу» в номенклатуре, основанной на рангах. Такие определения разграничивают таксоны в рамках данной филогении, и этот вид номенклатуры не требует использования абсолютных рангов. Кодекс вступил в силу в 2020 году с публикацией «Филонимов» — монографии , включающей список имен, установленных в соответствии с этим кодексом.

Амбирегнальные протисты

Некоторые простейшие , иногда называемые амбирегнальными простейшими , считались одновременно простейшими и водорослями , или простейшими и грибами , и их названия были опубликованы либо под МКЗН , либо под МКН, либо под обеими . [25] [26] В результате двойной язык в схемах классификации простейших привел к путанице. [27] [28] [29]

Группы, заявленные как протозоологами , так и фикологами, включают эвглениды , динофлагелляты , криптомонады , гаптофиты , глаукофиты , многие гетероконты (например, хризофиты , рафидофиты , силикофлагелляты , некоторые ксантофиты , протеромонады ), некоторые монадоидные зеленые водоросли ( вольвокальные и празинофиты ), хоанофлагелляты , бикозоециды , эбрииды и хлорарахниофиты .

Слизевики , плазмодиальные формы и другие « грибоподобные » организмы, заявленные как протозоологами, так и микологами , включают мицетозои , плазмодиофориды , акразиды и лабиринтуломицеты . Грибы, заявленные как протозоологами, так и микологами, включают хитридиевые грибы , бластоклады и кишечные грибы .

Другими проблемными группами являются цианобактерии (ICNP/ICN) и микроспоридии (ICZN/ICN).

Нерегулируемые таксоны

Зоологический кодекс не регулирует названия таксонов ниже подвида или выше надсемейства. Существует много попыток ввести некоторый порядок в номенклатуру этих таксонов, [30] [31] включая PhyloCode , Duplostensional Nomenclatural System, [32] [33] и circumscriptional nomenclature . [34] [35]

Ботанический код применяется в первую очередь к рангам надсемейства и ниже. Существуют некоторые правила для названий выше ранга надсемейства, но принцип приоритета к ним не применяется, а принцип типификации является необязательным. Эти названия могут быть либо автоматически типифицированными названиями , либо описательными названиями . [36] [37] В некоторых обстоятельствах таксон имеет два возможных названия (например, Chrysophyceae Pascher, 1914, nom. descrip. ; Hibberd, 1976, nom. typificatum ). Описательные названия проблематичны, поскольку, если таксон разделен, не очевидно, какая новая группа принимает существующее название. Между тем, с типифицированными названиями существующее название принимает новая группа, которая все еще носит тип этого названия. Однако типифицированные названия представляют особые проблемы для микроорганизмов. [29]

