Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Гомолог Tribbles 1 — это протеинкиназа , которая у людей кодируется геном TRIB1 . [ 5] [6] [7] Ортологи этой протеин-псевдокиназы ( псевдофермента ) можно найти практически повсеместно в животном мире. [8] Он выполняет свои биологические функции посредством связывания с сигнальными белками уровня MAPKK пути MAPK, тем самым выявляя регуляторную роль в функции этого пути, который опосредует пролиферацию, апоптоз и дифференциацию в клетках. Tribbles-1 кодируется геном trib1, который у людей находится на хромосоме 8 в позиции 24.13 на самом длинном плече (q). Недавние кристаллические структуры показывают, что Tribbles 1 имеет необычную трехмерную структуру, содержащую «сломанную» область C-спирали, сайт связывания для убиквитинированных субстратов, таких как C/EBPalpha, и ключевую регуляторную область C-хвоста. [9] Подобно TRIB2 и TRIB3 , TRIB1 недавно рассматривался как потенциальная аллостерическая лекарственная мишень. [10]
Функция
Tribbles-1 — один из трех членов подсемейства Tribbles, которое является частью семейства протеинкиназ CAMK Ser/Thr, суперсемейства протеинкиназ. Подсемейство Tribbles является одной из псевдокиназ, что означает, что, хотя оно и экспрессирует предполагаемые киназные регионы в своей структуре, оно не является каталитическим. Подсемейство Tribbles не имеет функционального кармана связывания АТФ и, следовательно, не может фосфорилировать свои субстраты; вместо этого белки Tribbles функционируют как белки-каркасы, которые связывают свои субстраты, чтобы локализовать их в своей функции или от нее [8]
Экспрессия Tribbles-1 сильно варьируется, постоянно меняется в зависимости от времени и типа клеток [11] , что предполагает большое количество регуляции, которая существует в клетке. Первичная структура белка содержит область PEST, указывающую на белки, которые очень восприимчивы к деградации в клетке; Tribbles-1 играет роль в регуляции своей собственной экспрессии путем связывания со своим субстратом, который не только выполняет свою функцию на пути MAPK, но и защищает его от деградации во время связывания. Это, в частности, создает положительную обратную связь в функции Tribbles-1, поскольку функция Tribbles-1 напрямую способствует увеличению его количества. Поскольку положительные обратные связи часто наблюдаются в биологии в обстоятельствах, которые требуют смягчения внешнего стимула, положительная обратная связь, демонстрируемая Tribbles-1, предполагает, что он играет функциональную роль в клеточном ответе.
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000173334 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Wilkin F, Suarez-Huerta N, Robaye B, Peetermans J, Libert F, Dumont JE, Maenhaut C (сентябрь 1997 г.). «Характеристика фосфопротеина, мРНК которого регулируется митогенными путями в клетках щитовидной железы собак». European Journal of Biochemistry . 248 (3): 660–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . PMID 9342215.
- ^ Hegedus Z, Czibula A, Kiss-Toth E (июль 2006 г.). «Трибблы: новые регуляторы клеточной функции; эволюционные аспекты». Cellular and Molecular Life Sciences . 63 (14): 1632–41. doi :10.1007/s00018-006-6007-9. PMC 11136108 . PMID 16715410. S2CID 24556931.
- ^ "Ген Entrez: TRIB1 разрушает гомолог 1 (Drosophila)".
- ^ ab Eyers PA, Keeshan K, Kannan N (апрель 2017 г.). «Трибблы в 21 веке: эволюционирующие роли псевдокиназ трибблов в биологии и болезнях». Тенденции в клеточной биологии . 27 (4): 284–298. doi : 10.1016 /j.tcb.2016.11.002. PMC 5382568. PMID 27908682.
- ^ Мерфи Дж.М., Накатани Ю., Джеймисон С.А., Дай В., Люсет И.С., Мейс П.Д. (ноябрь 2015 г.). «Молекулярный механизм рекрутирования белка, связывающего CCAAT-энхансер, с помощью псевдокиназы TRIB1». Структура . 23 (11): 2111–21. дои : 10.1016/j.str.2015.08.017 . ПМИД 26455797.
- ^ Foulkes DM, Byrne DP, Bailey FP, Eyers PA (октябрь 2015 г.). «Псевдокиназы триббла: новые цели для химической биологии и открытия лекарств?». Biochemical Society Transactions . 43 (5): 1095–103. doi :10.1042/BST20150109. PMID 26517930.
- ^ Sung HY, Francis SE, Crossman DC, Kiss-Toth E (апрель 2006 г.). «Регуляция экспрессии и функции модулятора сигнализации млекопитающих tribbles специфична для типа клеток». Immunology Letters . 104 (1–2): 171–7. doi :10.1016/j.imlet.2005.11.010. PMID 16364454.
Дальнейшее чтение
- Tang K, Finley RL, Nie D, Honn KV (март 2000 г.). «Идентификация взаимодействия 12-липоксигеназы с клеточными белками с помощью дрожжевого двугибридного скрининга». Биохимия . 39 (12): 3185–91. doi :10.1021/bi992664v. PMID 10727209.
- Wu M, Xu LG, Zhai Z, Shu HB (июль 2003 г.). «SINK — это взаимодействующий с p65 отрицательный регулятор NF-kappaB-зависимой транскрипции». Журнал биологической химии . 278 (29): 27072–9. doi : 10.1074/jbc.M209814200 . PMID 12736262.
- Kiss-Toth E, Bagstaff SM, Sung HY, Jozsa V, Dempsey C, Caunt JC и др. (октябрь 2004 г.). «Человеческие трибблы, семейство белков, контролирующих каскады митоген-активируемых протеинкиназ». Журнал биологической химии . 279 (41): 42703–8. doi : 10.1074/jbc.M407732200 . hdl : 2262/33449 . PMID 15299019.
- Xu C, Zhang J, Huang X, Sun J, Xu Y, Tang Y и др. (июнь 2006 г.). «Структура раствора человеческого пептидилпролилизомеразоподобного белка 1 и понимание его взаимодействия со SKIP». Журнал биологической химии . 281 (23): 15900–8. doi : 10.1074/jbc.M511155200 . PMID 16595688.
- Sung HY, Guan H, Czibula A, King AR, Eder K, Heath E и др. (июнь 2007 г.). «Human tribbles-1 контролирует пролиферацию и хемотаксис гладкомышечных клеток через сигнальные пути MAPK». Журнал биологической химии . 282 (25): 18379–87. doi : 10.1074 /jbc.M610792200 . PMC 2366084. PMID 17452330.
Внешние ссылки