Смотрите также

Ссылки

  1. ↑ Международная комиссия по зоологической номенклатуре 1999, Глава 2, Статья 5. Принцип биноминальной номенклатуры ( «Статья 5. Принцип биноминальной номенклатуры | Международный кодекс зоологической номенклатуры». Архивировано из оригинала 29 марта 2023 г. . Получено 29 марта 2023 г. .)
  2. ^ Международная комиссия по зоологической номенклатуре 1999, Глоссарий – «биномен», «номенклатура, биноминальный» ( «Глоссарий | Международный кодекс зоологической номенклатуры». Архивировано из оригинала 6 февраля 2023 года . Получено 29 марта 2023 года .)
  3. ^ Басби, Артур III и др. (1997). Руководство по горным породам и окаменелостям . стр. 103.
  4. ^ Кнапп, Сандра . «Что в имени? История таксономии: Линней и рождение современной таксономии». NHM.ac.uk. Музей естественной истории, Лондон . Архивировано из оригинала 18 октября 2014 г. Получено 17 июня 2011 г.
  5. ^ Баухин, Гаспар. "Pinax theatri botanici". Библиотека Киотского университета. Архивировано из оригинала 17 октября 2016 года . Получено 19 июня 2016 года .
  6. ^ ab Лорен, Мишель (3 августа 2023 г.). Появление PhyloCode: продолжающаяся эволюция биологической номенклатуры. CRC Press. doi : 10.1201/9781003092827. ISBN 978-1-003-09282-7.
  7. ^ Николсон, Дэн (1991). «История ботанической номенклатуры». Анналы ботанического сада Миссури . 78 (1): 33–56. doi :10.2307/2399589. JSTOR  2399589.
  8. ^ Скерман, В. Б. Д.; Макгоуэн, В.; Снит, П. А. Х. А. (1980). «Утвержденные списки названий бактерий». Int. J. Syst. Bacteriol . 30 : 225–420. doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .
  9. ^ Читвуд, Б. Г. (1958). «Обозначение официальных названий для высших таксонов беспозвоночных». Bull. Zool. Nomencl . 15 : 860–895. doi : 10.5962/bhl.part.19410 .
  10. ^ Сильва, ПК (1958). «Более поздние отправные точки у водорослей» (PDF) . Таксон . 7 (7): 181–184. doi :10.2307/1216399. JSTOR  1216399.
  11. ^ (Турланд и др. 2018, статья 13)
  12. ^ (Турланд и др. 2018, статья F.1.1)
  13. ^ ICZN - Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). Международный кодекс зоологической номенклатуры . Четвертое издание. Международный фонд зоологической номенклатуры, Лондон, Великобритания. 306 стр., [1].
  14. ^ Орен, Аарон (2004). «Предложение о дальнейшей интеграции цианобактерий в соответствии с Бактериологическим кодексом». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (ч. 5): 1895–1902. doi : 10.1099/ijs.0.03008-0 . PMID  15388760.
  15. ^ «Проект Биокода». 1997.
  16. ^ Макнил, Джон (4 ноября 1996 г.). «Глава 2. Биокод: интегрированная биологическая номенклатура для 21-го века?». Труды мини-симпозиума по биологической номенклатуре в 21-м веке .
  17. ^ "Проект Биокода (2011)". Международный комитет по биономенклатуре (ICB).
  18. ^ Greuter, W.; Garrity, G.; Hawksworth, DL; Jahn, R.; Kirk, PM; Knapp, S.; McNeill, J.; Michel, E.; Patterson, DJ; Pyle, R.; Tindall, BJ (2011). «Проект биокода (2011): принципы и правила, регулирующие наименование организмов». Taxon . 60 : 201–212. doi :10.1002/tax.601019.
  19. ^ Хоксворт, DL (2011). «Представляем проект Биокода (2011)». Таксон . 60 (1): 199–200. doi :10.1002/tax.601018.
  20. ^ DL Hawksworth (2011) Биокод 2011. Введение. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
  21. ^ Вернер Гройтер (2011) Биокод 2011. Пояснительный пролог. http://www.bionomenclature.net/biocode2011.html
  22. ^ Орен, Аарон (2019). в Руководстве Берджи по систематике архей и бактерий (1-е изд.). Wiley. стр. 1-12. doi :10.1002/9781118960608.bm00004.pub2. ISBN 978-1-118-96060-8. S2CID  240836383.
  23. ^ de Queiroz, K.; Gauthier, J. (декабрь 1990 г.). «Филогения как центральный принцип таксономии: филогенетические определения названий таксонов» (PDF) . Systematic Zoology . 39 (4): 307–322. doi :10.2307/2992353. JSTOR  2992353. Архивировано из оригинала (PDF) 13 ноября 2017 г.
  24. ^ Лорен, Мишель (23 июля 2023 г.). «Филокод: логический результат тысячелетий эволюции биологической номенклатуры?». Zoologica Scripta . 52 (6): 543–555. doi :10.1111/zsc.12625. ISSN  0300-3256. S2CID  260224728.
  25. ^ Корлисс, Дж. О. (1995). «Двухцарственные протисты и коды номенклатуры: краткий обзор проблемы и предлагаемых решений». Бюллетень зоологической номенклатуры . 52 : 11–17. doi : 10.5962/bhl.part.6717 .
  26. ^ (Макнил и др. 2012, Преамбула: 8)
  27. ^ Адл, СМ и др. Разнообразие, номенклатура и таксономия простейших. Систематическая биология , стр. 684-689, 2007, [2].
  28. ^ Эльбрахтер, М. и др. Установление повестки дня для исследований известковых динофлагеллятов (Thoracosphaeraceae, Dinophyceae), включая номенклатурный синопсис родовых названий. Таксон 57, стр. 1289–1303, 2008, [3]
  29. ^ ab (Лар и др., 2012)
  30. ^ Дюбуа, А. (2006). Предлагаемые правила включения названий зоологических таксонов более высокого ранга в Международный кодекс зоологической номенклатуры. 2. Предлагаемые правила и их обоснование. Zoosystema , 28 (1): 165‒258, [4].
  31. ^ Frost, DR et al. (2006). Древо жизни амфибий. Бюллетень Американского музея естественной истории 297: 1–291, [5],
  32. ^ Дюбуа, Ален (2015). «Дуплостенциональная номенклатурная система для высшей зоологической номенклатуры». Dumerilia . 5 : 1–108.
  33. ^ Дюбуа, Ален; Олер, Аннемари; Пирон, Р. Александр (26 февраля 2021 г.). «Новые концепции и методы филогенетической таксономии и номенклатуры в зоологии, на примере новой ранжированной кладономии современных амфибий (Lissamphibia)». Megataxa . 5 (1). doi : 10.11646/megataxa.5.1.1 . ISSN  2703-3090.
  34. ^ Клюге, Н. Дж. (2010). Объемные названия высших таксонов Hexapoda. Bionomina, 1, 15-55, [6].
  35. ^ Клюге, Н. Дж. (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Entomological Review . 79 (2): 133–147.
  36. ^ (Макнил и др. 2012, статья 16)
  37. ^ (Турланд и др. 2018, статья 16)

Библиография

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме «Номенклатурные коды» .